Methoden zur Ermöglichung der räumlichen Transkriptomik von Knochengewebe

Unser Ziel ist es, bessere Therapieansätze für die Behandlung eines menschlichen Knochenkrebses namens Osteosarkom zu finden. Um dies zu erreichen, wollen wir die biologischen Prozesse aufdecken, die für die Entstehung dieses Tumors und vor allem für die Entwicklung seiner Metastasen verantwortlich sind, die die Todesursache des Patienten löschen. Durch die Anwendung einer räumlichen Transkriptomik-Analyse an mehreren übereinstimmenden Proben von Metastasen der primären Osteosarkom-Linie des Menschen lokalisierten wir mehrere gemeinsame Patientenzellpopulationen, die sich in den Tumorbereichen befinden, und identifizierten durch deren Vergleich mehrere Schlüsselgene, die wertvolle therapeutische Ziele zur Verhinderung von Lungenmetastasen darstellen könnten.

Die spezielle Transkriptomik-Analyse von Herzgewebe, wie z. B. Knochen, war eine große Herausforderung, da es nicht möglich war, eine qualitativ hochwertige RNA und Gewebemorphologie zu erhalten und gleichzeitig das Herzgewebe für die Sektion zu verarbeiten. Unser Protokoll schließt diese Lücke und ermöglicht es Forschern, spezielle Transkriptomik-Analysen auch erfolgreich auf Herzgewebe anzuwenden.