合成mRNA转染后肿瘤细胞迁移和侵袭的实时定量测量

摘要

许多上调的基因刺激肿瘤细胞迁移和侵袭，导致预后不良。确定哪些基因调节肿瘤细胞迁移和侵袭至关重要。该协议提出了一种实时研究基因表达增加对肿瘤细胞迁移和侵袭的影响的方法。

摘要

肿瘤细胞具有高度的运动性和侵袭性，并显示出基因表达模式的改变。了解基因表达的变化如何调节肿瘤细胞迁移和侵袭对于了解肿瘤细胞浸润到邻近健康组织和转移的机制至关重要。以前，已经证明基因敲低，然后基于阻抗的肿瘤细胞迁移和侵袭实时测量能够识别肿瘤细胞迁移和侵袭所需的基因。最近，针对 SARS-CoV-2 的 mRNA 疫苗增加了人们对使用合成 mRNA 进行治疗的兴趣。本文对合成mRNA方法进行了修正，研究了基因过表达对肿瘤细胞迁移和侵袭的影响。这项研究表明，通过合成 mRNA 转染和基于阻抗的实时测量提高基因表达可能有助于识别刺激肿瘤细胞迁移和侵袭的基因。本方法论文提供了有关检查基因表达改变对肿瘤细胞迁移和侵袭影响的程序的重要细节。

引言

肿瘤细胞运动在转移中起着至关重要的作用 ^1,2。肿瘤细胞扩散到邻近和遥远的健康组织使癌症治疗变得困难，并导致复发^3,4。因此，了解肿瘤细胞运动的机制并制定相关的治疗策略至关重要。由于许多肿瘤细胞改变了基因表达谱，因此了解基因表达谱的哪些变化导致肿瘤细胞运动性改变至关重要 ^5,6。

已经开发了几种测定法来测量 体外细胞迁移。由于只允许在特定时间点进行测量，一些检测仅提供有限的信息，而另一些则实时提供有关肿瘤细胞运动的全面信息⁷。尽管这些细胞运动测定中的许多可以在给定时间或终点提供定量结果，但它们无法提供有关实验期间细胞迁移速率动态变化的足够详细的信息。此外，根据实验设计、细胞类型和细胞数量，可能很难检查细胞迁移速率的潜在变化。此外，可以通过传统运动测定的简单定量来研究简单处理的效果，但可能需要更复杂的定量来研究各种联合处理的复杂效果⁸。

已经^开发出一种用于监测覆盖有微电极的微量滴定板孔底电流的仪器9。细胞与孔表面的粘附阻碍了电子流动，阻抗与细胞的定量和定性结合相关。孔底存在微电极，可以测量细胞粘附、扩散和增殖。微电极存在于上腔室的微孔膜下方，允许测量细胞迁移和侵袭到下腔室，上腔室涂有细胞外基质 （ECM） 蛋白以允许侵袭¹⁰。

此前，已经证明，基于阻抗的肿瘤细胞迁移和侵袭的实时测量在整个实验过程中提供了实时数据，以及在各种实验条件下的即时比较和量化¹¹。在该方法论文中，诱导基因敲低以测试目标蛋白在肿瘤细胞迁移和侵袭中的作用。由于在测试的实验条件下，使用小干扰 RNA （siRNA） ⁸ 电穿孔后需要 3-4 天才能完全实现基因敲低效应，因此在电穿孔后重新接种细胞，并在 3 天后重新收获，以进行基于阻抗的肿瘤细胞迁移和侵袭实时测量。

激酶 （Crk） 和 Crk 样 （CrkL） 的 CT10 调节因子是介导各种生长因子受体激酶通路和非受体酪氨酸激酶通路下游的蛋白质-蛋白质相互作用的接头蛋白¹²。Crk 和 CrkL 蛋白水平升高会导致几种人类癌症（包括胶质母细胞瘤¹³）的预后不良。然而，目前尚不清楚 Crk 和 CrkL 蛋白升高如何导致预后不良。因此，确定 Crk 和 CrkL 过表达对肿瘤细胞功能的影响非常重要。此前，进行了一项基因敲低研究，以证明胶质母细胞瘤细胞迁移和侵袭需要内源水平的 Crk 和 CrkL 蛋白⁸。在这里，已经开发了一种改进的测定系统来解决 Crk 和 CrkL 过表达对肿瘤细胞迁移和侵袭的影响。

最近，由于针对 SARS-CoV-2 的 mRNA 疫苗的开发，mRNA 的体外合成及其治疗应用再次受到关注（由 Verbeke 等人审查 ¹⁴）。此外，在癌症和其他疾病中使用合成mRNA方面也取得了显着进展^15,16。细胞电穿孔是递送合成 mRNA 和诱导瞬时基因修饰的有效方法（Campillo-Davo 等人 ¹⁷ 评论），使用合成 mRNA 可在永生化成纤维细胞中快速有效地表达基因¹⁸。本方法论文将使用合成mRNA的基因过表达与实时细胞分析相结合，以研究肿瘤细胞迁移和侵袭。然而，用于 siRNA 的实验方案不适用于合成 mRNA 转染，因为外源蛋白的水平在合成 mRNA 转染时迅速增加并逐渐降低¹⁸。因此，该方法已被修改为在转染后立即进行细胞迁移和侵袭的实时分析，而无需额外培养细胞。

本方法论文表明，将基于阻抗的实时测量与用合成mRNA转染肿瘤细胞相结合，可以快速、全面地分析基因上调对肿瘤细胞迁移和侵袭的影响。本方法论文描述了测量胶质母细胞瘤细胞迁移和侵袭如何受 Crk 和 CrkL 过表达影响的详细程序。通过研究合成mRNA对肿瘤细胞迁移的浓度依赖性影响，该论文清楚地描述了蛋白质水平的增加如何刺激肿瘤细胞迁移。此外，还提出了一种改变ECM凝胶浓度的方法，以评估基因表达变化对肿瘤细胞侵袭的影响。

研究方案

1. mRNA的合成

注意:对于mRNA合成，所有试剂和设备必须在使用前经过特殊处理以灭活RNase。有关本协议中使用的所有材料、仪器和试剂的详细信息，请参阅 材料表 。

1. DNA的线性化
   注:将 CrkI 和 CrkL 的小鼠 cDNA 克隆到 pFLAG-CMV-5a 表达载体中，以在 C 末端添加 FLAG 表位标签，并将亚克隆到 pcDNA3.1/myc-His 载体中以掺入 T7 启动子，如前所述^18,19。
   1. 向微量离心管中加入 10 μL 10x 反应缓冲液、1.5 μL PmeI （10,000 单位/mL） 和 10 μg 质粒 DNA，用限制性内切酶线性化质粒 DNA。加入无核酸酶的水，使反应体积达到100μL。
   2. 通过敲击混合，旋转，并将反应混合物在37°C孵育过夜。
   3. 旋转，向反应混合物中加入 5 μL 10% 十二烷基硫酸钠 （SDS） 和 1 μL 蛋白酶 K（20 mg/mL，RNA 级）。通过敲击混合，旋转，并在50°C下孵育30分钟。
   4. 在通风橱下，向质粒反应混合物中加入100μL苯酚:氯仿:异戊醇的底相进行提取。涡旋，然后在室温下以18,800× g 离心5分钟。将上相移至新管中。
   5. 用氯仿:异戊醇在24:1重复步骤1.1.4。
   6. 在新管中，加入200μL无核酸酶水，使反应体积达到300μL，然后加入30μL的3M乙酸钠和600μL的100%乙醇。
   7. 涡旋混合，然后在-20°C下放置30-60分钟，使DNA的乙醇沉淀。
   8. 在4°C下以18,800× g 离心20分钟，弃去上清液，并用1mL 70%乙醇冲洗沉淀。重复离心10分钟，然后完全除去上清液。
   9. 打开盖子干燥 2 分钟，加入 30 μL 无核酸酶的水，并重悬 DNA 沉淀。
   10. 使用分光光度计测定DNA浓度。
   11. 使用琼脂糖凝胶电泳验证线性化DNA的大小和数量。
2. 使用 T7 RNA 聚合酶进行 RNA 合成
   1. 向微量离心管中加入 2 μL 10x 转录缓冲液、ATP、GTP、UTP、CTP 和 T7 以及 1 μg 线性化 DNA。加入无核酸酶的水，使反应体积达到20μL。
   2. 通过敲击混合，旋转，并将反应混合物在37°C下孵育2小时用于RNA合成。
   3. 旋转下来，加入1μL的DNase（2U / μL），并在37°C下孵育15分钟以除去模板DNA。
3. RNA的氯化锂沉淀
   1. 向反应混合物中加入 10 μL 氯化锂 （7.5 M）。通过敲击混合，旋转，并将反应混合物在-20°C下孵育30分钟。
   2. 在4°C下以18,800× g 离心20分钟，弃去上清液，并用500μL 70%乙醇冲洗沉淀。重复离心10分钟，然后完全除去上清液。
   3. 打开盖子干燥 2 分钟，加入 30 μL 无核酸酶的水，并重悬 RNA 沉淀。
4. 上限
   1. 将RNA样品在65°C加热10分钟，然后将其置于冰上冷却。
   2. 加入 10x 加帽缓冲液、10 mM GTP 和 1 mM （10x） S-腺苷甲硫氨酸 （SAM） 各 5 μL，加帽酶混合物和 O-甲基转移酶混合物各 2 μL，以及 1.25 μL RNase 抑制剂。通过敲击混合，旋转，并将反应混合物在37°C下孵育1小时。
5. Poly（A） 尾矿
   1. 旋转样品，然后加入 6 μL 无核酸酶水、20 μL 5x E-PAP 缓冲液、10 μL 25 mM MnCl₂、10 μL 10 mM ATP 和 4 μL E-PAP poly（A） 拖尾酶。通过敲击混合，旋转，并将反应混合物在37°C下孵育2小时。
6. 氯化锂沉淀和合成mRNA的定量
   1. 加入50μL氯化锂（7.5M），并按照步骤1.3.1-1.3.3所述进行氯化锂沉淀。
   2. 使用分光光度计测量mRNA的浓度。
   3. 使用甲醛（1%-2%）琼脂糖（1%）凝胶电泳验证mRNA的大小和数量。

2. 细胞侵袭和迁移 （CIM） 板的细胞外基质 （ECM） 凝胶涂层

注:细胞侵袭和迁移 （CIM） 板是商业制造的 16 孔板，用于基于阻抗的实时细胞分析。对于细胞侵袭测定，如前所述，用ECM凝胶涂覆CIM板，但进行了一些修改¹¹。

1. 从冰箱中取出等分试样的ECM凝胶原液，并将其放在冰上。
2. 通过将 990 μL Dulbecco 改良 Eagle 培养基 （DMEM）（不含血清或抗生素）与 10 μL ECM 凝胶在微量离心管中混合，将 ECM 凝胶 （10 mg/mL） 稀释至工作浓度 （100 μg/mL）。通过轻柔的移液进行混合。
3. 将 60 μL 稀释的 ECM 凝胶加入 CIM 板上室的 16 个孔中的每一个。应用反向移液方法，同时避免气泡^20,21。
   注意:优化每个细胞系的ECM凝胶浓度。对于胶质母细胞瘤细胞系，使用 0.1 μg/μL 至 1 μg/μL ECM 凝胶进行优化。
4. 将CIM板的上腔室与板盖脱开，放在CO₂ 培养箱内的保护性塑料片上约4小时以形成凝胶层。
   注意:在用ECM凝胶涂覆CIM板期间，CIM板上室的电极不应与实验者的手或设备的表面直接接触，包括生物安全柜或CO₂ 培养箱。

3. 肿瘤细胞的制备

注意:所有细胞培养材料必须保持无菌。如前所述，在生物安全柜下收集和电穿孔肿瘤细胞，并配备适当的个人防护设备 （PPE），但进行了一些修改¹¹.

1. 肿瘤细胞培养
   1. 在37°C下，在5%CO₂ 培养箱（培养条件）中，在10mL DMEM中培养U-118MG细胞，每100mm x 20 mm聚苯乙烯组织培养皿中含有5%胎牛血清（FBS）和1%抗生素。
2. 肿瘤细胞的血清耗竭
   注:在细胞迁移和侵袭测定之前，必须通过使用高浓度的FBS将细胞暴露于FBS中存在的化学引诱剂。
   1. 除去旧培养基，每培养皿加入 10 mL 预热的含有 0.5% FBS 和 1% 抗生素的 DMEM（低血清培养基）。
   2. 重复步骤 3.2.1。
   3. 将细胞在37°C下在5%CO₂ 培养箱中孵育4小时或更长时间。
3. 收获肿瘤细胞
   1. 除去旧培养基，每培养皿加入 8 mL 预热的 Dulbecco 磷酸盐缓冲盐水 （DPBS），除去 DPBS，加入预热的 0.05% 胰蛋白酶-EDTA（2 mL/培养皿）以覆盖表面，并在 CO₂ 培养箱中孵育 30 秒。
   2. 小心吸出胰蛋白酶-EDTA，加入低血清培养基（7 mL /培养皿），然后将细胞收集到50 mL或15 mL离心管中。
   3. 分装少量细胞，并使用手持式自动细胞计数仪对细胞进行计数。
   4. 计算细胞总数和 10,000 个细胞/μL 所需的体积。
   5. 通过在室温下以100× g 离心细胞5分钟来旋转细胞，吸出上清液，加入含有0.5%FBS（不含抗生素）的计算体积的DMEM，并轻轻重悬细胞沉淀。
   6. 每次处理时，将 110 μL 含有 110 万个细胞的细胞悬液转移到微量离心管中。
   7. 重复步骤3.3.6，将细胞转移到四个微量离心管中，进行四种不同的处理。
      注意:CIM 板共有 16 个孔。设计四种不同的处理进行比较，以便可以为每个处理分配四个CIM板孔。使用电穿孔细胞进行以下实验:蛋白质印迹分析（每 35 mm 组织培养皿 30 万个细胞）、四个孔的实时细胞迁移测定（10 万个细胞/孔）和四个孔的实时细胞侵袭测定（10 万个细胞/孔）用于每次处理。如果实验设计发生变化，调整需要电穿孔的电池数量。

4. 肿瘤细胞的电穿孔

1. 要除去培养基，将 1 mL DPBS 添加到每个试管中的细胞悬液中，将细胞悬液旋转 3 次，每次 10 秒，同时使用微型离心机每 10 秒将试管旋转 180°，并使用微量移液管除去上清液。
   注意:形成紧凑但易于重悬的细胞沉淀非常重要。
2. 向细胞沉淀中加入 110 μL 重悬缓冲液 R，以 10 μL 形式获得 10 万个细胞。
3. 将合成的 mRNA 添加到细胞沉淀中，以获得 0.2-20 ng/μL 的浓度，具体取决于所需的表达水平。通过轻敲或轻柔移液轻轻混合并重悬细胞沉淀。
   注:使用不同浓度的合成mRNA，使用蛋白质印迹分析检查蛋白质表达，并确定导致所需表达水平的合成mRNA的浓度，以研究蛋白质表达与生物学效应之间的特定相关性。
4. 用电穿孔系统在 1,350 V 下电穿孔 10 μL 细胞悬液 10 ms，每次三个脉冲。
5. 将电穿孔细胞转移到含有 1.1 mL 含有 0.5% FBS 的 DMEM 的新微量离心管中。
6. 重复电穿孔，直到细胞悬液的其余部分被电穿孔。将微量离心管中的电穿孔细胞合并，在 1.1 mL 中获得 110 万个细胞。
   注:100 μL 和 10 μL 电穿孔吸头均可用于电穿孔大量细胞，但 10 μL 和 100 μL 的电穿孔吸头包含在两个单独的试剂盒中，需要单独购买。重悬缓冲液 R 包含在两种试剂盒中。
7. 完成所有相应的电穿孔后，轻轻地重悬合并的细胞。
8. 将 30 万个细胞接种在 35 mm x 10 mm 聚苯乙烯组织培养皿中，加入含有 5% FBS 的 2 mL DMEM，并在培养条件下培养细胞 1 天，用于总细胞裂解物制备和蛋白质印迹分析。
9. 将其余的电穿孔细胞保持在室温下，直到实时细胞分析系统准备就绪。

5. 设置实时细胞分析仪、程序和 CIM 板

注:如前所述，准备实时细胞分析仪和两个CIM板¹¹.

1. 实时细胞分析仪的平衡
   1. 使用前数小时将实时细胞分析仪移至 CO₂ 培养箱中，以在培养条件下平衡系统。
2. 设置分析程序
   1. 双击桌面上的 实时细胞分析软件图标，打开分析程序。
   2. 打开 "默认实验模式设置 "选项后，选择用于分别运行三个实验的选项。
      注意: 每个支架都有一个单独的窗口。有不同的选项卡可以设置测量间隔和持续时间、数据分析和其他实验条件。
   3. 通过单击 "数字 "选项卡打开每个底座。
   4. 单击"实验 注释 "选项卡，选择要保存数据的文件夹，然后输入实验的名称。
   5. 单击 "布局 "选项卡，通过一次选择四个孔并输入样品信息，为每个处理条件设置四重孔，然后单击 "应用"。
   6. 单击 "计划 "选项卡 | 添加一个步骤 以设置电池阻抗测量的两步模式。然后，单击 "应用 "以设置第一步。
   7. 再次单击" 添加步骤 "，输入 10 分钟作为间隔，输入 48 小时作为迁移和入侵的持续时间，然后单击 "应用 "以设置第二步。
      注意: 第一步进行一次性基线测量（一次扫描，间隔 1 分钟）。第二步在摇篮上测量实验的细胞阻抗（例如，以10分钟的间隔进行289次扫描，持续48小时）。根据实验设计调整间隔和持续时间。
   8. 移动到下一个底座，然后重复步骤 5.2.3-5.2.7 进行设置。
3. CIM板的制备
   1. 在细胞阻抗测量开始前一小时，用含有10%血清或其他化学引诱剂的160μLDMEM填充CIM板下腔室的孔。
   2. 将包含ECM凝胶涂层孔（用于侵入）或未涂层孔（用于迁移）的上腔室与下腔室组装在一起。
   3. 将 50 μL 低血清培养基加入 CIM 板上室的孔中用于细胞迁移测定，并将 CIM 板置于系统的支架中。
   4. 单击"消息"选项卡，并确保显示"连接正常"消息。CIM板现在已准备好进行实验。
   5. 在进行实时细胞分析之前，将组装好的CIM板在CO₂ 培养箱中预孵育30-60分钟，以使CIM板适应培养条件。

6. 实时细胞分析和数据导出

注意:如前所述，执行基线读数、细胞接种、细胞阻抗测量和数据导出¹¹.

1. 基线读数
   注意:在CIM板适应后，在将细胞添加到上室的孔中之前，应读取基线。
   1. 单击每个底座的 "开始 "按钮。当 "另存为 "窗口出现时，保存实验文件以执行基线读数。
2. 细胞接种
   1. 从支架上取下 CIM 板，并将其放入板架上的生物安全柜中。
   2. 根据控制单元中的程序，将 100 μL（含有 100,000 个细胞）电穿孔细胞加入 CIM 板上室的孔中。应用反向移液方法，同时避免气泡。
   3. 在室温下将CIM板留在生物安全柜下30分钟，以确保细胞均匀地分布在孔底。
3. 电池阻抗测量
   1. 将完全组装好的 CIM 板移回相应的底座。单击底座开始按钮 开始 第二步的电池阻抗测量。
   2. 单击" 绘图 "选项卡，然后单击" 全部添加 "按钮，然后选择" 平均 "和" STD DEV "框以实时可视化数据。
      注意:x 轴的默认绘图选项是时间，y 轴的标格索引是。"绘图选择"部分允许用户为 y 轴选择替代选项:"归一化像元索引"或"增量像元索引"。完成最终扫描后，实验完成，结果自动保存。
4. 导出数据进行分析
   1. 单击"绘图"选项卡，然后选择"平均"和"STD DEV"框，以分别复制每个孔的数据。
   2. 右键单击绘图区域，然后选择 "以列表格式复制数据"。
   3. 打开一个空的电子表格文件，粘贴数据，然后保存该文件。
   4. 返回分析程序，单击每个底座的 "板 "选项卡，然后选择" 释放 "以关闭底座的实验。
   5. 返回电子表格文件，调整原始数据的时间，使第二步的开始时间成为测量的实际开始时间。

结果

Crk 和 CrkL 蛋白在许多细胞类型的运动中起着重要作用，包括神经元²²、T 细胞²³、成纤维细胞 ^18,19 和多种肿瘤细胞¹³。由于已报道 Crk 和 CrkL 蛋白在胶质母细胞瘤^24,25,26 中升高^，因此本研究研究了 CrkI（Crk 的剪接变体）过表达对胶质母细胞...

讨论

迁移和侵袭是肿瘤细胞的重要特征。测量肿瘤细胞的运动性并了解控制肿瘤细胞运动的潜在机制为治疗干预提供了重要的见解^2,27。已经开发了几种方法来研究细胞迁移⁷.使用划痕或培养插入物的伤口愈合测定是一种简单且常用的方法，可提供间隙闭合的对比图像。单个细胞追踪测定需要通过延时成像监测单个细胞，为此可以用荧光染?...

材料

Name	Company	Catalog Number	Comments
AlphaImager HP	ProteinSimple	92-13823-00	Agarose gel imaging system
α-Tubulin antibody	Sigma	T9026	Used to detect α-tubulin protein (dilution 1:3,000)
CIM-plate 16	Agilent Technologies, Inc	5665825001	Cell invasion and migration plates
Crk antibody	BD Biosciences	610035	Used to detect CrkI and CrkII proteins (dilution 1:1,500)
CrkL antibody	Santa Cruz	sc-319	Used to detect CrkL protein (dilution 1:1,500)
Dulbecco’s Modified Eagle’s Medium (DMEM)	ATCC	302002	Cell culture medium
Dulbecco's phosphate-buffered saline (DPBS)	Corning	21-031-CV	Buffer used to wash cells
Fetal bovine serum (FBS)	Hyclone	SH30910.03	Culture medium supplement
Heracell VIOS 160i CO2 incubator	Thermo Scientific	51030285	CO2 incubator
IRDye 800CW goat anti-mouse IgG secondary antibody	Li-Cor	926-32210	Secondary antibody for Western blot analysis (dilution 1:10,000)
IRDye 800CW goat anti-rabbit IgG secondary antibody	Li-Cor	926-32211	Secondary antibody for Western blot analysis  (dilution 1:10,000)
Lithium chloride	Invitrogen	AM9480	Used for RNA precipitation
Matrigel matrix	Corning	354234	Extracellular matrix (ECM) gel
MEGAscript T7 transcription kit	Invitrogen	AM1334	Used for RNA synthesis
Millennium RNA markers	Invitrogen	AM7150	Used for formaldehyde agarose gel electrophoresis
Mini centrifuge	ISC BioExpress	C1301P-ISC	Used to spin down cells
Mouse brain QUICK-Clone cDNA	TaKaRa	637301	Source of genes (inserts) for cloning
NanoQuant	Tecan	M200PRO	Nucleic acid quantification system
Neon electroporation system	ThermoFisher Scientific	MPK5000	Electroporation system1
Neon transfection system 10 µL kit	ThermoFisher Scientific	MPK1025	Electroporation kit
Neon transfection system 100 µL kit	ThermoFisher Scientific	MPK10096	Electroporation kit
NorthernMax denaturing gel buffer	Invitrogen	AM8676	Used for formaldehyde agarose gel electrophoresis
NorthernMax formaldehyde load dye	Invitrogen	AM8552	Used for formaldehyde agarose gel electrophoresis
NorthernMax running buffer	Invitrogen	AM8671	Used for formaldehyde agarose gel electrophoresis
Nuclease-free water	Teknova	W3331	Used for various reactions during mRNA synthesis
Odyssey CLx Imager	Li-Cor		Imager for Western blot analysis
pcDNA3.1/myc-His	Invitrogen	V80020	The vector into which inserts (mouse CrkI and CrkL cDNAs) were cloned
pFLAG-CMV-5a	Millipore Sigma	E7523	Source of the FLAG epitope tag
Phenol:chloroform:isoamyl alcohol	Sigma	P2069	Used for DNA extraction
PmeI	New England BioLabs	R0560L	Used to linearize the plasmids for mRNA synthesis
Poly(A) tailing kit	Invitrogen	AM1350	Used for poly(A) tail reaction
Polystyrene tissue culture dish (100 x 20 mm style)	Corning	353003	Used for culturing cells before transfection
Polystyrene tissue culture dish (35 x 10 mm style)	Corning	353001	Used for culturing transfected cells
Proteinase K	Invitrogen	25530049	Used to remove protein in the reaction mixture
Purifier Axiom Class II, Type C1	Labconco Corporation	304410001	Biosafety cabinet for sterile handling of cells
Resuspension Buffer R	ThermoFisher Scientific		A buffer included in the electroporation kits, MPK1025 and MPK10096. The buffer is used to resupend cells before electroporation, and its composition is proprietary information.
RNaseZap	Invitrogen	AM9780	RNA decontamination solution
Scepter	Millipore	C85360	Handheld automated cell counter
ScriptCap 2'-O-methyltransferase kit	Cellscript	C-SCMT0625	Used for capping reaction
ScriptCap m7G capping system	Cellscript	C-SCCE0625	Used for capping reaction
Sodium dodecyl sulfate solution	Invitrogen	15553-035	Detergent used for the proteinase K reaction
Sorvall Legend XT centrifuge	Thermo Scientific	75004532	Benchtop centrifuge to spin down cells
Trypsin-EDTA	Gibco	25300-054	Used for dissociation of cells
U-118MG	ATCC	HTB15	An adherent cell line derived from a human glioblastoma patient
Vinculin antibody	Sigma	V9131	Used to detect vinculin protein (dilution 1:100,000)
xCELLigence RTCA DP	Agilent Technologies, Inc	380601050	Instrument used for real-time cell analysis
1Electroporation parameters and other related information for various cell lines are available on the manufacturer's homepage (https://www.thermofisher.com/us/en/home/life-science/cell-culture/transfection/neon-transfection-system/neon-transfection-system-cell-line-data.html?).