Secuenciación e identificación de microbiota biográfica multiespecie a partir de muestras de rizosfera

Para empezar, establecer un biofilm de rizosfera multiespecie y obtener la suspensión celular de la microbiota. Mezcle los medios de caldo de soja tríptico con medios de glutamato de glicerol con sales mínimas en una proporción de uno a uno. Incubar la suspensión celular en el medio a 30 grados centígrados durante la noche para activar las bacterias.

Coloque filtros de celdas de nailon de 100 micrómetros en una placa de 24 pocillos. Inocular la suspensión bacteriana en tres réplicas y cultivar el biofilm de la película durante 36 horas a 30 grados centígrados. Retire el filtro que contiene la biopelícula de la película y agregue dos mililitros de tampón PBSS a una nueva placa de celdas de 24 pocillos.

Coloque el filtro en la placa para lavar la biopelícula y eliminar las células libres. Después de la identificación y el cultivo de las cinco especies principales en la biopelícula, incubar las 31 combinaciones de comunidades sintéticas en el medio. Siguiendo el procedimiento mencionado, se observaron gradientes significativos en la capacidad de formación de biopelículas de la microbiota del suelo de la rizosfera del pepino.

La secuenciación del amplicón del biofilm confirmó la presencia de varias especies en la película.