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Method Article
다음 프로토콜은 가상 슬라이스 이미지에 대한 췌장 해부 과정을 설명하고, 전체 췌장에있는 모든 GFP - 태그 베타 세포의 후속 부량.
건강과 질병의 특정 세포 인구의 변화를 추적하는 것은 생명 의학 연구의 중요한 목표입니다. 모니터링 췌장 베타 세포 증식과 아일릿 성장의 과정은 특히 도전이다. 우리는 ImageJ (rsb.info.nih.gov / 엘제이 /)에 대해 작성된 매크로와 형광 - 태그 베타 세포와 유전자 변형 생쥐의 췌장 손상에서 베타 세포의 분포를 캡처하는 방법을 개발했습니다. 췌장 해부 및 조직 삭제에 따라, 전체 췌장은 어떤 후 GFP - 태그 베타 세포 검사 있으며, 가상의 슬라이스로 캡처합니다. 분석 총 베타 세포 지역 아일릿 번호 및 각 아일릿과 베타 세포의 작은 클러스터에 대한 특정 매개 변수와 위치에 대한 참조와 크기 분포의 부량을 포함합니다. 아일 레츠의 전체 분포는 3 차원에 역모를, 각 아일릿의 크기와 모양에 대한 배포의 정보를 한 눈에 전체 베타 세포 분야에서 변화의 양적 및 질적 비교를 허용하실 수 있습니다.
1 부 : 표본의 준비
2 부 : 이미징 및 손상 췌장에있는 베타 세포 영역을 quantifying
손상 성인 췌장의 베타 세포의 전체 분포의 그림 1A 가상 슬라이스 이미지 분석
10 주에서 남성 마우스 췌장의 개별 광학 패널의 이미지 2X 목적에 따라 촬영. 이미지 아일 레츠의 전체 분포, 베타 세포 (<10 셀)의도 작은 클러스터를 포함합니다.
손상 성인 췌장의 베타 세포의 전체 분포의 그림 1B 가상 슬라이스 이미지 분석
오른쪽에있는 등 지느러미 췌장과 왼쪽에있는 복부 췌장과 통일된 가상 조각. 스케일 바 5mm이다.
대표 결과
가상 슬라이스 이미지에 대한 췌장의 능숙 준비의 모든 효과에 대한 부량 수 GFP - 태그를 명확하고 뚜렷한 아일 레츠와 가상 슬라이스 이미지로 전체 췌장의 베타 세포를. 현장에있는 전체 췌장의 성공적인 가상 슬라이스 영상뿐만 아니라 개인과 전체 아일릿 지역뿐만 아니라 아일릿 크기 분포, 지역 분석, 성장 패턴뿐만 아니라 검사와 베타 세포를 계량하는 방법을 제공합니다. ImageJ는 가상 슬라이스 이미지의 분석에서 동시에 모든 베타 세포를 감지하는 능력을 유지하는 동안, 또한 특정 아일릿 크기 (면적 또는 직경에 의해)로 분석을 제한, 또는 위치에 의해 계량하는 베타 세포를 제어할 수 있습니다. 표준 분석 유물 예를 들어, 하나의 베타 세포 (<170 μm의 2) 및 기록 영역, 경계 (주변 거리), 순환성 (1.0 완벽한 원형을 나타냅니다 진원도의 정도)보다 작은 파편을 제외 각 아일릿에 대한 Feret의 직경 (지역 가장 긴 거리) 발견했습니다. 가상 슬라이스 분석들은 모양에 따라 개별 아일 레츠에 중복 아일 레츠를 구분하고 구분 워터셰트 세그먼트를 채용하여 가상 슬라이스 이미지를 향상시킬 수 있습니다. 분석 더욱 자세한 이미지의 일련의 생산, 이것은 각각 개별적으로 번호와 해당 정보 테이블에 나열된 (그림 아르 낮은 높은 강도 (그림 1C) 모두에서 이미지의 마스크, 모든 추정 아일 레츠의 개요를 포함 . 1D), 그리고 원래 가상 슬라이스 이미지 (그림의 1B). 스큐 큰 구조를 둘러싼 무료의 빛을 포함하여 아일 레츠의 부량하거나, 아일 레츠, 작은 입자 특히 희미한 신호의 총 수를 줄임으로써 임계 값을 선택하면 그 잠재적인 기술 편견을합니다.
손상 성인 췌장의 베타 세포의 전체 분포의 그림 1C 가상 슬라이스 이미지 분석
가상 슬라이스의 형광 입자의 마스크. 색상 코드 : [1] 파란색 : 낮은 강도의 형광, [2] 녹색 : 중간 강도의 형광 및 [3] 빨간 : 높은 강도의 형광.
손상 성인 췌장의 베타 세포의 전체 분포의 1D 가상 슬라이스 이미지 분석을 그림
개인 아일 레츠 / 베타 - 세포 클러스터의 부량. 각 아일릿이 (베타 - 세포의 작은 클러스터를 포함) 해당 차트에 대한 자세한 정보는, 번호입니다. (3) 순환성 (2) 경계 (1) 면적 : 네 개의 매개 변수는 각 구조에 찍은 숫자 1.0는 완벽한 원형을 나타냅니다 진원도의 정도, 그리고 (4) Feret의 직경 : 지역 가장 긴 거리. # 706은 몇 베타 세포의 면적 분석 해상도를 표시합니다. 워터셰트 세분화는 그림과 같이 인접 아일 레츠 그룹을 감지하고 적절하게 독특한 아일 레츠 (아일 레츠 1554, 1555 및 1556)로 그들을 구별.
손상 성인 췌장의 베타 세포의 전체 분포의 그림 1E 가상 슬라이스 이미지 분석
면적, 둘레, 그리고 Feret의 직경 축과 가상 슬라이스 분석 3 차원 플롯. 각 점은 아일릿을 나타냅니다.
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손상 췌장에서 아일 레츠와 베타 세포 클러스터의 가상 슬라이스 이미지의 분석 아일 레츠의 전체 분포의 대규모보기를 제공합니다. 개발 및 시간이 지남에 따라 전체 아일릿 분포의 변화에 따라서 공부하고 비교할 수 있습니다. 이러한 예제는 췌장 아일릿 형성 (1) 우리의 분석에 증명됩니다. 여러 시간 지점 (P1 - P21)에서 신생아 쥐 pancreata의 포괄적인 분석 아일 레츠는 분열에 의해 형성되는...
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연구는에서 지원하는 미국 보건 서비스 그랜트 DK - 081527, DK - 072473 시카고 당뇨병 연구 및 교육 센터 (동물 모델 코어) 대학 및 Kovler 가족 재단에서 선물 DK - 20595.
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Name | Company | Catalog Number | Comments |
Forceps | Miltex Inc. | ||
Scissors | F.S.T. | 14001-13 | 01n2 |
Scissors | F.S.T. | 14072-10 | 02s5 |
Large glass slide | Electron Microscopy Sciences | 71862-01 | 75x51x1.2mm |
Large cover glass | Ted Pella, Inc. | 260462 | 50x75mm |
Glass Slide | Fisher Scientific | 12-550-15 | 25x75x1.0mm |
Cover glass | Fisher Scientific | 12-458-5M | 75x25mm |
Cover glass | Erie Scientific | 25mm circle | |
Fluorescent microscope | Olympus Corporation | ||
Dissection microscope | Olympus Corporation | ||
Stereo Investigator | MBF Bioscience | ||
MIP-GFP mice | Jackson Laboratory |
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