В центре внимания автора: Совершенствование производства клеток крови in vitro с помощью мультиомики одиночных клеток и функциональной геномики

Моя лаборатория изучает гены и механизмы, влияющие на образование клеток крови. Мы производим клетки крови из индуцированных человеком плюрипотентных стволовых клеток, и мы хотим делать это более эффективно, чтобы поддерживать клиническое производство клеточной терапии, адаптированной для конкретных пациентов. Мы используем методы геномики отдельных клеток для выявления закономерностей в экспрессии генов и других факторов, которые могут помочь поддержать образование клеток крови.

Одной из основных проблем для производства клеток крови in vitro является то, что это дорого и неэффективно. Для решения этой проблемы мы используем генетические подходы. Мы хотим использовать подсказки из генетики человека и кроветворения in vivo, чтобы направлять улучшения, которые мы вносим в систему in vitro.

Мы пытаемся использовать функциональную геномику и анализ одного ядра, чтобы продвинуться вперед в этой области с точки зрения идентификации генов и сигнальных сетей, которые управляют формированием правильных типов клеток крови in vitro. Создание высококачественного мультиомного набора данных помогло нам обнаружить факторы транскрипции, энергию и обычные механизмы, которые управляют дифференцировкой клеток крови in vitro. Мы используем эти данные, чтобы понять генетические данные человека, такие как локусы, и неопределенные факторы, которые стимулируют дифференциацию, которую мы раньше не могли увидеть.

Мы очень рады использовать идеи из этих мультимодальных наборов данных, которые мы смогли создать на основе выделения высококачественных ядер. Мы намерены сосредоточить наши будущие исследования на генах и механизмах развития, которые могут производить типы клеток крови, в конечном итоге в клиническом масштабе in vitro.