Los autores desean agradecer a los miembros del Instituto de Investigación de Patología Clínica del Hospital de China Occidental, que contribuyeron con orientación técnica para la inmunofluorescencia múltiple de calidad y el procesamiento de IHQ. Este protocolo contó con el apoyo de la Fundación Nacional de Ciencias Naturales de China (82200078).

El protocolo está aprobado por las directrices del Comité de Ética del Hospital de China Occidental, Universidad de Sichuan, China. Las muestras de tejido de cáncer de pulmón se obtuvieron durante la cirugía en el Centro de Cáncer de Pulmón del Hospital de China Occidental, y se obtuvo el consentimiento informado de cada paciente.
1. Preparación de la sección de tejido
<ol><li>Preparación FFPE<ol><li>Sumergir los tejidos clínicos en una solución de formalina neutra durante más de 72 h.</li>
		<li>Completar el proceso de deshidratación de los tejidos utilizando xileno y soluciones alcohólicas graduadas20.</li>
		<li>Realice la inclusión manual de parafina y el corte de tejido con un espesor de sección de 4 μm. Use portaobjetos de microscopio de adhesión para asegurarse de que los cortes de tejido no se caigan.</li>
		<li>Hornee los portaobjetos en un horno a 65 °C durante 2 h para asegurarse de que el tejido y los portaobjetos estén secos. Guárdelo en una caja deslizante a temperatura ambiente.</li>
	</ol></li>
	<li>Pretratamiento de la sección de tejido<ol><li>Trate previamente los portaobjetos de tejido en un horno a 65 °C durante 5 min, y luego sumérjalos secuencialmente en soluciones de xileno durante 2 x 15 min, soluciones de etanol anhidro durante 2 x 15 min, solución de etanol al 90% durante 10 min, solución de etanol al 85% durante 10 min, solución de etanol al 80% durante 10 min y solución de etanol al 75% durante 10 min, A continuación, lave los portaobjetos con agua esterilizada durante 3 x 1 min. NOTA: Esta técnica experimental solo se puede utilizar para tejido FFPE, no para tejido congelado o fresco, ya que el proceso de reparación de antígenos múltiples a alta temperatura hace que el tejido se caiga del portaobjetos.</li>
	</ol></li>
</ol>2. Optimización del anticuerpo primario
NOTA: Se utilizaron experimentos convencionales de IHQ para determinar las condiciones de incubación de anticuerpos individuales, incluyendo principalmente la concentración de anticuerpos y las condiciones de reparación de antígenos. Consulte las condiciones en el manual de instrucciones de anticuerpos.
<ol><li>Utilice una concentración de anticuerpos ligeramente superior al rango de concentración recomendado y valores intermedios.</li>
	<li>Optimizar las rutinas de tampón de recuperación de antígenos PH6 y PH9 de acuerdo con la ubicación de la expresión de proteínas. Usar PH9 para las proteínas expresadas en el núcleo y usar cualquiera de las dos rutinas (PH6 o PH9) para otras proteínas.</li>
</ol>3. Método de tinción mIHC
NOTA: La tinción de mIHC de ópalo es uno de los métodos de mIHC disponibles. En este protocolo experimental de 5 colores, como cada muestra de tejido debe teñirse con cuatro anticuerpos, se necesitan cuatro incubaciones de anticuerpos primarios, incubaciones de anticuerpos secundarios e incubaciones cromogénicas de amplificación de la señal TSA, así como cinco restauraciones de antígenos. Por último, se realiza la tinción de 4'6-diamidino-2-fenilindol (DAPI) y el sellado con agente de estallido antifluorescente.
<ol><li>Preparación del reactivo principal NOTA: Determine la cantidad de reactivo que se agregará de acuerdo con el tamaño de los portaobjetos de tejido. Use suficiente volumen para cubrir completamente la sección de tejido (generalmente, 50-150 μL por portaobjetos). Las soluciones de trabajo necesarias para el experimento se preparan de la siguiente manera:<ol><li>Solución de trabajo del tampón de lavado: diluir el tampón de lavado 20x a 1:20 con agua bidestilada y almacenar a temperatura ambiente.</li>
		<li>Solución de trabajo del tampón PH6: Diluir 100x tampón PH6 a 1:100 con agua bidestilada. Preparar antes de usar y almacenar a temperatura ambiente.</li>
		<li>Solución de trabajo del tampón PH9: Diluir 50x tampón PH9 a 1:50 con agua bidestilada. Preparar antes de usar y almacenar a temperatura ambiente.</li>
		<li>Polímero HRP: Prepare esta solución lista para usar solo para anticuerpos primarios de origen conejo y ratón.</li>
		<li>Solución de trabajo de fluoróforos: Reconstituya cada polvo de fluoróforo (excepto el fluoróforo 780) en 75 μL de DMSO. Antes de cada procedimiento, diluya el fluoróforo en diluyente de amplificación 1x a 1:100. Deseche cualquier porción no utilizada de la solución de trabajo de fluoróforos.</li>
		<li>Solución de trabajo de fluoróforo 780: Reconstituya TSA-DIG en 75 μL de DMSO y el polvo de fluoróforo 780 en 300 μL de agua bidestilada. Antes del procedimiento, diluya TSA-DIG en diluyente de amplificación 1x a 1:100 y diluya el fluoróforo 780 con diluyente Ab a 1:25.</li>
		<li>Solución de trabajo DAPI: Diluir la solución DAPI a 1:50 con agua bidestilada o PBS. Preparar antes de usar y conservar a 4 °C durante no más de 48 h. NOTA. Lave los portaobjetos solo con agua doblemente destilada y una solución de trabajo tampón de lavado recién preparada durante este experimento de tinción de fluorescencia multietiqueta. Las secciones de tejido no deben entrar en contacto con el agua del grifo; Los contaminantes en el agua del grifo pueden adherirse a las secciones de tejido y causar autofluorescencia. Mantenga las muestras alejadas de la luz durante todo el experimento.</li>
	</ol></li>
	<li>Recuperación de antígenos<ol><li>Coloque los portaobjetos en una caja de tinción y reparación y llénela con solución tampón de trabajo PH6 o PH9, cúbralos con la tapa y caliéntelos en un horno microondas durante 2 x 8 minutos al 100% de potencia. NOTA: Agregue agua doblemente destilada a la caja de reparación durante el proceso de calentamiento para evitar una evaporación excesiva que puede hacer que las rodajas se sequen.</li>
		<li>Deje que los portaobjetos se enfríen a temperatura ambiente antes de continuar (30-60 min).</li>
		<li>Lave los portaobjetos 3 x 2 min con agua bidestilada. Use un bolígrafo de barrera hidrofóbica para rodear la sección de tejido en el portaobjetos.</li>
	</ol></li>
	<li>Bloqueante<ol><li>Sumerja las secciones de tejido en tampón de lavado, cúbralas con una solución de bloqueo e incube los portaobjetos en una cámara humidificada a temperatura ambiente durante 10 minutos.</li>
	</ol></li>
	<li>Incubación primaria de anticuerpos<ol><li>Retire la solución bloqueante de los portaobjetos y cubra las secciones de tejido con la solución primaria de anticuerpos que funciona. Incubar los portaobjetos en una cámara humidificada durante 1 h a 37 °C en la incubadora o durante la noche a 4 °C en el frigorífico. NOTA: No deje que los portaobjetos se sequen.</li>
	</ol></li>
	<li>Introducción del polímero HRP<ol><li>Lave los portaobjetos en solución de trabajo tampón de lavado durante 3 x 2 min. Agregue Polymer HRP directamente gota a gota a las secciones de tejido e incube durante 15 min a temperatura ambiente. NOTA: En el caso de los portaobjetos almacenados en el refrigerador, manténgalos a temperatura ambiente durante aproximadamente 30 minutos antes de lavarlos para eliminar el anticuerpo primario.</li>
	</ol></li>
	<li>Generación de amplificación de señal de tiramina (TSA)<ol><li>Lave el portaobjetos con solución de trabajo tampón de lavado durante 3 x 2 minutos, agregue la solución de trabajo de fluoróforo directamente gota a gota a las secciones de tejido e incube durante 10 minutos a temperatura ambiente. Lave el portaobjetos con la solución de trabajo del tampón de lavado durante 3 x 2 min.</li>
	</ol></li>
	<li>Procedimiento especial para el fluoróforo 780 NOTA: El fluoróforo 780 es débil y se coloca rutinariamente en último lugar en el esquema de coincidencia de colores de todo el experimento. El fluoróforo 780 no se utiliza normalmente en este protocolo experimental, pero debido a su especificidad, se enumeran sus pasos experimentales.<ol><li>Introducción de TSA-DIG<ol><li>Lave el portaobjetos con solución de trabajo tampón de lavado durante 3 x 2 minutos, agregue la solución de trabajo TSA-Drg gota a gota a las secciones de tejido e incube durante 10 minutos a temperatura ambiente.</li>
		</ol></li>
		<li>Tratamiento con microondas<ol><li>Lave los portaobjetos con una solución de trabajo tampón de lavado durante 3 x 2 min.</li>
			<li>Coloque los portaobjetos en una caja de tinción y reparación, llénela con solución reparadora, cúbrala con la tapa y caliéntela en un horno microondas durante 2 x 8 minutos al 100% de potencia. Deje que los portaobjetos se enfríen a temperatura ambiente antes de continuar (30-60 min).</li>
			<li>Lave los portaobjetos durante 3 x 2 minutos con agua bidestilada.</li>
		</ol></li>
		<li>Generación de señales de fluoróforo 780<ol><li>Sumerja las secciones en tampón de lavado, cúbralas con una solución de trabajo de fluoróforo 780 e incube los portaobjetos en una cámara humidificada durante 1 h a temperatura ambiente.</li>
			<li>Lave los portaobjetos con una solución de trabajo tampón de lavado durante 3 x 2 min. NOTA: NO realice el tratamiento con microondas después de este paso.</li>
		</ol></li>
		<li>Utilice el fluoróforo 780 como último paso de todo el flujo de trabajo y, a continuación, tiña los núcleos directamente con la solución de trabajo DAPI. NOTA: Omita el paso 3.7 si no está utilizando el fluoróforo 780.</li>
	</ol></li>
	<li>Tratamiento con microondas NOTA: Este paso de microondas elimina el complejo HRP primario-secundario y vuelve a exponer los antígenos, lo que permite la introducción del siguiente anticuerpo primario.<ol><li>Coloque los portaobjetos en una caja de tinción y reparación, llénela con solución tampón de trabajo PH6 o PH9, cúbralos con la tapa y caliéntelos en un horno microondas durante 2 x 8 minutos al 100% de potencia.</li>
		<li>Deje que los portaobjetos se enfríen a temperatura ambiente antes de continuar (30-60 min). Lave los portaobjetos 3 x 1 min con agua bidestilada.</li>
		<li>Sumerja los portaobjetos en la solución de trabajo del tampón de lavado durante 2 min. Realice la siguiente incubación de anticuerpos.</li>
	</ol></li>
	<li>Próxima incubación de anticuerpos<ol><li>Repita los pasos 3.2 a 3.8 (excepto el paso 3.7).</li>
	</ol></li>
	<li>Tinción nuclear celular y sellado de tejidos<ol><li>Cubra las secciones de tejido con la solución de trabajo DAPI e incube los portaobjetos en una cámara humidificada durante 5 minutos a temperatura ambiente. Lave los portaobjetos durante 3 x 2 minutos con agua bidestilada.</li>
		<li>Retire las gotas de agua de los portaobjetos, agregue 10-20 μL de extintor antifluorescente a cada portaobjetos y selle los portaobjetos con una cubierta de microscopio.</li>
		<li>Guarde los portaobjetos terminados a 4 °C, protegidos de la luz, durante más de 1 mes. NOTA: Tenga cuidado de evitar las burbujas de aire.</li>
	</ol></li>
</ol>4. Configura el control negativo
<ol><li>Procese los portaobjetos de control negativo como los portaobjetos que contienen tejido, pero sin la adición de reactivos como anticuerpos primarios, anticuerpos secundarios, reactivos TSA y DAPI, que se utilizan para eliminar la autofluorescencia tisular al escanear la película.</li>
</ol>5. Escaneo totalmente automático de portaobjetos de tejido
NOTA: El equipo utilizado para la obtención de imágenes espectrales es un analizador de cuantificación de tejidos multiespectrales totalmente automatizado, y la visualización de imágenes y análisis de portaobjetos de 5 colores se puede realizar utilizando el sistema de referencia (consulte la Tabla de materiales). El sistema utiliza imágenes multiespectrales para la desmezcla cuantitativa de múltiples fluoróforos y la autofluorescencia tisular.
<ol><li>Configure manualmente el tiempo de exposición y el programa de escaneo para cada canal de fluorescencia y confirme que el instrumento ha completado la exposición y el escaneo totalmente automáticos de los portaobjetos de tejido. NOTA: La superficie del portaobjetos debe estar limpia y libre de película de agua. Tenga cuidado con la cantidad de sellador: demasiado hará que el cubreobjetos se deslice y que el instrumento informe de un error.</li>
</ol>6. Análisis de fluorescencia
<ol><li>Haga doble clic en el software (consulte la Tabla de materiales), arrastre el archivo de imagen de fluorescencia multicolor obtenido del escaneo original al software y establezca el tipo de imagen en fluorescencia.</li>
	<li>Haga clic en el botón Brillo y contraste y verifique los canales en el panel. Haga clic fuera y luego en el canal para seleccionar el canal de fluorescencia de interés. Arrastre la pantalla mínima y la pantalla máxima para ajustar el brillo y el contraste de cada canal.</li>
	<li>Después del análisis, determine la vista que se va a guardar, haga clic en Mostrar descripción general de diapositivas y Mostrar ubicación del cursor para eliminar estos dos contenidos, mantenga la barra de escala y haga clic en Archivo | Exportar instantánea | Contenido actual del visor para exportar un archivo png. NOTA: Cada canal de fluorescencia y una figura combinada deben exportarse para futuros análisis.</li>
	<li>Para un análisis más detallado de la positividad de las células diana, utilice el software de identificación y segmentación de células21 (ver Tabla de materiales).</li>
</ol>

Descifrando el microambiente tumoral mediante mIHQ en el carcinoma escamoso de pulmón

<ol>
	<li>Zaidi, A. U., Enomoto, H., Milbrandt, J., Roth, K. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dual+fluorescent+in+situ+hybridization+and+immunohistochemical+detection+with+tyramide+signal+amplification.">Dual fluorescent in situ hybridization and immunohistochemical detection with tyramide signal amplification.</a> The Journal of Histochemistry and Cytochemistry. 48 (10), 1369-1375 (2000).</li><li>Lovisa, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Epithelial-to-mesenchymal+transition+induces+cell+cycle+arrest+and+parenchymal+damage+in+renal+fibrosis.">Epithelial-to-mesenchymal transition induces cell cycle arrest and parenchymal damage in renal fibrosis.</a> Nature Medicine. 21 (9), 998-1009 (2015).</li><li>Nghiem, P. 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M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Challenges+and+opportunities+in+the+statistical+analysis+of+multiplex+immunofluorescence+data.">Challenges and opportunities in the statistical analysis of multiplex immunofluorescence data.</a> Cancers. 13 (12), 3031 (2021).</li><li>Mori, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterizing+the+tumor+immune+microenvironment+with+Tyramide-based+multiplex+immunofluorescence.">Characterizing the tumor immune microenvironment with Tyramide-based multiplex immunofluorescence.</a> Journal of Mammary Gland Biology and Neoplasia. 25 (4), 417-432 (2020).</li><li>Mansfield, J. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cellular+context+in+epigenetics:+quantitative+multicolor+imaging+and+automated+per-cell+analysis+of+miRNAs+and+their+putative+targets.">Cellular context in epigenetics: quantitative multicolor imaging and automated per-cell analysis of miRNAs and their putative targets.</a> Methods. 52 (4), 271-280 (2010).</li></ol>

Todos los autores declaran que no existen conflictos de intereses.

La mIHC es una técnica experimental indispensable en el campo de la investigación científica para el análisis cuantitativo y espacial de múltiples marcadores proteicos a nivel de una sola célula en una sola sección de tejido, proporcionando datos intuitivos y precisos para el estudio de la patología de la enfermedad centrándose en la estructura tisular detallada y las interacciones celulares en el contexto del tejido original. La adopción generalizada de la tecnología mIHC requerirá protocolos experimentales ...

La amplificación de la señal de tiramina (TSA), que tiene una historia de más de 20 años, es una clase de técnicas de ensayo que utilizan peroxidasa de rábano picante (HRP) para el marcaje in situ de alta densidad de antígenos diana y se aplica ampliamente en ensayos de inmunoabsorción enzimática (ELISA), hibridación in situ (ISH), inmunohistoquímica (IHC) y otras técnicas para la detección de antígenos biológicos. mejorar sustancialmente la sensibilidad de la señal detectada1. La tinción policromática de ópalo basada en la tecnología TSA ha sido desarrollada recientemente y ampliamente utilizada en varios estudios 2,3,4,5. La tinción tradicional de inmunofluorescencia (FI) proporciona a los investigadores una herramienta fácil para la detección y comparación de la distribución de proteínas en las células y tejidos de varios organismos modelo. Se basa en la unión específica de anticuerpos/antígenos e incluye abordajes directos e indirectos6. La inmunotinción directa implica el uso de un anticuerpo primario conjugado con fluoróforos contra el antígeno de interés, lo que permite la detección fluorescente directa mediante un microscopio de fluorescencia. El abordaje de inmunotinción indirecta implica la aplicación de un anticuerpo secundario conjugado con fluoróforos contra el anticuerpo primario no conjugado 6,7.
Los métodos tradicionales de tinción por inmunofluorescencia de una sola etiqueta pueden teñir solo uno, dos o, en algunos casos, tres antígenos en los tejidos, lo cual es una limitación importante para extraer la rica información contenida en las secciones de tejido. La interpretación de los resultados cuantitativos a menudo depende de la observación visual y la cuantificación precisa mediante software de imágenes, como ImageJ. Existen limitaciones técnicas, como la restricción de especies de anticuerpos, señales débiles de etiquetado fluorescente y superposición de colores de colorantes fluorescentes (Tabla 1). La técnica Opal multiplex IHC (mIHC) se basa en la derivación TSA, que permite la tinción multiplex y el marcaje diferencial de más de 7-9 antígenos en la misma sección de tejido, sin restricción en el origen del anticuerpo primario, pero requiere una alta especificidad del anticuerpo correspondiente contra el antígeno. El procedimiento de tinción es similar al de la tinción de inmunofluorescencia normal, excepto por dos diferencias: cada ronda de tinción implica el uso de un solo anticuerpo y se agrega un paso de elución de anticuerpos. Los anticuerpos unidos al antígeno por enlaces no covalentes pueden eliminarse mediante elución por microondas, pero se conserva la señal fluorescente TSA unida a la superficie del antígeno por enlaces covalentes.
Las moléculas de tiramina (T) activadas marcadas con el colorante están altamente enriquecidas en el antígeno diana, lo que permite una amplificación eficiente de la señal fluorescente. Esto permite el marcaje directo del antígeno sin interferencia de anticuerpos, y luego se puede lograr el marcaje multicolor después de múltiples ciclos de tinción 8,9,10 (Figura 1). Aunque esta tecnología produce imágenes fiables y precisas para el estudio de la enfermedad, la creación de una estrategia útil de tinción de inmunohistoquímica fluorescente multiplex (mfIHC) puede llevar mucho tiempo y ser exigente debido a la necesidad de una amplia optimización y diseño. Por lo tanto, este protocolo de panel multiplex se ha optimizado en un tinción IHQ automatizada con un tiempo de tinción más corto que el del protocolo manual. Este enfoque puede ser aplicado directamente y adaptado por cualquier investigador para estudios inmuno-oncológicos en muestras de tejido humano fijadas en formol e incluidas en parafina (FFPE)11. Además, los métodos para la preparación de portaobjetos, la optimización de anticuerpos y el diseño multiplex serán útiles para obtener imágenes robustas que representen interacciones celulares precisas in situ y para acortar el período de optimización para el análisis manual12.
El mfIHC incluye principalmente la adquisición de imágenes y el análisis de datos. En cuanto a la adquisición de imágenes, las muestras teñidas complejas marcadas con varios colores deben detectarse con equipos profesionales de imágenes espectrales para identificar las diversas señales de colores mezclados y obtener imágenes de alta relación señal-ruido sin interferencia de la autofluorescencia tisular. Los equipos actuales para la obtención de imágenes espectrales incluyen principalmente microscopios confocales espectrales y sistemas de obtención de imágenes de tejidos multiespectrales. El sistema de imagen tisular multiespectral es un sistema de imagen profesional diseñado para el análisis cuantitativo de cortes de tejido, y su característica más importante es la adquisición de información espectral de la imagen, que proporciona tanto la estructura morfológica como la información de mapeo óptico de muestras de tejido biológico13,14. Cualquier píxel de la imagen espectral contiene una curva espectral completa, y cada colorante (incluida la autofluorescencia) tiene su espectro característico correspondiente, lo que permite el registro completo y la identificación precisa de señales multietiqueta mezcladas y superpuestas.
En términos de análisis de datos, las muestras marcadas multicolor son extremadamente complejas debido a la estructura morfológica y las células constituyentes de las muestras de tejido. El software ordinario no puede identificar automáticamente diferentes tipos de tejidos. Por lo tanto, el software inteligente de análisis cuantitativo de tejidos se utiliza para el análisis cuantitativo de la expresión de antígenos en regiones específicas 15,16,17,18.
Sobre todo, la tinción de inmunofluorescencia multietiqueta fusionada con la tecnología de imágenes multiespectrales y análisis de patología cuantitativa tiene las ventajas de un gran número de objetivos de detección, tinción efectiva y análisis preciso y, por lo tanto, puede mejorar significativamente la precisión del análisis histomorfológico, revelar la relación espacial entre las proteínas con resolución a nivel celular y ayudar a extraer información más rica y confiable de muestras de secciones de tejido19 (Tabla 1).

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Reagents</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Anti-CD8</td>
			<td>Abcam</td>
			<td>ab237709</td>
			<td>Primary antibody, 1/100, PH9</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Anti-CD68</td>
			<td>Abcam</td>
			<td>ab955</td>
			<td>Primary antibody, 1/300, PH9</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Anti-CK5/6</td>
			<td>Millipore</td>
			<td>MAB1620</td>
			<td>Primary antibody, 1/150, PH9</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Anti-HMGCS1</td>
			<td>GeneTex</td>
			<td>GTX112346</td>
			<td>Primary antibody, 1/300, PH6</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Animal nonimmune serum</td>
			<td>MXB Biotechnologies</td>
			<td>SP KIT-B3</td>
			<td>Antigen blocking</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fluormount-G</td>
			<td>SouthernBiotech</td>
			<td>0100-01</td>
			<td>Anti-fluorescent burst</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Opal PolarisTM 7-Color Manual IHC Kit</td>
			<td>Akoya</td>
			<td>NEL861001KT</td>
			<td>Opal mIHC Staining</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Wash Buffer</td>
			<td>Dako</td>
			<td>K8000/K8002/K8007/K8023</td>
			<td>Washing the tissues slides</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Software</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>HALO</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>intelligent quantitative tissue analysis software, paid software</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>inForm</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>intelligent quantitative tissue analysis software, paid software</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PerkinElmer Vectra</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>multispectral tissue imaging systems, fully automatic scanning of tissue slides.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>QuPath 0.3.2</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>intelligent quantitative tissue analysis software, open source software, used in this experiment.</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

multiplex immunohistochemistry staining for paraffin-embedded lung cancer tissue

El cáncer de pulmón es la principal causa de morbilidad y mortalidad relacionadas con tumores malignos en todo el mundo, y el complejo microambiente tumoral se ha considerado la principal causa de muerte en pacientes con cáncer de pulmón. La complejidad del microambiente tumoral requiere métodos eficaces para comprender las relaciones de célula a célula en los tejidos tumorales. La técnica de inmunohistoquímica múltiple (mIHC) se ha convertido en una herramienta clave para inferir la relación entre la expresión de proteínas aguas arriba y aguas abajo de las vías de señalización en los tejidos tumorales y desarrollar diagnósticos clínicos y planes de tratamiento. mIHC es un método de tinción de inmunofluorescencia multietiqueta basado en la tecnología de amplificación de señal de tiramina (TSA), que puede detectar simultáneamente múltiples moléculas diana en la misma muestra de sección de tejido para lograr diferentes análisis de coexpresión y colocalización de proteínas. En este protocolo experimental, secciones de tejido incluido en parafina de carcinoma escamoso de pulmón de origen clínico se sometieron a tinción inmunohistoquímica múltiple. Mediante la optimización del protocolo experimental, se logró la tinción inmunohistoquímica multiplex de células diana y proteínas marcadas, resolviendo el problema de la autofluorescencia y la diafonía de canales en los tejidos pulmonares. Además, la tinción inmunohistoquímica multiplex se utiliza ampliamente en la validación experimental de la secuenciación de alto rendimiento relacionada con tumores, incluida la secuenciación de una sola célula, la proteómica y la secuenciación del espacio tisular, lo que proporciona resultados intuitivos y visuales de validación de patologías.

Tyramine signal amplification (TSA), which has a history of more than 20 years, is a class of assay techniques that use horseradish peroxidase (HRP) for high-density in situ labeling of target antigens and is widely applied in enzyme-linked immunosorbent assays (ELISAs), in situ hybridization (ISH), immunohistochemistry (IHC), and other techniques for the detection of biological antigens, substantially improving the sensitivity of the detected signal1. Opal polychromatic staining based on TSA technology has been recently developed and widely used in several studies2,3,4,5. Traditional immunofluorescence (IF) staining provides researchers with an easy tool for the detection and comparison of the distribution of proteins in the cells and tissues of various model organisms. It is based on antibody-/antigen-specific binding and includes direct and indirect approaches6. Direct immunostaining involves the use of a fluorophore-conjugated primary antibody against the antigen of interest, which enables direct fluorescent detection using a fluorescence microscope. The indirect immunostaining approach involves the application of a fluorophore-conjugated secondary antibody against the unconjugated primary antibody6,7.
Traditional, single-label, immunofluorescence staining methods can stain only one, two, or in some cases, three antigens in tissues, which is a major limitation in mining the rich information contained in tissue sections. The interpretation of quantitative results often depends on visual observation and accurate quantification by imaging software, such as ImageJ. There are technical limitations, such as antibody species restriction, weak fluorescent label signals, and fluorescent dye color overlap (Table 1). The Opal multiplex IHC (mIHC) technique is based on TSA derivation, which allows multiplex staining and differential labeling of more than 7-9 antigens on the same tissue section, with no restriction on the origin of the primary antibody, but requires high specificity of the corresponding antibody against the antigen. The staining procedure is similar to that of normal immunofluorescence staining, except for two differences: each round of staining involves the use of only one antibody and an antibody elution step is added. Antibodies bound to the antigen by noncovalent bonds can be removed by microwave elution, but the TSA fluorescent signal bound to the surface of the antigen by covalent bonds is retained.
Activated tyramine (T) molecules labeled with the dye are highly enriched at the target antigen, allowing efficient amplification of the fluorescent signal. This allows direct labeling of the antigen without antibody interference, and then multicolor labeling can be achieved after multiple staining cycles8,9,10 (Figure 1). Although this technology produces reliable and accurate images for the study of disease, the creation of a useful multiplex fluorescent immunohistochemistry (mfIHC) staining strategy can be time-consuming and exacting due to the need for extensive optimization and design. Therefore, this multiplex panel protocol has been optimized in an automated IHC stainer with a shorter staining time than that of the manual protocol. This approach can be directly applied and adapted by any researcher for immuno-oncology studies on human formalin-fixed and paraffin-embedded (FFPE) tissue samples11. Moreover, the methods for slide preparation, antibody optimization, and multiplex design will be helpful in obtaining robust images that represent accurate cellular interactions in situ and to shorten the optimization period for manual analysis12.
The mfIHC mainly includes image acquisition and data analysis. In terms of image acquisition, multicolor-labeled complex-stained samples need to be detected with professional spectral imaging equipment to identify the various mixed color signals and obtain high signal-to-noise images without interference from tissue autofluorescence. Current equipment for spectral imaging mainly includes spectral confocal microscopes and multispectral tissue imaging systems. The multispectral tissue imaging system is a professional imaging system designed for the quantitative analysis of tissue sections, and its most important feature is the acquisition of image spectral information, which provides both morphological structure and optical mapping information of biological tissue samples13,14. Any pixel in the spectral image contains a complete spectral curve, and each dye (including autofluorescence) has its corresponding characteristic spectrum, which enables the complete recording and accurate identification of mixed and overlapping multilabel signals.
In terms of data analysis, multicolor-labeled samples are extremely complex due to the morphological structure and constituent cells of the tissue samples. Ordinary software cannot automatically identify different tissue types. Hence, intelligent quantitative tissue analysis software is used for quantitative analysis of antigen expression in specific regions15,16,17,18.
Above all, multilabel immunofluorescence staining fused with multispectral imaging and quantitative pathology analysis technology has the advantages of a large number of detection targets, effective staining, and accurate analysis, and it can therefore significantly improve the accuracy of histomorphological analysis, reveal the spatial relationship between proteins with cellular-level resolution, and help to mine richer and more reliable information from tissue section samples19 (Table 1).

Autor destacado: Mejora de la localización de fluorescencia multicolor en una muestra de carcinoma de pulmón

Tinción inmunohistoquímica multiplex para tejido de cáncer de pulmón incluido en parafina

Our research focused on optimizing the mIHC protocol on paraffin section obtained from clinic sources. We aimed to effectively address autofluorescence and autofluorescence channel crosstalk issues in lung tissue. The current experimental challenges we are facing involve addressing the issues of autofluorescence and channel crosstalk in lung tissue, whereby achieving successful multicolor fluorescence localization they need for labeled target cells and proteins.Our highly efficient multiple antigen in situ labeling method, which requires less than three hours per antibody, seamlessly integrates a multispectral imaging system and a specialized pathology software. This optimized mIHC protocol is easily adaptable for use in other research laboratories.

Optimizamos el esquema de emparejamiento del anticuerpo primario CD8 y los fluoróforos. Ambos conjuntos de resultados de fluorescencia correspondieron exactamente a las mismas condiciones de incubación de anticuerpos en el grupo experimental, excepto por el cambio en el fluoróforo emparejado con anticuerpos. Como se muestra en la Figura 2, hubo una diferencia significativa en la coincidencia de canales de las células T CD8+ con el fluoróforo 480 y el fluoróforo 690. El canal con fluor?...

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Este protocolo experimental describe y optimiza un método de tinción de inmunohistoquímica múltiple (IHQ), principalmente mediante la optimización de las condiciones de incubación de anticuerpos de un solo canal y el ajuste de la configuración de anticuerpos y canales para resolver los problemas de autofluorescencia y diafonía de canales en tejidos de cáncer de pulmón de origen clínico.

Lung cancer is the leading cause of malignant tumor-related morbidity and mortality all over the world, and the complex tumor microenvironment has been ...

Nuestra investigación se centró en la optimización del protocolo de mIHQ en la sección de parafina obtenida de fuentes clínicas. Nuestro objetivo era abordar de manera efectiva los problemas de autofluorescencia y diafonía de canales de autofluorescencia en el tejido pulmonar. Los desafíos experimentales actuales a los que nos enfrentamos implican abordar los problemas de la autofluorescencia y la diafonía de canales en el tejido pulmonar, logrando con éxito la localización de fluorescencia multicolor que necesitan para las células diana y las proteínas marcadas.Nuestro método de marcaje in situ de antígenos múltiples altamente eficiente, que requiere menos de tres horas por anticuerpo, integra a la perfección un sistema de imágenes multiespectrales y un software de patología especializado. Este protocolo optimizado de mIHC es fácilmente adaptable para su uso en otros laboratorios de investigación.

multiplex-immunohistochemistry-staining-for-paraffin-embedded-lung

Research

JoVE Journal

Cancer Research

Multiplex Immunohistochemistry Staining for Paraffin-embedded Lung Cancer Tissue

1.2K vistas.  Sichuan University. Nuestra investigación se centró en la optimización del protocolo de mIHQ en la sección de parafina obtenida de fuentes clínicas. Nuestro objetivo era abordar de manera efectiva los problemas de autofluorescencia y diafonía de canales de autofluorescencia en el tejido pulmonar. Los desafíos experimentales actuales a los que nos enfrentamos implican abordar los problemas de la autofluorescencia y la diafonía de canales en el tejido pulmonar, logrando con éxito la localización de fluor...

Video: Autor destacado: Mejora de la localización de fluorescencia multicolor en una muestra de carcinoma de pulmón

Lung cancer is the leading cause of malignant tumor-related morbidity and mortality all over the world, and the complex tumor microenvironment has been considered the leading cause of death in lung cancer patients. The complexity of the tumor microenvironment requires effective methods to understand cell-to-cell relationships in tumor tissues. The multiplex immunohistochemistry (mIHC) technique has become a key tool for inferring the relationship between the expression of proteins upstream and downstream of signaling pathways in tumor tissues and developing clinical diagnoses and treatment plans. mIHC is a multi-label immunofluorescence staining method based on Tyramine Signal Amplification (TSA) technology, which can simultaneously detect multiple target molecules on the same tissue section sample to achieve different protein co-expression and co-localization analysis. In this experimental protocol, paraffin-embedded tissue sections of lung squamous carcinoma of clinical origin were subjected to multiplex immunohistochemical staining. By optimizing the experimental protocol, multiplex immunohistochemical staining of labeled target cells and proteins was achieved, solving the problem of autofluorescence and channel crosstalk in lung tissues. In addition, multiplex immunohistochemical staining is widely used in the experimental validation of tumor-related, high-throughput sequencing, including single-cell sequencing, proteomics, and tissue space sequencing, providing intuitive and visual pathology validation results.

This experimental protocol describes and optimizes a multiplex immunohistochemistry (IHC) staining method, mainly by optimizing single-channel antibody incubation conditions and adjusting the settings of antibodies and channels to solve the problems of autofluorescence and channel crosstalk in lung cancer tissues of clinical origin.

Investigación

Investigación sobre el cáncer

Optimizing Multiplex Immunohistochemistry (mIHC) Staining for Lung Cancer Tissue Samples to Address Autofluorescence Issues

To begin, obtain previously prepared formula and fixed and paraffin embedded lung cancer tissue sample slide. Incubate it at 65 degrees Celsius for five minutes. Perform dehydration by immersing the slide in xylene, followed by ethanol solutions of decreasing concentrations.Then immerse the slides in sterilized water three times for one minute each. For antigen retrieval, place the slide in a staining and repair box. Fill it with immunohistochemical antigen repair buffer working solution of pH six or nine.Cover the box with a lid, and heat it in a microwave oven for eight minutes at 100%power. Then cool the slide to room temperature. Cover the tissue with a blocking solution, and then incubate in a humidified chamber at room temperature for 10 minutes.After removing the blocking solution, cover the slide with the primary antibody working solution, and place it in a humidified chamber. Then incubate this chamber for one hour at 37 degrees Celsius. Next, wash the slide with wash buffer working solution for two minutes.Add polymer horseradish peroxidase directly dropwise onto the slide, and incubate it for 15 minutes at room temperature. After washing the slide, add fluorophore working solution directly dropwise onto the slide, and incubate it for 10 minutes at room temperature. Once the slide is washed, give microwave treatment as demonstrated previously.When the slide is cooled to room temperature, wash it three times with double distilled water for one minute each. Next, dip the slide in the wash buffer working solution for two minutes, and perform antibody incubation, horseradish peroxidase, and fluorophore addition as demonstrated. For cell nuclear staining, cover the slide with DAPI working solution and incubate it in a humidified chamber for five minutes at room temperature.Then wash the slides with double distilled water three times, one minute each. Remove water droplets from the slide. Add 10 to 20 microliters of anti-fluorescence quencher to the slide, and seal it with a microscope cover glass.

Optimización de la tinción de inmunohistoquímica múltiple (mIHC) para muestras de tejido de cáncer de pulmón para abordar problemas de autofluorescencia

Analyzing Fluorescence in Lung Cancer Tissue Samples Stained with Optimized Multiplex Immunohistochemistry (mIHC) Technique

To begin, obtain previously prepared stained lung cancer tissue sample slides. For automatic scanning of the stained slides, manually set the exposure time and scanning program for each fluorescence channel. Drag the multicolor fluorescence image file obtained from the original scan into the software and set the image type to fluorescence.Click the brightness and contrast button and check the channels on the panel. Click outside and then on the channel to select the fluorescence channel of interest. Drag the minimum display and maximum display to adjust the brightness and contrast of each channel.Once the view to be saved is determined, click on show slide overview and show cursor location to remove these two contents and keep the scale bar. Click file followed by export snapshot and current viewer content To export a PNG file. The non-small cell lung squamous carcinoma tissues showed that macrophages and CD eight positive T-cells significantly infiltrated around and within carcinoma foci.HMGCS1 protein exhibited widespread expression in squamous carcinoma cell plasma.