Method Article
Droplet מבוססי פלטפורמות microfluidic הם המועמדים המבטיחים לניסויים תפוקה גבוהה שכן הם מסוגלים להפיק, picoliter עצמית מידור כלי ובזול בשיעורים קילוהרץ. באמצעות שילוב עם מהירות, רגישות גבוהה שיטות ספקטרוסקופיות ברזולוציה פלואורסצנטי, כמויות גדולות של מידע שנוצר בתוך מערכות אלה ניתן לחלץ ביעילות, לרתום ולנצל אותו.
הפיתוח של פלטפורמות microfluidic לביצוע כימיה וביולוגיה יש במידה רבה היתה מונעת על ידי מגוון של היתרונות הפוטנציאליים הנלווים מזעור המערכת. היתרונות כוללים את היכולת ביעילות תהליך ננו כדי femoto ליטר כרכים של מדגם, שילוב קליל של רכיבים פונקציונליים, נטייה פנימית כלפי ריבוב בקנה מידה גדול, התפוקה אנליטי משופר, שליטה משופרת ועקבות אינסטרומנטלי מופחת. 1
בשנים האחרונות עניין רב יש התמקדו בפיתוח של אגל מבוססי (או זרם מקוטע) מערכות microfluidic ואת הפוטנציאל שלהם כפי פלטפורמות בניסויים תפוקה גבוהה. 2-4 הנה מים ב-תחליב שמן נעשים באופן ספונטני טופס ערוצי microfluidic כתוצאה של אי יציבות נימי בין שני שלבים immiscible. חשוב לציין, microdroplets כרכים ויצירות הגדיר במדויק יכול להיות שנוצר בתדירויותשל כמה קילוהרץ. יתר על כן, על ידי encapsulating ריאגנטים עניין בתוך תאים בודדים מופרדים בשלב immiscible רציפה, הן מדגם צולבות לדבר פיזור (דיפוזיה ו טיילור מבוסס) ניתן למנוע, מה שמוביל זיהום צולבות מינימלית ויכולת הזמן תהליכים אנליטיים בדייקנות רבה. בנוסף, מאחר ואין קשר בין התוכן של הטיפות ואת הקירות ערוץ (אשר הרטובות על ידי השלב מתמשך) ספיגה ואובדן ריאגנטים על קירות הערוץ נמנע.
לאחר טיפות מסוג זה נוצרו ומעובדים, יש צורך לחלץ את המידע הנדרש אנליטית. מבחינה זו, שיטת הזיהוי של הבחירה צריכה להיות מהירה, לספק רגישות גבוהה ומגבילה נמוך של גילוי, לחול על מגוון של מינים מולקולרית, להיות הרסני ולהיות מסוגלים להיות משולב עם התקנים microfluidic באופן קליל. כדי לענות על צורך זה פיתחנו כמוuite של כלים ניסיוניים פרוטוקולים המאפשרים הפקת כמויות גדולות של מידע photophysical מ קטן בנפח סביבות, ואת החלות על ניתוח של מגוון רחב של פרמטרים פיזיים כימיים וביולוגיים. להלן שתי דוגמאות של שיטות אלה מוצגים ליישם זיהוי של תאים בודדים ועל מיפוי של תהליכי ערבוב בתוך picoliter נפח טיפות. אנו מדווחים על תהליך הניסוי כולו כולל ייצור שבב microfluidic, ההגדרה אופטיים בתהליך של הדור אגל וזיהוי.
1. ייצור שבב
2. ניסיוני ההתקנה
3. Droplet הדור רכישת נתונים
4. Cell הכרה ומיפוי של ערבוב בתוך טיפות
5. ניתוח נתונים
6. נציג תוצאות
Cell הכרה
דוגמאות אופייניות של variation של ספירת פוטון כפונקציה של הזמן עבור מבוססי תאים ניסויים מוצגים איורים 4 א ו - ג, על פני תקופה של 200 אלפיות השנייה. חשוב לציין לוריא-Bertani מרק (מדיום LB) משמש רקע חלושות fluorescing המגדיר את הגבולות טיפה מימית, תוך פרצי פוטון מובהק, המתאים נוכחות של תאים בודדים, ניתן להבחין על גבי רקע זה. הרקע LB פלורסנט מאופיינת בחתך מלבני כ (מסומן על ידי קווים מנוקדים אדום וירוק).
רוחב חצי מלא לכל היותר (FWHM) של התפרצויות פלורסנט הנובעים E. תאים coli הוא פי 30 יותר קצרה טיפה רקע האירועים, אשר עולה בקנה אחד עם האורך היחסי של טיפות (40 מיקרון, המתאים לנפח של 30 picolitres) וא ' coli התאים (1.5-2.0 מיקרון). 10
עם ערוץ כפול לזהותיון המערכת, את קיומו של תאים חיים או תאים מתים ניתן להבחין בין ניתוח של ערוצי ירוק ואדום. איורים 4 B ו-D להראות את התפלגות הסתברות המתאר את מספר התאים לכל טיפה.
מיפוי של אירועים באמצעות ערבוב FLIM
החיים פלואורסצנציה מולקולרית היא תכונה מהותית של fluorophore יחיד מושפע רק על ידי הסביבה הכימית שלו. לפיכך המדידות שלו יכול לשמש כדי להשיג מידע סביבתי (כגון פתרון ה-pH, טמפרטורה, הקוטביות ואת צמיגות) עם רזולוציה דיוק מעולה מאשר מדידות זמן משולב הקרינה, אשר תלויים בגורמים ניסיוני (כמו ריכוז, עוצמה עירור, אוסף אופטי יעילות). 9,11
הציג כמו בכל מקום אחר, 8 ניתן למפות את דפוסי ערבוב בתוך טיפות באמצעות שני fluorophores עם דיהחיים ערכים fferent. בתערובת המכילה שני (לא אינטראקציה) מינים פלורסנט ריקבון ייקח בטופס biexponential כפי שמוצג במשוואה 1:
חיים הפרט מוגדרים τ1 ו τ2 וכן את המשרעת של כל רכיב ניתנת על ידי α1 ו α2 בהתאמה. החיים הממוצע אז יכול להיות מוגדר כדלקמן:
איפה β1 ו β2 הם שבריר של כל מרכיב ואת מוגדרות כדלקמן:
מאחר נפח בדיקה קבועה טיפות זורמים על פני העמדה, מסלול חייו של הערכים לאורך טיפות ברוחב מסוים ניתן להשיג כך. מסלול אופייני עבור רוחב מסוים על בסיס ממוצעעורך בין הטיפות 6000, ניתן לראות ציור 5a.
שילוב מסלולים ברחבי רוחב כולו של ערוץ מוביל להיווצרות ריכוז המפה 2D (או ערבוב). תוצאה טיפוסית מוצג באיור 5 ב.
על ידי חישוב ממוצע התוצאות בין מספר רב של טיפות, טעות התקן של התוצאות המתקבלות ניתן לצמצם מאוד (1% של שגיאה סטנדרטית עם מרווח ביטחון של 95% עבור ציור 5a). שיטת קביעת מסלול חייו מניח כי כל טיפות זהים כמעט. זה הוכח כנכון בעיקר משתי סיבות עיקריות: אם הטיפות היו שונים באופן משמעותי, את מסלולי החיים הממוצע שהושג היה שטוח, פחות פרופילים היסטוריות (ואת ההבדלים החדים בחיים לאורך טיפות בממוצע מזוהים באופן עקבי). יתר על כן, התוצאות הן לשעתקו ללא תלות הפרטטיפות או ניתח את כמות טיפות להשתמש בהם בחישובים. 8
1. תרשים זרימה על תהליך ייצור שבבים microfluidic.
איור 2 תרשים) המייצג את משאבות מזרק מזרקים, מחובר השבב microfluidic להיווצרות אגל ב) ייצוג סכמטי של ההתקנה אופטי אופייני לייזר דו - שני fluorophore (ירוק ואדום) עירור וגילוי.. DC = dichroic במראה, EM = מסנן פליטה, L = עדשה, PH = חור פין, APD = גלאי photodiode מפולת שלגים.
איור 3 על שבב היווצרות טיפת אסטרטגיות: א) זרימה התמקדות תצורה, ב) T-בצומת תצורה.. ג) ביום אנקפסולציה שבב droplets של שני ריאגנטים מימית להפריד במקור.
איור 4 readout אופטי של עקבות של 0.2 נרשמה (א) מת (ג) תאים חיים (ספיקה להשעיה תאים: 1 דקות μl -1, שמן: 2 דקות μl -1).. כל אות בצורת קשת מתאים המדיום LB פלורסנט חלושות היוצרת את אגל מימית, עם גבולות אגל מסומן בקווים מקווקווים. אותות הירוק מייצג readout תחת אותות 633nm אדום באורכי גל מעל 633 ננומטר. תאים נבדלים על ידי ספייק האנכי הנובע צבעים DNA intercalating. הסתברות הפצה התפוסה הסלולר בתוך טיפות יחיד (ב) תאים מתים (ד) בתאים חיים.
איור 5) אופיינית למסלול חייו בממוצע לאורך אגל ברוחב מסוים;. ב)ייצוג טיפוסי השילוב של כל מסלולי בממוצע נחקר לרוחב מלא של טיפות לתוך החיים 2D (או ריכוז, כפי שבאה לידי ביטוי Str-AF488% FITC /%) המפה.
תיארנו ייצור של המכשיר microfluidic, התקנה ניסיונית ופרוטוקולים הקשורים להיווצרות microdroplet ו אנקפסולציה מגיב זיהוי אופטי של טיפות מעובד. שתי הדוגמאות שנבחרו (זיהוי של תאים בודדים בטיפות ואת מיפוי של תהליכי ערבוב בתוך טיפות זורם) מייצגים יישומים נפוצים כי כרגע נחקרים עם מיקרופלואידיקה רביב.
כמו הניסויים שהוצגו להמחיש, את השימוש של פלטפורמות אגל microfluidic להציג מאפיינים אטרקטיביים מסוימים, כגון תפוקה גבוהה, מעין מושלם הכליאה, שחזור גבוהה ... כמות גדולה של מידע הפיק את המהירות הגבוהה שבה מידע זה שנוצר, אם כי, דורשים שימוש בשיטות זיהוי מהיר עם רזולוציה גבוהה spatiotemporal אם את היתרון המלא תועלת מן הפלטפורמות האלה מיניאטורי. במקרה זה להוכיח כי מדובראפשרי באמצעות מדויק מאוד טכניקות ספקטרוסקופיות ניאון. בפרט, זיהוי FLIM טכניקה (אשר עושה שימוש לייזר פעמו עם תקופות חזרה קצר ככל ns כמה) מגלה את היכולת להשיג מידע מהר מאוד במהירות טיפות זורם (כ 200 לשנייה). במקרה זה ההחלטה זמן של אירועים זוהה היה נמוך כמו 1 μs. במונחים של מגבלות גודל טיפה ריכוז, השימוש בעדשות גדולות צמצם המספרי לייזרים כוח גדול יותר יהיה קל להתיר את גילוי ריכוזים nM בתוך טיפות קטן כמו 5 מיקרומטר (מגבלות גודל טיפה להיות שהוטלו על ידי החלטות של photolithographic תהליך ייצור של השלב מיצוב submicron).
טיפות Microfluidic הם מועמדים אידיאליים לבצע ניסויים בקנה מידה גדול הכוללים כמויות קטנות של חומרים כימיים, אל היעד אירוע יחיד /. המגבלות הנוכחיות של טכנולוגיה זו כרוך קושי ליצור droplets ממגוון גדול (עשרות או מאות) של מקורות שונים באופן תפוקה גבוהה. בנוסף, הקושי להתמקד ולטפל בכל אגל יחיד שנוצר מטיל מגבלות חמורות על תחולת מעשי של טכניקות אלה. לכן, נושאים אלה עומדים במרכז מאמצי מחקר חשוב שנועד לפתח את הפתרונות הטכנולוגיים הדרושים שיאפשרו פלטפורמות אגל microfluidic להיות שיטה התייחסות סטנדרטית של מחקר וניתוח יישומי תפוקה גבוהה.
המחברים רוצים להכיר את התמיכה של מועצות מחקר ומענקים הבאים: EPSRC, HFSP, קרן המחקר הלאומית של קוריאה (מספר גרנט R11-2009-044-1002-0K20904000004-09A050000410).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
שם מגיב | סוג | חברה | מספר קטלוגי |
והעמסת 5-isothiocyanate (FITC) | מגיב | Sigma-Aldrich | F3651 |
Streptavidin-Alexa פלואוריד 488 | מגיב | מולקולרית בדיקות | S11223 |
Perfluorodecalin | מגיב | Sigma-Aldrich | P9900 |
1H, 1H, 2H, 2H-perfluorooctanol | מגיב | Sigma-Aldrich | 370533 |
Sylgard 184 אלסטומר סיליקון ערכת | מגיב | ראש ממשלת בריטניה Farnell בע"מ | 1673921 |
auramine-O | מגיב | Sigma-Aldrich | 861030 |
485 ננומטר פעמו לייזר דיודה | ציוד | PicoQuant | LDH-PC-485 |
TCSPC קארד | ציוד | PicoQuant | TimeHarp 100 |
dichroic במראה | ציוד | Chroma טכנולוגיה קורפ | z488rdc, |
מיקרוסקופ המטרה | ציוד | אולימפוס | UPLSAPO 60XW |
מפולת שלגים photodiode | ציוד | AQR-141, EG & G, פרקין אלמר-). | AQR-141 |
DMEM | מגיב | Invitrogen | ABCD1234 |
SYTO9 | מגיב | Invitrogen | S34854 |
Propidium יודיד | מגיב | Invitrogen | P3566 |
Escherichia coli העליון 10 זן | תאים | Invitrogen | C4040-10 |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved