IntelliSleepScorer, un pacchetto software con un'interfaccia utente grafica per il punteggio automatizzato delle fasi del sonno dei mouse

Abbiamo sviluppato un software GUI facile da usare nel punteggio del sonno telematico per valutare automaticamente le fasi del sonno nei topi. Il nostro obiettivo è quello di affrontare la sfida del punteggio manuale ad alta intensità di lavoro e migliorare l'accessibilità per i ricercatori che non hanno molta esperienza di codifica. Nel tele sleep score raggiunge un'accuratezza del 95,2% nel punteggio automatico delle fasi del sonno nei topi e ha dimostrato la generalizzabilità su altri due set di dati indipendenti disponibili pubblicamente.

L'interfaccia grafica include una funzione di correzione manuale, che consente agli utenti di modificare la fase del sonno segnata per qualsiasi epoca. Forniamo anche visualizzazioni del valore ASAP per spiegare le decisioni di punteggio del modello. Gli utenti esperti possono anche mettere a punto il nostro modello pre-albero con i propri dati, poiché tutti i file necessari e gli script di estrazione sono disponibili su GitHub.

La nostra ricerca si concentra sulla traduzione della genetica emergente in biologia e sull'abilitazione di terapie di nuova generazione per il trattamento delle malattie psichiatriche. Abbiamo lavorato su geni la cui disfunzione è stata implicata in queste malattie utilizzando approcci molecolari, cellulari ed elettrofisiologici, sia in vitro che negli animali.