トリカブトム振子試料の分析のための2D-HPLC-MSへの分子ネットワーク操作の統合

データ調製を開始するには、2D HPLC-MS の生質量スペクトルデータをエクスポートします。次に、[セッション構成] ページの WINSCP インターフェイスで GNPS FTP サーバーに接続し、接続情報を入力します。情報を入力したら、[スタート]ボタンをクリックしてGNPSFTPサーバーへの接続を確立します。

Webブラウザを開いてGNPSのWebサイトにアクセスして、分子ネットワークを作成します。新規ユーザーは、アカウントにサインアップしてからログインする必要があります。GNPS Webサイトのメインインターフェイスで、[データ解析]の下の[分子ネットワークの作成]をクリックします。

[タスクの作成] ページで、[入力ファイルの選択] ボタンをクリックし、データ ファイルを選択してアップロードします。「Workflow Option」タブで、分子ネットワークまたはMNを生成するさまざまなパラメータを設定します。これらのパラメータには、ピーク抽出アルゴリズム、ピークオーバートラベル値、類似性の計算方法などが含まれます。必要に応じて適切なパラメータ設定を行った後、ページの下部にある「送信」ボタンをクリックしてタスクを実行します。

タスクの実行後、[ジョブ] タブで作成したタスクを見つけ、ワークフロー名をクリックして分析結果を表示します。このWebサイトでは、MN図、代替図、共生ネットワーク、およびその他の関連情報を提供しています。MNによって同定されたAPBサンプル中のアルカロイド成分のうち、4つはアコニチン、14-ベンゾイラコニン、14-O-アセチルネオリン、およびヒパコニチンでした。

4つの化合物は同じ親核を持っていました。アコニチン、14-ベンジルアコニン、14-ベンゾイラコニン、ヒパコニチンは類似しており、置換基のみが異なっていました。