Nous tenons à remercier Amanda Rychel pour l&#39;assistance à l&#39;élaboration du protocole laps de temps et Lynn Pillitteri pour construire POLAR POLAR ::-eGFP. Nous sommes également reconnaissants à ABRC pour fournir le h-rb construire. Ce protocole a été élaboré grâce à un soutien de l&#39;attribution du Japon PRESTO Science Technologie et de l&#39;Agence. La recherche sur POLAR a également été soutenu par l&#39;Université de Washington Banque Research Fund (RRF-4098) et la National Science Foundation (MCB-0855659). KMP est un NSF Graduate Research Fellow (DGE-0718124), et KUT est un enquêteur HHMI-GBMF.

1. La stérilisation des semences <ol><li> Préparer la solution de stérilisation des semences: eau de javel 33%, 0,1% de Triton X-100. </li><li> Placer les semences portant souhaité construction rapporteur fluorescent (s) et le génotype (s) dans 1,7 ml tube et appliquer 1 ml de solution de stérilisation. Incuber sur nutator pendant 15 min. </li><li> Dans une hotte stérile, utiliser une pipette pour éliminer la solution de stérilisation du tube, laissant derrière graines. Rincer avec 1 ml d&#39;eau stérile. Répétez quatre fois. </li><li> Incuber à 4 ° C pendant deux jours ou plus. </li></ol> 2. Préparation des diapositives Chambre médias <ol><li> Mélanger 20 ml de solution 0,5% de Bacto Agar (pur agarose) dans l&#39;eau dans une fiole jaugée de 200 ml, et à micro-ondes jusqu&#39;à dissolution complète. Soyez prudent lorsque vous la solution à ébullition. </li><li> Refroidir la solution à environ 60 ° C. </li><li> Prélever 1 ml de solution d&#39;agar avec une pipette et appliquer lentement le couvercle en verre à l&#39;intérieur de la chambre de coulissement (Lab-Tek II Chambered # 1.5 Système lamelle couvre-objet en allemand). Solution which est trop chaud ou appliquée trop rapidement peut faire fondre la colle ou du verre fissure. </li><li> Immédiatement ajouter un deuxième ml solution d&#39;agar. Gélose doit maintenant couvrir complètement le fond de la chambre de coulissement. Ce support minimal est suffisante pour soutenir le développement dans un cotylédon usine, qui contient des nutriments stockés, pendant quatre à cinq jours par le maintien de l&#39;humidité et permettant la diffusion de gaz. </li><li> Laisser refroidir sur une diapositive de table avec chambre à couvert. Si flacon est recouverte hermétiquement, la solution peut être sauvé et réchauffés pour une utilisation future. </li></ol> 3. Dissection semences <ol><li> Retirer le tube de semences stériles de 4 ° C de stockage. </li><li> Placez un mouchoir en papier sur la scène d&#39;un microscope à dissection et l&#39;humidifier avec de l&#39;eau. Réglez le tissu pour créer une surface lisse. Le tissu est utilisé pour stabiliser les graines pour la dissection. </li><li> Pipeter 20-30 graines du tube sur le tissu, en prenant soin de les placer dans le champ de la portée dissection de vue. </li><li> En utilisant des pinces pointues (Roboz, n ° 5 pointe biologie), Retirez soigneusement le tégument de l&#39;intérieur des semis. Téguments à la fois extérieur et intérieur doivent être enlevés. </li><li> Quand l&#39;imagerie du cotylédon, il est avantageux de retirer l&#39;hypocotyle et la radicule. Cotylédons contiennent des substances nutritives suffisantes pour développer pendant plusieurs jours en vertu du présent protocole. Si intacte, l&#39;hypocotyle se redresser et allonger considérablement, passant du stade cotylédon hors du champ de vision laps de temps. Utiliser un scalpel pour découper les cotylédons libres de l&#39;hypocotyle. </li><li> Tenir cotylédons disséqués immergés dans l&#39;eau, dans un microtube ou similaire. </li><li> Répéter 3.4 à 3.6 jusqu&#39;à ce que le nombre souhaité de cotylédons est atteinte. 15-20 dissections succès sont recommandées avant le montage. </li></ol> 4. Cotylédons de montage dans la chambre de coulissement <ol><li> L&#39;utilisation d&#39;un couvre-petit (18 mm 2), couper à travers les médias d&#39;agar et soulever toute la couche de base en verre jusqu&#39;à la chambre de coulissement du. </li><li> Pipeter disséqué cotylédons avec un minimum d&#39;eau à partir de maintenanttube dans la chambre de coulissement, sous la couche de gélose levée. </li><li> Abaissez doucement la gélose sur les cotylédons. Si l&#39;excès d&#39;eau est présente, la tremper loin avec un tissu, en prenant soin de ne pas déranger les cotylédons. Les échantillons doivent plus se déplacer facilement quand montage est terminé. </li><li> Placer le couvercle sur la diapositive chambre et faites glisser pour déplacer la platine du microscope. </li></ol> 5. Time Lapse d&#39;imagerie <ol><li> Mise en place inversée microscope confocal à l&#39;image du fluorophore désiré (s). LSM700 paramètres utilisés: pour la GFP, l&#39;excitation à 488 nm et la collecte avec un filtre passe-bande à 440-530 nm; d&#39;appel d&#39;offres, l&#39;excitation à 555 nm et la collecte avec un filtre passe-bande à 570-610 nm. </li><li> Inspectez spécimens naturalisés pour les dommages. Programmer les emplacements des intact, bien monté cotylédons dans le logiciel de microscope. Dans le Zen 2009: Focus sur un cotylédon avec objectif 20x et objectif déplacer au centre de la chambre de coulissement. Sous Mode d&#39;acquisition, changer Zoom à 0,5 et hauteur d&#39;axe &lt;/ Em&gt; à 48x48 pixels. Cochez la case Positions et l&#39;image de synthèse Scan ... bouton sous positions, puis augmenter le nombre de carreaux horizontaux et verticaux à 30-35. Lorsque la numérisation est terminée, cliquez sur le bouton positions sous l&#39;onglet Dimensions et réticule lieu à chaque cotylédon à observer. </li><li> Mettre en place la série z englobant l&#39;épiderme cotylédon de tous Zen samples.In 2009: Cochez la case Z-Stack. Sélectionnez chaque position dans la liste Position, puis cliquez sur le bouton Déplacer vers. Concentrez-vous sur le plan supérieur de l&#39;épiderme des cotylédons et cliquez sur le bouton Set abord sous Z-Stack. Focus sur la position la plus basse à laquelle épiderme est utilement visible et cliquez sur le bouton Set dernier. Cliquez sur le bouton situé à côté optimale, ce qui montre le meilleur z-épaisseur de coupe, à définir. Vérifiez chaque cotylédon à confirmer que ces paramètres englobent tous les échantillons, les paramètres z ne peut pas être réglé pour indivpositions idual en 2009 Zen. </li><li> Mettre en place des séries chronologiques à la résolution souhaitée et la longueur. Intervalles de 15-30 minutes pendant trois jours sont efficaces pour la dynamique des protéines dans la division cellulaire épidermique. Cet intervalle peut être modifié selon les besoins. Dans le Zen 2009: Cliquez sur la case de séries chronologiques. En vertu de séries chronologiques, Cycles mis pour le nombre d&#39;images de votre choix à l&#39;aide du curseur ou en tapant dans le champ de texte. Définition de la fréquence à 30 et utilisez le menu déroulant pour sélectionner min. </li><li> Commencez xyzt multi-position de balayage. Notez que le nombre de postes doit être limitée par les spécifications de numérisation, si le temps de cycle total est supérieur à l&#39;intervalle souhaité, les points dans le temps ne sera pas correcte. Un maximum de six positions simultanées sont possibles lorsque l&#39;imagerie GFP et RFP à 59 z tranches dans un intervalle de 30 min à l&#39;aide de notre système. Dans le Zen 2009: Taille de l&#39;image Changement de la résolution souhaitée, puis cliquez sur Démarrer expérience. </li></ol> 6. Montage vidéo <ol><li> A partir du fichier confocal données, effectuez une intensité maximale z-projection de chaque combinaison temps / position et l&#39;exportation sous forme de fichiers image dans un format sans perte comme TIFF. Les noms de fichiers doivent être dans une série par poste (par exemple, POLAR-GFP_pos1_0001, POLAR-GFP_pos1_0002, etc, ne POLAR-GFP_0001_pos1) pour les logiciels pour les combiner en un film. Dans le Zen 2009: Copie Utilisation: sous-ensemble sous l&#39;onglet Traitement de diviser positions dans des fichiers séparés, puis projection d&#39;intensité maximale. Enfin, l&#39;exportation au format TIFF (fichier Export, pleine fenêtre resolution image - série). </li><li> Utilisez FIDJI 7,8 pour aligner les images successives en exécutant la macro bUnwarpJ 9 (Plugins: Inscription: bUnwarpJ). Changer le mode d&#39;enregistrement en Mono. Toutes les options avancés peuvent utiliser des valeurs par défaut. Pour les longues séquences laps de temps, téléchargez et installez la macro &quot;Affine + Conformément Inscription élastique image 2D», qui s&#39;appliquera bUnwarpJ à une série d&#39;images automatiquement et ouvert ynos données à l&#39;aide du fichier: Import: Séquence d&#39;images de l&#39;utiliser. Décochez MOPS sites d&#39;extraction et de course. </li><li> Utilisez FIDJI / ImageJ ou Quicktime Pro pour ouvrir la séquence d&#39;images alignées et enregistrer au format vidéo de votre choix (AVI est un bon choix). </li></ol>

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Aucun conflit d&#39;intérêt déclaré.

Cette technique time-lapse confocale permet des études longitudinales sur l&#39;expression des protéines marquées par fluorescence et la localisation dans des cellules individuelles de l&#39;épiderme cotylédon Arabidopsis, qui dans le cas de la polaire et d&#39;autres protéines changent dynamiquement est essentielle à une bonne compréhension de leur fonction. Auparavant, soutenue laps de temps d&#39;imagerie a été utilisée pour examiner l&#39;infection fongique racine d&#39;Arabidopsis ...

<table border="1"><tbody><tr><td> Nom du réactif </td><td> Entreprise </td><td> Numéro de catalogue </td><td> Commentaires </td></tr><tr><td> Bacto Agar </td><td> BD </td><td> 214010 </td><td></td></tr><tr><td> Une chambre de tiroir </td><td> Nunc (Thermo Scientific) </td><td> 155360 </td><td> Ou deux chambre (155 379) </td></tr><tr><td> Microscope à balayage laser confocal </td><td> Zeiss </td><td> LSM700 </td><td> Zen 2009 logiciels </td></tr><tr><td> 20x objectif </td><td> Zeiss </td><td> 420650-9901 </td><td> NA 0,8, Plan-Apochromat </td></tr><tr><td> Microscope à dissection </td><td> Benz (National) </td><td> 431TBL </td><td> S&#39;allume ci-dessous </td></tr><tr><td> N ° 5 forceps, la biologie de pointe </td><td> Roboz instruments chirurgicaux </td><td> RS-4978 </td><td> Pointes très finessont essentiels </td></tr></tbody></table>

long-term, high-resolution confocal time lapse imaging of arabidopsis cotyledon epidermis during germination

Imagerie in vivo de la dynamique du comportement cellulaire dans une séquence de développement peut être un outil puissant pour comprendre les mécanismes de structuration des tissus. Au cours du développement animal, la prolifération cellulaire et les événements clés de structuration se produire très rapidement. Par exemple, dans Caenorhabditis elegans toutes les divisions cellulaires nécessaires au plan de corps de la larve sont terminés dans les six heures après la fécondation, avec sept cycles mitotiques 1; les mitoses seize ou plus de l&#39;embryogenèse chez la drosophile se produire en moins de 24 heures 2. En revanche, les divisions cellulaires au cours du développement des plantes est lente, typiquement de l&#39;ordre d&#39;une journée 3,4,5. Cela impose un défi unique et un besoin à long terme imagerie en temps réel pour documenter les comportements dynamiques de la division cellulaire et la différenciation des événements pendant l&#39;organogenèse végétale. Épiderme Arabidopsis est un excellent modèle pour la signalisation de l&#39;enquête, le devenir cellulaire et le développement des plantes. Dans le cotylédon, ce tissu est constitué de cellules d&#39;air et résistant à l&#39;eau des chaussées entrecoupés de stomates uniformément répartie, soupapes qui s&#39;ouvrent et se ferment pour contrôler les échanges gazeux et la perte d&#39;eau. Un espacement correct de ces stomates est essentielle à leur fonction et leur développement suit une séquence de division asymétrique et les étapes de différenciation des cellules pour produire de l&#39;épiderme organisé (Fig. 1). Ce protocole permet l&#39;observation des cellules et des protéines de l&#39;épiderme pendant plusieurs jours de développement. Ce laps de temps permet une documentation précise des cellules souches divisions et la différenciation des cellules épidermiques, y compris les stomates et des cellules épidermiques de la chaussée. Protéines fluorescentes peuvent être fusionnés à des protéines d&#39;intérêt pour évaluer leur dynamique au cours de la division cellulaire et les processus de différenciation. Cette technique nous permet de comprendre la localisation d&#39;une protéine nouvelle, POLAR 6, pendant la phase de prolifération des cellules de la lignée des stomates en eépiderme cotylédon e Arabidopsis, où il est exprimé dans les cellules précédant les événements de la division asymétrique et se déplace vers une zone caractéristique du cortex cellulaire se produit peu de temps avant la division. Les images peuvent être enregistrées et vidéo simplifié facilement produit en utilisant un logiciel du domaine public de visualiser la localisation des protéines dynamique et types cellulaires comme ils changent au fil du temps.

<html> Un ensemble de points dans le temps informatifs recueillies par cette méthode est illustré à la figure 3. Les membranes cellulaires sont étiquetés avec DP (h-rb) et la GFP est fusionnée à la protéine POLAR sous son promoteur natif (POLAR POLAR ::-GFP) 6 A l&#39;échelle de temps de 30 minutes, nous voyons des divisions cellulaires, ainsi que les changements dans la localisation des protéines qui les ont précédés. Divisions cellulaires asymétriques sous la forme lig...

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Long-term, High-resolution Confocal Time Lapse Imaging of Arabidopsis Cotyledon Epidermis during Germination

Nous décrivons un protocole utilisant des lames de chambre et des médias pour immobiliser cotylédons des plantes pour l&#39;imagerie confocale de l&#39;épiderme pendant plusieurs jours de développement, la documentation différenciation des stomates. Protéines fluorophore-marqués peuvent être suivis de manière dynamique par l&#39;expression et la localisation subcellulaire, accroître la compréhension de leurs rôles possibles lors de la division cellulaire et la différenciation de type.

À long terme, à haute résolution d&#39;imagerie confocal Time Lapse d&#39;<em&gt; Cotylédon Arabidopsis</emEpiderme&gt; cours de germination

Imaging in vivo dynamics of cellular behavior throughout a developmental sequence can be a powerful technique for understanding the mechanics of tissue ...

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Research

JoVE Journal

Biology

Long-term, High-resolution Confocal Time Lapse Imaging of Arabidopsis Cotyledon Epidermis during Germination

13.6K vues.  University of Washington. Nous décrivons un protocole utilisant des lames de chambre et des médias pour immobiliser cotylédons des plantes pour l'imagerie confocale de l'épiderme pendant plusieurs jours de développement, la documentation différenciation des stomates. Protéines fluorophore-marqués peuvent être suivis de manière dynamique par l'expression et la localisation subcellulaire, accroître la compréhension de leurs rôles possibles lors de la division cellulaire et l...