A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
פרוטוקול זה מתאר שיטה לחילוץ וטיהור מיקרו-גרעינים מלימפוציטים אנושיים באמצעות צנטריפוגה של שיפוע צפיפות סוכרוז. הוא מספק בסיס ניסיוני לחקירת ההרכב והתפקוד של מיקרו-גרעינים.
מיקרו-גרעין (MN) הוא מבנה גרעיני לא תקין הנוצר בתאים, במיוחד במח העצם או בתאי דם, כאשר הם נחשפים לנזק חיצוני, כגון קרינה, עקב נזק לא פתור ל-DNA או שגיאות מיטוטיות. לאחר היווצרותם, MNs יכולים לתרום באופן פעיל לתהליכים מסרטנים שונים, כולל איתות דלקתי וסידורים גנטיים כרומוזומליים. MNs מכילים DNA גרעיני, היסטונים, שברי נוקלאופרוטאין וחלבונים פעילים אחרים, הקשורים קשר הדוק לתפקודיהם. חקר היווצרותם ומרכיביהם של MNs הוא חיוני להבנת תפקידם בהנעת תהליכים מסרטנים. מיצוי וטיהור של MNs חיוניים להשגת יעדי מחקר אלה. עם זאת, חוסר היציבות של הממברנה הגרעינית MN ורגישותה לקרע הופכים את התהליכים הללו למאתגרים מבחינה טכנית. נכון לעכשיו, רק מחקרים מעטים דיווחו על שימוש בצנטריפוגה של שיפוע צפיפות להפרדת MN. מחקר זה מסכם ומפשט את תהליכי ההפרדה והטיהור של MN. בודדו לימפוציטים בדם היקפי אנושי שנחשפו לקרינה, ו-MNs הופרדו וטוהרו באמצעות חוצצי סוכרוז בריכוזים שונים בתהליך דו-שלבי. השלמות והטוהר של ה-MNs אומתו, וסיפקו הדגמה ברורה ומעשית של הליך הניסוי לחוקרים החוקרים את הגורמים והתפקודים של MNs.
המיקרו-גרעין (MN) הוא מבנה תת-תאי בציטופלזמה המכיל DNA גרעיני, היסטונים ושברי נוקלאופרוטאין, המוקפים במבני ממברנה 1,2. ה-MN נפרד לחלוטין מהגרעין הראשי ומופיע בדרך כלל בקרבתו בצורה אליפסה או מעגלית, עם גודל שנע בין 1/16 ל-1/3 מקוטר הגרעין הראשי. היווצרות MNs קשורה בעיקר לשברי כרומוזומים א-צנטריים, מיסגרגציה כרומוזומלית, שבירת כרומוזומים דיצנטרית, חוסר יציבות כרומוזומלית וצבירה של דקות כפולות (DBs)3. MNs מתרחשים לעתים רחוקות בתאים בריאים ונגרמים בעיקר מחשיפה לגנוטוקסינים אקסוגניים, מה שמוביל לנזק ל-DNA או לטעויות מיטוטיות 4,5. נזקי קרינה הם תורם משמעותי להיווצרות MN, וחשיפה אנושית לקרינה מייננת (IR) גדלה עם התקדמות ביישומים קליניים וטכנולוגיים 6,7. חשיפה ל-IR גורמת לשבירות חד-גדיליות (SSBs) ושבירות דו-גדיליות (DSBs) ב-DNA התאי, מה שעלול לגרום למוות תאים או לאפופטוזיס 8,9,10. MNs הם שברים של כרומוזומים, כרומוזומים שלמים או כרומטידים המיוצרים עקב תיקון DSB לא מתוקן או לא תואם. הם משמשים כאינדיקטורים קריטיים למידת הנזק שנגרם על ידי IR 7,11,12. הבנה מקיפה של הרכיבים בתוך MNs חיונית להפחתת תופעות הלוואי של טיפול בקרינה ולמזעור חשיפת הציבור לקרינה לא רצויה 6,13. עם זאת, החלבונים וחומצות הגרעין הכלולים ב-MNs נותרו מאופיינים באופן חלקי עד היום.
מאמינים כי MNs נובעים מאינדוקציה של סוגים שונים של נזק ל-DNA. מנגנוני השכפול ויכולות תיקון ה-DNA שלהם נפגעים, מה שמוביל לנזק נרחב ל-DNA תוך תקופה קצרה 3,14,15. MNs הם גם אינדיקטורים חשובים לחוסר יציבות כרומוזומלית, הקיימת באופן עקבי בתאים טרום סרטניים 3,14,16,17,18,19. MNs שימשו זה מכבר כסמנים ביולוגיים לרעילות גנומית, סיכון לגידול ודרגת גידול 3,20,21. לאחר היווצרותם, MNs יכולים להניע באופן פעיל תהליכים מסרטנים רבים, כולל איתות דלקתי22,23 וסידור מחדש גנטי כרומוזומלי 24,25,26. לדוגמה, MNs יוזמים מפל דלקתי על ידי גיוס קולטן זיהוי דפוס ויראלי (PRR) סינתאז GMP-AMP מחזורי (cGAS) מהציטופלזמה 4,22,23,27. חלבונים אחרים שעשויים להיות נוכחים ב-MNs כוללים אקסונוקלאזים28, מנגנוני שעתוק4 וקופקטורים תרגום. עדיין לא ברור אם MNs מרכיבים פרופיל חלבון ייחודי ומוטה מספריית החלבונים הציטופלזמיים או רוכשים באופן פסיבי חלבונים בשפע גבוה מהגרעין והציטופלזמה במהלך היווצרותם. מעבר לחלבונים בודדים כגון cGAS, המידה שבה סביבות ספציפיות משפיעות על הרכב ה-MN הכולל עדיין לא נקבעה. ההבנה של כל נוף המיקרו-גרעינים מוגבלת, ללא מערכי נתונים זמינים לציבור לחקירה. לכן, יש צורך בדחיפות במיצוי MNs שלמים ומטוהרים לניתוחים מעמיקים ומקיפים של מרכיביהם.
אחת הסיבות לעיכוב בשכפול ה-DNA ב-MNs עשויה להיות מתח שכפול הנגרם על ידי מחסור באנזימים וקופקטורים הנדרשים לסינתזה ותיקון DNA. מחסור זה עשוי לנבוע מהרכבה לקויה של המעטפת הגרעינית של MN, מה שמוביל להיעדר קומפלקס נקבוביות גרעיניות20. כתוצאה מכך, MNs אינם מסוגלים לייבא חלבוני מפתח החיוניים לשמירה על שלמות הממברנה הגרעינית ויציבות הגנום 2,29,30,31. הממברנה הגרעינית הלא שלמה של MN נוטה להיקרע, מה שהופך את מיצוי ה-MN למאתגרת ביותר.
נכון לעכשיו, MNs מופקים בעיקר באמצעות צנטריפוגה של שיפוע צפיפות סוכרוז 27,32,33 ומטוהרים על ידי זרימה ציטומטרית 34. במחקר זה, תהליך ההפרדה והטיהור של MNs סוכם ופשט. בודדו לימפוציטים בדם היקפי מבני אדם שנחשפו לקרינה, ו-MNs טוהרו פעמיים באמצעות חוצצי סוכרוז בריכוזים שונים. השלמות והטוהר של ה-MNs אומתו, וסיפקו לחוקרים הדגמה ניסויית מעשית ואינטואיטיבית לחקר הגורמים והתפקודים של MNs.
כל הניסויים שכללו דגימות דם היקפיות אנושיות נערכו בהתאם להנחיות ולתקנות הרלוונטיות. מחקר זה אושר על ידי הוועדה האתית של בית החולים 416 לתעשייה גרעינית בסין (סקירת 2020 [מס' 48]), והתקבלה הסכמה מדעת מכל המשתתפים. קריטריוני ההחרגה כללו אנשים עם מחלות כרוניות עיקריות, כגון גידולים, גאוט או הפרעות דם, כמו גם כאלה שנחשפו לחומרים רדיואקטיביים או גנוטוקסיים במקצועם. לצורך מחקר זה, 10 מ"ל של דם היקפי נאספו מגבר בריא בן 28 לתוך צינור איסוף דם המכיל נתרן הפרין כנוגד קרישה. הדגימה הוקרנה במבחנה עם 60קרני Co γ ב-37 מעלות צלזיוס באמצעות מכשיר סטנדרטי ברמה טיפולית של אנרגיה קינטית גמא אוויר. מינון ההקרנה הוגדר ל-4.0 Gy, עם קצב מינון של 0.6350 Gy/min. לאחר ההקרנה, הדגימה הודגרה ב-37 מעלות צלזיוס למשך שעתיים, חוסנה למדיום RPMI-1640 ותרבית ב-37 מעלות צלזיוס למשך 60 שעות. פרטים על הריאגנטים והציוד המשמשים במחקר זה מסופקים בטבלת החומרים.
1. הכנת מיקרוגרעין וגרעין
2. בידוד לימפוציטים
3. ליזיס של לימפוציטים
4. בידוד ראשוני של MNs באמצעות שיפוע צפיפות סוכרוז
5. טיהור משני של MNs באמצעות שיפוע צפיפות סוכרוז
6. זיהוי MNs
לאחר חשיפה לקרינה, דם היקפי אנושי הודגר עם RPMI-1640 למשך 60 שעות, ולאחר מכן נוסף ציטוכלזין B להכנת מיקרו-גרעין (MN). לימפוציטים בודדו באמצעות תמיסת הפרדת לימפוציטים, ואחריה ליזה עם ליזאט תאים שהוגדר במיוחד והומוגניזציה עדינה בהומוגנייזר זכוכית. ההומוגנאט היה מעורבב 1:1 עם מאגר ס...
בשיטה זו נעשה שימוש בלימפוציטים של דם היקפי אנושי מוקרן לבידוד וטיהור של מיקרו-גרעינים (MNs). מחקרים קודמים רבים דיווחו על השלבים המפורטים לליזה תאית והפרדה ראשונית של MNs 4,32,33,34. תמיסת הליזיס של התאים כו?...
ללא.
כל הדמויות נוצרו על ידי המחברים באמצעות משרד WPS. עבודה זו נתמכה על ידי הקרן למדעי הטבע של המכללה הרפואית צ'נגדו (CYZ19-38), ותוכנית התמיכה במדע וטכנולוגיה של מחוז סצ'ואן (2024NSFSC0592).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
15 mL conical tube | Thermo | 339650 | |
4% paraformaldehyde solution | Beyotime | P0099 | |
50 mL conical tube | Thermo | 339652 | |
Anti-γ-H2AX antibody | Bioss | bsm-52163R | |
Bovine serum albumin | Beyotime | ST023 | |
Calcium chloride | Biosharp | BS249 | |
Cytochalasin B | Macklin | 14930-96-2 | |
DAPI dyeing solution | Bioss | S0001 | |
Dithiothreitol (DTT) | Coolaber | CD4941 | |
EDTA | Biosharp | BS107 | Ethylene Diamine Tetraacetic Acid |
Fluorescence microscope | Nikon | Ti2-U | |
Homogenizer | Ybscience | YB101103-1(20 mL) | |
Horizontal controlled temperature centrifuge | Thermo | Sorvall ST1R plus | Brake speed is set to "5" |
Human lymphocyte separation solution | Beyotime | C0025 | |
Magnesium acetate | Macklin | M833330 | |
NP-40 | Coolaber | SL9320 | 10% solution |
Phosphate buffer solution(PBS) | HyClone | SH30256.01B | |
Protease inhibitors | Coolaber | SL1086 | Cocktail (100×) |
Secondary antibody | Bioss | Bs-0295G | Goat Anti-Rabbit IgG H&L/FITC |
Spermidine | Coolaber | CS10431 | |
Spermine | Coolaber | CS10441 | |
Sucrose | Coolaber | CS10581 | |
Tris-HCl | Biosharp | BS157 | |
Triton X-100 | Beyotime | P0096 |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved