この作品は、PDにし、JM低から医師の医療教育研究財団（テネシー大学）賞で持続可能なエネルギー教育研究センター賞（テネシー大）、PDに米国心臓協会賞13SDG14500046によってサポートされていました彼の揺れインキュベーター、卓上遠心、およびウエスタンブロット分析装置の使用のためにエリック·T. Boder（テネシー大学）;、著者らは、フェロプラストに分裂酵母を変換するためのプロトコルのためにキャロラインLeplante（エール大学）に感謝し、センター彼らの超遠心機を使用するための環境バイオテクノロジー（東大テネシー州）、酵母抗体についてのギュンター·ダウム（グラーツ大学技術、オーストリア）;技術支援のための産婦人科（東大テネシー州の医療センター）の職員。

1。 （分裂）酵母細胞から脂肪滴を分離酵母サッカロミセス·セレビシエ 、 出芽人気のモデル生物からの液滴の単離は、以下のプロトコル6とほぼ同じです。調剤の違いに注目している。 1。成長している酵母細胞<ol><li>メディアを準備します。ガラス瓶や培養フラスコ中のdH 2 Oリットル当たりYE5Sの粉末36グラムを兼ね備えています。メディアの約2 Lは必要とされるであろう。 20分間121℃でオートクレーブ媒体。媒体を室温まで冷却させる。 S.のためのcerevisiaeの YPDでYE5Sを交換してください。 </li><li>無菌技術を使用して、250ミリリットルの培養フラスコに冷却YE5Sメディアの10〜20ミリリットル入れます。無菌木の棒または同等を使用した寒天プレートからの酵母細胞の少量のメディアを接種する。細胞は30℃で所望の光学密度まで成長させAでの光学密度を測定する分光光度計を用いて波長595nm。 </li><li> 2.8 Lのフラスコ内に残っ​​ているメディアをセットします。振盪インキュベーター中で細胞増殖の間に適切な混合を確実にするために2.8 Lのフラスコあたり培地1 L以下で使用しない。湿った細胞の最終収率は、プロテオミクスとlipidomic分析のための十分な脂肪滴を取得することができるように約10グラムである必要があります。 </li><li>各ステップ1.1で調製した培地を1リットルた2.8 Lのフラスコにステップ1.2から細胞を紹介する。 </li><li> 30℃で所望の密度まで細胞を増殖させる</li><li>細胞は脂肪滴があることを確認してください。準備金の細胞の1ミリリットル。試料の光学密度（OD）を測定する。サンプルに細胞のODあたりのエタノールにBODIPY 503分の493の100 mMストックの0.1ミリリットルを追加します。ガラススライドとカバーガラスの間にサンプルを3μLを配置します。 GFPフィルター（ 図1A）と蛍光顕微鏡下で可視化する。 </li><li> 4＆＃でステップ1.5から細胞をペレット化176、C 10分間3800×gで。遠心管の容量に応じて、バッチで動作します。 </li><li> YE5Sメディアを捨て、ソルビトール、EMM + 600 mMの緩衝液で細胞を洗浄。ソルビトールは、浸透サポートを提供します。 </li><li>無菌の50ml遠心チューブに細胞を移し、10分間、2,000×gで4℃で細胞をペレット化。上清を取り除きます。湿潤細胞を秤量する。細胞1グラムあたり（EMM + 600mMのソルビトール）緩衝液2mlで細胞を再懸濁する。 </li></ol> 2。スフェロとその後の溶解に分裂酵母細胞への変換<ol><li> ）酵母溶解酵素を5 mgの1をそれぞれ追加し、2）酵母トリコデルマハルジアナムあたりのグラムステップ1.9で計量した湿った細胞の由来の酵素を溶解する。 S.のためのセレビシエはザイモリアーゼ同量のこれらの酵素を増強する。 </li><li> 60分間、100rpmで穏やかに振とう下、30℃で細胞をインキュベートする。 </li><li>スフェロ脂質DRを持っていることを確認してくださいoplets。ステップ1.6（ 図1B）を繰り返すことにより。 </li></ol> 3。密度勾配遠心<ol><li> 5分間、2,000×gで4℃で遠心分離することにより、スフェロプラストをペレット化。 </li><li>慎重にプラスチック製のトランスファーピペットを用いて上清を除去します。 </li><li>優しくソルビトールの氷冷10mMトリス-HCl、600 mmのペレット状のスフェロプラストを再懸濁し、200μMのEDTA。スフェロは非常に脆弱であることに留意してください。 </li><li>ステップ3.1と同じ設定を使用して、もう一度フェロプラストをペレット化。慎重に上清を除去し、2ミリリットル/ G-細胞の濃度で12％のFicoll、10 mMトリス-HCl、および200μMのEDTA中のプラスチックトランスファーピペットを使用してスフェロ再懸濁します。 </li><li>ガラスホモジナイザーに再懸濁フェロプラストを移し、ゆっくりとガラスホモジナイザーのゆったり乳棒を用いて、氷の上で、20〜30ストロークを均質化する。 </li><li>遠心管に溶解したスフェロプラストを転送し、同じVOオーバーレイ12％フィコール、10mMトリス-HCl、および200μMEDTA緩衝液LUME。各チューブは、約3分の2杯になるように使用する遠心管の数を選択してください。 </li><li> SW28ローターまたは同等の中で1.5時間、100,000×gで4℃で遠心します。ストップ（ローター減速= 0）に海岸にローターを許可します。 </li><li>優しくピペッターまたは曲がっパスツールピペットのいずれかを使用して、新しい遠心管（複数可）に、液滴を含む最白浮き層（ 図2A）、転送します。それは大まかに遠心管の3分の1を満たすように、試料に12％の十分な容量のFicollを追加し、10 mMトリス-HCl、および200μMのEDTA緩衝液。 </li><li>新しい遠心管（S）のサンプル（S）の先頭に8％のFicoll相当ボリュームを追加し、10 mMトリス-HCl、および200μMのEDTA緩衝液。この添加後、チューブをバッファフルの三分の二程度にする必要があります。 </li><li> SW28ローターまたは同等の中で1時間、100,000×gで4℃で遠心します。 R（停止するまで惰性ローターを許可するotor減速= 0）。 </li><li>優しくピペッターまたは曲がっパスツールピペットのいずれかを使用して、新しい遠心管（複数可）に、液滴を含むことになるトップ浮遊白層（ 図2B）を 、転送します。それは遠心管の約3分の1を満たすように600mMのソルビトールを追加し、8％フィコール、10mMトリス-HCl、試料200μMEDTA緩衝液。 </li><li>新しい遠心管（S）のサンプル（S）のトップにソルビトール250 mMと同等のボリュームを追加し、10 mMトリス-HCl、および200μMのEDTA緩衝液。この添加後、チューブをバッファフルの三分の二程度にする必要があります。 </li><li> SW28ローターまたは同等の中で1時間、100,000×gで4℃で遠心します。ストップ（ローター減速= 0）に海岸にローターを許可します。 </li><li>透析管に、唯一の脂質小滴と結合したタンパク質を含有し、そしてフィコールを排除するために10mMトリス-HCl及び200μMEDTA緩衝液中にO / Nを透析する必要があり頂白色層（ 図2C）を転送する。 </li></ol><pクラス= &quot;jove_title&quot;&gt; 2。ヒト胎盤絨毛細胞から脂肪滴を分離胎盤は、シングルトン妊娠前任期で自然分娩の発症に選択的帝王切開の配信を受けている健康な女性から採取した。被験者は、自分の胎盤を収集するための書面によるインフォームドコンセントを与えた。胎盤の収集、およびその後の使用は、テネシー大学からの承認を得て行われ、ノックス治験審査委員会の医学のテネシー大学大学院（＃の8757Bと＃3338、それぞれ）した。 1。ヒト胎盤絨毛細胞を単離するプロトコルの第1部では、ペトロフらの以前公開されたプロトコルの変形である。26 次の解決策を準備します。 <ul><li> NaCl水溶液（1 L）：1 Lの溶液を得たのdH 2 O 9のNaCl（M 58.4グラム/モル）を溶解する。濾過滅菌（0.2;の膜）。 </li><li> 10倍ハンクス液（10×HBSS）（1 L）：4のKCl（M 74.5グラム/モル）、0.6グラムのKH 2 PO 4（M 136.086グラム/モル）、80グラムのNaCl（M 58.44グラム/モル）; 10gのD-グルコース（M 180.16グラム/モル）、2 HPO 4（M 141.96グラム/モル）のNa。 1 Lの溶液を得たのdH 2 O中の成分の各々を溶解する。濾過滅菌（0.2μmの膜）。 </li><li>酵素消化緩衝液（0.6ミリリットル）：3.3ミリリットル、7.5％のNaビスカーボネート、17.5ミリリットルの1MのHEPES、及び266.1ミリリットルのdH 2 Oで70ミリリットル10倍のHBSSを組み合わせ、濾過滅菌（0.2μm膜）。 4℃で保存する</li><li> DNアーゼ私は：使用直前に、DNA分解酵素のバイアルに5ミリリットルの無菌の0.9％NaClを追加します。 -20℃での使用·保管まで氷上に保つ</li></ul><ol><li>解剖の準備胎盤<ol><li>できるだけ配達時に近いヒト胎盤およびプロセスを取得します。このような胎盤を輸送する冷却器として密封容器を使用してください。とき手は、常に十分注意してください玲人間の生体物質。 </li><li>生物学的安全フード、滅菌オートクレーブ容器に胎盤を転送し、慎重に無菌の0.9％NaCl（生理食塩水）溶液を用いて、胎盤および膜から血を洗う。液体生物学的廃棄物として1リットルのビーカーに血まみれの生理食塩水を捨てる。 </li><li>滑らかな表面を上に向け臍帯を保有して、無菌領域に胎盤を置きます。シャープ、ファインポイントハサミとピンセットで胎児の膜および臍帯を削除します。 </li><li>母体の表面（粗面）が上を向いているように、胎盤を裏返し。上層基板組織、表面から約3ミリメートルを削除します。 </li></ol></li><li>胎盤を解剖<ol><li>絨毛膜板を避けて一度に1子葉を解剖。生理食塩水250ミリリットルビーカーに絨毛組織を収集しています。 </li><li>液体廃棄物の1リットルのビーカーを使用して、ピンセットで回転させることによって、0.9％NaClを別のビーカー内の組織数回すすいでください。 </li><li> 150ミリメートルペトリ皿に一度に1子葉を転送します。ピンセットで保持し、シャーレ上の血管からかみそりの刃で組織をこすり。 0.9％NaClを含む別のビーカー中に掻き組織を置きます。すべての組織片について、この手順を繰り返します。 </li><li>細胞解離ふるいに組織の一部を転送し、溶出液が透明になるまで徹底的に0.9％NaClですすいでください。全ての組織に対して、この手順を繰り返します。 </li><li>細胞解離ふるいに掻き組織をすすいだ後、余分な液体と重さ、それを排出します。 この時点で、組織は、O / N DMEM中で4℃で無菌三角フラスコ内に格納することができる。 </li></ol></li><li>胎盤組織の酵素消化<ol><li>あらかじめ温めておいた酵素希釈緩衝液100ml、1ミリリットルのDNase Iと20ミリリットル2.5％10Xトリプシン：組織消化液を調製する。 </li><li> 500ミリリットルの滅菌三角フラスコに総採取した組織（通常は約250〜300グラム）から60グラムを転送する、組織を分割する。 </li><l私は&gt;組織を含む三角フラスコに組織消化物を追加し、150 rpmで45分間シェーカーで37℃でインキュベートする。 </li></ol></li><li>解離した細胞を回収する<ol><li>組織が安定するまで最初の45分解離した後、傾斜で消化フラスコを設定します。 </li><li>未解離組織を収集しないように注意しながら、上清を集める。回収した上清に、HBSSを同量を追加し、滅菌15mL遠心管に移す。解離していない組織の追加部分については、解離していない組織とステップ3.2から始まる手順を繰り返してください。 </li><li>遠心分離機で15分間、1,000×gで4℃でホモジネート。 </li><li>各バッチには、遠心分離後、ペレットを乱すことなく、上清を吸引除去する。胎盤絨毛細胞は赤血球の上にある、ペレットの白い部分に主にある。 </li><li> STに絨毛細胞（ペレットの白い部分）を転送erile 50ミリリットルコニカル遠心管、氷上に保つ。 </li><li> 3つ全ての消化段階から細胞を収集した後、滅菌50mlコニカル遠心管の最上部に挿入さ100μmナイロン細胞ストレーナーを用いて懸濁液を濾過する。細胞懸濁液の濾過が遅くなる場合は、チューブ内に真空を引くために、フィルタを上に持ち上げる。 </li><li> 10分間1,000×gで4℃で遠心。慎重にペレットを乱すことなく、上清を除去します。 </li></ol></li></ol> 2。胎盤絨毛細胞をホモジナイズ<ol><li>分離プロセスを開始する前に、20mMのトリス-HCl、pH7.4および1mMのEDTAを含有する低張溶解培地（HLM）を50mlを調製する。使用直前に、HLMにプロテアーゼ阻害剤を添加し、氷上でメディアを保持します。 </li><li>生物学的安全フード内で、細胞への氷冷HLMの4倍の細胞ペレットの量を追加します。やさしく、徹底的に細胞をピペッティングして細胞を再懸濁アップANを10mlピペットを用いてdをダウン。 </li><li> 10分間氷上に懸濁した細胞をインキュベートします。 </li><li>氷の上でなければなりませんダウンスホモジナイザーに細胞を移す。ゆっくりホモジナイザーのゆったりした乳棒で20〜25穏やかなストロークを適用することにより、細胞を均質化する。 </li><li>遠心未破壊細胞、核および細胞破片を除去するために10分間3,000×gで4℃で細胞溶解物。 </li><li>上清を回収し、（25,000×gで遠心分離することができるまたは代替）SW28チューブに移す。ミトコンドリアを除去するために20分間25000×gで4℃で遠心します。 </li></ol> 3。超遠心分離によって脂質小滴を単離する<ol><li> 100mMの炭酸ナトリウム（M 106グラム/モル）緩衝液（pH 11.5）および60％スクロース（w / w）の溶液50mlを50mlを調製する。使用直前に炭酸ナトリウム緩衝液にプロテアーゼ阻害剤を添加し、氷上に保つ。 </li><li> 50ミリリットル遠心管にステップ2.6から上清を回収し、調整SW28ローター、または同等のための超遠心管の底部へのスクロースおよび転写の20％。 〜氷冷100mMの炭酸ナトリウム緩衝液（pH 11.5）を10mlのチューブに充填するために、氷冷HLM 0.5〜1 mlの密度に調整オーバーレイ上清。 </li><li> SW28スイングバケットローターを使用して45分間13万×gで4℃で遠心します。ストップ（ローター減速= 0）に海岸にローターを許可します。 </li><li>浮遊層を集め、10％ショ糖に調整し、SW41Tiローター用13.2ミリリットル超遠心管の底部、または同等に移す。オーバーレイ密度約5mlの氷冷100mMの炭酸ナトリウム緩衝液（pH 11.5）を、0.5mlの氷冷HLMの上清を用いて調整した。 </li><li> SW41Tiスイングバケットローターを用いて60分間274,000×gで4℃で遠心します。脂肪滴層の破壊を最小限にするために、停止（ロータ減速= 0）に海岸にローターを許可します。 </li><li>慎重に含む最浮動層（ 図2D）を収集1ミリリットルピペットを繰り返しステップ3.4に脂肪滴。 </li><li> SW41Tiスイングバケットローターを用いて30分間274,000×gで4℃で遠心します。ストップ（ローター減速= 0）に海岸にローターを許可します。 </li><li>慎重に100μlのHLMを含む3 1.5mlチューブに曲げたパスツールピペットで脂肪滴を含むトップ白色浮動層を収集します。 </li></ol> 特徴付ける脂質滴画分（プロトコール1及び2） 脂肪滴画分の回収および純度は、光又は電子顕微鏡と組み合わせてウエスタンブロットによって検証することができる。さらに、異なる遠心分離工程後のアリコートを収集することができ、浄化効率を決定するために保持される。ウェスタンブロッティングでは、tは上に他の膜画分に脂肪滴を比較するよりも、全細胞溶解物の当量を表し、脂肪滴の体積分率を比較することがより適切である総タンパク質含有量24の彼が根拠。

<ol>
	<li>Ploegh, H. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+lipid-based+model+for+the+creation+of+an+escape+hatch+from+the+endoplasmic+reticulum.">A lipid-based model for the creation of an escape hatch from the endoplasmic reticulum.</a> Nature. 448, 435-438 (2007).</li><li>Herker, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Efficient+hepatitis+C+virus+particle+formation+requires+diacylglycerol+acyltransferase-1.">Efficient hepatitis C virus particle formation requires diacylglycerol acyltransferase-1.</a> Nat. Med. 16, 1295-1298 (2010).</li><li>Ding, Y. F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isolating+lipid+droplets+from+multiple+species.">Isolating lipid droplets from multiple species.</a> Nat. Protoc. 8, 43-51 (2013).</li><li>Kalscheuer, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Preparative+isolation+of+lipid+inclusions+from+Rhodococcus+opacus+and+Rhodococcus+rubber+and+identification+of+granule-associated+proteins.">Preparative isolation of lipid inclusions from Rhodococcus opacus and Rhodococcus rubber and identification of granule-associated proteins.</a> Arch. Microbiol. 177, 20-28 (2001).</li><li>Low, K. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lipid+droplet-associated+proteins+are+involved+in+the+biosynthesis+and+hydrolysis+of+triacylglycerol+in+mycobacterium+bovis+bacillus+calmette-guerin.">Lipid droplet-associated proteins are involved in the biosynthesis and hydrolysis of triacylglycerol in mycobacterium bovis bacillus calmette-guerin.</a> J. Biol. Chem. 285, 21662-21670 (2010).</li><li>Leber, R., Zinser, E., Zellnig, G., Paltauf, F., Daum, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterization+of+lipid+particles+of+the+yeast,+Saccharomyces+cerevisiae.">Characterization of lipid particles of the yeast, Saccharomyces cerevisiae.</a> Yeast. 10, 1421-1428 (1994).</li><li>Grillitsch, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lipid+particles/droplets+of+the+yeast+Saccharomyces+cerevisiae+revisitied:+lipidome+meets+proteome.">Lipid particles/droplets of the yeast Saccharomyces cerevisiae revisitied: lipidome meets proteome.</a> Biochim. Biophys. Acta. , 1165-1176 (2011).</li><li>Binns, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+intimate+collaboration+between+peroxisomes+and+lipid+bodies.">An intimate collaboration between peroxisomes and lipid bodies.</a> J. Cell Biol. 173, 719-731 (2006).</li><li>Ivashov, V. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lipidome+and+proteome+of+lipid+droplets+from+the+methylotropic+yeast+Pichia+pastoris.">Lipidome and proteome of lipid droplets from the methylotropic yeast Pichia pastoris.</a> Biochim. Biophys. Acta. 1831, 282-290 (2013).</li><li>Connerth, M., Grillitsch, K., Kofeler, H., Daum, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Analysis+of+lipid+particles+from+yeast.">Analysis of lipid particles from yeast.</a> Lipidomics: Vol. 1: Methods and Protocols. 579, 359-374 (2009).</li><li>Wolinski, H., Kohlwein, S. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microscopic+analysis+of+lipid+droplet+metabolism+and+dynamics+in+yeast.">Microscopic analysis of lipid droplet metabolism and dynamics in yeast.</a> Methods Mol. Biol. 457, 151-163 (2008).</li><li>Jolivet, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Protein+composition+of+oil+bodies+in+Arabidopsis+thaliana+ecotype+WS.">Protein composition of oil bodies in Arabidopsis thaliana ecotype WS.</a> Plant Physiol. Biochem. 42, 501-509 (2004).</li><li>Katavic, V., Agrawal, G. K., Hajduch, M., Harris, S. L., Thelen, J. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Protein+and+lipid+composition+analysis+of+oil+bodies+from+two+Brassica+napus+cultivers.">Protein and lipid composition analysis of oil bodies from two Brassica napus cultivers.</a> Proteomics. 6, 4586-4598 (2006).</li><li>Zhang, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Proteomic+study+and+marker+protein+identification+of+Caenorhabditis+elegans+lipid+droplets.">Proteomic study and marker protein identification of Caenorhabditis elegans lipid droplets.</a> Mol. Cell. Proteomics. 11, 317-328 (2012).</li><li>Krahmer, N., Hilger, M., Kory, N., Wilfling, F., Stoehr, G., Mann, M., Farese, R. V., Walther, T. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Protein+correlation+profiles+identify+lipid+droplet+proteins+with+high+confidence.">Protein correlation profiles identify lipid droplet proteins with high confidence.</a> Mol. Cell Proteomics. 12, 1115-1126 (2013).</li><li>Cermelli, S., Gou, Y., Gross, S. P., Welte, M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+lipid-droplet+proteome+reveals+that+droplets+are+a+protein-storage+depot.">The lipid-droplet proteome reveals that droplets are a protein-storage depot.</a> Curr. Biol. 16, 1783-1795 (2006).</li><li>Brasaemle, D. L., Dolios, G., Shapiro, L., Wang, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Proteomic+analysis+of+proteins+associated+with+lipid+droplets+of+basal+and+lipolytically+stimulated+3T3-L1+adipocytes.">Proteomic analysis of proteins associated with lipid droplets of basal and lipolytically stimulated 3T3-L1 adipocytes.</a> J. Biol. Chem. 279, 46835-46842 (2004).</li><li>Liu, P. S., Ying, Y. S., Zhao, Y. M., Mundy, D. I., Zhu, M. F., Anderson, R. G. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chinese+hamster+ovary+K2+cell+lipid+droplets+appear+to+be+metabolic+organelles+involved+in+membrane+traffic.">Chinese hamster ovary K2 cell lipid droplets appear to be metabolic organelles involved in membrane traffic.</a> J. Biol. Chem. 279, 3787-3792 (2004).</li><li>Fujimoto, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+of+major+proteins+in+the+lipid+droplet-enriched+fraction+isolated+from+the+human+hepatocyte+cell+line+HuH7.">Identification of major proteins in the lipid droplet-enriched fraction isolated from the human hepatocyte cell line HuH7.</a> Biochim. Biophys. Acta. , 47-59 (2004).</li><li>Sato, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Proteomic+profiling+of+lipid+droplet+proteins+in+hepatoma+cell+lines+expressing+hepatitis+C+virus+core+protein.">Proteomic profiling of lipid droplet proteins in hepatoma cell lines expressing hepatitis C virus core protein.</a> J. Biochem. 139, 921-930 (2006).</li><li>Umlauf, E., Csaszar, E., Moertelmaier, M., Schuetz, G. J., Parton, R. G., Prohaska, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Association+of+stomatin+with+lipid+bodies.">Association of stomatin with lipid bodies.</a> J. Biol. Chem. 279, 23699-23709 (2004).</li><li>Zhang, H. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Proteome+of+skeletal+muscle+lipid+droplet+reveals+association+with+mitochondria+and+apolipoprotein+A-I.">Proteome of skeletal muscle lipid droplet reveals association with mitochondria and apolipoprotein A-I.</a> J. Proteome Res. 10, 4757-4768 (2011).</li><li>Wu, C. C., Howell, K. E., Neville, M. C., Yates, J. R., McManaman, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Proteomics+reveal+a+link+between+the+endoplasmic+reticulum+and+lipid+secretory+mechanisms+in+mammary+epithelial+cells.">Proteomics reveal a link between the endoplasmic reticulum and lipid secretory mechanisms in mammary epithelial cells.</a> Electrophoresis. 21, 3470-3482 (2000).</li><li>Brasaemle, D. L., Wolins, N. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isolation+of+lipid+droplets+from+cells+by+density+gradient+centrifugation.">Isolation of lipid droplets from cells by density gradient centrifugation.</a> Curr. Protoc. Cell Biol. , 3.15.1-3.15.12 (2005).</li><li>Long, A. P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lipid+droplet+de+novo+formation+and+fission+are+linked+to+the+cell+cycle+in+fission+yeast.">Lipid droplet de novo formation and fission are linked to the cell cycle in fission yeast.</a> Traffic. 13, 705-714 (2012).</li><li>Petroff, M. G., Phillips, T. A., Ka, H., Pace, J. L., Hunt, J. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isolation+and+culture+of+term+human+trophoblast+cells.">Isolation and culture of term human trophoblast cells.</a> Methods Mol. Med. 121, 203-217 (2006).</li><li>Cho, S. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+of+mouse+Prp19p+as+a+lipid+droplet-associated+protein+and+its+possible+involvement+in+the+biogenesis+of+lipid+droplets.">Identification of mouse Prp19p as a lipid droplet-associated protein and its possible involvement in the biogenesis of lipid droplets.</a> J. Biol. Chem. 282, 2456-2465 (2007).</li><li>Ding, Y. B., Wu, Y. B., Zeng, R., Liao, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Proteomic+profiling+of+lipid+droplet-associated+proteins+in+primary+adipocytes+of+normal+and+obese+mouse.">Proteomic profiling of lipid droplet-associated proteins in primary adipocytes of normal and obese mouse.</a> Biochim. Biophys. Acta. 44, 394-406 (2012).</li><li>Jagerstrom, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lipid+droplets+interact+with+mitochondria+using+SNAP23.">Lipid droplets interact with mitochondria using SNAP23.</a> Cell Biol. Int. 33, 934-940 (2009).</li><li>Xu, N. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+FATP1-DGAT2+complex+facilitates+lipid+droplet+expansion+at+the+ER-lipid+droplet+interface.">The FATP1-DGAT2 complex facilitates lipid droplet expansion at the ER-lipid droplet interface.</a> J. Cell Biol. 198, 895-911 (2012).</li><li>Ozeki, S., Cheng, J. L., Tauchi-Sato, K., Hatano, N., Taniguchi, H., Fujimoto, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rab18+localizes+to+lipid+droplets+and+induces+their+close+apposition+to+the+endoplasmic+reticulum-derived+membrane.">Rab18 localizes to lipid droplets and induces their close apposition to the endoplasmic reticulum-derived membrane.</a> J. Cell Sci. 118, 2601-2611 (2005).</li><li>Yang, H. Y., Galea, A., Sytnyk, V., Crossley, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Controlling+the+size+of+lipid+droplets:+lipid+and+protein+factors.">Controlling the size of lipid droplets: lipid and protein factors.</a> Curr. Opin. Cell Biol. 24, 509-516 (2012).</li><li>Jacquier, N., Choudhary, V., Mari, M., Toulmay, A., Reggiori, F., Schneiter, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Lipid+droplets+are+functionally+connected+to+the+endoplasmic+reticulum+in+Saccharomyces+cerevisiae.">Lipid droplets are functionally connected to the endoplasmic reticulum in Saccharomyces cerevisiae.</a> J. Cell Sci. 124, 2424-2437 (2011).</li><li>Pu, J., Ha, C. W., Zhang, S., Jung, J. P., Huh, W. K., Liu, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Interactomic+study+on+interaction+between+lipid+droplets+and+mitochondria.">Interactomic study on interaction between lipid droplets and mitochondria.</a> Protein Cell. 2, 487-496 (2011).</li><li>Shaw, C. S., Jones, D. A., Wagemakers, A. J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Network+distribution+of+mitochondria+and+lipid+droplets+in+human+muscle+fibres.">Network distribution of mitochondria and lipid droplets in human muscle fibres.</a> Histochem. Cell Biol. 129, 65-72 (2008).</li><li>Goodman, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+gregarious+lipid+droplet.">The gregarious lipid droplet.</a> J. Biol. Chem. 283, 28005-28009 (2008).</li><li>Brasaemle, D. L., Wolins, N. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Packaging+of+fat:+an+evolving+model+of+lipid+droplet+assembly+and+expansion.">Packaging of fat: an evolving model of lipid droplet assembly and expansion.</a> J. Biol. Chem. 287, 2273-2279 (2012).</li></ol>

著者らは、競合する経済的利益を宣言していません。

<html> このプロトコルの中の重要なステップ 培養細胞の成長中のメディアと細胞密度と一致していることを確認します。細胞の脂質滴はそれらに関連するタンパク質は、細胞が17培養された環境に大きく依存している点で独特である。したがって、細胞が成長する培地と細胞の密度は、密接に溶解する前に監視されるべきである。 <p cl...

細胞の脂質滴は、細胞内で複数の機能を果たす動的小器官である。それらはエネルギーに変換またはリン脂質合成のために使用することができる中性脂質の貯蔵のハブである。液滴は、アテローム性動脈硬化症、肥満症および関連する代謝疾患を含む生理学的および病理学的状態において中心的役割を果たし、また、感染症1,2。さらに、それらは、バイオディーゼル燃料のための魅力的な供給源である。 脂肪滴の細胞の役割に関する多くの情報は、幅広い生物3から精製された液滴のプロテオミクスおよびlipidomic分析から得られている。これらの生物は、細菌4,5、酵母6-11含ま12,13植物、14を線虫、そして15,16飛ぶました。ヒトの代謝性疾患における脂肪滴の役割への関心を考慮すると、液滴はまた、培養動物細胞であり、aから単離されているニマル組織。培養細胞株は、3T3-L1脂肪細胞17、チャイニーズハムスター卵巣（CHO）細胞K2 18、ヒトhepatocyes 19,20、および上皮細胞系21が含まれている。液滴が単離されたから動物組織は、マウス骨格筋22、肝臓23、及び乳腺23が含まれている。上述したように、ほとんどの液滴の分離の研究の目標は、中性およびリン脂質に結合した因子およびlipidomic分析プロテオーム解析を実行することである。 中性脂質以来 - 脂質滴の最も多い成分は - ほとんどの他の細胞材料よりも緻密であり、液滴の分離は、従来、密度勾配遠心分離を用いて行われた。その手法は、ここで紹介するの両方プレップの目玉です。従来の技術は、培養6,24分裂酵母細胞からの液滴の分離を視覚的に結合され、変更されたおよび胎盤組織から得られたヒト細胞をnoncultured。目標は、液滴分離のための出発点に、2つの非常に異なる細胞型を選択することによって、この技術の広い適用可能性を示すことである。この手法は、ほとんどの生物からの液滴を分離したい方のために有用であるはずである。 プロトコル1は、真核細胞分裂の間に25滴形成を観察するためのモデルとして使用されてきた分裂酵母、 シゾサッカロミセス·ポンベから脂質滴の単離が記載されている。出芽酵母サッカロミセス·セレビシエ（Saccharomyces cerevisiae）は、脂質滴生物学を研究するためのモデル生物として広く使用されている。プロトコル1は、生物や強調されている準備の違いの両方に適用可能である。 プロトコル2は、ヒト満期胎盤から得た順にある胎盤絨毛細胞から脂肪滴の単離を記載している。ザ·満期胎盤のコレクションは、安全かつ倫理的に脂肪滴のかなりの数が含まれ、容易に入手可能なヒト組織26、200〜250を得するユニークな機会を提供します。これは、液滴が培養された細胞に由来高等真核生物における最も脂肪滴分離作業とは対照的である。これらの研究では、脂肪酸は、多くの場合、中性脂質の合成、従って、液滴の成長を促進する培養物に添加される。これは、脂質滴を、胎盤組織中の天然の条件下で形成される、ここでの作業とは対照的である。 脂肪滴の画分の純度は、細胞小器官マーカー抗体を用いたウェスタンブロット分析によって決定される。これら2つのプロトコルが、後続のプロテオームとlipidomic分析するのに適した脂肪滴画分が得られる。

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="802">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">PROTOCOL #1:&#160;</td>
			<td style="width:163px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">1.Growing yeast cells and converting to spheroplasts</td>
			<td style="width:163px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Edinburgh Minimal Media (EMM)</td>
			<td>Sunrise Science Products</td>
			<td style="width:119px;">2005</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="147">
			<td height="147" style="height:147px;">Yeast extract with 5 supplements (YE5S)</td>
			<td>Sunrise Science Products</td>
			<td style="width:119px;">2011</td>
			<td style="width:167px;">YE5S media with 225 mg/ml of each supplement: adeninie, histidine, leucine, lysine, uracil. The equivalent for budding yeast would be YPD.</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">YPD powder</td>
			<td>Sunrise Science Products</td>
			<td style="width:119px;">1875</td>
			<td>For S. cerevisiae&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Sorbitol</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">BP439</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Yeast Lytic Enzyme</td>
			<td>MP Biomedicals</td>
			<td style="width:119px;">215352610</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Lysing Enzymes from Trichoderma harzianum</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">L1412</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Zymolayse-20T</td>
			<td>Sunrise Science Products</td>
			<td style="width:119px;">N0766391</td>
			<td>For S. cerevisiae&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">BODIPY 493/503</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td style="width:119px;">D-3922</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Microscope Slides</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">12-544-7</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Microscope Cover Glass</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">12-542-B</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Plastic transfer pipette</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">137115AM</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">1 liter glass bottle</td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">250 ml flask</td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">2.8 liter flasks</td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;"></td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">2. Yeast lipid droplet isolation</td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Tris-HCl</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">BP153</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">EDTA</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">BP120</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Ficoll 400</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">BP525</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">12-14k Spectra/Por Dialysis Membrane</td>
			<td>SpectrumLabs</td>
			<td style="width:119px;">132680</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">EDTA-free Protease Inhibitor Cocktail Tablets</td>
			<td>Roche Diagnostics</td>
			<td style="width:119px;">11873580001</td>
			<td>irritant</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Dounce Homogenizer&#160;</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">D9938</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Ultracentrifuge Tubes 25x89mm (for SW28)</td>
			<td>Beckman-Coulter</td>
			<td style="width:119px;">355642</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">12-14k Spectra/Por Dialysis Membrane</td>
			<td>SpectrumLabs</td>
			<td style="width:119px;">132680</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;"></td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">Name of Equipment</td>
			<td style="width:163px;">Company</td>
			<td style="width:119px;">Catalog Number</td>
			<td>Comments/Description</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">&#160;Temperature-controlled shaker</td>
			<td>New Brunswick Scientific</td>
			<td style="width:119px;">C25KC</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Thermo Sorvall Legend XTR centrifuge</td>
			<td>Thermo-Scientific</td>
			<td style="width:119px;">75004521</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Swinging Bucket Centrifuge Rotor</td>
			<td>Thermo-Scientific</td>
			<td style="width:119px;">75003607</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Fiberlite* F15-6x100y Fixed-Angle Rotor</td>
			<td>Thermo-Scientific</td>
			<td style="width:119px;">75003698</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Ultracentrifuge LB-M</td>
			<td>Beckman-Coulter</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">SW28 Ultracentrifuge Rotor</td>
			<td>Beckman-Coulter</td>
			<td style="width:119px;">342204</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;"></td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">PROTOCOL #2&#160;</td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">1. Placental villous cells isolation</td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Disposable underpads</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">23666062</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">Autoclavable pan (container), 3L</td>
			<td style="width:163px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">1336110</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Fine scissors, sharp-sharp, straight</td>
			<td>Fine science tools</td>
			<td style="width:119px;">1406011</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">London Forceps</td>
			<td>Fine science tools</td>
			<td style="width:119px;">1108002</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Dumont #7b Forceps</td>
			<td>Fine science tools</td>
			<td style="width:119px;">1127020</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Razor blades</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">S65921</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Screen cup for CD-1</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">S1145</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">40 mesh screen&#160;</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">S0770</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Fisherbrand cell stainers 100&#956;m</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">22363549</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">150 mm Petri Dishes</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">NC9054771</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">NaCl</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">S642</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">KCl</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">P333</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">KH2PO4</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">P386</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Na2HPO4</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">S374</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">D-glucose</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">D16</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">HEPES</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">BP310</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">2.5% trypsin 10x</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td style="width:119px;">15090046</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">DNase I grade II, from bovine pancreas</td>
			<td>Roche Applied Science</td>
			<td style="width:119px;">10104159001</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Sodium bicarbonate solution</td>
			<td>Sigma-aldrich</td>
			<td style="width:119px;">S8761</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">500 ml Erlenmeyer flasks</td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">250 ml beakers</td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">15 ml centrifuge tubes</td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">10 ml serological pipettes</td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">50 ml centrifuge tubes</td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">DMEM</td>
			<td style="width:163px;">Invitrogen</td>
			<td style="width:119px;">11965084</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">2. Lipid droplets isolation from villous placental cells</td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Tris-HCl</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">BP153</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">EDTA</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">BP120</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">D-Sucrose</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">BP220</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Sodium Carbonate&#160;</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">BP357</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">EDTA-free protease inhibitor cocktail tablets</td>
			<td>Roche Diagnostics</td>
			<td style="width:119px;">11873580001</td>
			<td>irritant</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Dounce homogenizer&#160;</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">D9938</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Ultracentrifuge tubes 25x89mm (for SW28)</td>
			<td>Beckman-Coulter</td>
			<td style="width:119px;">355642</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Ultra-Clear centrifuge tubes 14x89mm (for SW41)</td>
			<td>Beckman-Coulter</td>
			<td style="width:119px;">344059</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Disposable borosilicate glass pasteur pipets</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;">1367820C</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;"></td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">Name of Equipment</td>
			<td style="width:163px;">Company</td>
			<td style="width:119px;">Catalog Number</td>
			<td>Comments/Description</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">Biological safety hood&#160;</td>
			<td style="width:163px;">Thermo-Scientific</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Waterbath</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">&#160;Temperature-controlled shaker</td>
			<td>New Brunswick Scientific</td>
			<td style="width:119px;">C25KC</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Thermo Sorvall Legend XTR centrifuge</td>
			<td>Thermo-Scientific</td>
			<td style="width:119px;">75004521</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Swinging Bucket Centrifuge Rotor</td>
			<td>Thermo-Scientific</td>
			<td style="width:119px;">75003607</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Ultracentrifuge LB-M</td>
			<td>Beckman-Coulter</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">SW28 Ultracentrifuge Rotor</td>
			<td>Beckman-Coulter</td>
			<td style="width:119px;">342204</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">SW41 Ti Ultracentrifuge Rotor</td>
			<td>Beckman-Coulter</td>
			<td style="width:119px;">331336</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;"></td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;"></td>
			<td></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">Western blot</td>
			<td style="width:163px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">IRDye 680 Goat Anti-Rabbit IgG</td>
			<td style="width:163px;">LI-COR</td>
			<td style="width:119px;">926-68071</td>
			<td>dilution 1:15000</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">IRDye&#160; 800CW Goat Anti-Mouse IgG</td>
			<td style="width:163px;">LI-COR</td>
			<td style="width:119px;">926-32210</td>
			<td>dilution 1:5000</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">NuPAGE&#174; Novex&#174; 12% Bis-Tris gels</td>
			<td style="width:163px;">Invitrogen</td>
			<td style="width:119px;">NP0341</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">primary antibodies for PROTOCOL #1</td>
			<td style="width:163px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="60">
			<td height="60" style="height:60px;width:353px;">Erg6p</td>
			<td style="width:163px;">gift from Dr. G. Daum</td>
			<td style="width:119px;">Graz University of Technology, Austria</td>
			<td>dilution 1:5000</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">Dpm1p</td>
			<td style="width:163px;">Abcam</td>
			<td style="width:119px;">ab113686</td>
			<td>4 &#956;g/ml</td>
		</tr>
		<tr height="60">
			<td height="60" style="height:60px;width:353px;">Por1p</td>
			<td style="width:163px;">gift from Dr. G. Daum</td>
			<td style="width:119px;">Graz University of Technology, Austria</td>
			<td>dilution 1:5000</td>
		</tr>
		<tr height="60">
			<td height="60" style="height:60px;width:353px;">Pma1p</td>
			<td style="width:163px;">gift from Dr. G. Daum</td>
			<td style="width:119px;">Graz University of Technology, Austria</td>
			<td>dilution 1:10000</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">Vma1p (anti-ATP6V1A)</td>
			<td style="width:163px;">Abcam</td>
			<td style="width:119px;">ab113745</td>
			<td>0.5 &#956;g/ml</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;"></td>
			<td style="width:163px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">primary antibodies for PROTOCOL #2</td>
			<td style="width:163px;"></td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">perilipin 2 (anti-ADFP)</td>
			<td style="width:163px;">Abcam</td>
			<td style="width:119px;">ab52355</td>
			<td>2 &#956;g/ml</td>
		</tr>
		<tr height="25">
			<td height="25" style="height:25px;width:353px;">calnexin</td>
			<td style="width:163px;">Cell Signaling technology</td>
			<td style="width:119px;">2679</td>
			<td>dilution 1:1000</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">GM130</td>
			<td style="width:163px;">Biorbyt</td>
			<td style="width:119px;">orb40533</td>
			<td>dilution 1:25</td>
		</tr>
		<tr height="25">
			<td height="25" style="height:25px;width:353px;">COX IV</td>
			<td style="width:163px;">Cell Signaling technology</td>
			<td style="width:119px;">4850</td>
			<td>dilution 1:1000</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:353px;">MEK1</td>
			<td style="width:163px;">Biorbyt</td>
			<td style="width:119px;">orb38775</td>
			<td>dilution 1:50</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

isolation of cellular lipid droplets: two purification techniques starting from yeast cells and human placentas

脂肪滴は、ほとんどの真核および特定の原核細胞で見つけることができる動的な細胞小器官である。構造的には、液滴は、リン脂質単分子膜に囲まれた中性脂質のコアで構成されています。液滴の細胞の役割を決定する際に最も有用な技術の1つは、液滴と共に単離することができ、結合したタンパク質のプロテオーム同定されている。分裂酵母とヒト胎盤絨毛細胞：ここでは、二つの方法が2幅広い真核生物からの脂肪滴とその結合したタンパク質を分離するために記述されている。両方の技術は、違いがありますが、mainメソッド - 密度勾配遠心分離を - 両方の製剤で共有されている。これは、提示された液滴分離技術の広い適用可能性を示している。 第一のプロトコルにおいて、酵母細胞は、その細胞壁の酵素消化によって、スフェロプラストに変換される。結果としてフェロプラストはその後紳士ですLYゆったりホモジナイザーで溶解。フィコール密度勾配を提供するために、溶解物に添加し、そして混合物を3回遠心分離する。第一のスピンの後、脂質滴は、小胞体（ER）、原形質膜、および液胞と共に遠心分離管の白色フローティング層に局在している。二つの連続スピンはこれらの他の3小器官を除去するために使用される。結果は滴と結合したタンパク質を持っている層である。 第二のプロトコルでは、胎盤絨毛細胞は、細胞がゆったりホモジナイザーでホモジナイズするトリプシンで酵素消化によりヒト満期胎盤から単離され、DNA分解酵素Iをされています。低速·中速遠心分離工程は、未破壊細胞、細胞破片、核、ミトコンドリアを除去するために使用される。スクロース密度勾配を提供するために、ホモジネートに添加し、混合物を他の蜂巣から脂質滴を分離するために遠心分離されるR画。 両方のプロトコルにおける脂肪滴の純度は、ウェスタンブロット分析によって確認される。両方の調製物からの液滴画分は、その後のプロテオームとlipidomic分析に適している。

期待通りに密度勾配遠心分離が働いていた場合、浮動層が脂肪滴が含まれている必要があり、高速スピンの進行を通じて、他の細胞小器官が枯渇する。 プロトコル1は、ウェスタンブロット、マーカー脂肪滴（Erg6p）に対する抗体、および酵母、ER（Dpm1p）、ミトコンドリア（Por1p）中の脂質滴と相互作用することが見出されている細胞小器官を用いて行った、原形質膜（Pm...

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Isolation of Cellular Lipid Droplets: Two Purification Techniques Starting from Yeast Cells and Human Placentas

1つの細胞の脂質滴を単離するための技術）は、酵母細胞および2）ヒト胎盤が提示される。両方の手順は、液滴の中心を含有する得られた浮遊層が容易に、眼によって視覚化抽出し、純度についてウェスタンブロット分析によって定量化することができる密度勾配遠心分離である。

細胞の脂質滴の分離：酵母細胞とヒト胎盤から2精製技術

Lipid droplets are dynamic organelles that can be found in most eukaryotic and certain prokaryotic cells. Structurally, the droplets consist of a core of ...

isolation-cellular-lipid-droplets-two-purification-techniques

Research

JoVE Journal

Bioengineering

19.5K ビュー.  University of Tennessee.  1つの細胞の脂質滴を単離するための技術）は、酵母細胞および2）ヒト胎盤が提示される。両方の手順は、液滴の中心を含有する得られた浮遊層が容易に、眼によって視覚化抽出し、純度についてウェスタンブロット分析によって定量化することができる密度勾配遠心分離である。 

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Rotating Cell Culture Systems for Human Cell Culture: Human Trophoblast Cells as a Model

The field of human trophoblast research aids in understanding the complex environment established during placentation. Due to the nature of these studies, human in vivo experimentation is impossible. A combination of primary cultures, explant cultures and trophoblast cell lines1 support our understanding of invasion of the uterine wall2 and remodeling of uterine spiral arteries3,4 by extravillous trophoblast cells (EVTs), which is required for successful establishment of pregnancy. Despite the wealth of knowledge gleaned from such models, it is accepted that in vitro cell culture models using EVT-like cell lines display altered cellular properties when compared to their in vivo counterparts5,6. Cells cultured in the rotating cell culture system (RCCS) display morphological, phenotypic, and functional properties of EVT-like cell lines that more closely mimic differentiating in utero EVTs, with increased expression of genes mediating invasion (e.g. matrix metalloproteinases (MMPs)) and trophoblast differentiation7,8,9. The Saint Georges Hospital Placental cell Line-4 (SGHPL-4) (kindly donated by Dr. Guy Whitley and Dr. Judith Cartwright) is an EVT-like cell line that was used for testing in the RCCS.
The design of the RCCS culture vessel is based on the principle that organs and tissues function in a three-dimensional (3-D) environment. Due to the dynamic culture conditions in the vessel, including conditions of physiologically relevant shear, cells grown in three dimensions form aggregates based on natural cellular affinities and differentiate into organotypic tissue-like assemblies10,11,12 . The maintenance of a fluid orbit provides a low-shear, low-turbulence environment similar to conditions found in vivo. Sedimentation of the cultured cells is countered by adjusting the rotation speed of the RCCS to ensure a constant free-fall of cells. Gas exchange occurs through a permeable hydrophobic membrane located on the back of the bioreactor. Like their parental tissue in vivo, RCCS-grown cells are able to respond to chemical and molecular gradients in three dimensions (i.e. at their apical, basal, and lateral surfaces) because they are cultured on the surface of porous microcarrier beads. When grown as two-dimensional monolayers on impermeable surfaces like plastic, cells are deprived of this important communication at their basal surface. Consequently, the spatial constraints imposed by the environment profoundly affect how cells sense and decode signals from the surrounding microenvironment, thus implying an important role for the 3-D milieu13.
We have used the RCCS to engineer biologically meaningful 3-D models of various human epithelial tissues7,14,15,16. Indeed, many previous reports have demonstrated that cells cultured in the RCCS can assume physiologically relevant phenotypes that have not been possible with other models10,17-21. In summary, culture in the RCCS represents an easy, reproducible, high-throughput platform that provides large numbers of differentiated cells that are amenable to a variety of experimental manipulations. 
In the following protocol, using EVTs as an example, we clearly describe the steps required to three-dimensionally culture adherent cells in the RCCS.

Traditional, two dimensional cell culture techniques often result in altered characteristics with respect to differentiation markers, cytokines and growth factors. Three-dimensional cell culture in the rotating cell culture system (RCCS) reestablishes expression of many of these factors as shown here with an extravillous trophoblast cell line.

ヒト細胞培養のための回転細胞培養システム：モデルとしてのヒト栄養膜細胞

The field of human trophoblast research aids in  understanding the complex environment established during placentation. Due to the  nature of these ...

生物工学

Cellular Lipid Extraction for Targeted Stable Isotope Dilution Liquid Chromatography-Mass Spectrometry Analysis

The metabolism of fatty acids, such as arachidonic acid (AA) and linoleic acid (LA), results in the formation of oxidized bioactive lipids, including numerous stereoisomers1,2. These metabolites can be formed from free or esterified fatty acids. Many of these oxidized metabolites have biological activity and have been implicated in various diseases including cardiovascular and neurodegenerative diseases, asthma, and cancer3-7. Oxidized bioactive lipids can be formed enzymatically or by reactive oxygen species (ROS). Enzymes that metabolize fatty acids include cyclooxygenase (COX), lipoxygenase (LO), and cytochromes P450 (CYPs)1,8. Enzymatic metabolism results in enantioselective formation whereas ROS oxidation results in the racemic formation of products.
While this protocol focuses primarily on the analysis of AA- and some LA-derived bioactive metabolites; it could be easily applied to metabolites of other fatty acids. Bioactive lipids are extracted from cell lysate or media using liquid-liquid (l-l) extraction. At the beginning of the l-l extraction process, stable isotope internal standards are added to account for errors during sample preparation. Stable isotope dilution (SID) also accounts for any differences, such as ion suppression, that metabolites may experience during the mass spectrometry (MS) analysis9. After the extraction, derivatization with an electron capture (EC) reagent, pentafluorylbenzyl bromide (PFB) is employed to increase detection sensitivity10,11. Multiple reaction monitoring (MRM) is used to increase the selectivity of the MS analysis. Before MS analysis, lipids are separated using chiral normal phase high performance liquid chromatography (HPLC). The HPLC conditions are optimized to separate the enantiomers and various stereoisomers of the monitored lipids12. This specific LC-MS method monitors prostaglandins (PGs), isoprostanes (isoPs), hydroxyeicosatetraenoic acids (HETEs), hydroxyoctadecadienoic acids (HODEs), oxoeicosatetraenoic acids (oxoETEs) and oxooctadecadienoic acids (oxoODEs); however, the HPLC and MS parameters can be optimized to include any fatty acid metabolites13.
Most of the currently available bioanalytical methods do not take into account the separate quantification of enantiomers. This is extremely important when trying to deduce whether or not the metabolites were formed enzymatically or by ROS. Additionally, the ratios of the enantiomers may provide evidence for a specific enzymatic pathway of formation. The use of SID allows for accurate quantification of metabolites and accounts for any sample loss during preparation as well as the differences experienced during ionization. Using the PFB electron capture reagent increases the sensitivity of detection by two orders of magnitude over conventional APCI methods. Overall, this method, SID-LC-EC-atmospheric pressure chemical ionization APCI-MRM/MS, is one of the most sensitive, selective, and accurate methods of quantification for bioactive lipids.

This protocol will demonstrate the extraction and analysis of free and esterified bioactive fatty acids from cells. Fatty acids are accurately quantified using stable isotope dilution, chiral liquid chromatography, electron capture atmospheric chemical ionization multiple reaction monitoring mass spectrometry (SID-LC-ECAPCI-MRM/MS).

ターゲット安定同位体希釈液体クロマトグラフィー - 質量分析のための細胞の脂質の抽出

The metabolism of fatty acids, such as arachidonic acid (AA) and linoleic acid (LA), results in the formation of oxidized bioactive lipids, including ...

Development, Expansion, and In vivo Monitoring of Human NK Cells from Human Embryonic Stem Cells (hESCs) and Induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs)

We present a method for deriving natural killer (NK) cells from undifferentiated hESCs and iPSCs using a feeder-free approach. This method gives rise to high levels of NK cells after 4 weeks culture and can undergo further 2-log expansion with artificial antigen presenting cells. hESC- and iPSC-derived NK cells developed in this system have a mature phenotype and function. The production of large numbers of genetically modifiable NK cells is applicable for both basic mechanistic as well as anti-tumor studies. Expression of firefly luciferase in hESC-derived NK cells allows a non-invasive approach to follow NK cell engraftment, distribution, and function. We also describe a dual-imaging scheme that allows separate monitoring of two different cell populations to more distinctly characterize their interactions in vivo. This method of derivation, expansion, and dual in vivo imaging provides a reliable approach for producing NK cells and their evaluation which is necessary to improve current NK cell adoptive therapies.

Development, Expansion, and In vivo Monitoring of Human NK Cells from Human Embryonic Stem Cells hESCs and Induced Pluripotent Stem Cells iPSCs

This protocol describes the development, expansion, and in vivo imaging of NK cells derived from hESCs and iPSCs.

開発、展開、および<em生体内で&gt;</em&gt;ヒト胚性幹細胞（ヒトES細胞）からヒトNK細胞のモニタリングとや人工多能性幹細胞（性IPSC）

We present a method for deriving natural killer (NK) cells from undifferentiated hESCs and iPSCs using a feeder-free approach. This method gives rise to ...

Lipid Bilayer Vesicle Generation Using Microfluidic Jetting

Bottom-up synthetic biology presents a novel approach for investigating and reconstituting biochemical systems and, potentially, minimal organisms. This emerging field engages engineers, chemists, biologists, and physicists to design and assemble basic biological components into complex, functioning systems from the bottom up. Such bottom-up systems could lead to the development of artificial cells for fundamental biological inquiries and innovative therapies1,2. Giant unilamellar vesicles (GUVs) can serve as a model platform for synthetic biology due to their cell-like membrane structure and size. Microfluidic jetting, or microjetting, is a technique that allows for the generation of GUVs with controlled size, membrane composition, transmembrane protein incorporation, and encapsulation3. The basic principle of this method is the use of multiple, high-frequency fluid pulses generated by a piezo-actuated inkjet device to deform a suspended lipid bilayer into a GUV. The process is akin to blowing soap bubbles from a soap film. By varying the composition of the jetted solution, the composition of the encompassing solution, and/or the components included in the bilayer, researchers can apply this technique to create customized vesicles. This paper describes the procedure to generate simple vesicles from a droplet interface bilayer by microjetting.

Microfluidic jetting against a droplet interface lipid bilayer provides a reliable way to generate vesicles with control over membrane asymmetry, incorporation of transmembrane proteins, and encapsulation of material. This technique can be applied to study a variety of biological systems where compartmentalized biomolecules are desired.

マイクロ流体ジェッティングを使用して、脂質二重層小胞の生成

Bottom-up synthetic biology presents a novel approach for investigating and reconstituting biochemical systems and, potentially, minimal organisms. This ...

Isolation of Primary Human Colon Tumor Cells from Surgical Tissues and Culturing Them Directly on Soft Elastic Substrates for Traction Cytometry

Cancer cells respond to matrix mechanical stiffness in a complex manner using a coordinated, hierarchical mechano-chemical system composed of adhesion receptors and associated signal transduction membrane proteins, the cytoskeletal architecture, and molecular motors1, 2. Mechanosensitivity of different cancer cells in vitro are investigated primarily with immortalized cell lines or murine derived primary cells, not with primary human cancer cells. Hence, little is known about the mechanosensitivity of primary human colon cancer cells in vitro. Here, an optimized protocol is developed that describes the isolation of primary human colon cells from healthy and cancerous surgical human tissue samples. Isolated colon cells are then successfully cultured on soft (2 kPa stiffness) and stiff (10 kPa stiffness) polyacrylamide hydrogels and rigid polystyrene (~3.6 GPa stiffness) substrates functionalized by an extracellular matrix (fibronectin in this case). Fluorescent microbeads are embedded in soft gels near the cell culture surface, and traction assay is performed to assess cellular contractile stresses using free open access software. In addition, immunofluorescence microscopy on different stiffness substrates provides useful information about primary cell morphology, cytoskeleton organization and vinculin containing focal adhesions as a function of substrate rigidity.

A protocol is described to extract primary human cells from surgical colon tumor and normal tissues. The isolated cells are then cultured on soft elastic substrates (polyacrylamide hydrogels) functionalized by an extracellular matrix protein, and embedded with fluorescent microbeads. Traction cytometry is performed to assess cellular contractile stresses.

外科的組織からの初代ヒト結腸腫瘍細胞の単離およびトラクションサイトメトリーのためのソフト弾性基板上にそれらを直接培養

Cancer cells respond to matrix mechanical stiffness in a complex manner using a coordinated, hierarchical mechano-chemical system composed of adhesion ...

Techniques for the Evolution of Robust Pentose-fermenting Yeast for Bioconversion of Lignocellulose to Ethanol

Lignocellulosic biomass is an abundant, renewable feedstock useful for production of fuel-grade ethanol and other bio-products. Pretreatment and enzyme saccharification processes release sugars that can be fermented by yeast. Traditional industrial yeasts do not ferment xylose (comprising up to 40% of plant sugars) and are not able to function in concentrated hydrolyzates. Concentrated hydrolyzates are needed to support economical ethanol recovery, but they are laden with toxic byproducts generated during pretreatment. While detoxification methods can render hydrolyzates fermentable, they are costly and generate waste disposal liabilities. Here, adaptive evolution and isolation techniques are described and demonstrated to yield derivatives of the native Scheffersomyces stipitis strain NRRL Y-7124 that are able to efficiently convert hydrolyzates to economically recoverable ethanol despite adverse culture conditions. Improved individuals are enriched in an evolving population using multiple selection pressures reliant on natural genetic diversity of the S. stipitis population and mutations induced by exposures to two diverse hydrolyzates, ethanol or UV radiation. Final evolution cultures are dilution plated to harvest predominant isolates, while intermediate populations, frozen in glycerol at various stages of evolution, are enriched on selective media using appropriate stress gradients to recover most promising isolates through dilution plating. Isolates are screened on various hydrolyzate types and ranked using a novel procedure involving dimensionless relative performance index (RPI) transformations of the xylose uptake rate and ethanol yield data. Using the RPI statistical parameter, an overall relative performance average is calculated to rank isolates based on multiple factors, including culture conditions (varying in nutrients and inhibitors) and kinetic characteristics. Through application of these techniques, derivatives of the parent strain had the following improved features in enzyme saccharified hydrolyzates at pH 5-6: reduced initial lag phase preceding growth, reduced diauxic lag during glucose-xylose transition, significantly enhanced fermentation rates, improved ethanol tolerance and accumulation to 40 g/L.

Adaptive evolution and isolation techniques are described and demonstrated to yield derivatives of Scheffersomyces stipitis strain NRRL Y-7124 that are able to rapidly consume hexose and pentose mixed sugars in enzyme saccharified undetoxified hydrolyzates and to accumulate over 40 g/L ethanol.

エタノールへのリグノセルロースの生物変換のための堅牢なペントース発酵酵母の進化のための技術

Lignocellulosic biomass is an abundant, renewable feedstock useful for production of fuel-grade ethanol and other bio-products. Pretreatment and enzyme ...

Isolation of Mesenchymal Stem Cells from Human Alveolar Periosteum and Effects of Vitamin D on Osteogenic Activity of Periosteum-derived Cells

Mesenchymal stem cells (MSCs) are present in a variety of tissues and can be differentiated into numerous cell types, including osteoblasts. Among the dental sources of MSCs, the periosteum is an easily accessible tissue, which has been identified to contain MSCs in the cambium layer. However, this source has not yet been widely studied.
Vitamin D3 and 1,25-(OH)2D3 have been demonstrated to stimulate in vitro differentiation of MSCs into osteoblasts. In addition, vitamin C facilitates collagen formation and bone cell growth. However, no study has yet investigated the effects of Vitamin D3 and Vitamin C on MSCs.
Here, we present a method of isolating MSCs from human alveolar periosteum and examine the hypothesis that 1,25-(OH)2D3 may exert an osteoinductive effect on these cells. We also investigate the presence of MSCs in the human alveolar periosteum and assess stem cell adhesion and proliferation. To assess the ability of vitamin C (as a control) and various concentrations of 1,25-(OH)2D3 (10&#8722;10, 10&#8722;9, 10&#8722;8, and 10&#8722;7 M) to alter key mRNA biomarkers in isolated MSCs mRNA expression of alkaline phosphatase (ALP), bone sialoprotein (BSP), core binding factor alpha-1 (CBFA1), collagen-1, and osteocalcin (OCN) are measured using real-time polymerase chain reaction (RT-PCR).

We present a protocol to investigate the mRNA expression biomarkers of periosteum-derived cells (PDCs) induced by vitamin C (vitamin C) and 1,25-dihydroxy vitamin D [1,25-(OH)2D3]. In addition, we evaluate the ability of PDCs to differentiate into osteocytes, chondrocytes, and adipocytes.

人間歯槽骨膜から骨膜由来細胞の骨形成促進活性に及ぼすビタミン D の間葉系幹細胞の分離

Mesenchymal stem cells (MSCs) are present in a variety of tissues and can be differentiated into numerous cell types, including osteoblasts. Among the ...

Uptake of New Lipid-coated Nanoparticles Containing Falcarindiol by Human Mesenchymal Stem Cells

Nanoparticles are the focus of an increased interest in drug delivery systems for cancer therapy. Lipid-coated nanoparticles are inspired in structure and size by low-density lipoproteins (LDLs) because cancer cells have an increased need for cholesterol to proliferate, and this has been exploited as a mechanism for delivering anticancer drugs to cancer cells. Moreover, depending on drug chemistry, encapsulating the drug can be advantageous to avoid degradation of the drug during circulation in vivo. Therefore, in this&#160;study, this design is used to fabricate lipid-coated nanoparticles of the anticancer drug falcarindiol, providing a potential new delivery system of falcarindiol in order to stabilize its chemical structure against degradation and improve its uptake by tumors. Falcarindiol nanoparticles, with a phospholipid and cholesterol monolayer encapsulating the purified drug core of the particle, were designed. The lipid monolayer coating consists of 1,2-distearoyl-sn-glycero-3-phosphocholine (DSPC), cholesterol (Chol), and 1,2-distearoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-[methoxy(polyethylene glycol)-2000] (DSPE PEG 2000) along with the fluorescent label DiI (molar ratios of 43:50:5:2). The nanoparticles are fabricated using the rapid injection method, which is a fast and simple technique to precipitate nanoparticles by good-solvent for anti-solvent exchange. It consists of a rapid injection of an ethanol solution containing the nanoparticle components into an aqueous phase. The size of the fluorescent nanoparticles is measured using dynamic light scattering (DLS) at 74.1 &#177; 6.7 nm. The uptake of the nanoparticles is tested in human mesenchymal stem cells (hMSCs) and imaged using fluorescence and confocal microscopy. The uptake of the nanoparticles is observed in hMSCs, suggesting the potential for such a stable drug delivery system for falcarindiol.

This article describes the encapsulation of falcarindiol in lipid-coated 74 nm nanoparticles. The cellular uptake of the nanoparticles&#160;by human stem cells into lipid droplets is monitored by fluorescent and confocal imaging. Nanoparticles are fabricated by the rapid injection method of solvent shifting, and their size is measured with the dynamic light scattering technique.

ヒト間葉系幹細胞によって Falcarindiol を含む新しい脂質被覆ナノ粒子の取り込み

Nanoparticles are the focus of an increased interest in drug delivery systems for cancer therapy. Lipid-coated nanoparticles are inspired in structure and ...

Isolation of Adult Human Dermal Fibroblasts from Abdominal Skin and Generation of Induced Pluripotent Stem Cells Using a Non-Integrating Method

Induced pluripotent stem cells (iPSCs) could be considered, to date, a promising source of pluripotent cells for the management of currently untreatable diseases, for the reconstitution and regeneration of injured tissues and for the development of new drugs. Despite all the advantages related to the use of iPSCs, such as the low risk of rejection, the lessened ethical issues, and the possibility to obtain them from both young and old patients without any difference in their reprogramming potential, problems to overcome are still numerous. In fact, cell reprogramming conducted with viral and integrating viruses can cause infections and the introduction of required genes can induce a genomic instability of the recipient cell, impairing their use in clinic. In particular, there are many concerns about the use of c-Myc gene, well-known from several studies for its mutation-inducing activity. Fibroblasts have emerged as the suitable cell population for cellular reprogramming as they are easy to isolate and culture and are harvested by a minimally invasive skin punch biopsy. The protocol described here provides a detailed step-by-step description of the whole procedure, from sample processing to obtain cell cultures, choice of reagents and supplies, cleaning and preparation, to cell reprogramming by the means of a commercial non-modified RNAs (NM-RNAs)-based reprogramming kit. The chosen reprogramming kit allows an effective reprogramming of human dermal fibroblast to iPSCs and small colonies can be seen as early as 24 h after the first transfection, even with modifications with the respect to the standard datasheet. The reprogramming procedure used in this protocol offers the advantage of a safe reprogramming, without the risk of infections caused by viral vector-based methods, reduces the cellular defense mechanisms, and allows the generation of xeno-free iPSCs, all critical features that are mandatory for further clinical applications.

Cell reprogramming requires the introduction of key genes, which regulate and maintain the pluripotent cell state. The protocol described enables the formation of induced pluripotent stem cells (iPSCs) colonies from human dermal fibroblasts without viral/integrating methods but using non-modified RNAs (NM-RNAs) combined with immune evasion factors reducing cellular defense mechanisms.

腹部皮膚からの成人ヒト皮膚線維芽細胞の分離と非積分法を用いた人工多能性幹細胞の生成

Induced pluripotent stem cells (iPSCs) could be considered, to date, a promising source of pluripotent cells for the management of currently untreatable ...

Single-Cell Optical Action Potential Measurement in Human Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Cardiomyocytes

Conventional intracellular microelectrode techniques to quantify cardiomyocyte electrophysiology are extremely complex, labor intensive, and typically carried out in low throughput. Rapid and ongoing expansion of induced pluripotent stem cell (iPSC) technology presents a new standard in cardiovascular research and alternate methods are now necessary to increase throughput of electrophysiological data at a single cell level. VF2.1Cl is a recently derived voltage sensitive dye which provides a rapid single channel, high magnitude response to fluctuations in membrane potential. It possesses kinetics superior to those of other existing voltage indicators and makes available functional data equivalent to that of traditional microelectrode techniques. Here, we demonstrate simplified, non-invasive action potential characterization in externally paced human iPSC derived cardiomyocytes using a modular and highly affordable photometry system.

Here we describe optical acquisition and characterization of action potentials from induced pluripotent stem cell derived cardiomyocytes using a high-speed modular photometry system.

ヒト人工多能性幹細胞由来心筋細胞における単細胞光学作用電位測定

Conventional intracellular microelectrode techniques to quantify cardiomyocyte electrophysiology are extremely complex, labor intensive, and typically ...