IntelliSleepScorer, un paquete de software con una interfaz gráfica de usuario para la puntuación automatizada de la etapa del sueño de ratones

Desarrollamos un software de interfaz gráfica de usuario fácil de usar en tele puntuación del sueño para puntuar automáticamente las etapas del sueño en ratones. Nuestro objetivo es abordar el desafío de la puntuación manual que requiere mucha mano de obra y mejorar la accesibilidad para los investigadores sin mucha experiencia en codificación. En telesueño, la puntuación alcanza una precisión del 95,2% en la puntuación automática de las etapas del sueño en ratones y demostró su generalización en otros dos conjuntos de datos independientes disponibles públicamente.

La GUI incluye una función de corrección manual, que permite a los usuarios modificar la etapa de sueño puntuada para cualquier época. También proporcionamos visualizaciones de valor ASAP para explicar las decisiones de puntuación del modelo. Los usuarios experimentados también pueden ajustar nuestro modelo de pre-árbol con sus propios datos, ya que todos los archivos necesarios y los scripts de extracción están disponibles en GitHub.

Nuestra investigación se centra en traducir la genética emergente en biología y permitir terapias de próxima generación para tratar enfermedades psiquiátricas. Hemos estado trabajando en genes cuya disfunción se ha implicado en estas enfermedades utilizando enfoques moleculares, celulares y electrofisiológicos, tanto in vitro como en animales.