Comparaison de l'analyse bibliométrique à l'aide de bases de données PubMed, Scopus et Web of Science

Résumé

Les bases de données littéraires sont couramment utilisées pour évaluer les publications dans un sujet, une discipline, un pays ou une région du monde, une pratique connue sous le nom d'analyse bibliométrique. Le protocole actuel détaille comment utiliser les bases de données PubMed, Scopus et Web of Science pour effectuer une analyse bibliométrique.

Résumé

Les bases de données littéraires(c.-à-d.PubMed, Scopus et Web of Science) diffèrent en termes de couverture, de concentration et de l'outil qu'elles fournissent. PubMed se concentre principalement sur les sciences de la vie et les disciplines biomédicales, tandis que Scopus et Web of Science sont multidisciplinaires. Le protocole décrit dans la présente étude a été utilisé pour rechercher des publications d'auteurs jordaniens dans les années 2013-2017. Dans ce protocole, la façon d'utiliser chaque base de données pour effectuer ce type de recherche est expliquée en détail. Une recherche Scopus a donné lieu au plus grand nombre de documents (11 444 documents), suivi d'une recherche sur le Web des sciences (10 943 documents). PubMed a obtenu un plus petit nombre de documents en raison de sa portée et de sa couverture plus restreintes (4 363 documents). Les résultats montrent également une tendance chaque année : (1) le nombre de publications, (2) les disciplines qui ont le plus de publications, (3) les pays de collaboration et (4) le nombre de publications en libre accès. En revanche, PubMed dispose d'un service sophistiqué d'optimisation des mots clés(c.-à-d., Medical Subject Heading, ou MeSH), tandis que Scopus et Web of Science fournissent des outils d'analyse de recherche qui peuvent produire des chiffres représentatifs. Enfin, les caractéristiques de chaque base de données sont expliquées en détail et plusieurs indices qui peuvent être extraits à l'aide des résultats de recherche sont fournis. Cette étude fournit une base pour l'utilisation des bases de données de littérature pour l'analyse bibliométrique.

Introduction

Classiquement, les chercheurs ont utilisé des bases de données de littérature pour effectuer l'examen de la littérature pour leurs études¹. Une autre utilisation de ces bases de données de littérature a surgi à la fin du^19ème siècle, où les chercheurs ont analysé le corps de la littérature, une utilisation qui a lentement augmenté depuis². Au cours des dernières décennies, la numérisation de la littérature et la formation de bases de données de littérature en ligne ont permis aux chercheurs d'analyser facilement et efficacement l'ensemble de la littérature et de la performance de la recherche. Un exemple serait l'analyse de la performance de recherche pour un document³, un sujet⁴, une discipline⁵, un pays⁶, ou même une région dans le monde⁷. Ce type d'analyse est connu sous le nom d'analyse bibliométrique. Heartsill Young a défini l'analyse bibliométrique comme l'utilisation de méthodes statistiques pour analyser un corpus de littérature pour révéler le développement historique⁸. En d'autres termes, la bibliométrie est l'étude quantitative des unités publiées sur la base de la citation et de l'analyse de texte⁹.

Différentes bases de données sont utilisées pour faire l'analyse bibliométrique et chaque base de données a des caractéristiques différentes et peut fournir différents services¹⁰. Actuellement, les bases de données de littérature les plus couramment utilisées sont le Web de la science et Scopus pour presque toutes les disciplines, à la fois uniquement disponible sur une base d'abonnement¹¹, et PubMed pour les sciences biomédicales et de la vie, une base de données librement disponible¹⁰. Il ya aussi Google Scholar, qui pourrait être un outil facile à manipuler, mais il ne devrait pas être utilisé comme un outil d'analyse bibliométrique actuellement en raison de certaines lacunes telles que sa portée peu claire et la couverture, son manque d'outils d'analyse de citation, et son inclusion de non-pair contenu non scientifique^{examiné 12,13}. En outre, Google Scholar n'a pas les outils pour effectuer la recherche avancée et l'optimisation des mots clés¹⁴.

Plusieurs études antérieures ont comparé les caractéristiques des bases de données littéraires mentionnées précédemment à des fins de revue de littérature^{3,5,10,12,13,15 ,16,17}. Cependant, dans cette étude, les bases de données PubMed, Scopus et Web of Science seront utilisées pour effectuer une analyse bibliométrique, et les avantages et les inconvénients de chacune d'elles seront comparés. L'analyse bibliométrique peut être utilisée pour analyser la production de recherche dans presque n'importe quelle discipline, de sorte que le public cible serait tout chercheur qui a l'intention d'analyser les tendances de publication. Un exemple d'analyse d'une tendance à la publication en Jordanie en tant que pays sera présenté à l'aide de chaque base de données. La Jordanie a été choisie parce qu'une analyse bibliométrique pour un pays (contrairement à un sujet) n'est pas très simple. En outre, la Jordanie, en particulier, est mal étudiée d'une manière bibliométrique car elle peut être à la fois un nom d'auteur et un nom de pays. Nous expliquons comment surmonter un tel défi dans la recherche.

Protocole

REMARQUE : Voici les méthodes de recherche et une recherche par exemple pour chaque méthode est fournie. Notez que la pièce liée spécifiquement à l'analyse bibliométrique est également fournie.

1. PubMed

1. Choisissez la recherche avancée à partir de la page d'accueil PubMed (www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed).
2. Entrez le terme de recherche souhaité dans le champ de recherche. Choisissez les termes de recherche dans la base de données de la rubrique sujet médical (MeSH). L'exemple suivant décrit comment évaluer la recherche sur le « cancer ».
   1. Ouvrez la base de données MeSH : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh.
   2. Entrez le mot « cancer » dans le champ de recherche.
   3. Assurez-vous que les résultats montrent le mot «néoplasmes» en haut de la recherche, où il note que l'utilisation du mot «néoplasmes» est plus approprié, comme «néoplasmes» est le mot utilisé pour indexer les sujets pertinents.
   4. Vérifiez en outre d'autres termes énumérés sous le terme "néoplasmes" en cliquant dessus. Les résultats montreront d'autres termes utilisés pour décrire des sujets similaires(p. ex., tumeur), et énuméreront également d'autres sous-catégories (sous-titres) sous le terme néoplasme.
   5. Utilisez les listes déroulantes dans la section Constructeur pour spécifier le champ de l'article que PubMed recherchera pour le terme. Notez que les champs de recherche suivants sont disponibles : tous les champs, le titre, l'abstrait, les auteurs, l'affiliation, les conflits d'intérêts, la langue, la revue, l'éditeur, le type de publication, le numéro de subvention, les termes ISBN et MeSH.
   6. Ajoutez autant de champs que nécessaire et choisissez la relation entre ces champs (ET, OU, ou PAS). Voir tableau 1 pour plus de détails.
3. Cliquez sur Recherche.
4. Affiner les résultats de recherche dans les résultats à l'aide de différents filtres disponibles comme détaillé dans le tableau 2. Notez qu'à partir de maintenant, la recherche finale effectuée sera sauvegardée dans l'historique de la recherche avancée, qui a été consultée dans la première étape. Cela signifie que la recherche peut être interrompue à cette étape et reprise plus tard.
5. Assurez-vous que chaque nouvelle recherche est enregistrée dans l'écran d'historique de recherche avancée où elle sera attribuée un numéro(par exemple,#2). Utilisez ce numéro dans le champ de recherche ci-dessus pour soustraire les requêtes recherchées(p. ex., « #1 PAS #2 » pour soustraire les résultats de la recherche #2 des résultats de la recherche #1).
6. Exporter les résultats pour les analyser davantage.
   1. Utilisez l'outil FLink (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/flink/flink.cgi) pour exporter les résultats dans un format de valeurs séparées par virgule (CSV), et choisissez PubMed à partir de la S'il vous plaît choisir une base de données pour commencer la liste de déclassement.
   2. Choisissez l'entrée de l'historique entrez à partir de l'écran d'entrée, et un historique de recherche PubMed avancé apparaîtra à la liste de déroulant.
   3. Choisissez la recherche effectuée dans les étapes précédentes à la recherche avancée PubMed et cliquez sur Soumettre.
   4. Consultez le rapport qui en résulte puisqu'il offre la possibilité d'exporter les résultats de recherche dans un fichier format CSV.
7. Effectuer les étapes suivantes pour analyser la production de recherche jordanienne au cours d'une période de 5 ans entre le 1/1/2013 et le 31/12/2017 à l'aide de PubMed.
   1. Ouvrez le formulaire de recherche avancé dans le formulaire de recherche de documents sur le site Web De PubMed (www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed).
   2. Utilisez Jordan comme terme de recherche et spécifiez Affiliation comme champ de recherche. Notez que PubMed interprète l'affiliation comme toutes les informations relatives à l'auteur(c.-à-d. nom de l'auteur, adresse, affiliation), excluent ainsi tout document rédigé par un auteur nommé "Jordanie" dans lequel le pays affilié n'est pas la Jordanie. Suivez les étapes ci-dessous pour éviter d'inclure de tels résultats non pertinents.
   3. Tapez Jordan dans un autre champ et choisissez le type de champ Auteur.
   4. Choisissez l'opérateur PAS comme relation entre les deux champs et cliquez sur Recherche.
   5. Spécifiez les dates de publication du 1/1/2013 au 31/12/2017 dans la fenêtre des résultats, et choisissez l'article et l'examen du journal parmi les types d'article.
   6. Ouvrez FLink (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/flink/flink.cgi), et choisissez PubMed comme base de données.
   7. Choisissez l'entrée de l'historique entrez à partir de l'écran d'entrée, et choisissez la recherche à partir de la liste de déroulant.
   8. Cliquez sur Télécharger CSV.
      REMARQUE : La figure 1 détaille le rapport de recherche PubMed avec annotation pour chaque section du rapport.

2. Scopus

1. Inscrivez-vous afin d'accéder aux capacités de recherche complètes de la base de données Scopus. Vérifiez si l'institution locale est déjà enregistrée et a accès à la base de données puisque les établissements d'enseignement sont généralement enregistrés en Scopus.
2. Rendez-vous sur le site (www.scopus.com) et par défaut, Scopus ouvre l'écran du formulaire de recherche de documents.
3. Entrez le terme de recherche souhaité dans le champ de recherche disponible.
4. Spécifiez les champs de l'article à rechercher. Notez que les champs de recherche suivants sont disponibles : tous les champs, le titre, l'abstrait, les mots clés, les auteurs, les affiliations, les informations de financement, la langue, les références, la conférence, ISSN, CODEN, DOI, ORCID et le numéro CAS.
5. Ajoutez d'autres champs pour rechercher et indiquer la relation entre le champ nouvellement ajouté et l'autre champ déjà entré (ET, OU, ou PAS). Voir ( tableau 1) pour plus de détails.
6. Utilisez l'option Limite pour limiter la recherche en fonction des options fournies par Scopus, comme détaillé dans le tableau 2.Après l'exécution de la recherche, enregistrer la recherche et continuer plus tard si nécessaire.
   1. Dans ce cas, définir une alerte à l'aide de l'alerte d'option Set, où un e-mail sera envoyé lorsqu'un article répondant aux critères de recherche est ajouté.
7. Affiner les résultats de recherche en plus loin des résultats directement en choisissant parmi les options fournies par Scopus ( tableau 2), où Scopus montre le nombre de documents inclus pour chaque option.
8. Choisissez d'analyser les résultats directement sur le site Web de Scopus (cliquez sur Analyser les résultats de recherche), ou d'exporter les résultats dans les formats zip ou CSV après avoir rempli les critères de recherche.
9. Effectuer les étapes suivantes pour analyser la production de recherche jordanienne au cours d'une période de 5 ans entre le 1/1/2013 et le 31/12/2017 à l'aide de Scopus.
   1. Rendez-vous sur le site (www.scopus.com) et par défaut, Scopus ouvre l'écran du formulaire de recherche de documents.
   2. Tapez Jordan comme terme de recherche dans le formulaire de recherche de document.
   3. Spécifier le pays d'affiliation comme champ de recherche.
   4. Limitez la durée de recherche de 2013 à 2017. A noter qu'à partir de 2013, du 1/1/2013 et de 2017 au 31/12/2017.
   5. Limitez le type de document à l'article ou à l'examen, puis cliquez sur Recherche.
      REMARQUE : La figure 2 détaille le rapport de recherche Scopus avec une annotation pour chaque section du rapport.

3. Web de la science

1. Inscrivez-vous afin d'accéder aux capacités de recherche complètes de la base de données Web of Science. Vérifiez si l'institution locale est déjà enregistrée et a accès à la base de données car les établissements d'enseignement sont généralement inscrits dans le Web of Science.
2. Rendez-vous sur la page d'accueil du Web of Science (www.webofknowledge.com). Le site Web ouvre la recherche de base et inclut la collection Web of Science Core comme base de données sélectionnée pour la recherche.
3. Rechercher les champs comme indiqué dans le tableau 2.
4. Ajoutez un autre champ (si nécessaire) pour connecter les deux champs par ET, OU, ou PAS. Voir tableau 1.
5. Définissez la durée recherchée jusqu'en 1945. Après avoir terminé la recherche, les résultats sont enregistrés dans l'historique et peuvent être retournés à tout moment. Si nécessaire, définir une alerte si un nouveau document est ajouté au rapport de recherche.
6. Trier les résultats selon les données, les temps cités, les nombres d'utilisation, ou à d'autres catégories de la liste de déclassement fournie.
7. Affiner les résultats de recherche directement à partir des résultats en choisissant parmi les options fournies par Web of Science ( tableau 2), où Web of Science montre le nombre de documents inclus pour chaque option.
8. Affichez les résultats et analysez-les à l'aide d'une carte d'arbre ou d'un graphique à barres. Notez qu'il y a un tableau indiquant le nombre dans chaque catégorie.
9. Téléchargez les résultats. Notez que contrairement à Scopus et PubMed, Web of Science ne permet le téléchargement de 5 000 enregistrements à la fois(par exemple, une recherche de résultats de 10 000 est téléchargée en deux lots, le premier lot pour les 5 000 premiers enregistrements, et un deuxième lot pour les 5 000 enregistrements suivants).
10. Effectuer les étapes suivantes pour analyser les résultats de la recherche jordanienne au cours d'une période de 5 ans comprise entre le 1/1/2013 et le 31/12/2017 à l'aide du Web of Science.
    1. Tapez Jordan dans le champ de recherche et spécifiez l'adresse comme champ de recherche.
    2. Identifiez la durée de la recherche entre 2013 et 2017 et cliquez sur Recherche.
    3. Limitez la recherche à l'aide des filtres Article et Review.
    4. Choisissez d'analyser les résultats enregistrés dans l'historique de recherche maintenant ou plus tard.
    5. Choisissez d'analyser les résultats sous forme de tables ou de carte visuelle des arbres et des barres.
       REMARQUE : La figure 3 détaille le rapport de recherche sur le Web de la science avec une annotation pour chaque section du rapport.

Résultats

Résultats de la recherche PubMed

Au total, 4 363 documents ont été récupérés d'après la recherche effectuée dans le présent et le fait de la présente étude. Le texte intégral gratuit était disponible pour 1 767 documents (40,5 %). En 2013, un total de 532 documents ont été publiés, 663 documents en 2014, 811 documents en 2015, 952 documents en 2016 et 1 405 documents en 2017.

Discussion

Dans cette étude, les étapes par lesquelles les bases de données PubMed, Scopus et Web of Science sont utilisées pour effectuer une analyse bibliométrique ont été fournies. Il a été indiqué que l'outil le plus convivial et le plus facile à utiliser pour les services d'analyse bibliométrique est Web of Science; cependant, son inconvénient est que ses services ne sont pas disponibles gratuitement. PubMed est consacré aux sciences biomédicales et est affilié à plusieurs autres outils de la Bibliothèque nat...

matériels

Name	Company	Catalog Number	Comments
	clarivate	N/A	Web of Science provider, where the access was provided by the subscription made by the University of Jordan.
	Elsevier	N/A	Scopus provider, where the access was provided by the subscription made by the University of Jordan.