אנו מודים מרכז אוהיו מקיף אוניברסיטת סרטן למתן מימון עבור עבודה זו.

1. Cell קו עם המצע רקומבינציה משולב <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> התאים הלה הפכו ביציבות עם PDR-GFP (מתנה פלסמיד 7 מ מ Jasin, ממוריאל סלואן קטרינג Cancer Center) ומתוחזק puromycin לבחירת transformants. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> התאים passaged ב DMEM / FBS, המכיל 10% בסרום שור עוברית, 2 מ&quot;מ GlutaMAX, נתרן 1 mM pyruvate, פניצילין / סטרפטומיצין (100 U / mL/0.1 מ&quot;ג / מ&quot;ל), ו 1.5 UG / mL puromycin. </li></ol> המצע רקומבינציה ב-GFP-PDR הפלסמיד, וב transformants יציבה, מכיל שני אללים פעיל של ה-GFP (איור 1). אחת אלל אינו פעיל עקב הכללת ברצף קידוד של האתר 18 נ&quot;ב אנזים הכרה הגבלה עבור I-SCEI. הביטוי של I-SCEI בתאים אלה יוצר לשבור פעמיים גדילי דנ&quot;א (DSB). יש האלל השני של ה-GFP פעיל על ה-DNA הזה, אבל את החלק של הרצף שלה בקורלציה עם האתר I-SCEI על האלל הראשון הוא wild-type. זה האלל GFP השני יכול לתפקד בתור התורם רצף לתיקון הומולוגיים רקומבינציה של DSB ו תביא אלל GFP פעיל, אשר מזוהה בקלות על ידי cytometry הזרימה. לחלופין, DSB יכול להיות מתוקן על ידי nonhomologous סוף להצטרף, אשר יהרוס את האתר I-SCEI הגבלה תגרום GFP שלילי תאים. רמת רקומבינציה הומולוגיים בתא נקבע על ידי ספירת אחוז GFP חיובי תאים. קו זה התא, pHeLa-DR13-9, נבחר בין כל הכפילים לאות אפס רקע GFP ואחוז גבוה יחסית של ה-GFP חיובית על תאים transfection עם I-SCEI להביע pCBASce פלסמיד,. (PCBASce ושליטה וקטור שלה, pCAGGS, היו שניהם מסופק על ידי מ &#39;Jasin של מרכז הסרטן סלואן קטרינג הזיכרון). השורה הלה-DR13-9 תאים זמין המחברים על פי בקשה. 2. Transfection כדי לכלות BRCA1 אנדוגני הוסף חזור BRCA1 Mutant. <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> יום לפני transfection הראשונה (בדרך כלל יום שלישי): התחל עם צלחת 10 ס&quot;מ של הלה-DR13-9 תאים לפחות 90% ומחוברות. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> Trypsinize ב 1 מ&quot;ל ולעצור את התגובה על ידי הוספת 9 מ&quot;ל DMEM / FBS, ומערבבים היטב על ידי pipetting. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> הוסף 40 μL של תאים trypsinized היטב לכל צלחת 24 היטב מ&quot;ל של 0.5 DME / FBS. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> 1 יום transfections (יום רביעי): תאים יש ~ ומחוברות 40-50%, אם הרבה פחות ולהתחיל מחדש. Transfect על ידי ערבוב: 5 siRNA pmol + 0.3 UG BRCA1-DNA פלסמיד המבטא מוטציה ב 12.5 μL Opti-ממ, ו 0.5 Lipofectamine μL 2000 ב 12.5 μL Opti-ממ. המשך transfection על פי פרוטוקול Lipofectamine (Invitrogen). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> החלף את המדיה 4-6 שעות מאוחר יותר. SiRNA אנו משתמשים כדי לרוקן BRCA1 מבוסס על GCUCCUCUCACUCUUCAGU רצף ציון BRCA1 3&#39;-UTR רצפים 80,780 עד 80,798 (מספר ההצטרפות AY273801). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> יום 2: העברת התאים על ידי trypsinizing מהצלחת גם 24 לצלחת 6 באר. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> 3 יום transfections: 25 siRNA pmol + 0.75 UG BRCA1-DNA פלסמיד המבטא מוטציה + 0.75 pCBASce UG (או שליטה pCAGGS וקטור) ב 62.5 μL Opti-ממ ו 2.5 Lipofectamine μL 2000 ב 62.5 μL Opti-ממ. החלף את המדיה 4-6 שעות מאוחר יותר. </li></ol> 3. ניתוח Transfectants. <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> ביום 6, trypsinize התאים היטב כל עצירה 1 מ&quot;ל DMEM / FBS. ניתוח תאים לביטוי GFP יכול להיעשות על 5 או 7 ימים, אך אנו מוצאים כי ביום 6 עובד הכי טוב. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> נתח 10,000 תאים לכל היטב על ידי cytometry הזרימה. אנו משתמשים בכלי בקטון דיקינסון FACSCalibur של אוניברסיטת מדינת אוהיו מקיף סרטן משאב מרכז אנליטי cytometry משותף. יחיד, תאים חיים הם מגודרת באמצעות פרמטרים פיזור קדימה בצד. GFP חיובי תאים מזוהים באמצעות גלאי הקרינה GFP (FL1), והתוצאות מוצגות היסטוגרמה (איור 2, למטה). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> השמאל על התאים ניתן replated לצילום על ידי מיקרוסקופ פלואורסצנטי אם תרצה בכך. </li></ol> 4. נציג תוצאות: BRCA1 מסדיר את מסלול תיקון של DNA גדילי כפול נשבר על ידי רקומבינציה הומולוגיים 6,11. תאים אלה אשר עברו תיקון ע&quot;י רקומבינציה הומולוגיים מזוהים בקלות על ידי מיקרוסקופ פלואורסצנטי (איור 2, למעלה). דלדול של תוצאות BRCA1 לירידה GFP חיובי זיהה התאים (איור 2, מימין). התפוקה של FACSCalibur היא היסטוגרמה בעוצמה GFP לכל תא על ציר ה-X ואת מספר התאים על ציר Y (איור 2, למטה). בכל קבוצה טיפוסית של תוצאות מניסוי אחד, 15.5% מכלל התאים היו GFP חיובי לאחר I-SCEI ביטוי ושליטה דלדול RNAi (איור 3). לשם השוואה, דלדול של BRCA1 ו - וקטור להוסיף מופחת בחזרה GFP המרה ל 0.7%. תוספות האחורי של BRCA1 wild-type או של רקומבינציה BRCA1 (I21V) הומולוגיים שוחזר במלואו, כפי שזוהו על ידי השגת 15-16% GFP חיובי תאים. תוספות האחורי של (BRCA1 M18T) מוטציה (איור 3, מסלול 5) היתה השפעה דומה לזו של התוספת האחורי של שליטה וקטור. מאז גרסה זו מתבטאת ברמות דומות כמו חלבון אנדוגני 9, ולכן אנו מפרשים את וריאנט (M18T) BRCA1 הוא לא פונקציונלי רקומבינציה הומולוגיים. אנחנו בדרך כלל יש 10-20% של התאים להמיר את ה-GFP חיובי לאחר transfecting הביטוי I-SCEI פלסמיד. דלדול של BRCA1 reproducibly מפחית את ההמרה של ה-GFP חיובי תאים על ידי קיפול על 8-10. למרות אחוזי בפועל של ה-GFP חיובי תאים עשויים להשתנות מניסוי לניסוי, יחס חיובי של ה-GFP בתאים בעקבות דלדול BRCA1 דלדול יחסי שליטה בתוך ניסוי עקבי למדי. אנו לנרמל את התוצאות על ידי קביעת שיעור ההמרה מעצורים עד 100% והתוצאות להביע עם depletions BRCA1 ו התוספת הגב באחוזים. בדרך זו, אנו יכולים לשלב מספר רב של ניסויים, ואת וריאציה הניסוי אינה גבוהה. הוסף האחורי של מוטציות BRCA1 עד כה הניבו תוצאות חזקות: כל גרסה יש BRCA1 או שמלוא הפעילות הומולוגיים רקומבינציה או יש לו כל השפעה. שיקול חשוב בהשגת התוצאות הללו היא כי התנאים transfection שלנו לייצר רמות של החלבון BRCA1 כי כ שווה את הריכוז של חלבון אנדוגני בתאים שלא טופלו. גבוה מדי של overexpression של מוטציה של BRCA1 פגום אפילו עלול לגרום פעילות כלשהי הומולוגיים חיובי רקומבינציה. הבעיה שאנחנו צריכים להתגבר היה את הרעילות של transfection. דלדול של BRCA1 עצמה יכול להאט צמיחת תאים, ואת היתרה של ה-DNA Lipofectamine-2000 ו - פלסמיד ביחס למספר התאים על צלחת חייב להתקיים ברמה עקבית. דנ&quot;א מדי Lipofectamine הרבה או פלסמיד תפחית מספרים סלולריים, את מספר התאים יהיה מספיק כדי לקבל תוצאות אמינות cytometry הזרימה. יתרת ריאגנטים פלסמיד ו Lipofectamine לעומת מספר של תאים transfected חשוב מאוד לשמור על יכולת הקיום של התאים. <img src="/files/ftp_upload/2468/2468fig1.jpg" alt="איור 1" /> באיור 1. המצע רקומבינציה. האסטרטגיה אשר פותחה על ידי קבוצה של מ Jasin 7,12 מתואר. PDR-GFP פלסמיד המכיל שני אללים פגומים של ה-GFP, אשר אחד מהם מכיל I-SCEI endonuclease אתר הגבלה. שורת תאים הנגזרים הלה מכיל זה המצע DNA משולב באתר יחיד הגנום 9, ותיקון פעיל לשבור פעמיים תקועים ה-DNA באתר I-SCEI על ידי הומולוגיים תוצאות רקומבינציה בהמרה של אלל אחד GFP חיובי. <img src="/files/ftp_upload/2468/2468fig2.jpg" alt="איור 2" /> איור 2. גילוי ה-GFP חיובי תאים על ידי מיקרוסקופ פלואורסצנטי. תאים נבדקו לפי פרוטוקול זה, שליטה מתרוקנים התאים היו פעילים רקומבינציה הומולוגיים, זוהה על ידי אחוז גבוה של תאים עם ביטוי של GFP (משמאל). דלדול של BRCA1 על ידי תוצאות RNAi לירידה חדה במספר של ה-GFP חיובי תאים (מימין). <img src="/files/ftp_upload/2468/2468fig3.jpg" alt="איור 3" /> איור 3. תוצאות של התוספת האחורי של מוטציות BRCA1 missense. תוצאות מניסוי בודד מוצגים היסטוגרמה זו. בהעדר transfected I-SCEI להביע פלסמיד (מסלול 1) אין GFP חיובי תאים זוהה. התוצאות במסלולים 2-6 נלקחו כל מתאי שבו אני מביע-SCEI הפלסמיד היה transfected ביום 3. בתאים שהיו מרוקנים עבור גן רלוונטית (בלוציפראז) ועם וקטור התוספת בחזרה, 15.5% מכלל התאים היו GFP חיובי (מסלול 2). דלדול של BRCA1 ו - וקטור התוספת בחזרה חושף את ההשפעה של אובדן BRCA1 על רקומבינציה הומולוגיים (מסלול 3). ההשפעות של דלדול של BRCA1 ו התוספת האחורי של BRCA1 wild-type (מסלול 4), BRCA1 (M18T) (מסלול 5), BRCA1 (I21V) (מסלול 6) מוצגים. תוצאות אלו מניסוי אחד, יהיה משולב עם לפחות שני ניסויים חוזרים יותר כדי להשיג מידה של רקומבינציה הומולוגיים נתמך על ידי חלבון נתון מוטציה BRCA1.

<ol>
	<li>Carvalho, M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Determination+of+cancer+risk+associated+with+germ+line+BRCA1+missense+variants+by+functional+analysis.">Determination of cancer risk associated with germ line BRCA1 missense variants by functional analysis.</a> Cancer Res. 67, 1494-1501 (2007).</li><li>Couch, F. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genetic+epidemiology+of+BRCA1.">Genetic epidemiology of BRCA1.</a> Cancer Biol Ther. 3, 509-514 (2004).</li><li>Couch, F. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Assessment+of+functional+effects+of+unclassified+genetic+variants.">Assessment of functional effects of unclassified genetic variants.</a> Hum Mutat. 29, 1314-1326 (2008).</li><li>Tomlinson, G. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterization+of+a+breast+cancer+cell+line+derived+from+a+germ-line+BRCA1+mutation+carrier.">Characterization of a breast cancer cell line derived from a germ-line BRCA1 mutation carrier.</a> Cancer Res. 58, 3237-3242 (1998).</li><li>Ruffner, H., Joazeiro, C. A., Hemmati, D., Hunter, T., Verma, I. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cancer-predisposing+mutations+within+the+RING+domain+of+BRCA1:+loss+of+ubiquitin+protein+ligase+activity+and+protection+from+radiation+hypersensitivity.">Cancer-predisposing mutations within the RING domain of BRCA1: loss of ubiquitin protein ligase activity and protection from radiation hypersensitivity.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 98, 5134-5139 (2001).</li><li>Moynahan, M. E., Chiu, J. W., Koller, B. H., Jasin, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Brca1+controls+homology-directed+DNA+repair.">Brca1 controls homology-directed DNA repair.</a> Mol Cell. 4, 511-518 (1999).</li><li>Nakanishi, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Human+Fanconi+anemia+monoubiquitination+pathway+promotes+homologous+DNA+repair.">Human Fanconi anemia monoubiquitination pathway promotes homologous DNA repair.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 102, 1110-1115 (2005).</li><li>Pierce, A. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Double-strand+breaks+and+tumorigenesis.">Double-strand breaks and tumorigenesis.</a> Trends Cell Biol. 11, 52-59 (2001).</li><li>Ransburgh, D. J., Chiba, N., Ishioka, C., Toland, A. E., Parvin, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+of+breast+tumor+mutations+in+BRCA1+that+abolish+its+function+in+homologous+DNA+recombination.">Identification of breast tumor mutations in BRCA1 that abolish its function in homologous DNA recombination.</a> Cancer Res. 70, 988-995 (2010).</li><li>Easton, D. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+systematic+genetic+assessment+of+1,433+sequence+variants+of+unknown+clinical+significance+in+the+BRCA1+and+BRCA2+breast+cancer-predisposition+genes.">A systematic genetic assessment of 1,433 sequence variants of unknown clinical significance in the BRCA1 and BRCA2 breast cancer-predisposition genes.</a> Am J Hum Genet. 81, 873-883 (2007).</li><li>Snouwaert, J. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=BRCA1+deficient+embryonic+stem+cells+display+a+decreased+homologous+recombination+frequency+and+an+increased+frequency+of+non-homologous+recombination+that+is+corrected+by+expression+of+a+brca1+transgene.">BRCA1 deficient embryonic stem cells display a decreased homologous recombination frequency and an increased frequency of non-homologous recombination that is corrected by expression of a brca1 transgene.</a> Oncogene. 18, 7900-7907 (1999).</li><li>Pierce, A. J., Hu, P., Han, M., Ellis, N., Jasin, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ku+DNA+end-binding+protein+modulates+homologous+repair+of+double-strand+breaks+in+mammalian+cells.">Ku DNA end-binding protein modulates homologous repair of double-strand breaks in mammalian cells.</a> Genes Dev. 15, 3237-3242 (2001).</li><li>Spearman, A. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Clinically+applicable+models+to+characterize+BRCA1+and+BRCA2+variants+of+uncertain+significance.">Clinically applicable models to characterize BRCA1 and BRCA2 variants of uncertain significance.</a> J Clin Oncol. 26, 5393-5400 (2008).</li><li>Sweet, K., Senter, L., Pilarski, R., Wei, L., Toland, A. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterization+of+BRCA1+ring+finger+variants+of+uncertain+significance.">Characterization of BRCA1 ring finger variants of uncertain significance.</a> Breast Cancer Res Treat. 119, 737-743 (2009).</li></ol>

אין ניגודי אינטרסים הכריז.

היתרון של שיטה זו הוא כי אנו יכולים לחקור את הפונקציה של החלבון BRCA1 בוויסות תיקון DNA על ידי רקומבינציה הומולוגיים באמצעות תאים בעלי wild-type BRCA1 הביע endogenously. אימצנו שתי שיטות הוקמה נפרדים של הלומדים בתהליך הומולוגיים רקומבינציה של ניצול RNAi בתיווך דלדול כדי להשיג את שיטה חדשה לבדיקת גרסאות BRCA1 עבור לתפקד תיקון דנ&quot;א. המפתח להצלחה של שיטה זו היה להקים קו תא transfectable בקלות, כמו הלה, עם המצע רקומבינציה בגנום כך אנו מקבלים רמות גבוהות מאוד של ההמרה GFP. היו לנו מספר הוקרן שיבוטים של טרנספורמציה המקורי כדי להשיג אחד כי לא היה אות לגילוי GFP ברקע, אבל על transfection הביטוי I-SCEI הפלסמיד לו רמה גבוהה מאוד של ההמרה GFP. באמצעות שיטה זו, אנו נמצאים כעת בחקירת אחרים ספציפיים חומצה אמינית BRCA1 שאריות עבור לתפקד רקומבינציה הומולוגיים. יחד עם תובנות ביולוגיות מעבודה זו, מסקנות אלה יכול להיות מיושם על גנטיקה וסרטן קליניים. אחוז גבוה של מוטציות BRCA1 missense יש משמעות קלינית ידוע מאז ישנם וריאנטים נדירים רבים, ואין מספיק מידע עבור רבים של אלה לקבוע את הקשר סרטן על ידי ניתוח הפרדה גנטית 3,10,13,14. באמצעות שיטה זו, התוצאות של גרסה מסוימת על התפקוד הביולוגי של BRCA1 בוויסות הומולוגיים רקומבינציה יכול לשמש כדי ליידע את הנשים לבצע אחת הגרסאות הללו בגנום שלהם.

<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en">	
		
		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>DMEM</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen</td>
<td>11960</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>FBS</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>USA Scientific</td>
<td>9871-5200</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>siRNA</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen</td>
<td>N/A</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Lipofectamine-2000</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen</td>
<td>11668</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>TrypLE</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen</td>
<td>12604</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Puromycin</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Enzo Life Sciences</td>
<td>BML-GR312</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Opti-MEM I</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen</td>
<td>31985</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Sodium Pyruvate</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen</td>
<td>11360</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>GlutaMAX I</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen</td>
<td>35050</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Penicillin-Streptomycin</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen</td>
<td>15140</td>
<td>&nbsp;</td>		</tbody>
		</table>
		</div>

identifying the effects of brca1 mutations on homologous recombination using cells that express endogenous wild-type brca1

ניתוח פונקציונלי של מוטציות missense יכול להיות מסובך ידי נוכחות בתא של חלבון אנדוגני. מבנה פונקציה ניתוח BRCA1 כבר מסובך מחוסר assay חזקים החלבון BRCA1 מלא אורך הקשיים הכרוכים בעבודה עם שורות תאים המבטאים חלבון BRCA1 hypomorphic 1,2,3,4,5. פיתחנו מערכת לפיה את החלבון BRCA1 אנדוגני בתא היה מדולדל בחריפות על ידי RNAi מיקוד 3&#39;-UTR-mRNA BRCA1 ו הוחלף על ידי שיתוף transfecting פלסמיד המבטא גרסה BRCA1. אחד היתרונות של הליך זה היא כי ההשתקה חריפה של החלפת BRCA1 ו סימולטני לאפשר לתאים לגדול ללא מוטציות משני או התאמות שעלולות להתעורר לאורך זמן על מנת לפצות על אובדן של הפונקציה BRCA1. דלדול זה ולהוסיף גב ההליך נעשה קו הלה הנגזרות תא היה assayed בקלות לפעילות הומולוגיים רקומבינציה. Assay הומולוגיים רקומבינציה מבוסס על שיטה שפורסמו בעבר לפיה מצע רקומבינציה משולב לתוך הגנום (איור 1) 6,7,8,9. זה המצע רקומבינציה יש נדיר חיתוך I-SCEI אנזים הגבלה בתוך אתר אלל GFP פעיל, במורד הוא אלל second-GFP פעיל. Transfection של פלסמיד המבטא I-SCEI תוצאות לשבור פעמיים תקועים, אשר עשוי להיות מתוקן על ידי רקומבינציה הומולוגיים, ואם הומולוגיים רקומבינציה עושה לתקן את לשבור אותו יוצר אלל GFP פעיל כי הוא הבקיע בקלות ביטוי חלבון ה-GFP על ידי זרימת cytometry . דלדול של BRCA1 אנדוגני הביא לירידה של 8-10 פי בפעילות הומולוגיים רקומבינציה, ולהוסיף גב של הפונקציה רקומבינציה פלסמיד wild-type שוחזר במלואו הומולוגיים. כאשר נקודה מסוימת של מוטציות BRCA1 באורך מלא באו לידי ביטוי מתוך שיתוף transfected פלסמידים, ההשפעה של מוטציה missense ספציפי יכול להיות קלע. כדוגמה, את הביטוי של החלבון BRCA1 (M18T), סוג של משמעות קלינית ידוע 10, באה לידי ביטוי התאים האלה, היא לא הצליחה לשחזר BRCA1 תלויי הומולוגיים רקומבינציה. על ידי הביטוי לעומת זאת, גרסה של אחר, גם משמעות ידועה, BRCA1 (I21V) שוחזר במלואו BRCA1 תלויי הומולוגיים פונקציה רקומבינציה. אסטרטגיה זו של בדיקות תפקוד של מוטציות BRCA1 missense הוחל על מערכת ביולוגית אחרת assaying לתפקוד centrosome (קייס ואח&#39;, תצפיות לא פורסם). ככלל, גישה זו מתאימה לניתוח מוטציות בגן missense כל זה יש לנתח recessively.

Watch this Scientific Journal Video about Identifying the Effects of BRCA1 Mutations on Homologous Recombination using Cells that Express Endogenous Wild-type BRCA1 at JoVE.com

Identifying the Effects of BRCA1 Mutations on Homologous Recombination using Cells that Express Endogenous Wild-type BRCA1

אנו מספקים שיטה לבדיקת גרסאות BRCA1 ב assay רקמה תרבות המבוססת לתיקון הומולוגיים רקומבינציה של נזק לדנ&quot;א על ​​ידי depleting החלבון BRCA1 אנדוגני מתא באמצעות RNAi והחלפתו מוטציה נקודת BRCA1 המכיל לשנות קידוד.

זיהוי השפעות של מוטציות BRCA1 על רקומבינציה הומולוגיים באמצעות תאים אקספרס BRCA1 אנדוגני wild-type

The functional analysis of missense mutations can be complicated by the presence in the cell of the endogenous protein. Structure-function analyses of the ...

identifying-effects-brca1-mutations-on-homologous-recombination-using

Research

JoVE Journal

Biology

14.5K Views.  The Ohio State University. אנו מספקים שיטה לבדיקת גרסאות BRCA1 ב assay רקמה תרבות המבוססת לתיקון הומולוגיים רקומבינציה של נזק לדנ"א על ​​ידי depleting החלבון BRCA1 אנדוגני מתא באמצעות RNAi והחלפתו מוטציה נקודת BRCA1 המכיל לשנות קידוד.

Video: Identifying the Effects of BRCA1 Mutations on Homologous Recombination using Cells that Express Endogenous Wild-type BRCA1

Studying the Effects of Matrix Stiffness on Cellular Function using Acrylamide-based Hydrogels

Tissue stiffness is an important determinant of cellular function, and changes in tissue stiffness are commonly associated with fibrosis, cancer and cardiovascular disease1-11. Traditional cell biological approaches to studying cellular function involve culturing cells on a rigid substratum (plastic dishes or glass coverslips) which cannot account for the effect of an elastic ECM or the variations in ECM stiffness between tissues. To model in vivo tissue compliance conditions in vitro, we and others use ECM-coated hydrogels. In our laboratory, the hydrogels are based on polyacrylamide which can mimic the range of tissue compliances seen biologically12. "Reactive" cover slips are generated by incubation with NaOH followed by addition of 3-APTMS. Glutaraldehyde is used to cross-link the 3-APTMS and the polyacrylamide gel. A solution of acrylamide (AC), bis-acrylamide (Bis-AC) and ammonium persulfate is used for the polymerization of the hydrogel. N-hydroxysuccinimide (NHS) is incorporated into the AC solution to crosslink ECM protein to the hydrogel. Following polymerization of the hydrogel, the gel surface is coated with an ECM protein of choice such as fibronectin, vitronectin, collagen, etc.
The stiffness of a hydrogel can be determined by rheology or atomic force microscopy (AFM) and adjusted by varying the percentage of AC and/or bis-AC in the solution12. In this manner, substratum stiffness can be matched to the stiffness of biological tissues which can also be quantified using rheology or AFM. Cells can then be seeded on these hydrogels and cultured based upon the experimental conditions required. Imaging of the cells and their recovery for molecular analysis is straightforward. For this article, we define soft substrata as those having elastic moduli (E) &lt;3000 Pascal and stiff substrata/tissues as those with E &gt;20,000 Pascal.

The effect of substrata stiffness on cellular function can be modeled in vitro using polyacrylamide hydrogels of varying compliances.

שיחקרו את ההשפעות של מטריקס נוקשות על פונקציה נייד באמצעות Acrylamide מבוססי הידרוג

Tissue stiffness is an important determinant of cellular function, and changes in tissue stiffness are commonly associated with fibrosis, cancer and ...

Analyzing the Function of Small GTPases by Microinjection of Plasmids into Polarized Epithelial Cells

Epithelial cells polarize their plasma membrane into biochemically and functionally distinct apical and basolateral domains where the apical domain faces the 'free' surfaces and the basolateral membrane is in contact with the substrate and neighboring cells. Both membrane domains are separated by tight junctions, which form a diffusion barrier. Apical-basolateral polarization can be recapitulated successfully in culture when epithelial cells such as Madin-Darby Canine Kidney (MDCK) cells are seeded at high density on polycarbonate filters and cultured for several days 1 2. Establishment and maintenance of cell polarity is regulated by an array of small GTPases of the Ras superfamily such as RalA, Cdc42, Rab8, Rab10 and Rab13 3 4 5 6 7. Like all GTPases these proteins cycle between an inactive GDP-bound state and an active GTP-bound state. Specific mutations in the nucleotide binding regions interfere with this cycling 8. For example, Rab13T22N is permanently locked in the GDP-form and thus dubbed 'dominant negative', whereas Rab13Q67L can no longer hydrolyze GTP and is thus locked in a 'dominant active' state 7. To analyze their function in cells both dominant negative and dominant active alleles of GTPases are typically expressed at high levels to interfere with the function of the endogenous proteins 9. An elegant way to achieve high levels of overexpression in a short amount of time is to introduce the plasmids encoding the relevant proteins directly into the nuclei of polarized cells grown on filter supports using microinjection technique. This is often combined with the co-injection of reporter plasmids that encode plasma membrane receptors that are specifically sorted to the apical or basolateral domain. A cargo frequently used to analyze cargo sorting to the basolateral domain is a temperature sensitive allele of the vesicular stomatitis virus glycoprotein (VSVGts045) 10. This protein cannot fold properly at 39&deg;C and will thus be retained in the endoplasmic reticulum (ER) while the regulatory protein of interest is assembled in the cytosol. A shift to 31&deg;C will then allow VSVGts045 to fold properly, leave the ER and travel to the plasma membrane 11. This chase is typically performed in the presence of cycloheximide to prevent further protein synthesis leading to cleaner results. Here we describe in detail the procedure of microinjecting plasmids into polarized cells and subsequent incubations including temperature shifts that allow a comprehensive analysis of regulatory proteins involved in basolateral sorting.

This article details the procedures involved in overexpression and analysis of small GTPases in polarized epithelial cells using microinjection technique.

ניתוח פונקציה של GTPases קטנים על ידי Microinjection של פלסמידים לתוך תאים אפיתל מקוטב

Epithelial cells polarize their plasma membrane into biochemically and functionally distinct apical and basolateral domains where the apical domain faces ...

A PCR-based Genotyping Method to Distinguish Between Wild-type and Ornamental Varieties of Imperata cylindrica

Wild-type I. cylindrica (cogongrass) is one of the top ten worst invasive plants in the world, negatively impacting agricultural and natural resources in 73 different countries throughout Africa, Asia, Europe, New Zealand, Oceania and the Americas1-2. Cogongrass forms rapidly-spreading, monodominant stands that displace a large variety of native plant species and in turn threaten the native animals that depend on the displaced native plant species for forage and shelter. To add to the problem, an ornamental variety [I. cylindrica var. koenigii (Retzius)] is widely marketed under the names of Imperata cylindrica 'Rubra', Red Baron, and Japanese blood grass (JBG). This variety is putatively sterile and noninvasive and is considered a desirable ornamental for its red-colored leaves. However, under the correct conditions, JBG can produce viable seed (Carol Holko, 2009 personal communication) and can revert to a green invasive form that is often indistinguishable from cogongrass as it takes on the distinguishing characteristics of the wild-type invasive variety4 (Figure 1). This makes identification using morphology a difficult task even for well-trained plant taxonomists. Reversion of JBG to an aggressive green phenotype is also not a rare occurrence. Using sequence comparisons of coding and variable regions in both nuclear and chloroplast DNA, we have confirmed that JBG has reverted to the green invasive within the states of Maryland, South Carolina, and Missouri. JBG has been sold and planted in just about every state in the continental U.S. where there is not an active cogongrass infestation. The extent of the revert problem in not well understood because reverted plants are undocumented and often destroyed.
Application of this molecular protocol provides a method to identify JBG reverts and can help keep these varieties from co-occurring and possibly hybridizing. Cogongrass is an obligate outcrosser and, when crossed with a different genotype, can produce viable wind-dispersed seeds that spread cogongrass over wide distances5-7. JBG has a slightly different genotype than cogongrass and may be able to form viable hybrids with cogongrass. To add to the problem, JBG is more cold and shade tolerant than cogongrass8-10, and gene flow between these two varieties is likely to generate hybrids that are more aggressive, shade tolerant, and cold hardy than wild-type cogongrass. While wild-type cogongrass currently infests over 490 million hectares worldwide, in the Southeast U.S. it infests over 500,000 hectares and is capable of occupying most of the U.S. as it rapidly spreads northward due to its broad niche and geographic potential3,7,11. The potential of a genetic crossing is a serious concern for the USDA-APHIS Federal Noxious Week Program. Currently, the USDA-APHIS prohibits JBG in states where there are major cogongrass infestations (e.g., Florida, Alabama, Mississippi). However, preventing the two varieties from combining can prove more difficult as cogongrass and JBG expand their distributions. Furthermore, the distribution of the JBG revert is currently unknown and without the ability to identify these varieties through morphology, some cogongrass infestations may be the result of JBG reverts. Unfortunately, current molecular methods of identification typically rely on AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphisms) and DNA sequencing, both of which are time consuming and costly. Here, we present the first cost-effective and reliable PCR-based molecular genotyping method to accurately distinguish between cogongrass and JBG revert.

A PCR-based Genotyping Method to Distinguish Between Wild-type and Ornamental Varieties of Imperata cylindrica

We provide a cost-effective and rapid molecular genotyping protocol that employs variety-specific PCR primers that target DNA sequence differences within the chloroplast trnL-F spacer region to differentiate between varieties of Imperata cylindrica (cogongrass) that cannot be distinguished by morphology alone. These varieties include the federally listed noxious weed, cogongrass and closely-related, wide-spread ornamental variety, I. cylindrica var. koenigii (Japanese blood grass).

PCR מבוסס genotyping שיטה להבחין בין זנים wild-type ו נוי של Imperata cylindrica</em

Wild-type I. cylindrica (cogongrass) is one of the top ten worst invasive plants in the world, negatively impacting agricultural and natural resources in ...

Recombineering Homologous Recombination Constructs in Drosophila

The continued development of techniques for fast, large-scale manipulation of endogenous gene loci will broaden the use of Drosophila melanogaster as a genetic model organism for human-disease related research. Recent years have seen technical advancements like homologous recombination and recombineering. However, generating unequivocal null mutations or tagging endogenous proteins remains a substantial effort for most genes. Here, we describe and demonstrate techniques for using recombineering-based cloning methods to generate vectors that can be used to target and manipulate endogenous loci in vivo. Specifically, we have established a combination of three technologies: (1) BAC transgenesis/recombineering, (2) ends-out homologous recombination and (3) Gateway technology to provide a robust, efficient and flexible method for manipulating endogenous genomic loci. In this protocol, we provide step-by-step details about how to (1) design individual vectors, (2) how to clone large fragments of genomic DNA into the homologous recombination vector using gap repair, and (3) how to replace or tag genes of interest within these vectors using a second round of recombineering. Finally, we will also provide a protocol for how to mobilize these cassettes in vivo to generate a knockout, or a tagged gene via knock-in. These methods can easily be adopted for multiple targets in parallel and provide a means for manipulating the Drosophila genome in a timely and efficient manner.

Recombineering Homologous Recombination Constructs in Drosophila

Homologous recombination techniques greatly advance Drosophila genetics by enabling the creation of molecularly precise mutations. The recent adoption of recombineering allows one to manipulate large pieces of DNA and transform them into Drosophila6. The methods presented here combine these techniques to rapidly generate large homologous recombination vectors.

Recombineering הומולוגי רקומבינציה בבונה<em&gt; דרוזופילה</em

The continued development of techniques for fast, large-scale manipulation of endogenous gene loci will broaden the use of Drosophila melanogaster as a ...

Measuring the Effects of Bacteria on C. Elegans Behavior Using an Egg Retention Assay

C. elegans egg-laying behavior is affected by environmental cues such as osmolarity1 and vibration2. In the total absence of food C. elegans also cease egg-laying and retain fertilized eggs in their uterus3. However, the effect of different sources of food, especially pathogenic bacteria and particularly Enterococcus faecalis, on egg-laying
	behavior is not well characterized. The egg-in-worm (EIW) assay is a useful tool to quantify the effects of different types of bacteria, in this case E. faecalis, on egg- laying behavior.
	
	EIW assays involve counting the number of eggs retained in the uterus of C. elegans4. The EIW assay involves bleaching staged, gravid adult C. elegans to remove the cuticle and separate the retained eggs from the animal. Prior to bleaching, worms are exposed to bacteria (or any type of environmental cue) for a fixed period of time. After bleaching, one is very easily able to count the number of eggs retained inside the uterus of the worms. In this assay, a quantifiable increase in egg retention after E. faecalis exposure can be easily measured. The EIW assay is a behavioral assay that may be used to screen for potentially pathogenic bacteria or the presence of environmental toxins. In addition, the EIW assay may be a tool to screen for drugs that affect neurotransmitter signaling since egg-laying behavior is modulated by neurotransmitters such as serotonin and acetylcholine5-9.

Measuring the Effects of Bacteria on C. Elegans Behavior Using an Egg Retention Assay

An egg-in-worm (EIW) assay is a useful method to quantify egg-laying behavior. Alterations in egg laying can be a behavioral response of the model organism Caenorhabditis elegans to potentially harmful environmental substances such as those produced by pathogenic bacteria.

מדידת ההשפעות של חיידקים על<em&gt; ג Elegans</em&gt; התנהגות באמצעות Assay שימור ביצה

C. elegans egg-laying behavior is  affected by environmental cues such as osmolarity1 and  vibration2. In the total absence of food C. elegans also cease ...

gDNA Enrichment by a Transposase-based Technology for NGS Analysis of the Whole Sequence of BRCA1, BRCA2, and 9 Genes Involved in DNA Damage Repair

The widespread use of Next Generation Sequencing has opened up new avenues for cancer research and diagnosis. NGS will bring huge amounts of new data on cancer, and especially cancer genetics. Current knowledge and future discoveries will make it necessary to study a huge number of genes that could be involved in a genetic predisposition to cancer. In this regard, we developed a Nextera design to study 11 complete genes involved in DNA damage repair. This protocol was developed to safely study 11 genes (ATM, BARD1, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CHEK2, PALB2, RAD50, RAD51C, RAD80, and TP53) from promoter to 3&#39;-UTR in 24 patients simultaneously. This protocol, based on transposase technology and gDNA enrichment, gives a great advantage in terms of time for the genetic diagnosis thanks to sample multiplexing. This protocol can be safely used with blood gDNA.

gDNA Enrichment by a Transposase-based Technology for NGS Analysis of the Whole Sequence of BRCA1, BRCA2, and 9 Genes Involved in DNA Damage Repair

gDNA enrichment for NGS sequencing is an easy and powerful tool for the study of constitutional mutations. In this article, we present the procedure to analyse simply the complete sequence of 11 genes involved in DNA damage repair.

gDNA העשרה על ידי טכנולוגיה מבוססת Transposase לניתוח NGS של הרצף השלם של<em&gt; BRCA1</em&gt;,<em&gt; BRCA2</em&gt;, ו -9 גנים המעורבים בתיקון נזק לדנ&quot;א

The widespread use of Next Generation Sequencing has opened up new avenues for cancer research and diagnosis. NGS will bring huge amounts of new data on ...

Identifying Protein-protein Interaction Sites Using Peptide Arrays

Protein-protein interactions mediate most of the processes in the living cell and control homeostasis of the organism. Impaired protein interactions may result in disease, making protein interactions important drug targets. It is thus highly important to understand these interactions at the molecular level. Protein interactions are studied using a variety of techniques ranging from cellular and biochemical assays to quantitative biophysical assays, and these may be performed either with full-length proteins, with protein domains or with peptides. Peptides serve as excellent tools to study protein interactions since peptides can be easily synthesized and allow the focusing on specific interaction sites. Peptide arrays enable the identification of the interaction sites between two proteins as well as screening for peptides that bind the target protein for therapeutic purposes. They also allow high throughput SAR studies. For identification of binding sites, a typical peptide array usually contains partly overlapping 10-20 residues peptides derived from the full sequences of one or more partner proteins of the desired target protein. Screening the array for binding the target protein reveals the binding peptides, corresponding to the binding sites in the partner proteins, in an easy and fast method using only small amount of protein.
In this article we describe a protocol for screening peptide arrays for mapping the interaction sites between a target protein and its partners. The peptide array is designed based on the sequences of the partner proteins taking into account their secondary structures. The arrays used in this protocol were Celluspots arrays prepared by INTAVIS Bioanalytical Instruments. The array is blocked to prevent unspecific binding and then incubated with the studied protein. Detection using an antibody reveals the binding peptides corresponding to the specific interaction sites between the proteins.

Peptide array screening is a high throughput assay for identifying protein-protein interaction sites. This allows mapping multiple interactions of a target protein and can serve as a method for identifying sites for inhibitors that target a protein. Here we describe a protocol for screening and analyzing peptide arrays.

זיהוי אתרי אינטראקציה בין חלבונים באמצעות פפטיד מערכים

Protein-protein interactions mediate most of the processes in the living cell and control homeostasis of the organism. Impaired protein interactions may ...

Determination of Sialic Acids in Liver and Milk Samples of Wild-type and CMAH Knock-out Mice.

CMAH (cytidine monophosphate-N-acetylneuraminic acid hydroxylase) is responsible for the oxidation of cytidine monophosphate-N-acetylneuraminic acids in mammals. However, humans cannot oxidize cytidine monophosphate-N-acetylneuraminic acid to cytidine monophosphate-N-glycolylneuraminic acid due to a primary exon deletion of the CMAH gene. To understand the effects and implications of the lack of CMAH activity in more detail, a Cmah knock-out model in mice is of keen interest in basic and applied research. The analysis method to determine the phenotype of this mouse model is herein described in detail, and is based on the detection of both N-acetylneuraminic acid and N-glycolylenuraminic acid in the liver and milk of wild-type and Cmah knock-out mice. Endogenous sialic acids are released and derivatized with o-phenylenediamine to generate fluorogenic derivatives, which can be subsequently analyzed by HPLC. The presented protocol can be also applied for the analysis of milk and tissue samples from various other origins, and may be of use to investigate the nutritional and health effects of N-glycolylneuraminic acid.

Determination of Sialic Acids in Liver and Milk Samples of Wild-type and CMAH Knock-out Mice.

We describe a HPLC-based method for the determination of N-acetylneuraminic acid and N-glycolylenuraminic acid in mouse liver and milk.

קביעת חומצות סיאליות בדגימות כבד וחלב של סוג הבר<em&gt; CMAH</em&gt; נוק- out עכברים.

CMAH (cytidine monophosphate-N-acetylneuraminic acid hydroxylase) is responsible for the oxidation of cytidine monophosphate-N-acetylneuraminic acids in ...

A Method to Assess Bacteriocin Effects on the Gut Microbiota of Mice

Very intriguing questions arise with our advancing knowledge on gut microbiota composition and the relationship with health, particularly relating to the factors that contribute to maintaining the population balance. However, there are limited available methodologies to evaluate these factors. Bacteriocins are antimicrobial peptides produced by many bacteria that may confer a competitive advantage for food acquisition and/or niche establishment. Many probiotic lactic acid bacteria (LAB) strains have great potential to promote human and animal health by preventing the growth of pathogens. They can also be used for immuno-modulation, as they produce bacteriocins. However, the antagonistic activity of bacteriocins is normally determined by laboratory bioassays under well-defined but over-simplified conditions compared to the complex gut environment in humans and animals, where bacteria face multifactorial influences from the host and hundreds of microbial species sharing the same niche. This work describes a complete and efficient procedure to assess the effect of a variety of bacteriocins with different target specificities in a murine system. Changes in the microbiota composition during the bacteriocin treatment are monitored using compositional 16S rDNA sequencing. Our approach uses both the bacteriocin producers and their isogenic non-bacteriocin-producing mutants, the latter giving the ability to distinguish bacteriocin-related from non-bacteriocin-related modifications of the microbiota. The fecal DNA extraction and 16S rDNA sequencing methods are consistent and, together with the bioinformatics, constitute a powerful procedure to find faint changes in the bacterial profiles and to establish correlations, in terms of cholesterol and triglyceride concentration, between bacterial populations and health markers. Our protocol is generic and can thus be used to study other compounds or nutrients with the potential to alter the host microbiota composition, either when studying toxicity or beneficial effects.

Bacteriocins are believed to play a key role in defining microbial diversity in different ecological niches. Here, we describe an efficient procedure to assess how bacteriocins affect gut microbiota composition in an animal model.

שיטה להעריך אפקטים Bacteriocin על מיקרוביוטה המעיים של עכברים

Very intriguing questions arise with our advancing knowledge on gut microbiota composition and the relationship with health, particularly relating to the ...

Investigating the Detrimental Effects of Low Pressure Plasma Sterilization on the Survival of Bacillus subtilis Spores Using Live Cell Microscopy

Plasma sterilization is a promising alternative to conventional sterilization methods for industrial, clinical, and spaceflight purposes. Low pressure plasma (LPP) discharges contain a broad spectrum of active species, which lead to rapid microbial inactivation. To study the efficiency and mechanisms of sterilization by LPP, we use spores of the test organism Bacillus subtilis because of their extraordinary resistance against conventional sterilization procedures. We describe the production of B. subtilis spore monolayers, the sterilization process by low pressure plasma in a double inductively coupled plasma reactor, the characterization of spore morphology using scanning electron microscopy (SEM), and the analysis of germination and outgrowth of spores by live cell microscopy. A major target of plasma species is genomic material (DNA) and repair of plasma-induced DNA lesions upon spore revival is crucial for survival of the organism. Here, we study the germination capacity of spores and the role of DNA repair during spore germination and outgrowth after treatment with LPP by tracking fluorescently-labelled DNA repair proteins (RecA) with time-resolved confocal fluorescence microscopy. Treated and untreated spore monolayers are activated for germination and visualized with an inverted confocal live cell microscope over time to follow the reaction of individual spores. Our observations reveal that the fraction of germinating and outgrowing spores is dependent on the duration of LPP-treatment reaching a minimum after 120 s. RecA-YFP (yellow fluorescence protein) fluorescence was detected only in few spores and developed in all outgrowing cells with a slight elevation in LPP-treated spores. Moreover, some of the vegetative bacteria derived from LPP-treated spores showed an increase in cytoplasm and tended to lyse. The described methods for analysis of individual spores could be exemplary for the study of other aspects of spore germination and outgrowth.

Investigating the Detrimental Effects of Low Pressure Plasma Sterilization on the Survival of Bacillus subtilis Spores Using Live Cell Microscopy

This protocol illustrates the important consecutive steps required to assess the relevance of monitoring vitality parameter and DNA repair processes in reviving Bacillus subtilis spores after treatment with low pressure plasma by tracking fluorescence-labelled DNA repair proteins via time-resolved confocal microscopy and scanning electron microscopy.

חוקרים את מזיקה אפקטים של נמוך לחץ פלזמה עיקור על ההישרדות של Bacillus subtilis הנבגים באמצעות Live התא מיקרוסקופ

Plasma sterilization is a promising alternative to conventional sterilization methods for industrial, clinical, and spaceflight purposes. Low pressure ...