Ein einfaches, schnelles und teilautomatisiertes Protokoll für die Isolierung von Einzelkernen aus gefrorenem Säugetiergewebe für die Einzelkernsequenzierung

Diese Forschung konzentriert sich auf die Unterstützung von Arzneimittelforschungsstudien mit Einzelkern-RNA-Sequenzierung, um die Wirksamkeit und Sicherheit potenzieller Behandlungen zu untersuchen. Daher entwickeln wir standardisierte Kernextraktionsprotokolle für frisch gefrorene Gewebeproben aus verschiedenen Organen. Unser Ziel war es, die Kernextraktion zu automatisieren und zu standardisieren, um konsistente und zuverlässige Ergebnisse zu erzielen, indem wir die nicht-biologische Variabilität reduzieren.

Der Vorteil liegt in der Teilautomatisierung durch den Einsatz eines Roboterdissoziators und dem einfachen und kurzen Arbeitsablauf, der auf verschiedene Gewebeproben unterschiedlicher Spezies angewendet werden kann. Standardisierte Protokolle können uns helfen, Fragen zur Bioverteilung von Medikamenten zu beantworten und die Mechanismen zu erforschen, die den von uns beobachteten Sicherheitssignalen zugrunde liegen. In Zukunft werden wir die Anwendbarkeit unseres Protokolls für weitere nachgelagerte Anwendungen, wie z.B. ATAC-seq oder Multiomics, testen.

Wir werden auch versuchen, Protokolle zu etablieren, um viral exprimierte Transgene in einzelnen Zellkernen nachzuweisen.