עבודה זו מומנה על ידי קרנות הזנק שסופקו לד"ר סילביה פ זוסטיאק על ידי אוניברסיטת סנט לואיס, כמו גם על ידי מענק זרע ממרכז הנרי ואמיליה נסראללה למדעי המוח באוניברסיטת סנט לואיס שהוענק לד"ר סילביה פ זוסטיאק.

ייצור ואחריו אנקפסולציה תלת ממדית של ספרואידים סרטניים בהידרוג'לים PEG

<ol>
	<li>Hirschhaeuser, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Multicellular+tumor+spheroids:+an+underestimated+tool+is+catching+up+again.">Multicellular tumor spheroids: an underestimated tool is catching up again.</a> Journal of Biotechnology. 148 (1), 3-15 (2010).</li><li>Costa, E. C., de Melo-Diogo, D., Moreira, A. F., Carvalho, M. P., Correia, I. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spheroids+formation+on+non-adhesive+surfaces+by+liquid+overlay+technique:+Considerations+and+practical+approaches.">Spheroids formation on non-adhesive surfaces by liquid overlay technique: Considerations and practical approaches.</a> Biotechnology Journal. 13 (1), 1700417 (2018).</li><li>Li, Y., Kumacheva, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Hydrogel+microenvironments+for+cancer+spheroid+growth+and+drug+screening.">Hydrogel microenvironments for cancer spheroid growth and drug screening.</a> Science Advances. 4 (4), eaas8998 (2018).</li><li>Kamatar, A., Gunay, G., Acar, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Natural+and+synthetic+biomaterials+for+engineering+multicellular+tumor+spheroids.">Natural and synthetic biomaterials for engineering multicellular tumor spheroids.</a> Polymers. 12 (11), 2506 (2020).</li><li>Wang, C., Tong, X., Yang, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Bioengineered+3D+brain+tumor+model+to+elucidate+the+effects+of+matrix+stiffness+on+glioblastoma+cell+behavior+using+PEG-based+hydrogels.">Bioengineered 3D brain tumor model to elucidate the effects of matrix stiffness on glioblastoma cell behavior using PEG-based hydrogels.</a> Molecular Pharmaceutics. 11 (7), 2115-2125 (2014).</li><li>Nakod, P. S., Kim, Y., Rao, S. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Three-dimensional+biomimetic+hyaluronic+acid+hydrogels+to+investigate+glioblastoma+stem+cell+behaviors.">Three-dimensional biomimetic hyaluronic acid hydrogels to investigate glioblastoma stem cell behaviors.</a> Biotechnology and Bioengineering. 117 (2), 511-522 (2020).</li><li>Xiao, W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Bioengineered+scaffolds+for+3D+culture+demonstrate+extracellular+matrix-mediated+mechanisms+of+chemotherapy+resistance+in+glioblastoma.">Bioengineered scaffolds for 3D culture demonstrate extracellular matrix-mediated mechanisms of chemotherapy resistance in glioblastoma.</a> Matrix Biology. 85, 128-146 (2020).</li><li>Pedron, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Hyaluronic+acid-functionalized+gelatin+hydrogels+reveal+extracellular+matrix+signals+temper+the+efficacy+of+erlotinib+against+patient-derived+glioblastoma+specimens.">Hyaluronic acid-functionalized gelatin hydrogels reveal extracellular matrix signals temper the efficacy of erlotinib against patient-derived glioblastoma specimens.</a> Biomaterials. 219, 119371 (2019).</li><li>Hill, L., Bruns, J., Zustiak, S. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Hydrogel+matrix+presence+and+composition+influence+drug+responses+of+encapsulated+glioblastoma+spheroids.">Hydrogel matrix presence and composition influence drug responses of encapsulated glioblastoma spheroids.</a> Acta Biomaterialia. 132, 437-447 (2021).</li><li>Chen, J. -. W. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Crosstalk+between+microglia+and+patient-derived+glioblastoma+cells+inhibit+invasion+in+a+three-dimensional+gelatin+hydrogel+model.">Crosstalk between microglia and patient-derived glioblastoma cells inhibit invasion in a three-dimensional gelatin hydrogel model.</a> Journal of Neuroinflammation. 17 (1), 346 (2020).</li><li>Thakuri, P. S., Liu, C., Luker, G. D., Tavana, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biomaterials-based+approaches+to+tumor+spheroid+and+organoid+modeling.">Biomaterials-based approaches to tumor spheroid and organoid modeling.</a> Advanced Healthcare Materials. 7 (6), 1700980 (2018).</li><li>Shin, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Alginate-marine+collagen-agarose+composite+hydrogels+as+matrices+for+biomimetic+3D+cell+spheroid+formation.">Alginate-marine collagen-agarose composite hydrogels as matrices for biomimetic 3D cell spheroid formation.</a> RSC Advances. 6 (52), 46952-46965 (2016).</li><li>Pradhan, S., Clary, J. M., Seliktar, D., Lipke, E. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+three-dimensional+spheroidal+cancer+model+based+on+PEG-fibrinogen+hydrogel+microspheres.">A three-dimensional spheroidal cancer model based on PEG-fibrinogen hydrogel microspheres.</a> Biomaterials. 115, 141-154 (2017).</li><li>Imaninezhad, M., Hill, L., Kolar, G., Vogt, K., Zustiak, S. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Templated+macroporous+polyethylene+glycol+hydrogels+for+spheroid+and+aggregate+cell+culture.">Templated macroporous polyethylene glycol hydrogels for spheroid and aggregate cell culture.</a> Bioconjugate Chemistry. 30 (1), 34-46 (2018).</li><li>Mirab, F., Kang, Y. J., Majd, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Preparation+and+characterization+of+size-controlled+glioma+spheroids+using+agarose+hydrogel+microwells.">Preparation and characterization of size-controlled glioma spheroids using agarose hydrogel microwells.</a> PLoS One. 14 (1), e0211078 (2019).</li><li>Razian, G., Yu, Y., Ungrin, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Production+of+large+numbers+of+size-controlled+tumor+spheroids+using+microwell+plates.">Production of large numbers of size-controlled tumor spheroids using microwell plates.</a> Journal of Visualized Experiments: JoVE. 81, e50665 (2013).</li><li>Timmins, N. E., Nielsen, L. K., Hauser, H., Fussenegger, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Generation of Multicellular Tumor Spheroids by the Hanging-Drop Method. 140, (2007).</li><li>Zhao, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+3D+printed+hanging+drop+dripper+for+tumor+spheroids+analysis+without+recovery.">A 3D printed hanging drop dripper for tumor spheroids analysis without recovery.</a> Scientific Reports. 9 (1), 19717 (2019).</li><li>Amaral, R. L., Miranda, M., Marcato, P. D., Swiech, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparative+analysis+of+3D+bladder+tumor+spheroids+obtained+by+forced+floating+and+hanging+drop+methods+for+drug+screening.">Comparative analysis of 3D bladder tumor spheroids obtained by forced floating and hanging drop methods for drug screening.</a> Frontiers in Physiology. 8, 605 (2017).</li><li>Gencoglu, M. F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparative+study+of+multicellular+tumor+spheroid+formation+methods+and+implications+for+drug+screening.">Comparative study of multicellular tumor spheroid formation methods and implications for drug screening.</a> ACS Biomaterials Science &amp; Engineering. 4 (2), 410-420 (2018).</li><li>Zhang, C., Liu, C., Zhao, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mechanical+properties+of+brain+tissue+based+on+microstructure.">Mechanical properties of brain tissue based on microstructure.</a> Journal of the Mechanical Behavior of Biomedical Materials. 126, 104924 (2021).</li><li>Alifieris, C., Trafalis, D. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Glioblastoma+multiforme:+Pathogenesis+and+treatment.">Glioblastoma multiforme: Pathogenesis and treatment.</a> Pharmacology &amp; Therapeutics. 152, 63-82 (2015).</li><li>Zustiak, S. P., Leach, J. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Hydrolytically+degradable+poly+(ethylene+glycol)+hydrogel+scaffolds+with+tunable+degradation+and+mechanical+properties.">Hydrolytically degradable poly (ethylene glycol) hydrogel scaffolds with tunable degradation and mechanical properties.</a> Biomacromolecules. 11 (5), 1348-1357 (2010).</li><li>Zustiak, S. P., Wei, Y., Leach, J. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Protein-hydrogel+interactions+in+tissue+engineering:+Mechanisms+and+applications.">Protein-hydrogel interactions in tissue engineering: Mechanisms and applications.</a> Tissue Engineering Part B: Reviews. 19 (2), 160-171 (2013).</li><li>Kroger, S. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Design+of+hydrolytically+degradable+polyethylene+glycol+crosslinkers+for+facile+control+of+hydrogel+degradation.">Design of hydrolytically degradable polyethylene glycol crosslinkers for facile control of hydrogel degradation.</a> Macromolecular Bioscience. 20 (10), 2000085 (2020).</li><li>Raeber, G., Lutolf, M., Hubbell, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Molecularly+engineered+PEG+hydrogels:+a+novel+model+system+for+proteolytically+mediated+cell+migration.">Molecularly engineered PEG hydrogels: a novel model system for proteolytically mediated cell migration.</a> Biophysical Journal. 89 (2), 1374-1388 (2005).</li><li>Bruns, J., Egan, T., Mercier, P., Zustiak, S. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Glioblastoma+spheroid+growth+and+chemotherapeutic+responses+in+single+and+dual-stiffness+hydrogels.">Glioblastoma spheroid growth and chemotherapeutic responses in single and dual-stiffness hydrogels.</a> Acta Biomaterialia. 163, 400-414 (2023).</li><li>Kuwajima, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=ClearT:+a+detergent-and+solvent-free+clearing+method+for+neuronal+and+non-neuronal+tissue.">ClearT: a detergent-and solvent-free clearing method for neuronal and non-neuronal tissue.</a> Development. 140 (6), 1364-1368 (2013).</li><li>Holt, S. E., Ward, E. S., Ober, R. J., Alge, D. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Shooting+for+the+moon:+using+tissue-mimetic+hydrogels+to+gain+new+insight+on+cancer+biology+and+screen+therapeutics.">Shooting for the moon: using tissue-mimetic hydrogels to gain new insight on cancer biology and screen therapeutics.</a> MRS Communications. 7 (3), 427-441 (2017).</li><li>Jain, E., Scott, K. M., Zustiak, S. P., Sell, S. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fabrication+of+polyethylene+glycol-based+hydrogel+microspheres+through+electrospraying.">Fabrication of polyethylene glycol-based hydrogel microspheres through electrospraying.</a> Macromolecular Materials and Engineering. 300 (8), 823-835 (2015).</li><li>Raghavan, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparative+analysis+of+tumor+spheroid+generation+techniques+for+differential+in+vitro+drug+toxicity.">Comparative analysis of tumor spheroid generation techniques for differential in vitro drug toxicity.</a> Oncotarget. 7 (13), 16948 (2016).</li><li>Lee, K. -. H., Kim, T. -. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Recent+advances+in+multicellular+tumor+spheroid+generation+for+drug+screening.">Recent advances in multicellular tumor spheroid generation for drug screening.</a> Biosensors. 11 (11), 445 (2021).</li></ol>

למחברים אין מה לחשוף.

מודלים ספרואידים רב-תאיים מבוססי הידרוג'ל מפותחים יותר ויותר כדי לקדם תגליות טיפוליות בסרטן 11,13,29. הם מועילים מכיוון שהם מחקים פרמטרים מרכזיים של מיקרו-סביבת הגידול באופן מבוקר, ולמרות מורכבותם, הם פשוטים וזולים יותר לשימוש מאשר מודלים in ...

ספרואידים סרטניים התגלו ככלים שימושיים במבחנה בחקר אטיולוגיה של סרטן, פתולוגיה והיענות לתרופות1. באופן מסורתי, ספרואידים גודלו בתרבית בתנאים כגון לוחות הדבקה נמוכים או ביוריאקטורים, שבהם היצמדות התא מועדפת על פני היצמדות פני התא2. עם זאת, כיום ידוע כי כדי לשחזר את המיקרו-סביבה של הגידול בצורה נאמנה יותר, מודלים ספרואידים במבחנה צריכים ללכוד הן אינטראקציות תא-תא והן אינטראקציות מטריצת תאים. זה גרם לקבוצות רבות לתכנן פיגומים, כגון הידרוג'לים, שבהם ניתן לעטוף ספרואידים 3,4. מודלים ספרואידים מבוססי הידרוג'ל כאלה מאפשרים הבהרה של אינטראקציות תא-תא ומטריצת תאים על התנהגויות תאים שונות, כגון כדאיות, התפשטות, גזע או היענות לטיפול3.
במאמר זה אנו מתארים פרוטוקול לאנקפסולציה של ספרואידים מסוג גליובלסטומה בהידרוג'לים מפוליאתילן גליקול (PEG). ישנם דיווחים ספרותיים רבים על אנקפסולציה ספרואידית של תאי גליובלסטומה בהידרוג'לים. לדוגמה, ספרואידים נוצרו על ידי עטיפת תאי U87 בהידרוג'ל PEG המעוטרים בליגנד דבק RGDS ומוצלבים עם פפטיד בעל יכולת שבירה אנזימטית כדי לקבוע את ההשפעה של קשיחות הידרוג'ל על התנהגות התא5. תאי U87 נוצרו גם בהידרוג'לים אחרים מבוססי PEG או חומצה היאלורונית כדי להרחיב את אוכלוסיית תאי הגזע הסרטניים6 או לחקור מנגנונים בתיווך מטריצה של עמידות לכימותרפיה 7,8,9. גליובלסטומה ספרואידים היו עטופים גם בהידרוג'לים של ג'לטין כדי לחקור את ההצלבה בין תאי מיקרוגליה ותאים סרטניים ואת השפעתה על פלישת תאים10. בסך הכל, מחקרים כאלה הוכיחו את התועלת של מודלים מבוססי הידרוג'ל במבחנה בהבנת פתולוגיה של גליובלסטומה ובתכנון טיפולים.
יתר על כן, ישנן שיטות שונות לייצור ספרואידים סרטניים ואנקפסולציה הידרוג'ל11. לדוגמה, תאים מפוזרים יכולים להיות זרעים הידרוג'ל מותר ליצור spheroids לאורך זמן 5,12. חסרון אחד של שיטה כזו הוא polydispersity של spheroids שנוצרו, אשר יכול להוביל לתגובות תאים דיפרנציאליים. כדי לייצר ספרואידים אחידים, תאים יכולים להיות עטופים במיקרו-ג'לים ומתורבתים לפרקי זמן ממושכים עד שהם פולשים ומשפצים מחדש את הג'ל13, או שניתן להפקיד תאים בג'לים בתבנית עם 'חורים' כדוריים ולאפשר להם לצבור14. החיסרון של שיטות אלה הוא המורכבות היחסית שלהן, הצורך במחולל טיפות או אמצעים אחרים ליצירת מיקרוג'לים או "חורים" בג'ל, והזמן שלוקח לספרואידים לגדול ולהבשיל. לחלופין, ספרואידים יכולים להיווצר מראש במיקרו-בארות 9,15,16 או בלוחיות תלויות17,18 ואז לעטוף אותם בהידרוג'ל, בדומה לטכניקה שתוארה כאן. שיטות אלה פשוטות יותר וניתן לעשות זאת בצורה תפוקה גבוהה יותר. באופן מעניין, הוכח כי שיטת היווצרות הספרואידים יכולה להשפיע על התנהגויות תאים ספרואידים, כגון ביטוי גנים, התפשטות תאים, או היענות לתרופות19,20.
כאן, אנו מתמקדים בגליובלסטומה מכיוון שמדובר בגידול מוצק שסביבתו הטבעית היא מטריצת המוח הרכה והננו-נקבובית21, שניתן לחקות באמצעות הידרוג'ל רך וננו-נקבובי. גליובלסטומה הוא גם סרטן המוח הקטלני ביותר שאין לו תרופה זמינה22. עם זאת, הפרוטוקול המתואר כאן יכול לשמש לאנקפסולציה של ספרואידים המייצגים כל גידול מוצק. בחרנו להשתמש בהידרוג'לים מסוג PEG הנוצרים באמצעות תגובת חיבור מסוג מיכאל23. PEG הוא הידרוג'ל סינתטי, בלתי מתכלה ותואם ביולוגית, אינרטי המשמש כפיגומים וכתמיכה פיזית בתאים, אך אינו תומך בחיבור תאים23. ניתן להוסיף הדבקת תאים בנפרד באמצעות קשירה של חלבונים שלמים או ליגנדות דבק24, ופירוק ניתן להוסיף באמצעות שינויים כימיים של שרשרת פולימר PEG או קרוסלינקרים מתכלים הידרוליטית או אנזימטית25,26. זה מאפשר לכוונן תכונות ביוכימיות ללא תלות בתכונות הידרוג'ל מכניות או פיזיקליות, מה שיכול להיות יתרון בחקר אינטראקציות תא-מטריצה. כימיית הג'לציה מסוג מיכאל היא סלקטיבית ומתרחשת בתנאים פיזיולוגיים; לפיכך, הוא מאפשר אנקפסולציה ספרואידית פשוט על ידי ערבוב הספרואידים עם תמיסת קודמן הידרוג'ל.
בסך הכל, למתודולוגיה המוצגת כאן יש כמה מאפיינים בולטים. ראשית, ייצור ספרואידים סרטניים בהרכבה מרובת בארות הוא יעיל, מהיר, ועלות החומרים הנדרשים נמוכה. שנית, הספרואידים מיוצרים באצוות גדולות במגוון גדלים עם פיזור נמוך. לבסוף, נדרשים רק חומרים זמינים מסחרית. התועלת של המתודולוגיה מודגמת על ידי חקירת ההשפעה של תכונות המצע על כדאיות התא, המעגליות וגזע התא.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>70% Ethanol</td>
			<td>Fisher Scientific&#160;</td>
			<td>LC22210-4</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>15 mL Conicals</td>
			<td>FALCON</td>
			<td>352097</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>24-Well Plate Ultra Low Attachment plates</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>07-200-602</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>35 mm Petri Dish</td>
			<td>Amazon</td>
			<td>706011</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>4-arm poly(ethylene glycol)-acrylate (4-arm PEG-Ac; 10 kDa)</td>
			<td>Laysan Bio</td>
			<td>ACRL-PEG-ACRL-10K-5g</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>50 mL Conicals</td>
			<td>Fisher Scinetific</td>
			<td>3181345107</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>6-well AggreWell 400&#160;</td>
			<td>StemCell Technologies, Vancouver, Canada</td>
			<td>34421</td>
			<td>Square pyramidal microwells&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>anti-adherence rinsing solution</td>
			<td>StemCell Technologies, Vancouver, Canada</td>
			<td>Cat #: 07010</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Aspartic Acid-Arginine-Cysteine-Glycine-Valine-Proline-Methionine-Serine-Methionine-Arginine-Glycine-Cysteine-Arginine- Aspartic Acid (DRCG-VPMSMR-GCRD) peptide</td>
			<td>Genic Bio, Shanghai, China</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Custom synthesis</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Chemical Fume Hood</td>
			<td>KEWAUNEE</td>
			<td>99151</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Corning Matrigel Basement Membrane Matrix, LDEV Free&#160;</td>
			<td>Corning</td>
			<td>356234</td>
			<td>Basement membrane matrix</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DAPI (4&#39;,6-diamidino-2-phenylindole, dihydrochloride)</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>62247</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Detergent - Triton-X</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>T8787</td>
			<td>Nonionic surfactant</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dimethyl sulfoxide (DMSO)</td>
			<td>Fisher Scientific&#160;</td>
			<td>BP231-100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Disposable Pipettes (1 mL, 2 mL, 5 mL, 10 mL, 25 mL, 50 mL)</td>
			<td>Fisher Scinetific</td>
			<td>1 mL: 13-678-11B, 2mL: 05214038, 5mL(FALCON): 357529, 10mL: 13-678-11E, 25mL: 13-678-11, 50mL: 13-678-11F</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fetal Bovine Serum</td>
			<td>HyClone</td>
			<td>SH30073-03</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Formaldehyde 37% Solution</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>F1635</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glass Plates</td>
			<td>Slumpys</td>
			<td>GBS4100SFSL</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glass Transfer Pipettes</td>
			<td>Fisher Scinetific</td>
			<td>5 3/4&#34;: 1367820A, 9&#34;:136786B</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glycine-Arginine-Cysteine-Aspartic Acid-Arginine-Glycine-Aspartic Acid-Serine (GRCD-RGDS) peptide</td>
			<td>Genic Bio, Shanghai, China</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Custom synthesis</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hemacytometer</td>
			<td>Bright-Line</td>
			<td>383684</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hydrophobic solution - Repel Silane&#160;</td>
			<td>GE Healthcare Bio-Sciences</td>
			<td>17-1332-01</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Incubator</td>
			<td>NUAIRE</td>
			<td>NU-8500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Inverted Microscope (Axiovert 25)</td>
			<td>Zeiss</td>
			<td>663526</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Invitrogen DiOC16(3) (3,3&#39;-Dihexadecyloxacarbocyanine Perchlorate)</td>
			<td>Fisher Scientific&#160;</td>
			<td>D1125</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Leica Confocal SP8</td>
			<td>Leica Microsystems Inc.</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Light and Flourescent Microscope (Axiovert 200M)</td>
			<td>Zeiss</td>
			<td>3820005619</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Micro centrifuge tubes</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>2 mL: 02681258</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Microscope Software</td>
			<td>Zeiss</td>
			<td>AxioVision Rel. 4.8.2</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nestin Alexa Fluor 594&#160;</td>
			<td>Santa Cruz Biotechnology</td>
			<td>sc-23927</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Parafilm</td>
			<td>PARAFILM&#160;</td>
			<td>PM992</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PBS (1x), pH 7.4</td>
			<td>HyClone</td>
			<td>SH30256.01</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Penicillin Streptomycin</td>
			<td>MP Biomedicals</td>
			<td>1670046</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pipette Aid</td>
			<td>Drummond Scientific Co.</td>
			<td>P-76864</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pipette Tips (1&#8211;200 &#181;L, 101&#8211;1000 &#181;L)</td>
			<td>Fisher Scinetific</td>
			<td>2707509</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Plastic Standard Disposable Transfer Pipettes</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>13-711-9D</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Plastic Weigh Boats (100 mL)</td>
			<td>Amazon&#160;</td>
			<td>mdo-azoc-1030</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>poly(ethylene glycol)-dithiol (PEG-diSH; 3.4 kDa)</td>
			<td>Laysan Bio</td>
			<td>SH-PEG-SH-3400-5g</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Polydimehylsiloxane (PDMS) [Slygard 182 Elastomer Kit]</td>
			<td>Elsworth Adhesives</td>
			<td>3097358-1004</td>
			<td>Polydimethylsiloxane</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Powder Free Examination Gloves</td>
			<td>Quest</td>
			<td>92897</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Propidium iodide, 1 mg/mL aqueous soln.&#160;</td>
			<td>Fisher Scientific&#160;</td>
			<td>AAJ66584AB</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RPMI-1640 Medium (1x)</td>
			<td>HyClone</td>
			<td>SH30027-02</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Silicone spacers - Silicone sheet, 0.5 mm thick/13 cm x 18 cm</td>
			<td>Grace Bio-Labs</td>
			<td>JTR-S-0.5</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SOX2 Alexa Fluor 488&#160;</td>
			<td>Santa Cruz Biotechnology</td>
			<td>sc-365823</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tissue Culture Hood</td>
			<td>NUAIRE</td>
			<td>NU-425-600</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Triethanolamine, &#8805;99.0% (GC)&#160;</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>90279</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Trypsin 0.25% (1x)&#160;</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>SH30042.01</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>U-87 MG human glioblastoma cells</td>
			<td>American Type Culture Collection&#160;</td>
			<td>HTB-14</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

tumor spheroid fabrication and encapsulation in polyethylene glycol hydrogels for studying spheroid-matrix interactions

אנקפסולציה תלת ממדית (3D) של ספרואידים חיונית כדי לשכפל כראוי את המיקרו-סביבה של הגידול לצמיחת תאים אופטימלית. כאן, תכננו מודל גליובלסטומה תלת-ממדי במבחנה עבור אנקפסולציה ספרואידית כדי לחקות את המיקרו-סביבה החוץ תאית של הגידול. ראשית, יצרנו תבניות מיקרווול פירמידליות מרובעות באמצעות polydimethylsiloxane. תבניות מיקרו-באר אלה שימשו לאחר מכן לייצור ספרואידים סרטניים בגדלים מבוקרים היטב בין 50-500 מיקרומטר. לאחר יצירת הספרואידים, הם נקטפו ונעטפו בהידרוג'לים מבוססי פוליאתילן גליקול (PEG). הידרוג'ל PEG הוא פלטפורמה רב-תכליתית לאנקפסולציה ספרואידית, מכיוון שניתן לכוונן תכונות הידרוג'ל כגון קשיחות, מתכלות והיצמדות תאים באופן עצמאי. כאן, השתמשנו בהידרוג'ל רך מייצג (~ 8 kPa) כדי לתמצת ספרואידים של גליובלסטומה. לבסוף, פותחה שיטה להכתמה ותמונה של ספרואידים לקבלת תמונות באיכות גבוהה באמצעות מיקרוסקופ קונפוקלי. בשל הליבה הספרואידית הצפופה והפריפריה הדלילה יחסית, הדמיה יכולה להיות קשה, אך שימוש בתמיסת ניקוי וחתך אופטי קונפוקלי מסייע להקל על קשיי הדמיה אלה. לסיכום, אנו מראים שיטה לייצר ספרואידים אחידים, לעטוף אותם בהידרוג'לים PEG ולבצע מיקרוסקופ קונפוקלי על הספרואידים העטופים כדי לחקור את גדילת הספרואידים ואינטראקציות שונות בין תאים למטריצה.

Tumor spheroids have emerged as useful in vitro tools in studying cancer etiology, pathology, and drug responsiveness1. Traditionally, spheroids have been cultured in conditions such as low adhesion plates or bioreactors, where cell-cell adhesion is favored over cell-surface adhesion2. However, it is now recognized that to recapitulate the tumor microenvironment more faithfully, in vitro spheroid models should capture both cell-cell and cell-matrix interactions. This has prompted multiple groups to design scaffolds, such as hydrogels, where spheroids can be encapsulated3,4. Such hydrogel-based spheroid models enable the elucidation of cell-cell and cell-matrix interactions on various cell behaviors, such as viability, proliferation, stemness, or therapy responsiveness3.
Here, we describe a protocol for the encapsulation of glioblastoma spheroids in polyethylene glycol (PEG) hydrogels. There are multiple literature reports of glioblastoma cell spheroid encapsulation in hydrogels. For example, spheroids were formed by encapsulating U87 cells in PEG hydrogels decorated with an RGDS adhesive ligand and crosslinked with an enzymatically cleavable peptide to determine the effect of hydrogel stiffness on cell behavior5. U87 cells have also been formed in other PEG-based or hyaluronic acid-based hydrogels to expand the cancer stem cell population6 or to explore matrix-mediated mechanisms of chemotherapy resistance7,8,9. Glioblastoma spheroids have also been encapsulated in gelatin hydrogels to study the crosstalk between microglia and cancer cells and its effect on cell invasion10. Overall, such studies have demonstrated the utility of hydrogel-based in vitro models in understanding glioblastoma pathology and devising treatments.
Further, there are different methods for tumor spheroid fabrication and hydrogel encapsulation11. For example, dispersed cells could be seeded in hydrogels and allowed to form spheroids over time5,12. One drawback of such a method is the polydispersity of the formed spheroids, which could lead to differential cell responses. To produce uniform spheroids, cells could be encapsulated in microgels and cultured for extended periods until they invade and remodel the gel13, or cells could be deposited in templated gels with spherical &#39;holes&#39; and allowed to aggregate14. The drawback of these methods is their relative complexity, the need for a droplet generator or other means to form microgels or the &#39;holes&#39; in the gel, and the time it takes for spheroids to grow and mature. Alternatively, spheroids could be pre-formed in microwells9,15,16 or in hanging-drop plates17,18 and then encapsulated in a hydrogel, similar to the technique described here. These methods are simpler and can be done in a higher throughput fashion. Interestingly, it has been shown that the method of spheroid formation can affect spheroid cell behaviors, such as gene expression, cell proliferation, or drug responsiveness19,20.
Here, we focus on glioblastoma since it is a solid tumor whose native environment is the soft, nanoporous brain matrix21, which can be mimicked by a soft, nanoporous hydrogel. Glioblastoma is also the deadliest brain cancer for which there is no available cure22. However, the protocol described here can be used for the encapsulation of spheroids representing any solid tumor. We chose to use PEG hydrogels that are formed through a Michael-type addition reaction23. PEG is a synthetic, non-degradable, and biocompatible hydrogel that is inert and serves as scaffolding and physical cell support but does not support cell attachment23. Cell adhesiveness can be added separately via tethering of whole proteins or adhesive ligands24, and degradability can be added via chemical modifications of the PEG polymer chain or hydrolytically or enzymatically degradable crosslinkers25,26. This allows for biochemical properties to be tuned independently of mechanical or physical hydrogel properties, which could be advantageous in studying cell-matrix interactions. The Michael-type gelation chemistry is selective and happens at physiological conditions; hence, it allows for spheroid encapsulation by simply mixing the spheroids with the hydrogel precursor solution.
Overall, the methodology presented here has several notable characteristics. First, fabricating tumor spheroids in a multiwell assembly is efficient, quick, and the cost of the required materials is low. Second, the spheroids are produced in large batches in a variety of sizes with low polydispersity. Finally, only commercially available materials are required. The utility of the methodology is illustrated by exploring the effect of substrate properties on spheroid cell viability, circularity, and cell stemness.

מחבר זרקור: מודל הידרוג'ל חוץ גופי לחקר מיקרו-סביבה גליובלסטומה

ייצור ספרואידי גידול ואנקפסולציה בהידרוג'ל פוליאתילן גליקול לחקר אינטראקציות ספרואידים-מטריצה

Our lab focuses on designing in vitro hydrogel models for glioblastoma steroid encapsulation to mimic the tumor extracellular microenvironment. The effective substrate, mechanical and biochemical properties on steroid cell viability, circularity, stemness, and spreading are investigated with such models. Current experimental challenges in tumor module development revolve around a desire for complexity to mimic all aspects of the tumor microenvironment for physiological relevance, and also a desire for simplicity to make the model accessible, robust, low cost, and easy to use, and compatible with multiplex screening approaches.We present a protocol that enables fast, robust, and low-cost fabrication of tumor steroids and encapsulation in hydrogels made to mimic the tumor microenvironment. The model does not require any specialized equipment. It will be particularly useful for exploring steroid matrix interactions in building in vitro tissue physiology or pathology models.Understanding the interactions between glioblastoma cancer cells and their microenvironment can encourage development of new therapies to better treat this cancer. Furthermore, development of an in vitro model for glioblastoma cancer can enhance development of this model for other cancer diseases.

פלטפורמות סינון תרופות מבוססות ספרואידים לחקר השפעות כימותרפיות מבוקשות יותר ויותר בשל הדגש על אפנון המיקרו-סביבה של הגידול על אנקפסולציה ספרואידית בביו-חומרים המשכפלים רקמות טבעיות. כאן פיתחנו שיטה להכנת ספרואיד גידול רב-תאי ולאחר מכן אנקפסולציה והדמיה בהידרוג'ל תלת ממדי. הספרואידים מ...

Watch this Scientific Journal Video about Tumor Spheroid Fabrication and Encapsulation in Polyethylene Glycol Hydrogels for Studying Spheroid-Matrix Interactions at JoVE.com

כאן, אנו מציגים פרוטוקול המאפשר ייצור מהיר, חזק וזול של ספרואידים סרטניים ואחריו אנקפסולציה הידרוג'ל. זה ישים באופן נרחב כפי שהוא אינו דורש ציוד מיוחד. זה יהיה שימושי במיוחד לחקר אינטראקציות ספרואידים-מטריצה ובניית פיזיולוגיה של רקמות חוץ גופיות או מודלים פתולוגיים.

Three-dimensional (3D) encapsulation of spheroids is crucial to adequately replicate the tumor microenvironment for optimal cell growth.  Here, we ...

המעבדה שלנו מתמקדת בתכנון מודלים של הידרוג'ל חוץ גופי עבור אנקפסולציה של סטרואידים מסוג גליובלסטומה כדי לחקות את המיקרו-סביבה החוץ תאית של הגידול. המצע היעיל, התכונות המכאניות והביוכימיות על יכולת הקיום של תאי סטרואידים, מעגליות, גבעול והתפשטות נחקרים באמצעות מודלים כאלה. האתגרים הניסיוניים הנוכחיים בפיתוח מודולי הגידול סובבים סביב הרצון למורכבות כדי לחקות את כל ההיבטים של מיקרו-סביבת הגידול לצורך רלוונטיות פיזיולוגית, וגם רצון לפשטות כדי להפוך את המודל לנגיש, חזק, זול וקל לשימוש, ותואם לגישות סינון מולטיפלקס.אנו מציגים פרוטוקול המאפשר ייצור מהיר, חזק ובעלות נמוכה של סטרואידים סרטניים ואנקפסולציה בהידרוג'לים שנועדו לחקות את המיקרו-סביבה של הגידול. המודל אינו דורש ציוד מיוחד. זה יהיה שימושי במיוחד לחקר אינטראקציות מטריצת סטרואידים בבניית פיזיולוגיה של רקמות חוץ גופיות או מודלים פתולוגיים.הבנת יחסי הגומלין בין תאי סרטן גליובלסטומה לבין המיקרו-סביבה שלהם יכולה לעודד פיתוח טיפולים חדשים לטיפול טוב יותר בסרטן זה. יתר על כן, פיתוח מודל חוץ גופי לסרטן גליובלסטומה יכול לשפר את הפיתוח של מודל זה עבור מחלות סרטן אחרות.

tumor-spheroid-fabrication-encapsulation-polyethylene-glycol

Research

JoVE Journal

Bioengineering

Tumor Spheroid Fabrication and Encapsulation in Polyethylene Glycol Hydrogels for Studying Spheroid-Matrix Interactions

845 Views.  Saint Louis University. המעבדה שלנו מתמקדת בתכנון מודלים של הידרוג'ל חוץ גופי עבור אנקפסולציה של סטרואידים מסוג גליובלסטומה כדי לחקות את המיקרו-סביבה החוץ תאית של הגידול. המצע היעיל, התכונות המכאניות והביוכימיות על יכולת הקיום של תאי סטרואידים, מעגליות, גבעול והתפשטות נחקרים באמצעות מודלים כאלה....

Video: מחבר זרקור: מודל הידרוג'ל חוץ גופי לחקר מיקרו-סביבה גליובלסטומה

Three-dimensional (3D) encapsulation of spheroids is crucial to adequately replicate the tumor microenvironment for optimal cell growth. Here, we designed an in vitro 3D glioblastoma model for spheroid encapsulation to mimic the tumor extracellular microenvironment. First, we formed square pyramidal microwell molds using polydimethylsiloxane. These microwell molds were then used to fabricate tumor spheroids with tightly controlled sizes from 50-500 &#956;m. Once spheroids were formed, they were harvested and encapsulated in polyethylene glycol (PEG)-based hydrogels. PEG hydrogels are a versatile platform for spheroid encapsulation, as hydrogel properties such as stiffness, degradability, and cell adhesiveness can be tuned independently. Here, we used a representative soft (~8 kPa) hydrogel to encapsulate glioblastoma spheroids. Finally, a method to stain and image spheroids was developed to obtain high-quality images via confocal microscopy. Due to the dense spheroid core and relatively sparse periphery, imaging can be difficult, but using a clearing solution and confocal optical sectioning helps alleviate these imaging difficulties. In summary, we show a method to fabricate uniform spheroids, encapsulate them in PEG hydrogels and perform confocal microscopy on the encapsulated spheroids to study spheroid growth and various cell-matrix interactions.

Here, we present a protocol that enables fast, robust, and cheap fabrication of tumor spheroids followed by hydrogel encapsulation. It is widely applicable as it does not require specialized equipment. It would be particularly useful for exploring spheroid-matrix interactions and building in vitro tissue physiology or pathology models.

Fabrication of Square Pyramidal Microwells for Tumor Spheroid Fabrication

To begin pour two grams or about one milliliter of negative PDMS precursor solution onto one well of a six well square parametal master mold. After covering the master mold with PDMS, place the plate in a vacuum desiccate to degas the solution. Next, place the plate in an oven at 60 degrees Celsius for 24 hours to cure the PDMS.Once PDMS cures but is still warm, use a spatula to carefully remove the PDMS mold from the master mold. Then with a biopsy punch, cut it into a 35 millimeter diameter slab. Place the properly cut PDMS mold in a Petri dish and cover it with the lid to continue curing it at room temperature for an additional 24 hours.To prepare the positive PDMS mold place a 35 millimeter slab of the negative PDMS mold in a 35 millimeter Petri dish with the textured micro wells facing up. Pour 2.5 grams or about 1.2 milliliters of positive PDMS precursor solution onto the negative mold in the Petri dish. Degas the precursor solution for 30 minutes before placing it into the oven at 60 degrees Celsius for three to four hours.After curing, remove the molds from the Petri dish. Immediately peel the positive mold from the negative mold. Use a 10 millimeter biopsy punch to cut the positive molds into slabs.Next, use tweezers to gently dip the flat side of each 10 millimeter positive mold into the pre-prepared PDMS glue precursor solution. Carefully place one mold per well in a well of a 48 well plate. Gently press each mold to glue it to the well bottom.Incubate the assembled plate at 60 degrees Celsius for four to 24 hours to cure the glue.

ייצור מיקרו-בארות פירמידליות מרובעות לייצור ספרואידים סרטניים

Multicellular Tumor Spheroid Formation, Harvest, and Encapsulation in Hydrogels

To begin, place the PDMS microwell molds, anti-adherence rinsing solution and necessary lab wear in a tissue culture hood. To wash the PDMS microwell molds, use a 1, 000 microliter pipette to add 300 microliters of anti-adherence rinsing solution to each well. Then centrifuge the plate, 1, 620 G for three minutes.Use a vacuum pump and a Pasteur pipette to aspirate the solution. Next, place 500 microliters of cell suspension at the desired concentration in the microwells and centrifuge the plate at 1, 620 G for three minutes. Place the plate in a humidified incubator to allow spheroid formation.To harvest the spheroids, using a 1, 000 microliter pipette, firmly add 500 microliters of complete medium into each well. Pipette the added medium up and down at each quadrant three to four times to dislodge the speroids. Then use the pipette to gently aspirate the medium containing the spheroids into a microcentrifuge tube.Transfer 50 microliters of the steroid suspension in a microcentrifuge tube. Then sequentially add 4-Arm PEG acrylate and PEG dithiol into it. Mix the resultant solution by pipetting it up and down about 10 times.To yield 100 microliters of a 10%weight by volume PEG hydrogel precursor solution, pipette 20 microliters of the gel precursor solution in between two parafilm-lined glass slides separated with one millimeter silicon spacers and incubate the slides with gel precursor solution to allow for gelation. Once hydrogel gelation is complete, using a spatula, gently peel the gels off the separated glass slides. Place one gel per well into a 24-well plate, ensuring the surface containing the spheroids faces up.Add 500 microliters of complete medium to each well to submerge the hydrogel completely. Place the multi-well plate in a humidified incubator to culture the cells. The described technique using microwell molds resulted in the formation of spheroids with spherical shapes and tightly-controlled polydispersity.For spheroids with 3, 300 cells per microwell, the average spheroid size was about 250 microns and circularity was greater than 0.8, considering a value of 1 as a perfect sphere. Spheroid diameters were dependent on the microwell size and the number of cells per microwell.

היווצרות, קציר ואנקפסולציה של גידול רב-תאי בהידרוג'לים

Immunofluorescence Fixation, Staining, and Clearing of Encapsulated Spheroids for Confocal Microscopy

To begin, aspirate the media from the wells where the hydrogel-encapsulated cells are cultured in the 24-well plate. Rinse the hydrogels by pipetting 500 microliters of PBS directly onto each well containing the hydrogels, and then gently aspirate the PBS. Using a 1, 000 microliter pipette, add 500 microliters of fixative solution per well to fix the spheroids in the 24-well plate.Allow the fixative to soak the gels for 30 minutes at room temperature, before pipetting out the fixative solution and discarding it in a designated waste container. Next, rinse the hydrogels with PBS three times as demonstrated previously. If not used immediately, store the hydrogels in 500 microliters of PBS per well at four degrees Celsius for up to one week.To stain in the hydrogel-encapsulated cells, first, prepare appropriately diluted primary antibodies for nestin and SOX2. After aspirating the PBS from the wells, add 50 microliters of the diluted antibodies to each well. Incubate the cells with the antibodies for 24 hours to stain them completely.Then using a 1, 000 microliter pipette, remove the staining solution and discard the waste appropriately. After rinsing the hydrogels three times, store them in PBS at four degrees Celsius for up to two weeks prior to imaging, or image immediately. To clear the stained spheroid for improving imaging transparency, first aspirate the PBS from each well.Then sequentially treat the spheroids with 500 microliters of 20%40%and 80%formamide per well for 90 minutes each. Finally incubate the hydrogels in 100%formamide for 24 hours prior to imaging. The spheroids were imaged at varying z-stack depths, allowing for the cell viability assessment at each location within the z-stack.A maximum projection utilizing the spheroid stack represented the highest point of light intensity within each location, simplified into one image. Representative images of stained spheroids revealed that the self-renewal transcription factor, SOX2, was co-localized with DAPI in the nucleus. On the contrary, stem cell marker nestin was present throughout the cells.There was no difference between the free floating spheroid without gel and the encapsulated spheroids, possibly due to the inertness of the PEG gel used. The representative images of optical sections at about 90 microns into cleared and uncleared spheroids revealed that when clearing was performed, the spheroid core could be imaged about 30 microns deeper compared to an uncleared spheroid.