使用 果蝇 活动监测系统进行耐热性测定:数据分析的可执行应用程序指南

在研究生院，我对耐热性非常感兴趣，尤其是它的行为成分，从那时起，我就对行为体温调节和吸热动物用来调节体温的机制非常感兴趣。几十年来，研究人员通过对生物体的观察来研究耐热性。最近，出现了基于视频的自动化方法来测量耐热性的各个方面。

我认为，看到这些新技术将带我们去探索与热调节相关的一些错综复杂的行为和活动，这将是非常酷的。该领域的挑战之一是，尽管我们现在有办法监测和收集大量活动数据，但根据活动数据与实际应用的生物学相关性来解释活动数据的含义仍然是一个需要进一步研究的问题。拥有自动化程序的优势之一是您可以以更容易访问的方式处理大型数据集。

以前，必须手动浏览大型 Excel 文件来分析和解释结果。自动化程序使数据分析变得更加容易。首先，将苍蝇装入 DAM2 监测管中，并用棉花盖住管的两端。

将单只果蝇从保存瓶中吸出到监测管中。将检测管插入活动监测器中，并仔细记录与每组对应的槽号。将监测仪加载到检测培养箱中。

启动采集软件并确保在开始实验数据采集之前设置首选项。通过 DAMSystem 界面实时查看监控数据和索引号。在定义数量的指数通过后，在培养箱上设置有害温度，标志着适应期的结束。

使用采集软件中的 DAMSystem 显示屏实时监控活动计数。或者，直接在 DAMSystem 文件中监控活动数据可能更容易。复制文本文件并打开副本而不是原始文件，以防止干扰实时数据录制。

在观察到任何果蝇在几分钟内没有移动后，停止采集软件。采集数据后，使用引用的软件扫描文本文件以查找错误。根据在诱导有害温度之前实施的驯化间隔，在保存扫描文件之前选择特定的开始和停止点来对活动数据进行分箱。

现在，打开 HoTDAM！分析软件，然后单击 File and load monitor data 以导入扫描的监控数据文件。添加组名称以指示与 DAM2 监视器中每个单元格对应的处理组。

单击 Start Multi-Group Definition 以打开用于添加组名称的对话框。然后，单击相应的单元格以应用组名称，然后单击 Stop Multi-Group Designation。要将每只蝇的 TKD 导出为 CSV 文件，请单击 File（文件）、Export Knockdown Data（导出 Knockdown Data）和 Export All Monitors（导出所有监视器）或 Export Selected Monitors（导出所选监视器）。

输出将按组名称组织每个苍蝇的 TKD。现在单击 File（文件）、Export Activity Data（导出活动数据）和 Export All Monitors（导出所有监视器）或 Export Selected Monitors（导出所选监视器），将每个苍蝇的活动数据导出为 CSV 文件，仅保留时间戳和计数数据以简化数据文件，并为每个苍蝇分配指定的组标签。与对照雌性相比，硬化的 W1118 雌性在热应激期间表现出显着降低的敲低概率。

虽然在雄性中未观察到显著差异，但在热应激期间，与对照雄性相比，硬化的 TRPA1 雄性表现出显著更高的敲低概率，而硬化和对照雌性之间没有发现显著差异。对于 W1118 原液，硬化组和对照组之间耐热期间的平均活性差异明显，雄性和雌性活性计数在 30 分钟左右达到峰值。TRPA1 股票的活动显示初始活动急剧上升，随后所有组别的活动迅速下降。