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Method Article
Le protocole suivant décrit le processus de dissection pancréatique pour imagerie en coupes virtuelles, et la quantification ultérieure de tous les GFP-taggés cellules bêta dans le pancréas entier.
Traçage des changements de populations de cellules spécifiques dans la santé et la maladie est un objectif important de la recherche biomédicale. Le processus de surveillance du pancréas des cellules bêta des îlots prolifération et la croissance est particulièrement difficile. Nous avons développé une méthode pour capturer la distribution de cellules bêta dans le pancréas intact de souris transgéniques avec fluorescence taggés bêta-cellules avec une macro écrite pour ImageJ (rsb.info.nih.gov / ij /). Après dissection du pancréas et de compensation des tissus, le pancréas entier est capturé comme une tranche virtuel, après quoi le GFP-taggés bêta-cellules sont examinées. L'analyse inclut la quantification du total des cellules bêta des îlots nombre domaine, et la distribution granulométrique en référence à des paramètres spécifiques et des emplacements pour chaque îlot et des petits amas de cellules bêta. La distribution complète des îlots peuvent être tracées en trois dimensions, et les informations provenant de la distribution de la taille et la forme de chaque îlot permet une comparaison quantitative et qualitative des changements dans l'ensemble des cellules bêta région à un coup d'œil.
Partie 1: Préparation des spécimens
Partie 2: Imagerie et quantification de la zone des cellules bêta dans le pancréas intacts
Figure 1A analyse de l'image virtuelle Tranche de toute la distribution des cellules bêta dans le pancréas adulte une intacts
Images de panneaux individuels optiques d'un pancréas de souris mâles à 10 semaines prises en vertu d'un objectif 2x. Les images incluent la distribution complète des îlots, même de petits amas de cellules bêta (<10 cellules).
Figure 1B analyse virtuelle Slice image de toute la distribution des cellules bêta dans le pancréas adulte une intacts
Une tranche unique virtuel avec le pancréas dorsal sur le droit et le pancréas ventral sur la gauche. La barre d'échelle est de 5 mm.
Les résultats représentatifs
Compétent la préparation d'un pancréas pour l'imagerie virtuelle Slice permettra une quantification efficace de toutes les GFP-taggés cellules bêta du pancréas dans un ensemble comme une image virtuelle Trancher avec des îlots clairs et distincts. Le succès d'imagerie virtuelle Slice du pancréas entier in situ fournit les moyens d'examiner et de quantifier les cellules bêta, non seulement l'îlot espace individuel et au total, mais aussi la distribution de taille des îlots, des analyses régionales, et les schémas de croissance aussi bien. Alors que ImageJ maintient la capacité de détecter toutes les cellules bêta-simultanément dans l'analyse des images virtuelles Slice, il peut également contrôler les cellules bêta afin de quantifier en limitant l'analyse aux tailles des îlots de certains (par zone ou un diamètre), ou par emplacement. Une analyse standard exclut par exemple les artefacts, les débris de moins d'un bêta-cellule unique (<170 um 2) et enregistre la surface, le périmètre (la distance entourant une zone), la circularité (un degré de rondeur, où 1,0 représente un cercle parfait), et le diamètre de Féret (la plus longue distance dans une zone) pour chaque îlot détectée. Trancher l'analyse virtuelle est capable d'améliorer des images virtuelles en employant tranche de la segmentation des bassins versants, ce qui distingue et sépare les îlots qui se chevauchent en îlots individuels en fonction de leurs formes. L'analyse produit en outre une série d'images détaillées, ce qui comprend des masques de l'image sous les deux de basse intensité et haute (Fig. 1C), un aperçu de tous les îlots présumés, qui sont chacun individuellement numérotés et répertoriés dans un tableau d'information correspondant (Fig. . 1D), et l'image virtuelle tranche d'origine (Fig. 1B). Notez que le biais potentiel technique lors du choix des valeurs de seuil peuvent fausser la quantification des îlots de lumière, y compris par les grandes structures environnantes gratuite, ou en réduisant le nombre total d'îlots, les signaux faibles en particulier à partir de petites particules.
Figure 1C analyse de l'image virtuelle Tranche de toute la distribution des cellules bêta dans le pancréas adulte une intacts
Un masque des particules fluorescentes dans la tranche virtuelle. Codes couleur: [1] bleu: faible intensité de fluorescence [2]; vert: la fluorescence d'intensité moyenne, et [3] rouge: la fluorescence de haute intensité.
Figure 1D l'analyse d'image virtuelle Tranche de toute la distribution des cellules bêta dans le pancréas adulte une intacts
Quantification des îlots individuels / groupes de cellules bêta. Notez que chaque îlot (y compris de petits amas de cellules bêta) est numéroté, avec ses informations détaillées dans un tableau correspondant. Quatre paramètres ont été pris pour chaque structure: (1) Zone; (2) du périmètre (3); circularité: un degré de rondeur, où le nombre 1.0 représente un cercle parfait, et (4) de diamètre Féret: la plus longue distance dans une zone. Notez que # 706 affiche la résolution des analyses d'une superficie de seulement quelques cellules bêta. Segmentation du bassin versant détecte groupes d'îlots adjacents, tels que celui illustré, et distingue de façon appropriée les îlots distincts que (îlots 1554, 1555 et 1556).
Figure 1E analyse de l'image virtuelle Tranche de toute la distribution des cellules bêta dans le pancréas adulte une intacts
3-dimensionnel parcelle de l'analyse tranches virtuelles, avec des axes de surface, périmètre, et le diamètre de Féret. Chaque point représente un îlot.
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L'analyse des images virtuelles Slice d'îlots et de cellules bêta dans le pancréas grappes intactes offre une vue à grande échelle de toute la distribution des îlots. Évolution et les changements dans la distribution de l'îlot au total au cours du temps peuvent ainsi être étudiées et comparées. Un tel exemple est montré dans notre analyse de la formation des îlots pancréatiques (1). Une analyse complète de pancréas des souris néonatales à des moments différents (P1-P21) a démontré que l...
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L'étude est soutenue par l'US Public Health Service Grant DK-081527, 072473 et DK-DK-20595 à l'Université de Chicago recherche sur le diabète et le Centre de Formation (Animal Core Model), et un don de la Fondation de la Famille Kovler.
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Name | Company | Catalog Number | Comments |
Forceps | Miltex Inc. | ||
Scissors | F.S.T. | 14001-13 | 01n2 |
Scissors | F.S.T. | 14072-10 | 02s5 |
Large glass slide | Electron Microscopy Sciences | 71862-01 | 75x51x1.2mm |
Large cover glass | Ted Pella, Inc. | 260462 | 50x75mm |
Glass Slide | Fisher Scientific | 12-550-15 | 25x75x1.0mm |
Cover glass | Fisher Scientific | 12-458-5M | 75x25mm |
Cover glass | Erie Scientific | 25mm circle | |
Fluorescent microscope | Olympus Corporation | ||
Dissection microscope | Olympus Corporation | ||
Stereo Investigator | MBF Bioscience | ||
MIP-GFP mice | Jackson Laboratory |
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