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Method Article
* Diese Autoren haben gleichermaßen beigetragen
Hier stellen wir zwei Protokolle für die Aufzeichnung von Mikro-Elektrokortikographie (μEcoG) mit hoher Dichte bei Ratten und Mäusen vor, einschließlich chirurgischer, Implantations- und Aufzeichnungsmethoden. μECoG-Aufzeichnungen werden entweder in Kombination mit laminarer Polytrodenaufzeichnung im auditorischen Kortex der Ratte oder mit optogenetischer Manipulation der neuronalen Aktivität im somatosensorischen Kortex der Maus durchgeführt.
Die Elektrokortikographie (ECoG) ist eine methodische Brücke zwischen den grundlegenden Neurowissenschaften und dem Verständnis der menschlichen Gehirnfunktion bei Gesundheit und Krankheit. ECoG zeichnet neurophysiologische Signale direkt von der kortikalen Oberfläche mit zeitlicher Auflösung im Millisekundenbereich und spaltenförmiger räumlicher Auflösung über große Regionen des kortikalen Gewebes gleichzeitig auf, wodurch es einzigartig positioniert ist, um sowohl lokale als auch verteilte kortikale Berechnungen zu untersuchen. Hier beschreiben wir das Design von kundenspezifischen High-Density-Micro-ECoG-Bauelementen (μECoG) und deren Einsatz in zwei Verfahren. Diese Gitter weisen 128 niederohmige Elektroden mit einem Abstand von 200 μm auf, die auf einem durchsichtigen Polymersubstrat mit Perforationen zwischen den Elektroden hergestellt sind; Diese Eigenschaften ermöglichen die gleichzeitige μECoG-Aufzeichnung mit laminaren Polytroden-Aufzeichnungen und optogenetischen Manipulationen. Zunächst stellen wir ein Protokoll für die kombinierte epidurale μECoG-Aufzeichnung über den somatosensorischen Kortex von Mäusen mit optogenetischer Manipulation spezifischer genetisch definierter kortikaler Zelltypen vor. Dies ermöglicht eine kausale Aufschlüsselung der unterschiedlichen Beiträge verschiedener neuronaler Populationen zur sensorischen Verarbeitung und gleichzeitig die Überwachung ihrer spezifischen Signaturen in μECoG-Signalen. Zweitens stellen wir ein Protokoll für akute Experimente vor, um die neuronale Aktivität des auditorischen Kortex von Ratten mit μECoG-Gittern und laminaren Polytroden aufzuzeichnen. Dies ermöglicht eine detaillierte topographische Kartierung von sensorisch evozierten neuronalen Reaktionen über die kortikale Oberfläche gleichzeitig, mit Aufzeichnungen von mehreren neuronalen Einheiten, die über die kortikale Tiefe verteilt sind. Diese Protokolle ermöglichen Experimente, die verteilte kortikale Aktivität charakterisieren und können zum Verständnis und eventuellen Interventionen bei verschiedenen neurologischen Erkrankungen beitragen.
Die Gehirnfunktionen, die der Empfindung, der Kognition und der Handlung zugrunde liegen, sind organisiert und über weite räumliche und zeitliche Skalen verteilt, die von den Spitzen einzelner Neuronen über die elektrischen Felder reichen, die von Populationen von Neuronen in einer kortikalen Säule erzeugt werden, bis hin zur topographischen Organisation von Säulen in Gehirnbereichen (z. B. Somatotopie im somatosensorischen Kortex, Tonotopie im primären auditorischen Kortex). Um die Gehirnfunktion zu verstehen, müssen elektrische Signale über diese räumlichen Skalen hinweg wahrgenommenwerden 1. Die Neurowissenschaften verfügen derzeit über viele weit verbreitete Methoden, um die Aktivität des Gehirns zu überwachen. Elektrophysiologisch ermöglichen laminare Polytroden (wie Neuropixel) die Überwachung einer bescheidenen Anzahl (~300) einzelner Neuronen, typischerweise innerhalb einer Handvoll weit voneinander entfernter Spalten, mit hoher zeitlicher Auflösung (≥1 kHz). Die Ca2+ -Bildgebung ermöglicht die Überwachung einer geringen bis großen Anzahl genetisch und anatomisch identifizierter einzelner Neuronen innerhalb von ~1-2 mm räumlicher Ausdehnung bei einer niedrigeren (~10 Hz) zeitlichen Auflösung2. Die fMRT ermöglicht die Überwachung des Stoffwechselzustands einer großen Anzahl von Neuronen (~1 Mio. Neuronen in einem Volumen von 36 mm3 ) über das gesamte Gehirn bei sehr geringer zeitlicher Auflösung (~0,2 Hz). EEG/MEG ermöglicht die Überwachung der elektrischen Aktivität der gesamten kortikalen Oberfläche/des Gehirns bei bescheidener zeitlicher Auflösung (<100 Hz) und sehr geringer räumlicher Auflösung (Zentimeter)3. Während jede dieser Methoden grundlegende, synergistische Einblicke in die Gehirnfunktion geliefert hat, sind Methoden, die die direkte Erfassung elektrophysiologischer Signale mit hoher zeitlicher Auflösung von präzisen anatomischen Orten über weite räumliche Regionen des Kortex ermöglichen, im Entstehen. Die Notwendigkeit einer breiten räumlichen Abdeckung wird durch die Tatsache unterstrichen, dass sich die neuronale Funktion im Gehirn auf der Oberfläche im Vergleich zur Tiefe viel dramatischer ändert4.
Die Elektrokortikographie (ECoG) ist eine Methode, bei der Gitter aus niederohmigen Elektroden auf die Oberfläche des Gehirns implantiert werden und die Aufzeichnung oder Stimulation des Kortexermöglichen 1,5. ECoG wird typischerweise in der Neurochirurgie des Menschen als Teil der klinischen Aufarbeitung zur Behandlung pharmakologisch hartnäckiger Epilepsie eingesetzt. Es bietet jedoch auch einzigartige Einblicke in die verteilte kortikale Verarbeitung beim Menschen, wie z.B. sprachliche und sensorische topographische Kartierung 6,7. Diese Fähigkeiten haben zu seiner Verwendung in Tiermodellen motiviert, darunter Affen, Ratten und Mäuse 5,8,9,10,11. Bei Nagetieren konnte kürzlich gezeigt werden, dass micro-ECoG (μECoG) eine hohe zeitliche Auflösung (~100 Hz) direkte elektrische Überwachung von neuronalen Populationen mit säulenbezogener räumlicher Auflösung (~200 μm) und breiter räumlicher Abdeckung (viele Millimeter) ermöglicht. μECoG ermöglicht es Forschern, verteilte neuronale Dynamiken zu untersuchen, die mit komplexer sensorischer Verarbeitung, kognitiven Funktionen und motorischem Verhalten in Tiermodellen verbunden sind12,13. Jüngste Fortschritte haben μECoG mit Optogenetik und laminaren Polytrodenaufzeichnungen integriert 14,15,16,17,18,19,20, was multiskalige Untersuchungen kortikaler Netzwerke ermöglicht und die Lücke zwischen mikroskaliger neuronaler Aktivität und makroskaliger kortikaler Dynamik schließt 21,22. Entscheidend ist, dass die Verwendung von μECoG die Translation von Ergebnissen und Erkenntnissen aus Tiermodellen auf den Menschen viel direkter macht, da das μECoG-Signal in menschlichen und nicht-menschlichen Tiermodellen sehr ähnlich ist23. Daher sind integrative Ansätze entscheidend für ein besseres Verständnis neuronaler Schaltkreise und vielversprechend für die Entwicklung neuartiger therapeutischer Interventionen für neurologische Erkrankungen 5,24,25.
Folglich besteht ein wachsender Bedarf an Protokollen, die μECoG-Arrays mit hoher Dichte mit laminaren Aufzeichnungen und optogenetischen Werkzeugen integrieren, um umfassende Multiskalenuntersuchungen der kortikalen Prozessierung zu ermöglichen 8,26. Um diese Lücke zu schließen, haben wir kundenspezifische μECoG-Bauelemente mit 128 niederohmigen Elektroden mit 40 μm Elektrodendurchmesser und 20 μm Elektrodenabstand auf einem flexiblen, transparenten Polymersubstrat (Parylen-C und Polyimid) mit Perforationen zwischen den Elektroden entwickelt, die gleichzeitige μECoG- und laminare Polytrodenaufzeichnungen mit optogenetischen Manipulationen ermöglichen13,22. Zu den wichtigsten Aspekten dieses experimentellen Protokolls gehören: (i) säulenförmige räumliche Auflösung und großräumige Abdeckung der kortikalen Aktivität durch μECoG-Arrays mit hoher Dichte; (ii) die Fähigkeit, aus mehreren kortikalen Schichten mit laminaren Polytroden aufzuzeichnen, die durch das μECoG-Gitter eingefügt werden; und (iii) die Einbeziehung optogenetischer Techniken zur selektiven Aktivierung oder Hemmung spezifischer neuronaler Populationen, wodurch eine kausale Dissektion neuronaler Schaltkreise ermöglichtwird 27,28,29. Die Konfiguration mit hoher Dichte ermöglicht Aufzeichnungen mit hoher räumlicher Auflösung und bietet effektiv eine "säulenförmige Ansicht" der kortikalen Aktivität, da frühere Studien gezeigt haben, dass μECoG-Signale die Aktivität auf einer räumlichen Skala auflösen können, die mit dem Durchmesser der kortikalen Säule von Nagetieren (~20 μm) vergleichbar ist11. Diese integrierte Methodik ermöglicht die gleichzeitige Überwachung und Manipulation der neuronalen Aktivität auf mehreren Skalen, was möglicherweise kausale Experimente zur Bestimmung der neuronalen Quellen von μECoG-Signalen sowie zur verteilten kortikalen Verarbeitung ermöglicht. Um diese Ziele zu erreichen, enthält dieses Manuskript detaillierte Protokolle für die Verwendung von μECoG-Arrays mit hoher Dichte in zwei Kombinationen.
Zunächst beschreiben wir μECoG in Kombination mit der Manipulation von Pyramidenzellen der Schicht 5 (L5) im primären somatosensorischen Kortex der Maus (S1). In der Maus wird das μECoG-Array epidural platziert (aufgrund der chirurgischen Hartnäckigkeit der Durotomie bei Mäusen). Eine optische Faser wird über dem Gitter positioniert oder mit einer Linse kombiniert, um das optogenetische Licht auf einen kleinen Zielbereich der kortikalen Oberfläche zu fokussieren. Die optogenetische Strategie wird hier für die Hemmung von erregenden Neuronen der Schicht 5 beschrieben, kann aber ohne weiteres an jede Population von Neuronen angepasst werden, die mit der entsprechenden, populationsspezifischen, Cre-exprimierenden Mauslinie versehen sind. Zweitens beschreiben wir die kombinierte Verwendung von μECoG mit laminaren Siliziumpolytroden zur gleichzeitigen Aufzeichnung von kortikalen Oberflächenpotentialen (CSEPs) und der Spike-Aktivität mehrerer Neuronen über kortikale Schichten aus dem auditorischen Kortex der Ratte (A1). Das Array verfügt über Perforationen zwischen den Elektroden, die das Einführen von laminaren Mehrkanalpolytroden durch das Gitter ermöglichen, um die neuronale Aktivität über verschiedene kortikale Schichten hinweg aufzuzeichnen. Während der Kraniotomie wird das μECoG-Array subdural über der auditorischen Rinde platziert und die laminare Polytrode durch die Perforationen eingeführt. Neuronale Signale von der μECoG- und der laminaren Sonde werden gleichzeitig aufgezeichnet und bei 6 kHz bzw. 24 kHz abgetastet, wobei ein Verstärkersystem verwendet wird, das optisch mit einem digitalen Signalprozessor verbunden ist.
Beide Protokolle folgen den gleichen Schlüsselschritten (Anästhesie, Fixierung, Kraniotomie, μECoG-Aufzeichnung), weisen jedoch bemerkenswerte Unterschiede auf. In der folgenden Beschreibung werden die freigegebenen Schritte zusammengeführt, während die Besonderheiten der einzelnen Protokolle mit Anmerkungen versehen sind. Die folgenden Schritte entsprechen der μECoG-Aufzeichnung mit Optogenetik (Maus) oder der μECoG-Aufzeichnung mit einer laminaren Sonde (Rat). Alle hier beschriebenen Verfahren wurden in Übereinstimmung mit den lokalen Ethik- oder Rechtsbehörden (IACUC oder Ethikkommissionen) durchgeführt. Die verwendeten Medikamente können je nach genehmigtem ethischem Protokoll variieren.
1. Vorbereitung und Protokoll für Verfahren an Mäusen und Ratten
2. Chirurgie
3. Aufnahme
Wir haben die Protokolle zur Aufzeichnung elektrokortikographischer Signale in Kombination mit optogenetischen Methoden und laminaren Aufzeichnungen beschrieben. Hier werden typische Signale vorgestellt, die aus dem somatosensorischen Kortex der Maus (Abbildung 1, Abbildung 2 und Abbildung 3) und innerhalb des auditorischen Kortex von Ratten als Reaktion auf sensorische Stimulation (
Die hier beschriebenen Protokolle ermöglichen die Integration von Mikro-Elektrokortikographie-Arrays (μECoG) mit hoher Dichte mit laminaren Sonden und optogenetischen Techniken. Die einfache Anwendung dieses Protokolls in Nagetiermodellen macht es zu einem leistungsfähigen Werkzeug für die Untersuchung der kortikalen Dynamik, und die Anzahl der Probanden kann leicht erhöht werden. Das μECoG-Gitter mit hoher Dichte ermöglicht eine effiziente, räumlich präzise Kartierung der korti...
Die Autoren erklären, dass keine konkurrierenden finanziellen Interessen bestehen.
Diese Arbeit wurde unterstützt durch das Lawrence Berkeley National Laboratory LDRD für das Neural Systems and Machine Learning Lab (K.E.B.), NINDSR01 NS118648A (K.E.B.& D.E.F.) und NINDS R01 NS092367 (D.E.F.).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1 disposable #11 blade | Swann Morton | 303 | For surgical procedures |
2 disposable #10 blades | Swann Morton | 3901 | For surgical procedures |
30 mm cage bars | Thorlabs | ER | cage components |
30 mm cage plate | Thorlabs | CP33T | holding the lenses |
70% ethanol | Decon Labs | V1016 | Cleaning / Disinfectant (diluted to 70%) |
Amalgambond PLUS Adjustable Precision Applicator Brush Teal 200/Bx | Henry Schein | 1869563 | precision applicator for the cement |
Amalgambond PLUS Catalyst 0.7 mL Syringe Ea | Henry Schein | 1861119 | cement component |
Amplifier (Tucker-Davis Technologies) | Tucker-Davis Technologies | PZ5M-512 | Used for auditory stimulus and recording software. |
Articulated arm | Noga | DG60103 | for holding the fine adjustment screw system |
Aspheric lenses for light collection (and one for focusing the light) | Thorlabs | ACL25416U-B | for collecting LED light |
Auditory equipment | Tucker-Davis Technologies, Sony, Cortera | RP2.1 Enhanced Real-Time Processor/HB7 Headphone Drive | Used for auditory stimulus and recording software. |
Buprenorphine | Sterile Products LLC | #42023017905 | General analgesia |
C&B Metabond Base Cement Ea | Henry Schein | 1864477 | cement component |
C&B Metabond L-Powder Cement Clear 3 g | Henry Schein | 1861068 | cement component |
Chlorprothixene hydrochloride (mouse) | Sigma Aldrich | Cat. No. C1671 | For sedation, must be prepared the same day and kept at 4 |
Custom-designed 128-channel micro-electrocorticography (μECoG) grids | Neuronexus | E128-200-8-40-HZ64 | For neurophysiology recordings. Placed onto the cortex. |
Dengofoam gelatin sponges | Dengen dental | 600034 (SKU) | can be used dry or wet, saturated with sterile sodium chloride solution |
Drill bit, size 5 to 9 (Mouse) | Fine Science Tools | 19007-XX | XX is the size of the drill bit e.g. 05 or 09. For mouse procedures |
Drill bitSteel Round Bur (5.5 mm/7.5 mm) | LZQ Tools | Dental Bar Drill Bit Stainless Steel Bur | For rat procedures |
Dumont No. 5 forceps | Fine Science Tools | 11251-10 | For surgical procedures |
Dumont tweezers #5 bent 45° | World precision instruments | 14101 | for removing craniotomy window |
DVD Player (Sony) | Sony | CDP-C345 | System used to accept and play back stimulus sets |
Electrostatic Speaker | Sony | XS-162ES | Used for auditory stimulus and recording software. Located within the rig, plays sound to the sedated rodent |
Enzymatic detergent (Enzol) | Advanced sterilization products | 2252 | Cleaning/Disinfectant |
EverEdge 2.0 Scaler Sickle Double End H6/H7 #9 | Henry Schein | 6011862 | for scrubing the skull |
Fine adjustment screw system in 3 dimension | Narishige | U-3C | for precise positioning of the optical fiber end |
Gold pin | Harwin Inc | G125-1020005 | Used for contact reference in mouse Soldered to the silver wire |
Gripping forceps | Fine Science Tools | 00632-11 | For surgical procedures |
Isoflurane | Covetrus | 11695067772 | require a vaporizer |
Ketamine (Hydrochloride Injection) (Rat) | Dechra | 17033-101-10 | Anesthesia/Analgesic |
LED | New Energy | LED XLAMP XPE2 BLUE STARBOARD | Blue LED light source |
LED driver | Thorlabs | LEDD1B | LED driver |
Lidocaine | Covetrus | VINB-0024-6800 | to be diluted to 1% in saline |
Meloxicam | Covetrus | 6451603845 | Anti-inflammatory used for general analgesia |
Micromanipulator | Narishige (Stereotaxic Rig) | SR-6R + SR-10R-HT components | Used to manipulate ECoG and rodent with fine movements |
No. 2 forceps | Fine Science Tools | 91117-10 | For surgical procedures |
No. 55 forceps | Fine Science Tools | 1129551 | For surgical procedures |
Ophtalmic lubricant (Artificial tears) | Akorn | 17478-062-35 | Used to protect eyes from dessication during surgical procedures |
Optical fiber 200µm Core diameter | Thorlabs | M133L02 | FC/PC connector 2 m long |
Pentobarbital (Rat) | Covetrus / Dechra | VINV-C0II-0008 | Anesthesia/Analgesic |
Platinum Black | Sigma | 205915-250MG | For neurophysiology recordings (Used for electroplating the contacts on the μECoG grids). |
Povidone Iodine 10% | Betadine | https://betadine.com/medical-professionals/betadine-solution/ | no catalog number ( not retail ) |
Powder detergent (Contrex AP) | Decon Labs | 5204 | Cleaning / Disinfectant |
Pre-cut tape for oxygen tube | ULINE (Various Providers) | S-14726 | Used to attach oxygen tube to the nose-cone of the rodent stereotaxic rig |
Scalpel handle # 3 | World precision instruments | 500236-G | for blades # 10, #11 and #15 |
Scraper | Fine Science Tools | 1007516 | For surgical procedures |
Short 30 G needles | ExelInt | 26437 | For surgical procedures and injections |
Silver Wire | Warner Instruments | 63-1319 | For neurophysiology recordings (Used for grounding and as a reference electrode). |
Sterilized saline (0.9% sodium chloride for injection) | Hospira | 00409-7101-67 (NDC) | For dilution of injectable, and replacement of body fluids |
Stoelting Hopkins Bulldog | Fine Science Tools | 10-000-481 | For surgical procedures |
Surface disinfectant (Coverage Plus NDP Disinfectant) | Steris life science | 638708 | Cleaning/Disinfectant |
TDT ZIF-clip connectors for acquisition. | Tucker-Davis Technologies | ZIF-Clip Analog Headstages | Connects ECoG with outside acquisition equipement |
Two-pronged holding fork | Tucker-Davis Technologies | Z-ROD128 | Used to connect the TDT-clips with the micromanipulator |
Xylazine (Rat) | Covetrus | 1XYL006 | Anesthesia/Analgesic |
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