Method Article
Wir beschreiben ein Flippase-induzierte intersectional Gal80/Gal4 Repression (FINGR)-Methode, so dass Gewebe-spezifische FLP zu GAL80 Expressionsmuster zu bestimmen. Überall dort, wo Gal4 und FLP überlappen, wird Gal4 Ausdruck eingeschaltet (GAL80 ausgeflippt) oder aus (GAL80 gespiegelt in). Die FINGR Methode ist vielseitig für klonale Analyse und neuronalen Schaltkreis-Mapping.
Die Gal4 / UAS binären Methode ist mächtig für die Gen-und neuronalen Schaltkreisen Manipulation in Drosophila. Für die meisten neurobiologischen Studien ist jedoch Gal4 Ausdruck selten Gewebe-spezifisch genug, um für eine präzise Korrelation der Schaltung mit Verhaltensproblemen Auslesen zu ermöglichen. Zur Überwindung dieser großen Hürde haben wir vor kurzem entwickelte die FINGR Methode zu einer restriktiveren Gal4 Ausdruck in das Gewebe von Interesse zu erreichen. Die FINGR Methode besteht aus drei Komponenten: 1) die traditionelle Gal4/UAS System, 2) eine Reihe von FLP / FRT-vermittelte GAL80 Konvertierungstools, und 3) Enhancer-trap FLP (ET-FLP). Gal4 wird verwendet, um die primären neuronalen Schaltkreise von Interesse zu definieren. Vergleich der Gal4 mit einem UAS-Effektorzellen, wie UAS-MJD78Q oder UAS-Shi ts, regelt die neuronale Aktivität, die wiederum durch Veränderungen in-the-fly Verhalten manifestiert. Mit einem zusätzlichen UAS-Reporter wie UAS-GFP, die neuronalen Schaltkreis in das spezifische Verhalten Beteiligten können gleichzeitig für die morphologische Analyse zugeordnet werden. Wanne P> GAL80> ("flip out") und Wanne P> stop> GAL80 ("Flip-in '):. Für Gal4 Linien mit breiten Ausdruck kann Gal4 Ausdruck mithilfe zweier komplementärer GAL80-converting-Tools beschränkt werden Schließlich können die Ermittler wiederum GAL80-oder ausschalten, bzw. mit Hilfe von Gewebe-spezifischen ET-FLP. In den Flip-in-Modus, GAL80 wird Gal4 Ausdruck, wo Gal4 und ET-FLP schneiden zu unterdrücken. In den Flip-out-Modus, wird GAL80 entlasten Gal4 Repression in Zellen, in denen Gal4 und FLP überlappen. Beide Ansätze ermöglichen die Beschränkung der Anzahl der Zellen in der Gal4-Schaltung definiert, sondern in einer inversen Muster. Die FINGR Methode ist kompatibel mit dem riesigen Sammlung von Gal4-Linien in-the-fly-Community und vielseitig einsetzbar für traditionelle klonale Analyse und neuronalen Schaltkreis-Mapping. In diesem Protokoll, zeigen wir die Zuordnung von FLP Expressionsmuster in ausgewählten ET-FLPx2 Linien und die Wirksamkeit der Methode FINGR in Sehzellen. Das Prinzip der FINGR Methode sollte auch auf andere genetische Modellorganismen in der Gal4/UAS, GAL80 und FLP / FRT verwendet werden.
1. Drosophila-Stämmen
2. Reagenzien
Phosphat-gepufferte Salzlösung (PBS, 1X), pH 7,4.
4% Paraformaldehyd (PFA), in PBS von 16% PFA, EM Grad (Kat. Nr. 15710, Electronic Microscopy Sciences, Hatfield, PA) verdünnt
PBT, 1XPBS mit 0,1% Triton-X 100 (Sigma)
Anti-Elav (mAb, 9F8A9; Developmental Studies Hybridoma Bank, University of Iowa), Flecken alle Neuronen in Drosophila.
Anti-Repo (mAb 8D12; Developmental Studies Hybridoma Bank, University of Iowa) Flecken Gliazellen in Drosophila.
Alexa 594 Hühner gegen Maus Sekundär-Antikörper (Invitrogen)
3. Mapping the Expressionsmuster von Enhancer-trap FLPx2 Zeilen (* entscheidende Schritte)
4. Die Anwendung von zwei sich ergänzenden GAL80-Converting-Werkzeuge der Repression Gal4 in Photorezeptoren
Schritte 4.1 und 4.2 kann wiederholt werden, mit ET-FLPx2 Linien sein, dass ausdrückliche FLP in einer Untergruppe von Sehzellen. Alternativ entweder der GMR-Gal4, UAS-polyQ; Wanne P> stop> GAL80 Fliegen oder GMR-Gal4, UAS-polyQ; Wanne P> GAL80> Fliegen können die einzelnen ET-FLPx2 Zeilen-Bildschirm für Linien überschritten, die zum Ausdruck FLP in Sehzellen. Wertvolle ET-FLPx2 Linien sind diejenigen, die nur ausdrücken FLP in einer Untergruppe oder einzelne Sehzellen (Abbildung 6).
5. Repräsentative Ergebnisse
Das Expressionsmuster von einer bestimmten ET-FLPx2 Linie kann leicht überprüft und dokumentiert in der F1-Larven oder erwachsenen Fliegen aus der Kreuzung zwischen yw, Aktin P abgeleitet> CD2> Gal4; UAS-GFP Jungfrauen und ET-FLPx2 Männer (Abbildung 1) . Typischerweise repliziert drei vor fünf der F1-Tiere werden seziert und untersucht, um die Reproduzierbarkeit der FLP Expressionsmuster (Bohm et al., 2010) zu bestimmen. Abbildung 2 zeigt die Expression der FLP in ET-FLPx2 Linie 173A in die Larven und erwachsenen ZNS. Die FLP-Muster kann weiter analysiert werden mit Hilfe eines neuronalen oder glialen Marker (Abb. 3 und 4).
Die Ergebnisse in Abbildung 7 zeigen die Wirksamkeit von GAL80 Flip-in-und Flip-out-Systeme in intersectional Verdrängung der Gal4 folgenden FLP-vermittelte Rekombination. Die Wanne P> stop> GAL80 Konstrukt scheint nicht alle undichten Ausdruck GAL80 (basierend auf den einheitlichen Degeneration und Depigmentierung von Photorezeptoren) haben, und doch ist es 100% effektiv in Spiegeln GAL80 in mit Hilfe von eyFLP zu unterdrücken GMR- Gal4 und zur Wiederherstellung der Blick auf normale Erscheinungen (Abb. 7A). Im Gegenteil, Badewanne P> GAL80> voll unterdrückt GMR-Gal4 vor der Einführung von eyFLP. Nach GAL80 Flip-out,, GMR-Gal4-Laufwerke UAS-polyQ Ausdruck, was zu entarten und depigmented Augen (Abb. 7B). In diesem Beispiel verwendeten wir ein pan-photorecetor FLP zu dem Fotorezeptor "Schaltungen" Karte, aber nicht untersuchen die Auswirkung auf das Verhalten. Mit ähnlichen Ansätzen mit verhaltensrelevanter Gal4 Linien, wir Teil der CCAP-Gal4 Schaltung abgebildet Regulierung Flügel Expansion in erwachsenen Fliegen (Bohm et al., 2010). Wir glauben, dass die FINGR Methode wird bei der Unterstützung von unserem Verständnis der neuronalen Grundlagen von Verhalten wertvoll.
Abbildung 1. . Untersuchung des Expressionsmusters eines ET-FLPx2 line Das FLP Expressionsmuster (blau Ovale) von einem ET-FLPx2 Linie kann durch Überschreiten einer ET-FLPx2 männlichen (oben links) mit einem Aktin-P> CD2> Gal4 bestimmt werden; UAS- GFP Jungfrau (oben rechts). Ubiquitous Aktin P> Gal4 Ausdruck in der elterlichen Weibchen ist durch die Einfügung der FRT (graue Dreiecke) flankiert CD2 Folge behindert. In der F1-Nachkommen, wird FLP Verbrauchsteuern die CD2-Sequenz erlaubt Aktin P> Gal4 zu UAS-GFP-Expression zu fahren.
Abbildung 2. Expression Muster einer ET-FLPx2 Linie in der larvalen und adulten Zentralnervensystems. Diese Bilder zeigen das ZNS (Gehirn und Bauchmark, VNC) aus dem Nachwuchs von der Paarung yw, Aktin P produziert seziert> CD2> Gal4; UAS-GFP Eltern auf die ET-FLPx2 173A Linie. Durch Rekombination aus dem> CD2> Kassette, aktiviert FLP Aktin P> GAL4 Ausdruck (die konsequente Ausdruck der UAS-GFP). Daher meldet der GFP-Muster FLP-exprimierenden Zellen. Panel A zeigt die Larven FLP Expressionsmuster während Panel B zeigt die Erwachsenen Expressionsmuster in line 173A.
Abbildung 3. Charakterisierung von Zelltypen, die Flippase Ausdruck in ET-FLPx2 Line # 688A. A, A Composite-Bild von einem festen F1 3 rd instar Larve mit anti-REPO aus einer Kreuzung zwischen ET-FLPx2 Zeile # 688A und ein GFP Flippase Berichtslinie gefärbt. BD, A hoher Vergrößerung (Zeiss Plan-Apochromat 63x Öl) Blick aus dem hinteren Ende eines VNC von einem 3 rd Larvenstadium übernommen.
Abbildung 4. Charakterisierung von Zelltypen innerhalb der Pilzkörper von ET-FLPx2 Line # 150. AC, A hoher Vergrößerung Bild (63x Öl-Immersion) der Pilzkörper von einem festen F1 dritten Larvenstadium Larve mit anti-REPO gefärbt.
Abbildung 5. Illustration von GAL80 Flip-in und Flip-out-Strategien. A. In den Flip-out-Strategie, Tubulin-Promotor angetrieben GAL80 (Tub P> GAL80>) ist konstitutiv aktiv, was die Unterdrückung der GMR-Gal4 und einem Wildtyp-Augen-Phänotyp (rote Augen). Diese Repression ist durch die Einführung von FLP (violett), die GAL80 out (Mitte, rot) Flip und ermöglichen es GMR-Gal4 zu UAS-polyQ Ausdruck Laufwerk entfernt. Dies führt in Photorezeptorzelle Degeneration (dargestellt durch weiße Punkte im Auge). B. In der reziproke Wert der bisherigen Strategie, ist Tubulin-Promotor angetrieben GAL80 Ausdruck von FRT (graues Dreieck) flankiert "Stop"-Codon unterbrochen. In Abwesenheit von GAL80 bindet GMR-Gal4 zu UAS-polyQ verursacht neuronale Degeneration in Photorezeptoren (dargestellt durch weiße Punkte im Auge). Nach der Überquerung der GMR-Gal4, UAS-polyQ; Wanne P> stop> GAL80 Männchen mit jungfräulichen Weibchen, die FLP auszudrücken in der Sehzellen, FLP (violett) wird Rekombination am FRT Websites katalysieren, Ausschneiden der "Stop"-Codon (Mitte, rot), so dass für GAL80 Meinungsäußerung und der GMR-Gal4. Dieser behält die Neurodegeneration in Sehzellen (dargestellt durch den Mangel an white Punkte im Auge).
Abbildung 6. Die Anwendung der Methode in FINGR Spiegeln GAL80 erfolgt mit ET-FLPx2 Line # 688A F1-Nachkommen aus einer Kreuzung zwischen ET-FLPx2 Zeile # 688A Jungfrau GMR-Gal4, UAS-polyQ;. TubP> GAL80 männlich. Das Fehlen von Pigment in der Mitte des Auges Ommatidia stellt FLP Ausdruck in Zeile # 688A. In diesem Bereich GAL80 Unterdrückung von GMR-Gal4 war erleichtert, so dass die Gal4 zu UAS-polyQ fahren.
Abbildung 7. Die Anwendung der Methode in FINGR Spiegeln GAL80 in oder out zu Gal4 in Photorezeptoren schneiden. A. Die Wanne P> stop> GAL80 Flip-in-System beschränkt GAL4 Ausdruck in einer FLP-abhängigen Weise. In GMR-Gal4, UAS-polyQ; Wanne P> stop> GAL80 Fliegen, Sehzellen sind entartet und depigmented (links fliegen). Nach der Einführung der eyFLP ist GAL80 in Photorezeptor-Zellen exprimiert, was zu einem vollen Unterdrückung von GMR-Gal4, die wiederum schaltet den Ausdruck polyQ und produziert Fliegen mit normalen Augen (rechts fliegen). B. Die Wanne P> GAL80> flip -out-System funktioniert in umgekehrter Weise, wie die Wanne P> stop> GAL80 Flip-in-System. Tub P> GAL80> konstitutiv reprimiert GAL4 und unterdrückt die Expression von polyQ (links fliegen, mit normalen Augen). Nach der Einführung der eyFLP ist GAL80 ausgeflippt von Sehzellen, entlastet die Unterdrückung der GMR-Gal4 und Drehen auf die Expression polyQ. Dies führt zu Fliegen mit degenerierten und depigmented Augen (rechts fliegen).
Die Gal4/UAS System wurde vielfach und erfolgreich durch Drosophilists für verschiedene biologische Studien (; Duffy, 2002 Brand & Perrimon, 1993) verwendet. Bis heute hat die Fliege-Community Tausende von Promotor-driven und Enhancer-trap Gal4 Linien erzeugt. Eine wesentliche Stärke des FINGR Methode ist, dass es mit dem Gal4/UAS ist, die es ermöglichen, deutlich erweitern die Macht der Gal4 in Drosophila-Studien.
Eine wichtige Anwendung der FINGR Methode ist die Feinabstimmung neuronalen Schaltkreisen zugrunde liegende Verhalten durch Gal4/Gal80 Kreuzung. Diese Verhaltensweisen können beinhalten, sind aber nicht beschränkt auf, Lernen und Gedächtnis, Balz, Schlaf und zirkadiane Rhythmik beschränkt. Die FINGR Methode kann auch verwendet werden, um die kritische Neuronen, die anfällig für Neurodegeneration bei der Modellierung menschlicher neurodegenerativer Erkrankungen wie Alzheimer, Amyotrophe Lateralsklerose (ALS), und der Parkinson-Erkrankungen sind abzubilden. In ähnlicher Weise könnte Brennpunkte von Neuronen oder neuronalen Schaltkreisen entscheidend für die Vermittlung von Kokain, Alkohol und andere Substanzabhängigkeit abgebildet mit dem FINGR Methode. Anzumerken ist, dass bedingte Gal4s (Osterwalder et al, 2001..; Roman et al, 2001) werden mit dem FINGR Methode könnte benutzt werden, um zeitliche Steuerung der neuralen Schaltkreisen und Verhaltensweisen zu erlangen. Änderung des GAL80-converting-Tools mit einem temperaturempfindlichen GAL80 (GAL80 ts, McGuire et al., 2003) produzieren kann Wanne P> stop> GAL80 ts oder Badewanne P> GAL80 ts>, Hinzufügen weiterer zeitlicher Flexibilität in der Schaltung Manipulation. Jenseits des Nervensystems ist die FINGR Methode gleichermaßen für die Beschränkung Gal4 Ausdruck in Teilmengen von Zellen, ob es die Flügel oder das Bein.
Die ET-FLPx2 Linien eine wertvolle Ressource für alle Drosophila Biologen in FRT / FLP-basierte klonale Analyse (Xu & Rubin, 1993), einschließlich MARCM (Lee & Luo, 1999) interessiert sein. Es wird auch erwartet, dass einige ET-FLPx2 Linien können Hitzeschock-FLP für die Herstellung von reproduzierbaren Klonen und für die wiederholte morphologischen und Verhaltensanalysen zu ersetzen. Wie Enhancer-trap Gal4-Linien sind die meisten ET-FLPx2 Linien unwahrscheinlich, dass speziell in den Zellen ein Interesse ausgedrückt werden. Die meisten Linien werden FLP in die Zellen von Interesse und in anderen Zellen oder Geweben, wie gut ausdrücken. Allerdings wird der Mangel an "Gewebsspezifität 'der beiden Gal4 und ET-FLPx2 nicht ein wichtiges Anliegen für die FINGR Methode, solange ihre überlappenden Bereich wünschenswert für ein bestimmtes Experiment ist. FINGR wurde entwickelt, um zwei "großen" Systemen in einer raffinierten eine Umdrehung.
Die Methoden in diesen Protokollen dargestellt sind eher Standard und sollte reproduzierbar sein. Die wichtigsten Vorsichtsmaßnahmen Schritte, die die Aufmerksamkeit erfordern, sind die Auswahl und Nutzung der Fixateur. Fixative andere als PFA sollte vermieden werden, da sie GFP Signal auslöschen werden. Wir haben auch festgestellt, dass die Dissektion Gericht sollte nicht zur Fixierung mit PFA verwendet werden, um die Möglichkeit, dass FLP Ausdruck nicht zuverlässig von GFP gemeldet werden vermieden.
Wir bedanken uns bei einem internen Fonds von der University of Oklahoma (bis BZ) und einen Zuschuss von NSF (IOS-1025556, zur BZ und RAB) für die Unterstützung TRF, RAB, XP, AAO, MLW, CAS, und diese Forschung. Eine NIH (RO1 NS060878, um BZ) teilweise RAB unterstützt. RAB erkennt ein NIH NRSA (T32 NS07292) Ausbildung Zuschuss für Brandeis University und einen NIH (RO1 GM21473) bewilligt, um Jeffrey Hall an der Brandeis, für die Unterstützung der frühen Phasen der Studie. Wir danken Jeffrey Hall für seine kontinuierliche Ermutigungen für dieses Projekt. Wir danken Dr. Kristin Scott für die Bereitstellung der Wanne P> GAL80> Stamm.
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