Isolement nucléaire à partir de cellules sanguines dérivées in vitro cryoconservées

Mon laboratoire étudie les gènes et les mécanismes qui affectent la formation des cellules sanguines. Nous produisons des cellules sanguines à partir de cellules souches pluripotentes induites par l’homme, et nous voulons le faire plus efficacement pour soutenir la production à l’échelle clinique de thérapies cellulaires adaptées à des patients spécifiques. Nous utilisons des modalités de génomique unicellulaire pour identifier des modèles d’expression génique et d’autres facteurs qui peuvent aider à soutenir la formation des cellules sanguines.

L’un des principaux défis de la production de cellules sanguines in vitro est qu’elle est coûteuse et inefficace. Nous utilisons des approches génétiques pour résoudre ce problème. Nous voulons utiliser des indices de la génétique humaine et de l’hématopoïèse in vivo pour guider les améliorations que nous apportons au système in vitro.

Nous essayons d’utiliser la génomique fonctionnelle et l’analyse de noyaux uniques pour faire progresser le domaine en termes d’identification des gènes et des réseaux de signalisation qui entraînent la formation des bons types de cellules sanguines in vitro. La création d’un ensemble de données multi-omiques de haute qualité nous a permis de découvrir les facteurs de transcription, l’énergie et la machinerie régulière qui pilotent la différenciation in vitro des cellules sanguines. Nous utilisons ces données pour comprendre les données génétiques humaines telles que les loci et les facteurs incertains qui sont à l’origine de la différenciation que nous n’avons pas été en mesure de voir auparavant.

Nous sommes très enthousiastes à l’idée de tirer parti des informations de ces ensembles de données multimodales que nous avons pu générer sur la base de l’isolement de noyaux de haute qualité. Nous avons l’intention de concentrer nos études futures sur les gènes et les mécanismes de développement qui peuvent produire des types de cellules sanguines, à l’échelle clinique in vitro.