Kryo-Elektronenmikroskopie-Screening-Automatisierung über mehrere Gitter hinweg mit Smart Leginon

Am Simons Electron Microscopy Center wollen wir lokalen und nationalen Forschern hervorragende Elektronenmikroskopie-Dienstleistungen, Fachwissen und Schulungen anbieten und innovative Methoden zur Optimierung von Arbeitsabläufen entwickeln. Unser Leistungsspektrum umfasst Service, Entwicklung, maschinelles Lernen und biomedizinische Forschung. Wir versuchen zu beantworten, wie wir unsere Dienstleistungen besser optimieren können.

Maschinelles Lernen verändert das Feld der Elektronenmikroskopie. Die Datenerfassung wird automatisiert. Datenanalysetools werden immer effizienter.

Dazu gehören die Entrauschung von Bildern, die Partikelauswahl, die 3G-Flexibilitätsanalyse und die Modellerstellung. Wir aktualisieren die Software regelmäßig, um verschiedene Situationen zu berücksichtigen, wie z. B. verschiedene Rasterlöcher, geneigte Sammlungen oder Fehler, die durch Beta-Testsoftware in unserer Produktionsumgebung identifiziert wurden. Wir integrieren auch das Feedback unserer Benutzer, sodass wir kontinuierlich Funktionen bereitstellen, die für sie nützlich sind.

Smart Leginon übernimmt die arbeits- und zeitaufwändigen Aufgaben des Screenings eines oder mehrerer Gitter auf einem KryoTEM. Es ermöglicht Betreibern und Forschern, Netze schneller zu screenen und zu analysieren und gleichzeitig Zeit für die parallele Optimierung der Netz- und Probenbedingungen zu gewinnen. Dies reduziert auch den Zeit- und Kostenaufwand für das Mikroskop.

Smart Leginon Autoscreen bietet ein vollständig unbeaufsichtigtes Multigrid-Screening, das etwa 10 Minuten dauert, um das Screening für 12 Raster einzurichten. Im Vergleich zum manuellen Screening spart unser Protokoll mehrere Stunden pro Tag. Seit der Einführung von Smart Leginon wurden andere freie und kommerzielle Software für eine ähnliche Automatisierung entwickelt.