Al cruzar plantas de guisantes, Mendel notó que uno de los rasgos parentales a veces desaparecería en la primera generación de crías, llamada generación F₁, y podría reaparecer en la próxima generación (F₂). Concluyó que uno de los rasgos debe ser dominante sobre el otro, causando así el enmascaramiento de un rasgo en la generación F₁. Cuando cruzó las plantas F₁, descubrió que el 75% de la descendencia en la generación F₂ tenía el fenotipo dominante, mientras que el 25% tenía el fenotipo recesivo.

El modelo de Mendel para explicar este resultado tenía cuatro partes. Primera, las versiones alternativas de los genes, llamadas alelos, explican las diferencias en los rasgos. Segunda, un organismo hereda dos copias de cada gen, una de cada padre. Tercera, la presencia de un alelo dominante enmascara el alelo recesivo. Cuarta, los dos alelos para un rasgo se separan durante la formación de gametos. Esta última parte del modelo se llama la Ley de Segregación. Si un padre tiene dos alelos diferentes, o es heterocigoto, estos alelos se separarán de forma equitativa y aleatoria durante la formación de gametos. Los científicos ahora entienden que la separación de los cromosomas durante la meiosis explica la segregación de los alelos parentales.

Pensemos en el cruce entre una planta de floración púrpura (genotipo PP) y una planta de floración blanca (pp). La generación resultante F₁ tiene flores púrpuras (Pp). Este fenotipo se explica por la parte (3) del modelo de Mendel, ya que el alelo púrpura dominante enmascara al alelo blanco recesivo. Sin embargo, cuando se cruzan las plantas F₁ (Pp x Pp), la descendencia puede ser púrpura o blanca con una proporción de 3 púrpura a 1 blanco. La relación genotípica correspondiente es de 1 PP: 2 Pp: 1 pp. Este resultado está respaldado por la Ley de Segregación de Mendel, ya que cada planta recibió un alelo de cada padre.