HBX-DDB1相互作用はcccDNAからのHPV転写を促進するための重要なステップであるため、このプロトコルはHPV機能治癒のための新しい治療薬を発見するための重要な資産になる可能性があります。私たちの手順は簡単で、画面に短い時間を必要とします。私が混ぜ合わせる相互作用は、細胞のライシスを必要とせずにリアルタイムで検出することができます。
また、スクリーニング品質はZ素数が高いと満足できる。HBX-DDB1相互作用の阻害は、HPV転写、タンパク質発現およびcccDNA産生の抑制をもたらすSmc5/6の回復をもたらす。抗ウイルス作用のこの新しいメカニズムは、現在のHPV療法の不十分さを克服することができる。
タンパク質とタンパク質の相互作用は、薬物標的の重要なクラスです。ウイルスとhasSタンパク質の相互作用を対象とする、ここで説明する分割ルシファーゼベースの酸は、他の感染症の治療法を開発するための新しい戦略を提供するかもしれない。プロトコルはシンプルで理解しやすいものですが、視覚的なデモンストレーションを行わなければ再現が難しい手順もあります。
したがって、視覚的なデモンストレーションは、私たちのプロトコルを理解するのに大きな助けになります。5回10〜5番目のHEK293T細胞を100ミリメートル皿に100ミリメートルのDMEMで播種し、摂氏37度で一晩インキュベートします。翌日、300マイクロリットルの総容量に対して、DNAプラスミドとDNA凝縮バッファーを発現するHBx-LgBitとSmBit-DDB1のそれぞれ1マイクログラムを希釈します。
16マイクロリットルのエンハンサー溶液を加え、1秒間ボルテックスでチューブを混合します。試料を室温で3分間インキュベートし、60マイクロリットルのトランスフェクション試薬を加える。チューブを10秒間ボルテックスし、サンプルをさらに8分間インキュベートする。
一方、細胞と皿から培地を吸引し、5ミリリットルのPVSで洗浄する。PVSを吸引し、7ミリリットルのDMEMを加えます。トランスフェクション複合体でチューブに3ミリリットルのDMEMを加え、ピペットを上下に混ぜ合わせ、混合物を細胞に加えます。
その後、セルを摂氏37度、炭酸ガス5%で10時間インキュベートします。インキュベーション後、使用済み培養培地を取り出し、5ミリリットルのPVSで細胞を洗浄する。0.25%トリプシンEDTAの1ミリリットルでPVSを取り出し、37°Cで細胞をインキュベートして取り外します。
次に、4ミリリットルのDMEMを加え、それを細胞層の表面にピペット化して培地を数回分散させ、懸濁液をチューブに移した。500倍Gで細胞を5分間遠心し、その上清を捨て、PVSの1ミリリットルで細胞ペレットを再懸濁する。セチフィケーションを繰り返し、上清を捨てます。
次いで、1ミリリットル当たり100万個の細胞の播種密度に10%FBSを添加した緩衝細胞培養培地で細胞ペレットを再懸濁する。ピペット50マイクロリットルの細胞懸濁液を96ウェルプレートの各ウェルに入れ、細胞を37°Cインキュベーターに10時間戻す。細胞がインキュベートしている間、スクリーニング化合物と溶媒を13.5倍の濃度に希釈する。
各ウェルに12.5マイクロリットルの発光基板を加え、室温で5分間プレートをインキュベートします。ルミノメーターでベースラインルミネッセンスを測定し、5マイクロリットルの化合物を加え、DMSOを制御した直後に各ウェルに加えます。30分毎に2時間発光を測定し、次いでDMSO処理と比較して化合物の阻害効果を計算する。
ベースライン発光信号を測定し、信号対バックグラウンド比を80以上と計算した。Z素数が0.5より大きかったことは、このアッセイシステムがハイスループットスクリーニングに許容されることを示す。DMSOのみのコントロールと比較して40%以上の阻害に閾値を設定することにより、ニタゾキサニドが候補薬物として同定された。
我々は、この方法で反応性小規模化合物ライブラリーをスクリーニングすることにより、HBX-DDB1相互作用の阻害剤としてニタゾキサニドを同定した。ニタゾキサニドを用いて、HBX-DDB1相互作用の阻害、ウイルス転写の減少、およびその後のウイルス産物レベルを確認する。標的タンパク質に融合した分割ルシファーゼの最適部分は、あらかじめ決定する必要があります。
この場合、HPXはHpXのC末端で大ビットに融合し、DDB1の終末でスモールビットに融合して最良の結果を得た。
