מדעי המוח המערכתיים מרוויחים רבות מההתקדמות בטכנולוגיית ההדמיה, במיוחד בשילוב עם גישות מולקולריות וגנטיות. חוקרים משתמשים יותר ויותר ברזולוציה גבוהה, בהקלטה כרונית ובמיקוד ספציפי לסוג התא כדי לנתח את תפקוד המוח בקנה מידה עדין יותר, זמן ארוך יותר ומיקום רב יותר. שינוי בולט אחד בפרדיגמות הניסוייות הוא התרחקות מההקלטה המורדמת לעבר מצבים ערים או חופשיים.
גישה זו מאפשרת לאפיין את פעילות המוח בתנאים טבעיים, אך גם מציבה אתגרים לשליטה מדויקת בגירויים ובמדידות. בעזרת פרוטוקול זה, אנו יכולים לדמיין את אותן אוכלוסיות עצביות בבעלי חיים הקבועים בראש ונעים בחופשיות. אנו יכולים להשוות ישירות את פעילותם הן בפרדיגמות מבוקרות היטב והן טבעיות.
הפרוטוקול שלנו מאפשר לחקור עיבוד מידע חושי על פני שכבות קליפת המוח. הוא מאפשר לנו להשוות תגובות עצביות לגירויים חושיים מבוקרים במצבים קבועים בראש ואת המשימות ההתנהגותיות שלו במהלך תנועה חופשית, ובכך להקל על הבנתנו את דינמיקת העיבוד החושי.
