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Method Article
アクティブ状態のためのアゴニストの親和定数を推定する方法( K B)Gタンパク質共役型受容体の多くは説明されています。分析は、絶対または相対的な尺度を提供する K B構成的受容体の活性化が測定可能であるかどうかによって異なります。私たちの方法は、受容体の活性化から、様々な応答の下流に適用されます。
アゴニストは、Gタンパク質共役受容体(GPCR)の人口をアクティブにすると、それは細胞または組織の応答で絶頂に達するシグナル伝達経路を誘発する。このプロセスは、単一の受容体、受容体の人口、または下流の応答のレベルで分析することができます。ここでは、単一の受容体のアクティブ状態のための一定のアゴニストの親和性の推定値を得るために下流の応答を分析する方法について説明します。
受容体は、アクティブと非アクティブな状態(図1)との間の量子スイッチその代替として動作します。アクティブ状態は、特定のGタンパク質または他のシグナル伝達パートナーと相互作用する。リガンドの非存在下で、非アクティブ状態が優勢。アゴニストの結合は、アクティブな状態(K B)のための定数の親和性が非アクティブ状態(K a)のそれよりもはるかに大きいため、受容体が活性状態に切り替える可能性が高くなります。の総和人口の受容体のすべてのランダムな出力は、時間の受容体の活性化の一定のレベルが得られます。最大値の半分の受容体の活性化を誘発するアゴニストの濃度の逆数は、観察された親和性定数(K OBS)と等価であり、アクティブ状態のアゴニスト受容体複合体の割合は、有効性(ε)(図2)として定義されています。
GPCRの下流応答を分析するための方法は、K OBSとアゴニストの1,2の相対的な有効性の推定を可能にすることが開発されている。このレポートでは、我々は別のアゴニストのように相対的なアゴニストK b値を推定するためにこの分析を変更する方法を示します。恒常的な活性を示すアッセイでは、我々はM -1の絶対的な単位で、K bを推定する方法を示します。
アゴニスト濃度反応曲線3,4を分析する我々の方法が構成されています運用モデル5を使用してグローバルな非線形回帰の。我々は、プリズム(グラフパッドソフトウェア社、サンディエゴ、CA)、ソフトウェアアプリケーションを使用して手順を説明します。分析は、Kの製品OBSと有効性(τ)に比例するパラメータの推定値が得られます。別のそれによって分割された1つのアゴニストのτKOBS、、の推定値は、K bの相対的な尺度(RA i)は6です。恒常的な活性を示す任意の受容体の場合は、それは自由な受容体複合体の効果(τSYS)に比例するパラメータを推定することが可能です。このケースでは、アゴニストのK bの値はτSYS 3 / OBSτKと同等です。
私たちの方法は、受容体サブタイプのアゴニストの選択性を決定するための、異なるGタンパク質を介してアゴニスト受容体のシグナル伝達を定量化するのに便利です。
1。アゴニスト濃度反応曲線の測定:ない恒常的な活性
2。アゴニスト濃度反応曲線の予備的分析:ない恒常的な活性
3。非線形回帰分析を用いてアゴニストRAI値の推定:ない恒常的な活性
4。構成的受容体の活性を示す細胞ベースのアッセイにおけるアゴニスト濃度反応曲線の測定
5。予備的恒常的な活性を示すアゴニスト濃度反応曲線のalysis
6。非線形回帰分析を用いて構成的受容体活性を示す応答のためのアゴニストのKB値の推定
RA I(相対K b値)を推定する手法が唯一のアゴニスト濃度-応答曲線の測定を必要とするため、これらの曲線が測定されるたびに、我々の分析を行うことができます。
実験的な準備(例えば、細胞または組織)の応答における日々の変動が大きい場合は、それぞれの濃度反応曲線の応答の測定は、毎日のための標準的なアゴニストの" トップ
利害の衝突は宣言されません。
この作品は、健康グラントGM 69829の国立研究所によってサポートされていました。
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