Ana transkripsiyon düzenleyicileri, ağırlıklı olarak çoklu genlerin ekspresyonunu düzenlemekten sorumlu olan düzenleyici proteinlerdir. Genellikle bu genlerin uyum içinde çalışmasıkarmaşık bir süreçtir. Bir ana transkripsiyon regülatörünün aktivasyonu, bu sonuç için gerekli olan bir transkripsiyonel aktivasyon kaskadına yol açabilir. Bu düzenleyiciler, ilgili çeşitli genlerin düzenleyici dizilerine doğrudan bağlanabilir veya ek transkripsiyonel düzenleyicilerin düzenleyici dizilerine bağlanarak transkripsiyonu dolaylı olarak düzenleyebilir ve üretimlerini indükleyebilirler. Bir organizmada belirli bir fenotipin ifadesi genellikle bir veya iki ana transkripsiyon düzenleyicisinin kontrolü altındadır. Bu düzenleyicilerin organizmaların işleyişindeki önemi ve hastalıklı fenotiplerin ifadesi onları ilaç geliştirme araştırmaları için ideal hedefler haline getirmektedir.

MEF2C, ağırlıklı olarak meme kanseri gelişiminden sorumlu olan ana transkripsiyonel bir düzenleyicidir. Hücre farklılaşması ve gelişiminden sorumlu MEF2 transkripsiyon aktivatörleri ailesine aittir. MEF2C'nin ana transkripsiyon regülatörü olarak işlevini gösteren birkaç karakteristik özelliği vardır. İki DNA bağlayıcı etki oluşur – MEF2 ve MADS-box. MEF2 alanı, yüksek afiniteli DNA bağlanması ve dimerizasyon fonksiyonu ile bilinir. MEF2C da TEAD1, hücre çoğalması ve farklılaşma düzenleyen transkripsiyon; MAPK7, bir transkripsiyon faktörünün artırılması için sorumlu olan ortak bir regülatör için bağlanma yerleri; EP300, hücre büyümesi ve bölünme düzenlenmesinde rol oynayan bir transkripsiyon faktörüdür; birçok histon deacetylases gibi HDAC4 olarak, HDAC7 ve HDAC9 vardır.

Deneysel analiz, MEF2C'nin onkojenik fenotipten sorumlu birçok geni doğrudan düzenleyebileceğini göstermiştir. Ayrıca dolaylı olarak diğer transkripsiyon faktörlerini aktive ederek fenotip düzenleyebilir: 1896 genler ve 2156 ikinci mertebeden düzenleyici etkileşimler ve 5852 genler ve 18801 üçüncü mertebeden etkileşimlerdir.