Méthodes pour permettre la transcriptomique spatiale des tissus osseux

Notre objectif est de trouver de meilleures approches thérapeutiques pour traiter un cancer des os humain appelé ostéosarcome. Pour ce faire, nous voulons découvrir les processus biologiques responsables de l’apparition de cette tumeur et surtout du développement de ses métastases, qui sont en train d’effacer la cause de décès du patient. En utilisant l’analyse transcriptomique spatiale sur plusieurs échantillons correspondants de métastases de la ligne d’ostéosarcome primaire humain, nous avons localisé dans plusieurs populations de cellules communes de patients résidant dans les zones tumorales, et en les comparant, nous avons identifié plusieurs gènes clés qui peuvent représenter des cibles thérapeutiques précieuses pour prévenir les métastases pulmonaires.

L’analyse transcriptomique spéciale du tissu cardiaque, comme l’os, a été très difficile en raison de l’incapacité à préserver une bonne qualité de l’ARN et de la morphologie des tissus, tout en traitant le tissu cardiaque pour la section. Notre protocole comble cette lacune, permettant aux chercheurs d’appliquer avec succès une analyse transcriptomique spéciale également aux tissus cardiaques.