IntelliSleepScorer, un progiciel doté d’une interface utilisateur graphique pour l’évaluation automatisée des phases de sommeil chez la souris

Nous avons développé un logiciel d’interface graphique facile à utiliser pour évaluer automatiquement les phases de sommeil chez les souris. Notre objectif est de relever le défi de la notation manuelle à forte intensité de main-d’œuvre et d’améliorer l’accessibilité pour les chercheurs sans grande expérience du codage. En télé-sommeil, le score atteint une précision de 95,2 % dans l’évaluation automatique des phases de sommeil chez la souris et a prouvé la généralisabilité sur deux autres ensembles de données indépendants accessibles au public.

L’interface graphique comprend une fonction de correction manuelle, permettant aux utilisateurs de modifier la phase de sommeil notée pour n’importe quelle époque. Nous fournissons également des visualisations de valeur ASAP pour expliquer les décisions de notation du modèle. Les utilisateurs expérimentés peuvent également affiner notre modèle de pré-arborescence avec leurs propres données, car tous les fichiers et scripts d’extraction nécessaires sont disponibles sur GitHub.

Nos recherches visent à transposer la génétique émergente en biologie et à mettre en place des thérapies de nouvelle génération pour traiter les maladies psychiatriques. Nous avons travaillé sur des gènes dont le dysfonctionnement a été impliqué dans ces maladies en utilisant des approches moléculaires, cellulaires et électrophysiologiques, à la fois in vitro et chez l’animal.