Los reguladores maestros de transcripción son proteínas reguladoras que se encargan principalmente de regular la expresión de múltiples genes. A menudo, estos genes trabajan en conjunto para impulsar un proceso complejo. La activación de un regulador de transcripción maestro puede conducir a una cascada de activación transcripcional necesaria para ese resultado. Estos reguladores pueden unirse directamente a las secuencias reguladoras de los diversos genes implicados, o pueden regular indirectamente la transcripción uniéndose a secuencias reguladoras de reguladores transcripcionales adicionales e inducir su producción. La expresión de un fenotipo particular en un organismo a menudo está bajo el control de uno o dos reguladores de transcripción maestros. La importancia de estos reguladores en el funcionamiento de los organismos y la expresión de fenotipos enfermos los convierten en objetivos ideales para la investigación en el desarrollo de fármacos.

MEF2C es un regulador transcripcional maestro que es predominantemente responsable del desarrollo del cáncer de mama. Pertenece a la familia Mef2 de activadores de transcripción responsables de la diferenciación y el desarrollo celular. Hay varios rasgos característicos de MEF2C que demuestran su función como regulador maestro de la transcripción. Consta de dos dominios de unión al ADN: Mef2 y MADS-box. El dominio Mef2 es conocido por su función de dimerización y unión al ADN de alta afinidad. MEF2C también tiene sitios de unión para TEAD1, un corregulador que es responsable de mejorar la transcripción; MAPK7, un factor de transcripción que regula la proliferación y diferenciación celular; EP300, un factor de transcripción implicado en la regulación del crecimiento y la división celular; y varias histonas desacetilasas, como HDAC4, HDAC7 y HDAC9.

El análisis experimental ha demostrado que MEF2C puede regular directamente muchos genes responsables del fenotipo oncogénico, así como indirectamente el fenotipo mediante la activación de otros factores de transcripción: 1896 genes y 2156 interacciones reguladoras de segundo orden y 5852 genes y 18801 interacciones de tercer orden.