Gynura bicolor DCの化学組成分析のための質量分析データの処理と分析

データ解析ソフトウェアを起動した後、my work列に移動し、Import mass links dataをクリックして新しいウィンドウを開きます。プラス記号をクリックし、高解像度マススペクトルメトリック分析によって取得したポジティブモードから5つのRAWファイルをすべて選択します。グループ名を入力し、[Create unify sample set]をクリックしてデータのインポートを開始します。

ポジモードで解析方法ファイルをダブルクリックします。「processing」をクリックし、「target by mass」ボタンをクリックします。ターゲット一致許容値とフラグメント一致許容値に 5PPM を入力します。

[ホーム]をクリックし、[付加物]をクリックします。プロチル化およびアセチル化の行を選択します。右矢印の形をしたボタンをクリックして、保存します。

[my work] 列で、[analysis] をクリックします。インポートしたデータと方法を選択し、[次へ]をクリックします。ファイル名を入力し、解析データの保存フォルダを選択して、[完了]をクリックします。

次に、プロセスボタンをクリックします。結果テーブルを分析のために空白のフォームにコピーします。次に、結果テーブルで化合物を選択します。

対応するセカンダリーマススペクトルが右下隅に表示されます。表状のボタンをクリックし、高エネルギーフラグメントオプションを選択して、二次フラグメントイオンの表を表示します。表中の二次フラグメントイオンを選択します。

セカンダリーマススペクトルに対応するイオンピークにカーソルを合わせると、対応する構造フラクチャーが表示されます。描画ソフトウェアでフラグメンテーションパターンを手動で描画します。BFHの化学組成同定により、6つの抽出剤の化合物結果に基づいて168の化合物が明らかになりました。

UPLC-TOF-MS における酸の切断経路を理解するために、3-O-トランス-クマロイルキニン酸を実証しました。加水分解反応による切断により、中間体が形成されました。エステルについては、trans-O-グルコシル-メチル-トランス-桂皮酸が炭素-炭素開裂を介して中間体への変換を示した。

配糖体の場合、シントルシンCは、アルファ溶解鎖における炭素-炭素結合の切断、またはベンゼン環上の炭素酸素炭素結合の切断を介して中間体に変換されました。Gene Ontology Enrichment Analysisは、同定された化合物の可能性のある遺伝子機能を示しました。また、KEGGのパスウェイアノテーション解析では、発現差のある遺伝子のパスウェイが示されました。