פולחן ופירום חיידקים מדגימות קרקע

Overview

מקור: מעבדות של ד"ר איאן פפר וד"ר צ'ארלס גרבה - אוניברסיטת אריזונה
מפגינים: בראדלי שמיץ ולואיזה איקנר

קרקעות פני השטח הן תערובת הטרוגנית של חלקיקים אנאורגניים ואורגניים המאחדים יחד ליצירת אגרגטים משניים. בתוך ובין האגרגטים יש חללים או נקבוביות המכילים חזותית הן אוויר והן מים. תנאים אלה יוצרים מערכת אקולוגית אידיאלית לחיידקים, כך שכל הקרקעות מכילות אוכלוסיות עצומות של חיידקים, בדרך כלל מעל מיליון לגרם של אדמה.

חיידקים הם המיקרואורגניזמים הפשוטים ביותר, הידועים בשם פרוקריוטים. בתוך קבוצה פרוקריוטית זו, ישנם חיידקים חוטיים המכונים actinomycetes. Actinomycetes הם למעשה חיידקים, אבל הם נחשבים לעתים קרובות קבוצה ייחודית בתוך הסיווג של חיידקים בגלל המבנה שלהם חוטים, אשר מורכב תאים מרובים תלויים יחד כדי ליצור hyphae. ניסוי זה משתמש במדיה מקרה גליצריל לבחור עבור מושבות actinomycete, במהלך דילול ו ציפוי. בדרך כלל, actinomycetes הם כ -10% מכלל אוכלוסיית החיידקים. חיידקים ואקטינומיצטים נמצאים בכל סביבה על פני כדור הארץ, אבל השפע והמגוון של חיידקים אלה באדמה הוא שאין שני לו. חיידקים אלה חיוניים גם לחיי אדם ומשפיעים על מה שאנשים אוכלים, שותים, נושמים או נוגעים בו. בנוסף, ישנם מינים חיידקיים שיכולים להדביק אנשים ולגרום למחלות, ויש חיידקים שיכולים לייצר מוצרים טבעיים המסוגלים לרפא אנשים. Actinomycetes חשובים במיוחד לייצור אנטיביוטיקה, כגון סטרפטומיצין. חיידקים חיוניים לרכיבה על אופניים מזינים, צמיחת צמחים והשפלה של מזהמים אורגניים.

חיידקים מגוונים מאוד מבחינת מספר המינים שניתן למצוא בקרקע, בין היתר משום שהם מגוונים מבחינה פיזיולוגית ומטבולית. חיידקים יכולים להיות הטרוטרופיים, כלומר הם משתמשים בתרכובות אורגניות, כגון גלוקוז, למזון ואנרגיה, או אוטוטרופי, כלומר הם משתמשים בתרכובות אנאורגניות, כגון גופרית בסיסית, למזון ואנרגיה. הם יכולים גם להיות אירוביים, ניצול חמצן לנשימה, או אנאירובי, ניצול צורות משולבות של חמצן, כגון חנקות או גופרתי, כדי להנשימה. חיידקים מסוימים יכולים להשתמש בחמצן או בצורות משולבות של חמצן וידועים בשם אנארובים פקולטיביים.

Procedure

1. הכנת דילול קרקע

  1. כדי להתחיל את ההליך, לשקול 10 גרם של דגימת קרקע ולהוסיף 95 מ"ל של מים deionized. לנער את ההשעיה היטב, ולתייג כמו "A".
  2. לפני שהאדמה מתיישבת, להסיר 1 מ"ל של ההשעיה עם pipette סטרילי ולהעביר אותו מים deionized 9 מ"ל ריק. מערבולת ביסודיות, ולתייג כמו "B".
  3. חזור על שלב דילול זה שלוש פעמים, בכל פעם עם 1 מ"ל של ההשעיה הקודמת ומים שעברו דה-יוניזציה של 9 מ"ל ריקים. תייג אותם ברצף כצינורות C, D ו- E. התוצאה היא דילול סדרתי של 10-1 עד 10-5 גרם של א

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Results

דגימה של 10 גרם של אדמה עם תכולת לחות של 20% על בסיס משקל יבש מנותחת עבור חיידקים קיימא culturable באמצעות טכניקות דילול ו ציפוי. הדילול נעשה כפי שמוצג בטבלה 1. 1 מ"ל של פתרון E הוא שפך מצופה על מדיום מתאים ותוצאה 200 מושבות חיידקים.

Equation 1

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Application and Summary

ישנם שני יישומים בסיסיים של דילול ו ציפוי של חיידקי קרקע. היישום הראשון הוא הספירה של חיידקים culturable בתוך אדמה מסוימת. כימות מספר חיידקי הקרקע נותן אינדיקציה לבריאות הקרקע. לדוגמה, אם יש 106 עד 108 חיידקים culturable נוכחים לכל גרם של אדמה, זה ייחשב מספר בריא. מספר קטן מ 106 לגרם מצבי?...

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Tags
CulturingEnumeratingBacteriaSoil SamplesAccurate CountHealthSoil EcosystemCulturing Bacterial ColoniesDilutionsImportantDecompositionNitrogen FixingNutrient CyclingSurface SoilsOrganic ParticlesInorganic ParticlesComplex MatrixPoresAirWaterIdeal EcosystemMillion Bacteria Per GramDilutionPlatingGrowth MediaSerial DilutionsSingle ColoniesMedia PlatesInitial CountsPrepare Serial DilutionsBacterial SamplesCalculate Soil Bacterial CountsProkaryotic OrganismsSpecies Diversity

Skip to...

0:00

Overview

1:25

Principles of Culturing and Enumerating Soil Bacteria

3:33

Preparation of Soil Dilutions

4:29

Making Spread Plates for Bacterial Culture

6:20

Bacterial and Actinomycetes Counts

7:09

Isolation of Pure Cultures

8:41

Applications

10:31

Summary

Videos from this collection:

article

Now Playing

פולחן ופירום חיידקים מדגימות קרקע

Environmental Microbiology

182.6K Views

article

קביעת תכולת הלחות בקרקע

Environmental Microbiology

357.3K Views

article

טכניקה אספטית במדעי הסביבה

Environmental Microbiology

125.3K Views

article

כתמי גרם של חיידקים ממקורות סביבתיים

Environmental Microbiology

98.2K Views

article

הדמיית מיקרואורגניזמים קרקע באמצעות מצג שקופיות מגע ומיקרוסקופיה

Environmental Microbiology

41.8K Views

article

פטריות נלאמנטיות

Environmental Microbiology

55.5K Views

article

הפקת דנ"א קהילתי ממושבות חיידקים

Environmental Microbiology

28.6K Views

article

זיהוי מיקרואורגניזמים סביבתיים עם תגובת שרשרת פולימראז ואלקטרופורזה ג'ל

Environmental Microbiology

44.1K Views

article

ניתוח RNA של דגימות סביבתיות באמצעות RT-PCR

Environmental Microbiology

40.1K Views

article

כימות מיקרואורגניזמים סביבתיים ווירוסים באמצעות qPCR

Environmental Microbiology

47.6K Views

article

ניתוח איכות מים באמצעות אורגניזמים מחוון

Environmental Microbiology

29.2K Views

article

בידוד חיידקים צואתיים מדגימות מים על ידי סינון

Environmental Microbiology

39.0K Views

article

זיהוי בקטריופאג'ים בדגימות סביבתיות

Environmental Microbiology

40.4K Views

article

ניתוח עקומת גדילה חיידקית והיישומים הסביבתיים שלה

Environmental Microbiology

294.6K Views

article

1 200 אצות באמצעות מתודולוגיה של Culturable

Environmental Microbiology

13.6K Views

JoVE Logo

Privacy

Terms of Use

Policies

Research

Education

ABOUT JoVE

Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved