定量的自家蛍光分析またはQAF分析用のオープンソースプラグインにアクセスするには、ソフトウェアFijiで。[更新サイトの管理] をクリックして、表示されているクリエイティブ計算の更新サイトを既存の更新サイトに追加します。Spectralis パイプライン プラグインをインストールするには、プラグインをダウンロードして Fiji を再起動します。
さまざまなSpectralisプラグインは、SpectralisまたはSpectralisバッチのプラグインドロップダウンメニューの下にあります。赤、緑、青、またはRGB形式で保存されたSpectralis QAF XMLエクスポートファイルは、0〜255の測定されたAF値スケールに制限され、標準および黒のキャリブレーション領域が含まれます。QAF画像を生成するには、プラグインのドロップダウンメニューを開きます。
Spectralisをクリックし、QAF XMLリーダーを選択して、開始画面を破棄します。プロンプトを表示する新しいウィンドウ、スペクトルXML QAFエクスポートを含むディレクトリを選択します。ディレクトリを選択し、「選択」をクリックします。
ウィンドウでは、QAFパラメータは、画像情報に含まれる基準校正係数またはRCF、および画像が撮影された患者の年齢を入力します。[OK] をクリックした後、[8 ビットへのマップ] というラベルの付いたポップアップが表示されたら、色分けされた QAF 画像の QAF または QAF の最小値と QAF または QAF の最大値を入力します。プラグインで一度に 1 つの画像を追加するには、[Spectralis]、[標準retina_OCTに追加] の順に選択し、最初の画面を閉じます。
ウィンドウが表示されたら、Spectralis OCT XMLエクスポートを含むディレクトリを選択します。フォルダを選択し、[選択]をクリックしてBScanを開きます。OCTボリュームがロードされ、プロンプトが表示されたら、登録済みのenFace画像を含むディレクトリを選択します。
適切なフォルダを選択し、「選択」をクリックします。この段階で、3つのウィンドウがポップアップします。1つは「en Face stack」というラベルが付いており、選択したフォルダから積み重ねられた画像が表示されます。
2番目のラベルの付いたBScanスタックはOCTBスキャンを表示し、中央または3番目のラベルはモダリティの選択とラベル付けされています。en Faceスタックからモダリティを選択します。プロンプト付きの新しいウィンドウとして、標準網膜を含むディレクトリを選択し、標準網膜を含むディレクトリを選択または作成します。
新しい標準網膜を調べ、カーソルをスクロールして移動し、その特定の場所の平均と標準偏差を表示します。[同意する]ボタンをクリックして、最新の写真を標準の網膜に追加するか、破棄します。標準の Retina を使用して一度に複数の画像を追加するBatch_QAF_、最初にマニフェストを準備します。
txt ファイルをケース ID と同じフォルダーに格納します。ドットtxtファイルの場所からOCTおよびenFaceスタックへの相対パスをリストし、名前の前後に空白を追加せずにタブスペースで区切る必要があります。BScan スタックをスクロールするには、下部のバーを左または右にドラッグするか、BScan フレームを選択し、キーボードの左右の矢印キーを使用します。
現在のBScanスタック領域の概要は、enFaceスタックウィンドウの赤い線と、BScan番号が表示されているBScanウィンドウの左上に表示されます。領域をマークするには、BScanウィンドウの描画線セグメントでマークを選択し、右クリックしてマウスカーソルを病変の端までドラッグします。プラスキーを押すとズームインし、マイナスキーを押すとズームアウトします。
最後に、[OK]をクリックして関心領域をマークします。中等度の加齢黄斑変性症の84歳の患者の眼のQAF画像は、特異な顕著な軟剤ドルーゼンを示しました。この領域をクローズアップすると、マークされたドルーゼンを表す茶色の中心と、周囲のISOホールを表す色付きのバンドが表示されました。
出力ファイルには、症例ID、ファイルの横方向、および選択されたイメージングモダリティが含まれていました。各行はISOホールを参照し、その病変の外縁からの距離はスプレッドシートの下側と上の列で指定されました。QAF測定値には、ISOホール内のピクセルの最小中央値と最大値、ピクセル数、平均ピクセル値、および平均の標準偏差が含まれていました。
早期加齢黄斑変性症の80歳患者の眼のQAF画像は、網膜下、ドルセノイド沈着を示しました。マークされた各病変の周囲には、ISOホールが色分けされて描かれていました。
