Pleins feux sur l’auteur : Intégration de la transcriptomique unicellulaire aux cultures d’organoïdes pour une recherche avancée et des connaissances thérapeutiques

Nous intégrons la transcriptomique unicellulaire et la technologie des organoïdes pour mieux comprendre la biologie de l’intestin grêle. Ces technologies nous permettent de mieux comprendre l’hétérogénéité cellulaire qui existe au sein de ce tissu. Les outils qui améliorent le débit, la sensibilité et les résolutions sont les clés qui ont fait avancer la recherche dans le domaine.

Quelques exemples sont l’amélioration des méthodes de calcul et les innovations technologiques. La réduction des coûts est également un objectif majeur. Le processus de préparation et de séquençage des banques d’échantillons peut entraîner des variations de transcription, ce qui constitue un défi.

Pour les organoïdes, les défis spécifiques comprennent le contexte spatial limité ou les informations sur la dynamique temporelle. L’analyse unicellulaire des organoïdes intestinaux humains fournit des informations jusqu’alors inaccessibles sur les types de cellules qui composent l’épithélium intestinal. Cela ouvre ainsi la fenêtre sur le paysage transcriptionnel de ces cellules.

Nous utilisons ces technologies pour identifier les biomarqueurs et les mécanismes des maladies intestinales humaines. Ces biomarqueurs et mécanismes feront progresser notre capacité à utiliser des approches fondées sur la médecine personnalisée pour traiter les maladies humaines et améliorer la santé humaine en général.