費用対効果の高いトランスクリプトームベースの薬物スクリーニング

トランスクリプトミクスは、細胞のプログラムと外部の変化に対する細胞の反応を深く理解することを可能にします。しかし、過去数十年間にライブラリーの作製およびシーケンシングコストが大幅に削減されたにもかかわらず、薬物スクリーニングに必要な規模でこの技術を適用することは依然として手が届かず、これらの方法の大きな可能性を妨げています。本研究は、小型の摂動培養とミニバルクトランスクリプトミクスを組み合わせた、トランスクリプトームベースの薬物スクリーニングのための費用対効果の高いシステムを提示しています。

最適化されたミニバルクプロトコルは、費用対効果の高いシーケンシング深度で有益な生物学的シグナルを提供し、既知の薬物や新しい分子の広範なスクリーニングを可能にします。トランスクリプトミクスと偏りのない薬物スクリーニングを組み合わせることの主な利点の1つは、これまで考慮されていなかった新しい薬剤標的を特定できる可能性があることです。従来の薬物スクリーニングアプローチは、確立された標的分子や経路に焦点を当てることが多く、新しい標的の同定を妨げ、予期せぬ副作用や効果が制限される薬剤につながる可能性があります。