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Method Article
Il protocollo seguente delinea il processo di dissezione del pancreas per l'imaging fetta virtuale, e la successiva quantificazione di tutte le GFP-tagged beta-cellule del pancreas intero.
Tracing cambiamenti di popolazioni di cellule specifiche in materia di salute e malattia è un obiettivo importante della ricerca biomedica. Il processo di monitoraggio pancreatiche beta-proliferazione delle cellule e la crescita delle isole è particolarmente impegnativo. Abbiamo sviluppato un metodo per catturare la distribuzione delle beta-cellule del pancreas intatto di topi transgenici con fluorescenza tag beta-cellule con una macro scritta per ImageJ (rsb.info.nih.gov / ij /). In seguito a dissezione del pancreas e di compensazione dei tessuti, il pancreas intero è catturata come una fetta virtuale, dopo di che la GFP-tagged beta-cellule sono esaminati. L'analisi include la quantificazione del totale delle cellule beta zona, il numero di isole pancreatiche e distribuzione delle dimensioni con riferimento a parametri specifici e le posizioni per ogni isola e per piccoli gruppi di beta-cellule. L'intera distribuzione delle isole possono essere tracciati in tre dimensioni, e le informazioni dalla distribuzione delle dimensioni e della forma di ogni isolotto consente un confronto quantitativo e qualitativo dei cambiamenti nella complessiva delle cellule beta zona a colpo d'occhio.
Parte 1: Preparazione dei campioni
Parte 2: immagini e quantificare le cellule beta nel pancreas zona intatta
Figura 1A virtuale immagine Fetta di analisi l'intera distribuzione delle beta-cellule in un pancreas adulto intatto
Immagini dei singoli pannelli ottico di un pancreas topo maschio a 10-settimana presa con un obiettivo 2x. Le immagini comprendono l'intera distribuzione di isolotti, anche piccoli gruppi di beta-cellule (<10 cellule).
Figura 1B virtuale immagine Fetta di analisi l'intera distribuzione delle beta-cellule in un pancreas adulto intatto
Una fetta unificato virtuale con il pancreas dorsale a destra e il pancreas ventrale a sinistra. Barra di scala è 5 mm.
Rappresentante Risultati
Preparazione di un pancreas avanzato per l'imaging fetta virtuale consentirà di quantificare efficace di tutte GFP-tagged beta-cellule del pancreas in un intero come immagine fetta virtuale con isolotti chiare e distinte. Successo di imaging fetta virtuale del pancreas intero in situ fornisce i mezzi per esaminare e quantificare le beta-cellule, non solo zona isolotto individuale e totale, ma anche distribuzione delle dimensioni delle isole, l'analisi regionale, e modelli di crescita pure. Mentre ImageJ mantiene la capacità di rilevare tutti i beta-cellule contemporaneamente l'analisi delle immagini Slice virtuali, può anche controllare quali beta-cellule per quantificare limitando l'analisi alle dimensioni isolotto certo (per area o diametro), o per posizione. Una analisi standard esclude per esempio gli artefatti, detriti più piccoli di un singolo beta-cellule (<170 micron 2) e registra l'area, il perimetro (la distanza che circonda una zona), la circolarità (un grado di rotondità, dove 1.0 rappresenta un cerchio perfetto), e del diametro Feret (la distanza più lunga in uno spazio) per ogni isolotto rilevato. Analisi fetta virtuale è in grado di migliorare le immagini fetta virtuale utilizzando segmentazione Watershed, che distingue e separa isolotti sovrapposizione in isolotti individuali in base al loro forme. L'analisi produce inoltre una serie di immagini dettagliate; questo include le maschere delle immagini sotto le due intensità bassa e alta (Fig. 1C), uno schema di tutte le isolette presunte, che sono singolarmente numerati ed elencati in una tabella di informazioni corrispondenti (Fig. . 1D), e l'immagine originale fetta virtuale (Fig. 1B). Si noti che polarizzazione potenziale tecnico per la scelta dei valori di soglia possono inclinare la quantificazione delle isole includendo luce circostante gratuita strutture di grandi dimensioni, o riducendo il numero totale di isole, i segnali deboli soprattutto da piccole particelle.
Figura 1C virtuale immagine Fetta di analisi l'intera distribuzione delle beta-cellule in un pancreas adulto intatto
Una maschera delle particelle fluorescenti nella fetta virtuale. Codici colori: [1] blu: fluorescenza a bassa intensità; [2] verde: fluorescenza intensità intermedia; e [3] rosso: a fluorescenza ad alta intensità.
Figura 1D virtuale Fetta di analisi delle immagini l'intera distribuzione delle beta-cellule in un pancreas adulto intatto
Quantificazione degli isolotti singoli / gruppi di beta-cellule. Si noti che ogni isolotto (tra cui piccoli gruppi di cellule beta) è numerata, con le sue informazioni in un grafico corrispondente. Quattro parametri sono stati presi per ogni struttura: (1) zona; (2) perimetro, (3) circolarità: un grado di rotondità, dove il numero 1.0 rappresenta un cerchio perfetto, e (4) Feret di diametro: la distanza più lunga all'interno di un'area. Si noti che # 706 visualizza la risoluzione di analisi con una superficie di poche cellule beta. Segmentazione spartiacque rileva gruppi di isolotti adiacenti, come quella mostrata, e si distingue opportunamente come isolotti distinti (isolotti 1554, 1555, e 1556).
Figura 1E virtuale immagine Fetta di analisi l'intera distribuzione delle beta-cellule in un pancreas adulto intatto
3-dimensionale trama dell'analisi fetta virtuale, con assi di area, perimetro, e il diametro di Feret. Ogni punto rappresenta un isolotto.
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L'analisi delle immagini fetta virtuale di isole e cellule beta nel pancreas cluster intatto offre una grande vista l'intera distribuzione delle isolette. Sviluppi e cambiamenti nella distribuzione delle isole totale nel corso del tempo può quindi essere studiati e confrontati. Un esempio è dimostrato nella nostra analisi della formazione di isole pancreatiche (1). Un analisi completa delle neonatale pancreas topi in vari momenti (P1-P21) ha dimostrato che le isole sono formate da fissione. Mentre il beta-prol...
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Lo studio è supportato da US Public Health Service Concessione DK-081527, 072473 e DK-DK-20595 per l'Università di Chicago Diabetes Centro di Ricerca e Formazione (Animal Models core), e un dono da parte della Fondazione Famiglia Kovler.
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Name | Company | Catalog Number | Comments |
Forceps | Miltex Inc. | ||
Scissors | F.S.T. | 14001-13 | 01n2 |
Scissors | F.S.T. | 14072-10 | 02s5 |
Large glass slide | Electron Microscopy Sciences | 71862-01 | 75x51x1.2mm |
Large cover glass | Ted Pella, Inc. | 260462 | 50x75mm |
Glass Slide | Fisher Scientific | 12-550-15 | 25x75x1.0mm |
Cover glass | Fisher Scientific | 12-458-5M | 75x25mm |
Cover glass | Erie Scientific | 25mm circle | |
Fluorescent microscope | Olympus Corporation | ||
Dissection microscope | Olympus Corporation | ||
Stereo Investigator | MBF Bioscience | ||
MIP-GFP mice | Jackson Laboratory |
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