Automazione dello screening della microscopia crioelettronica su più griglie utilizzando Smart Leginon

Al Simons Electron Microscopy Center, miriamo a fornire eccellenti servizi, competenze e formazione di microscopia elettronica ai ricercatori locali e nazionali e a sviluppare metodi innovativi per ottimizzare i flussi di lavoro. Il nostro ambito copre l'assistenza, lo sviluppo, l'apprendimento automatico e la ricerca biomedica. Stiamo cercando di rispondere, come possiamo ottimizzare al meglio i nostri servizi?

L'apprendimento automatico sta cambiando il campo della microscopia elettronica. La raccolta dei dati sta diventando automatizzata. Gli strumenti di analisi dei dati stanno rapidamente diventando sempre più efficienti.

Ciò include la riduzione del rumore delle immagini, il prelievo delle particelle, l'analisi della flessibilità 3G e la costruzione di modelli. Aggiorniamo regolarmente il software per tenere conto di diverse situazioni, come diversi fori della griglia, raccolta inclinata o bug identificati tramite il software di beta testing nel nostro ambiente di produzione. Integriamo anche il feedback dei nostri utenti, quindi forniamo continuamente funzionalità utili per loro.

Smart Leginon affronta le attività laboriose e dispendiose in termini di tempo per lo screening di una o più griglie su un crioTEM. Consente agli operatori e ai ricercatori di esaminare e analizzare più rapidamente le griglie, liberando tempo per ottimizzare le condizioni della griglia e del campione in parallelo. In questo modo si riducono anche i tempi e i costi del microscopio.

Smart Leginon autoscreen offre uno screening multigriglia completamente non presidiato, che richiede circa 10 minuti per impostare lo screening per 12 griglie. Rispetto allo screening manuale, il nostro protocollo consente di risparmiare diverse ore al giorno. Dall'introduzione di Smart Leginon, sono stati sviluppati altri software gratuiti e commerciali per un'automazione simile.