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Dieses Protokoll führt Franck-Condon Lineshape Analyses (FCLSA) von Emissionsspektren ein und dient als Tutorial für die Verwendung der ARL Spectral Fitting Software. Die Open-Source-Software bietet eine einfache und intuitive Möglichkeit, erweiterte Analysen von Emissionsspektren durchzuführen, einschließlich Energieberechnungen im angeregten Zustand, CIE-Farbkoordinatenbestimmung und FCLSA.
Die Anwendung ARL Spectral Fitting bietet eine kostenlose, öffentlich zugängliche und vollständig transparente Methode zur Durchführung der Franck-Condon-Linienformanalyse (FCLSA) für Spektraldaten, zusätzlich zur CIE-Farbkoordinatenbestimmung und grundlegenden spektralen Verarbeitung. Während einige der Funktionen in kommerzieller Software oder in Programmen akademischer Forschungsgruppen zu finden sind, glauben wir, dass ARL Spectral Fitting die einzige Anwendung ist, die alle drei oben genannten Attribute besitzt.
Dieses Programm ist als eigenständige, GUI-basierte Anwendung für einen durchschnittlichen Laborforscher gedacht, ohne dass Programmierkenntnisse oder proprietäre Software erforderlich sind. Zusätzlich zu der eigenständigen ausführbaren Datei, die auf ARL GitHub gehostet wird, stehen die zugehörigen MATLAB-Dateien zur Verwendung und Weiterentwicklung zur Verfügung.
FCLSA erweitert die in Lumineszenzspektren gefundenen Informationen und liefert aussagekräftige Einblicke in die Beziehung zwischen dem Boden und angeregten Zuständen einer photolumineszierenden Spezies. Diese Erkenntnis wird erreicht, indem Spektren mit zwei Versionen (Moden) einer Gleichung modelliert werden, die entweder durch vier oder sechs Parameter gekennzeichnet sind, je nachdem, welcher Modus verwendet wird. Nach der Optimierung kann der Wert jedes dieser Parameter verwendet werden, um Einblicke in das Molekül zu gewinnen und weitere Analysen durchzuführen (z. B. den freien Energiegehalt des Moleküls im angeregten Zustand). Diese Anwendung bietet Werkzeuge für die einfache manuelle Anpassung importierter Daten sowie zwei Methoden zur Optimierung dieser passgenauen Anpassung der kleinsten Quadrate, die auf dem Levenberg-Marquardt-Algorithmus basiert, und die ableitungsfreie Anpassung unter Verwendung des Nelder-Mead-Simplex-Algorithmus. Darüber hinaus können Schätzungen der Probenfarbe durchgeführt und in CIE- und RGB-Koordinaten gemeldet werden.
Photolumineszenzmessungen, die sowohl Fluoreszenz- als auch Phosphoreszenzspektren umfassen, sind in verschiedenen akademischen Bereichen und industriellen Anwendungen weit verbreitet1. Photokatalysatoren werden zunehmend in der organischen Synthese zur Herstellung komplexer und wertvoller Zielmoleküle 2,3,4 eingesetzt. Um die Energetik von Photokatalysatoren zu bestimmen, wird die Energie des angeregten Zustands routinemäßig anhand von Emissionsspektren geschätzt. Die Entwicklung neuartiger Beleuchtungsmaterialien, wie z.B. organische Leuchtdioden (OLED) Luminophore, erfordert, dass die beobachtete Farbausgabe charakterisiert und berichtet wird 5,6. Zu diesem Zweck werden routinemäßig Farbkoordinaten der Commission international de l'éclairage (CIE) verwendet7.
Der Zweck der ARL Spectral Fitting-Anwendung besteht darin, eine schnelle und einfache Methode zur Anreicherung von Spektraldaten durch aussagekräftige Analysen bereitzustellen, die sowohl in Bezug auf Benutzerfreundlichkeit als auch auf Verfügbarkeit (https://github.com/USArmyResearchLab/ARL_Spectral_Fitting) allgemein zugänglich sind. Diese Software führt mehrere routinemäßige spektrale Verarbeitungsfunktionen automatisch für den Benutzer aus, einschließlich Datennormalisierung und -konvertierung zwischen Wellenlänge, λ und Wellenzahl, Einheiten mit entsprechender Intensitätsskalierung, wie in der Gleichung unter1 gezeigt. Die Software ist in der Lage, eine Vielzahl von Eingabe- und Ausgabedateiformaten zu verarbeiten. Mehrere erweiterte Analysen werden einfach mit der Software durchgeführt, wie die Berechnung von CIE- und Chromatizitätskoordinaten, Farbvorhersage, Bestimmung der angeregten freien Energie (ΔGES) in verschiedenen Einheiten und FCLSA zur Bestimmung der FCLSA-Parameter8.
Eine auf grafischer Benutzeroberfläche (GUI) basierende Anwendung wurde verfolgt, da sie es jedem Forscher ermöglicht, diese Analyse durchzuführen und keine Hintergrundkenntnisse der Informatik erfordert. Diese Anwendung wurde in MATLAB mit dem App Designer-Tool geschrieben. Außerhalb von ARL Spectral Fitting ist es praktisch unmöglich, eine öffentlich zugängliche Implementierung einer Anwendung zur Durchführung der Franck-Condon-Linienformanalyse zu finden. Dies liegt daran, dass Forschungsgruppen ihre Implementierungen nicht öffentlich veröffentlichen, sondern es vorziehen, sie proprietär zu halten.
Die Franck-Condon-Linienformanalyse (FCLSA) wird häufig bei der photophysikalischen Charakterisierung neuartiger Verbindungen verwendet, da sie reichhaltige Informationen über das Molekül 9,10,11,12,13,14 vermittelt. Jeder der vier Parameter (sechs im Doppelmodus) gibt Auskunft über den angeregten Zustand des Moleküls. Die Energiegröße oder 0-0 Energielücke (E0) ist die Differenz zwischen nullten Energieniveaus des Bodens und angeregten Zuständen des Moleküls. Die volle Breite bei halbem Maximum (Δv1/2) informiert über die Breiten einzelner vibronischer Linien. Die Elektron-Schwingungs-Kopplungskonstante oder Huang-Rhys-Faktor (S) ist eine dimensionslose Berechnung, die auf der Gleichgewichtsverschiebung zwischen Grund- und angeregten Zuständen des Moleküls15 basiert. Schließlich ist der Quantenabstandsparameter (ħω) der Abstand zwischen Schwingungsmoden, die den nichtstrahlenden Zerfall eines Moleküls steuern.
Die Gleichungen für Single- und Doublemode-FCLSA lauten wie folgt:
wobei die Parameter wie zuvor definiert sind. In der Doppelmodusgleichung werden S und ħω in mittlere (M) und niedrige (L) Energieterme getrennt. ist die Intensität bei der Wellenzahl v10,16,17,18. In beiden Gleichungen wird die Summierung über N Quantenebenen mit einem Standardwert von N = 5 durchgeführt, wie es in der Literatur11 üblich ist, aber jede ganze Zahl kann in der ARL Spectral Fitting Software unter Settings | Passend.
1. Datenimport
2. Datenverarbeitung
HINWEIS: Der Benutzer möchte möglicherweise die Datenverarbeitung vor dem Anpassungsprozess durchführen. Zu den verfügbaren Prozessen gehören:
3. Manuelle Montage
HINWEIS: Basierend auf der Menge der im Spektrum sichtbaren Struktur kann es sehr vorteilhaft sein, die Anpassungsparameter vor der Optimierung mit geeigneten Schätzungen zu initialisieren. Diese Initialisierung kann die für die Optimierung erforderliche Zeit verringern und dazu beitragen, dass die von der Optimierung zurückgegebenen Werte für das Spektrum realistisch sind.
4. Optimierung
5. Chromatizitäts- und Freie-Energie-Berechnungen
6. Datenexport
Unter Verwendung der oben beschriebenen Anpassungsroutine wurde die Franck-Condon-Linienformanalyse an zwei Spektren durchgeführt, die mit der Anwendung vorverpackt sind: die Emissionsspektren Raumtemperatur (292 K) und niedrige Temperatur (77 K) für 9,10-Diphenylanthracen, gelöst in Toluol. Die Messungen wurden mit einem Spektrofluorometer mit flüssigen Lösungen in 1 cm Küvetten und einem Standard-Küvettenhalter für Raumtemperaturmessungen durchgeführt. Die Tieftemperaturmessungen wurden durch Eintauchen von NMR-Röhrchen in flüssigen Stickstoff in einem Dewar erhalten, um gefrorene Glasproben zu erzeugen. Alle Spektren wurden für die Detektorantwort korrigiert. Eine Singlemode-Anpassung war für das Raumtemperaturspektrum ausreichend, während der Doppelmodus zur Modellierung des Niedertemperaturspektrums verwendet wurde. Die Farbanalyse wurde für beide Spektren durchgeführt und ergab ähnliche Schätzungen.
Um dem Raumtemperaturspektrum gerecht zu werden, wurde die manuelle Anpassung nach der Optimierung der kleinsten Quadrate mit Standardanpassungen verwendet. Die endgültigen Parameterwerte waren wie folgt: E0 = 24380 cm-1, Δv 1/2 = 1200 cm-1, S = 1,25, ħω = 1280 cm-1. Der errechnete Bestimmtheitskoeffizient betrug 0,99947, wie in Abbildung 1 dargestellt. Die Berechnung der freien Energie des angeregten Zustands mit diesen Parameterwerten ergab einen Wert von 25.000 cm-1.
Simplex-Optimierung wurde verwendet, um das niedrige Temperaturspektrum anzupassen. Eine manuelle Anpassung war nach der Optimierung nicht notwendig. Die endgültigen Parameterwerte waren wie folgt: E 0 = 24764 cm-1, Δv 1/2 = 746 cm-1, S 1= 1,13, ħω 1 = 1382 cm-1, S2 = 0,31, ħω2= 651 cm-1. Der errechnete Bestimmtheitskoeffizient betrug 0,9991, wie in Abbildung 2 dargestellt. Die Berechnung der freien Energie des angeregten Zustands mit diesen Parameterwerten ergab einen Wert von 25.700 cm-1.
Die Farbanalyse des Tieftemperaturspektrums ergab folgende Ergebnisse: Farbortkoordinate = [0,15819, 0,03349], CIE-Koordinate = [0,19571, 0,041432, 1] und vorhergesagter RGB-Wert = [67, 0, 233]. Die für das Raumtemperaturspektrum erhaltenen Werte waren denen des Tieftemperaturspektrums mit nicht wahrnehmbaren Farbunterschieden sehr ähnlich.
Abbildung 1: Singlemode-Fit von 9,10-Diphenylanthracen (292 K): Diese Abbildung zeigt das Raumtemperatur-Emissionsspektrum von 9,10-Diphenylanthracen und seine FCLSA-Fit-Funktion, erreicht durch Least-Squares-Optimierung gefolgt von Handeinstellung der Parameterwerte. Dies ist ein Beispiel für ein lose strukturiertes Spektrum. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.
Abbildung 2: Doppelmodenanpassung von 9,10-Diphenylanthracen (77 K): Diese Abbildung zeigt das Niedertemperatur-Emissionsspektrum von 9,10-Diphenylanthracen und seine FCLSA-Fit-Funktion, die durch eine Simplex-Optimierung erreicht wird. Dies ist ein Beispiel für ein stark strukturiertes Spektrum. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.
Diese Anwendung bietet eine einfache und schnelle Analyse von Emissionsspektren durch zwei Hauptmethoden, die üblicherweise in der photophysikalischen Gemeinschaft verwendet werden. Die erste ist die Franck-Condon-Linienformanalyse (FCLSA), die einen Einblick in die Energetik und vibronische Kopplung gibt, die mit dem Zerfall angeregter Zustandsmoleküle in ihren Grundzustand verbunden sind. Dies wird durch die Optimierung von Parameterwerten erreicht, um die Anpassungsgüte eines Spektrums unter Verwendung einer von zwei möglichen FCLSA-Modellierungsgleichungen zu maximieren. Die zweite Analysemethode gibt Aufschluss über die beobachtete Farbe des vom Molekül emittierten Lichts. Durch die Kombination von Tristimulus-Farbkurven mit bereitgestellten Intensitätsdaten kann die CIE-Koordinate berechnet werden. Diese Bestimmung ermöglicht die hochgenaue Farbvorhersage von Absorptions- und Emissionsspektren.
Experimentelle Photolumineszenzspektren werden üblicherweise mit einer Photomultiplierröhre (PMT) oder einem ladungsgekoppelten Gerät (CCD) als Detektor gemessen und als Emissionsintensität versus Wellenlänge (nm) dargestellt. Viele photophysikalische Charakterisierungen, einschließlich FCLSA und Berechnung der freien Energie des angeregten Zustands, werden im Wellenzahlraum durchgeführt, wie die Verwendung von (cm-1) in den entsprechenden Gleichungen oben zeigt. Zusätzlich zur Umrechnung der x-Achse muss die als I(λ) bezeichnete Emissionsintensität gegenüber der Wellenlänge in
umgerechnet werden. Diese Anwendung identifiziert automatisch die ursprünglichen x-Achsen-Einheiten importierter Spektraldaten als Wellenlänge (nm) oder Wellenzahl (cm-1). Standardmäßig konvertiert die Anwendung dann die Spektraldaten, normalisiert das Spektrum bei maximaler Intensitätsspitze in Einheit und stellt das Spektrum als "Normalisierte
vs. Wellenzahl (cm-1)" dar, um anzuzeigen, dass die korrekte Intensitätskonvertierung angewendet wurde. Obwohl empfohlen wird, alle Anpassungen mit Wellenzahleinheiten durchzuführen, kann die Anwendung das Spektrum auch als "Normalized I(λ) vs. wavelength (nm)" darstellen, indem sie die Anweisungen in Abschnitt 2 oben befolgt.
Für die Verwendung in der Anwendung stehen zwei Optimierungsalgorithmen zur Verfügung. Die Standardoption ist gedämpfte kleinste Quadrate, die den Levenberg-Marquardt-Algorithmus21 verwendet. Durch die Kombination einer Version des Gradientenabstiegs und des Gauß-Newton-Algorithmus findet dieser Algorithmus lokale, nicht unbedingt globale Minima. Obwohl dies eine erhebliche Einschränkung ist, bietet der Algorithmus Vorteile in seiner Anpassbarkeit - diese Methode kann die bevorzugte Gewichtung von Datenpunkten berücksichtigen, eine robuste Anpassung durchführen und erweiterte Statistiken zur Güte der Anpassung anzeigen22. Die alternative Optimierungsmethode ist derivativfrei und basiert auf dem Nelder-Mead-Simplex-Algorithmus23. Dieser Algorithmus verwendet eine heuristische Methode, um ein globales Minimum der angegebenen Kostenfunktion zurückzugeben (in diesem Fall eine Summe der quadrierten Differenzen zwischen vorhergesagten und beobachteten Intensitäten). Die Simplex-Methode wurde bereits für FCLSA verwendet, obwohl der Code, der sie implementiert, nie veröffentlicht wurde24.
Sowohl die Least-Squares- als auch die Simplex-Optimierungsmethoden eignen sich am besten für strukturierte Spektren, die schmale, gut definierte und symmetrische Peaks aufweisen. Da Spektren weniger strukturiert werden, was bedeutet, dass sie an Symmetrie verlieren und sich die Peaks erweitern, führen diese Methoden zu weniger robusten Anpassungen, bei denen die Parameter stark korreliert werden können. Typischerweise sind Spektren, die bei niedrigen Temperaturen oder in starren Medien aufgezeichnet wurden, strukturierter als diejenigen, die bei Raumtemperatur oder in flüssiger Lösung 12,25,26 erhalten wurden. Die robusten Passformoptionen, die in der Methode der kleinsten Quadrate enthalten sind, können dazu beitragen, dieses Problem zu lindern. Dieses Problem kann erheblich verringert werden, wenn einer oder mehrere der Parameter während der Optimierung auf einen konstanten Wert festgelegt werden. Zum Beispiel können IR-Spektroskopie-Experimente verwendet werden, um relevante Quantenabstandswerte (ħω) zu bestimmen. Alternativ können relevante Literaturwerte verwendet werden, um benutzerdefinierte Grenzen für die Parameter festzulegen.
In einigen Fällen stellen die FCLSA-Anpassung und die aus den Optimierungsroutinen erhaltenen Parameter die Daten nicht angemessen dar, selbst wenn robuste Anpassungsoptionen oder feste Parameter verwendet werden. Dies ist ein Fehler der Anpassungsalgorithmen und kann mit den mehreren FCLSA-Anpassungsparametern (potenzielle Überparametrierung) oder der spektralen Form der Daten (merkmallose Spektren) zusammenhängen. In diesen Fällen kann eine weitere Verbesserung der Passungen durch eine "manuelle Anpassung" der Daten unter Manipulation der FCLSA-Parameter erreicht werden. Die Angemessenheit solcher Anpassungen kann visuell beurteilt und quantifiziert werden, indem Statistiken zur Güte der Anpassung verglichen werden, die automatisch in das Diagramm aufgenommen werden.
Eine allgemeine Routine für eine genaue Anpassung von Hand besteht aus den folgenden fünf Schritten: Ermitteln Sie zunächst manuell oder automatisch eine erste Schätzung für E0 mit einer der drei bereitgestellten Methoden. Standardmäßig wird der Wert des Parameters der Wellenzahl zugewiesen, die der höchsten beim Datenimport erkannten Intensitätsspitze zugeordnet ist. Alternativ kann der Benutzer E0 als die Wellenzahl definieren, bei der das Emissionsspektrum sein entsprechendes Anregungsspektrum schneidet. Die letzte Methode zur Bestimmung von E0 verwendet die sogenannte X%-Regel, wobei X = 1 oder 10 ist. Bei dieser Methode wird E0 einer Wellenzahl X% der vollen Breite bei halbmaximaler (FWHM) Intensität des prominentesten Datenpeaks unter Annahme einer Gaußschen Bandform zugewiesen. Der zweite Schritt im manuellen Anpassungsprotokoll besteht darin, ħω basierend auf Quantenabständen zu berechnen, die in der Struktur des Emissionsspektrums beobachtet wurden. Wenn möglich, beziehen Sie sich auf das IR-Spektrum des Moleküls und versuchen Sie, den Photolumineszenz-basierten Wert mit einer starken Bande im IR-Spektrum zu korrelieren. Drittens bestimmen Sie S basierend auf den relativen Intensitäten der spektralen Peaks. Viertens, bestimmen Sie ein grobes Δv1/2 basierend auf der Bandbreite. Fünftens: S und Δv1/2 bei Bedarf iterativ nachjustieren.
Die Schwierigkeit, FCLSA mit breiten, relativ merkmallosen Spektren durchzuführen, wurde durch das Anpassungsverfahren für 9,10-Diphenylanthracen in flüssiger Lösung bei 292 K im Vergleich zu dem Verfahren für das strukturiertere Spektrum in gefrorenem Glas bei 77 K demonstriert. Bei der Anpassung des Raumtemperaturspektrums ergab die Optimierung einen anfänglichen Bestimmtheitskoeffizienten von 0,9971, der durch manuelle Abstimmung der Parameter und visuelle Inspektion der Ergebnisse auf 0,9994 verbessert wurde. Im Gegensatz dazu war eine manuelle Anpassung der Niedertemperaturvariante aufgrund der Feinstruktur des Spektrums nicht erforderlich, was nach der Simplexoptimierung zu einem Bestimmtheitskoeffizienten von 0,9991 führte.
In vielen Fällen liefern beide Optimierungsroutinen (kleinste Quadrate und Simplex) sehr ähnliche Ergebnisse. Dies deutet darauf hin, dass sie ein globales Minimum für die FCLSA-Parameter gefunden haben. Im Allgemeinen ist die Methode der kleinsten Quadrate tendenziell besser für Daten geeignet, die verrauscht sind, nicht gut strukturiert sind oder viele Datenpunkte nahe Null am Ende des Spektrums enthalten. Umgekehrt gibt die Simplex-Methode tendenziell bessere Anpassungen zurück als die Methode der kleinsten Quadrate für Daten, die gut strukturiert sind und nur wenige Ausreißerpunkte aufweisen. In diesen Fällen erfordert die Simplex-Methode typischerweise wenig manuelle Voroptimierung der Parameterwerte und keine Anpassung nach der Optimierung. Für die Fälle, in denen das Rauschen der Daten oder der allgemeine Mangel an Struktur eine qualitativ hochwertige Anpassung mit einer der bereitgestellten Optimierungsmethoden verhindert, wird empfohlen, die manuelle Anpassungsmethode (siehe oben) ohne nachträgliche Optimierung anzuwenden.
Diese Anwendung bietet mehrere Vorteile gegenüber früheren Implementierungen der Franck-Condon-Linienformanalyse. Der erste und wichtigste Vorteil ist, dass es kostenlos, öffentlich zugänglich und vollständig transparent ist. Dies wird erreicht, indem der Code auf GitHub veröffentlicht wird, wodurch jeder mit einem Computer und einer Internetverbindung (https://github.com/USArmyResearchLab/ARL_Spectral_Fitting) Zugriff erhält. Jeder kann nicht nur auf diese Anwendung zugreifen, sondern auch den zugrunde liegenden Code anzeigen. Dies bietet die Möglichkeit für Feedback und Entwicklung aus der Community. Ein weiterer Vorteil liegt in der Benutzerfreundlichkeit dieser Anwendung. Es sind keine Hintergrundkenntnisse in Informatik oder Befehlszeileninteraktion erforderlich. Vielmehr verwendet diese Software eine einfache grafische Benutzeroberfläche (GUI), die es Forschern aller Hintergründe ermöglicht, die oben beschriebenen Spektralanalysen durchzuführen. Darüber hinaus bietet diese Anwendung dem Benutzer mehrere Möglichkeiten zur Steuerung der Optimierungsmethoden und kann verwendet werden, um die freie Energie des angeregten Zustands zu bestimmen. Schließlich berechnet und meldet die Software mehrere nützliche Farbwerte, darunter Farbortkoordinaten, CIE-Koordinaten, RGB und hexadezimale Farbcodes. Alle diese Analysen können in Sekunden durchgeführt werden, wobei der Benutzer nur einen Knopfdruck erfordert.
Die Autoren haben nichts offenzulegen.
Die Forschung wurde vom Army Research Laboratory gesponsert und unter der Kooperationsvertragsnummer W911NF-20-2-0154 durchgeführt. Die in diesem Dokument enthaltenen Ansichten und Schlussfolgerungen sind die der Autoren und sollten nicht so interpretiert werden, dass sie die offizielle Politik des Army Research Laboratory oder der US-Regierung darstellen, weder ausdrücklich noch implizit. Die US-Regierung ist berechtigt, Nachdrucke für Regierungszwecke zu reproduzieren und zu verteilen, ungeachtet der hierin enthaltenen Urheberrechtsvermerke.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
ARL Spectral Fitting | Army Research Laboratory | v1.0 | https://github.com/USArmyResearchLab/ARL_Spectral_Fitting/releases/tag/v1.0 |
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