自新型冠状病毒病大流行爆发以来,一种简单有效的方法,在胸部CT扫描图像中对这种感染的典型病理病变进行适当分割,显得具有根本性。因此,我们的目标是提供一组知识,以便让人们对这些肺病理发现进行简单而高效的分割。希望这将有助于科学界开发专门的放射学和人工智能研究,以改善这些患者的诊断方法。
从 3D 切片器的 DICOM 浏览器中,继续选择要分段的学习,然后单击"加载"。您可以在查看器部分中查看所选案例。如您所见,此患者呈现地面玻璃不透明度双边和合并区域一样,这是 COVID-19 的典型案例。
然后转到"段"部分,并添加三个段,一个用于总肺体积,一个用于地面玻璃不透明度,另一个用于合并区域。转到阈值仪器,将上限阈值设置为负 250 Hounsfield 单位。排序只选择空气,并留下软组织,骨骼和合并区域一样,系统不能自动从软组织识别,然后单击应用。
然后,要移除患者外部的空气,并为此使用"孤岛"工具,然后转到"仅保留所选岛屿"。然后点击患者体内。你看外面的空气已经清除了。
现在,您希望将合并区域添加到肺总体积中。为此,请使用具有"球体画笔"设置的"画图"工具,根据需要调整尺寸,并小心避免软组织。使用"球体"画笔,您可以根据正在处理的切片上下绘制,从而加快该过程。
现在,您要对合并区域进行细分。为此,请确保在肺总体积内工作,无需使用各种其他部分。使用阈值仪器,提高阈值以确保包括软组织和整合,并设置较低的阈值为负 250。
请注意,您同时选择了软组织、血管和整合,但当您单击"应用"时,只选择了合并区域。现在,要分割地面玻璃区域,请选择地面玻璃段。保留上一个分段的设置,将阈值从负 750 设置为负 250 Hounsfield 单位。
请注意,这些值可能因 CT 扫描设置而异。始终根据弗莱施纳协会对地面玻璃的定义进行调整。选择与可见容器的不透明度。
然后,单击"应用"。您会注意到,也选择了中间空间。要进行调整,请转到平滑仪器。
选择哪个座位更适合 CT 扫描的构造算法。正如您所看到的,中间空间已被删除。您可以检查到分段编辑器的分段结果,并可以查看已定义的分段的 3D 模型。
您可以使用左侧的滑块来调整模型的透明度。3D 视图可用于确认正确的分段过程。我们现在有三个不同的部分,一个用于总肺体积,另一个用于COVID-19整合和地面玻璃区域的典型发现。
您可以从由于段统计模块而定义的段中提取一些统计信息。删除"标量体积"选项,然后有一个表,表示总肺和合并区域以及地面玻璃区域的体积。您可以使用它来计算疾病的严重程度。
您还可以导出已定义的段。您可以转到"数据"部分。然后,仅使要导出的段可见,单击眼睛图标。
然后右键单击并导出二进制标签图仅可见。您可以保持标签图,如您喜欢。您必须为已定义的每个段重复此过程。
通过这样做,您现在有三个标签映射对应于您定义的段。这可以在您喜欢的文件类型中导出,也可以最适合进一步分析。此外。通过这些方法,研究人员可以快速获得COVID-19病理发现的准确分割,并可提取特定特征。
向科学界提供这种知识,可以开发准确、全自动的分段方法,并确定精确的预测因素。