从废水中增强低分子量 DNA 的提取，用于抗菌素耐药性的综合评估

我们对抗生素耐药性的进化、传播和分子机制感兴趣。具体来说，本文的工作来自我们对环境抵抗的兴趣。目前，我们正在尝试构建一个本地数据库，以使用一年的数据来跟踪抗菌素耐药性的时空变化。

基于培养的技术和基因组学相结合，用于检测和监测抗菌素耐药性。样品中的 DNA 经过 PCR 或鸟枪法测序，以分析微生物多样性并检测耐药基因。此外，宏条形码和基于基因的 AMR 检测组合用于高级 AMR 检测。

已知片段化的低分子量 DNA 是 AMR 基因的储存库，但很少关注开发专门用于线性和低分子量 DNA 高产量提取的方法。我们的工作重点是解决这一差距。我们的方案引入了一个简单的预处理步骤，以富集从废水中提取的低分子量 DNA 的比例。

因此，它可以完整地捕获环境 AMR，而不排除游离 DNA 组分。该方案可以开发成一种无需试剂盒的方法，只需多做一点工作。反过来，这为开发具有成本效益的捕获环境 AMR 的技术铺平了道路。

我们希望超越突变耐药性，探索非遗传机制对抗生素耐药性的贡献。我们特别感兴趣的是比较水平基因转移和基因组突变对不同环境中对抗生素适应的相对贡献。