Pour commencer, importez l’imagerie numérique et les communications en médecine ou les données DICOM en cliquant sur le bouton DCM situé dans le coin supérieur gauche de la barre d’outils et en cliquant sur le bouton d’importation de fichiers DICOM. Pour régler la luminosité d’une image, cliquez sur Ajuster la fenêtre et le niveau de volume ou cliquez avec le bouton gauche de la souris sur l’image et faites glisser la souris vers le haut ou vers le bas. Cliquez ensuite avec le bouton gauche de la souris sur la tranche d’image et déplacez la souris vers la gauche ou la droite pour ajuster le contraste.
Référez-vous aux noyaux de matière grise profonde ou aux barres d’échelle de contraste de l’intensité du signal et assurez-vous qu’elle reste cohérente tout au long de la segmentation pour choisir le contraste approprié pour le plexus choroïde. Pour démarrer la segmentation du plexus choroïde latéral des troisième et quatrième ventricules, sélectionnez l’éditeur de segments dans le menu déroulant du module. Cliquez maintenant sur le menu déroulant de la segmentation pour sélectionner différentes segmentations et renommer celle sélectionnée.
Utilisez la liste déroulante du volume principal et sélectionnez les ensembles NIfTI ou DICOM qui doivent être modifiés. Cliquez deux fois sur le bouton d’ajout pour inclure deux segments pour le plexus choroïde du ventricule latéral. Double-cliquez sur leurs titres et renommez-les plexus choroïde du ventricule latéral droit et plexus choroïde du ventricule latéral gauche.
Cliquez à nouveau sur le bouton d’ajout pour introduire des segments pour le plexus choroïde des troisième et quatrième ventricules. Ensuite, renommez-les respectivement le troisième plexus choroïde ventriculaire et le plexus choroïde du quatrième ventricule. Commencez par le plexus choroïde du ventricule latéral dans le plan axial et assurez-vous de positionner les images en fonction de la ligne bicommissurale.
Utilisez le trigonum collatéral comme point de référence pour localiser le plexus choroïde du ventricule latéral. Pour démarrer la segmentation manuelle, sélectionnez l’outil de peinture ou de dessin situé dans la section des effets de l’éditeur de segments. Lors de l’utilisation de l’outil de peinture, sélectionnez le diamètre de pinceau souhaité pour la peinture.
Utilisez le niveau du noyau rouge pour déterminer quand arrêter de segmenter le plexus choroïde dans les ventricules latéraux. Pour localiser le plexus choroïde du troisième ventricule, commencez dans le plan sagittal et utilisez le foramen de Monro, le fornix, le corps calleux, le thalamus et la veine cérébrale interne comme points de repère. De même, pour le plexus choroïde du quatrième ventricule, commencez dans le plan sagittal et utilisez le pédoncule cérébelleux supérieur, le pont et la moelle épinière comme points de référence pour localiser le plexus choroïde dans le quatrième ventricule.
Dans le menu déroulant des modules, accédez à Quantification et sélectionnez Statistiques de segment. Ensuite, dans la section d’entrée, sélectionnez la carte de segmentation nouvellement créée pour la quantification sous l’outil de segmentation et sélectionnez le volume IRM dans le volume du détartreur. Pour la table de sortie, sélectionnez l’option de table sous Sortie et appuyez sur Appliquer.
Un tableau affichant le volume du plexus choroïde en différentes unités apparaîtra. Cliquez sur le bouton d’enregistrement situé dans la partie supérieure gauche de la barre d’outils pour stocker les fichiers générés. Conservez les fichiers de segmentation dans les formats nrrd, nii.
GZ, ou TSV.
