Segmentation of the Choroid Plexus Using Manual Delineations

시작하려면 도구 모음의 왼쪽 상단 모서리에 있는 DCM 버튼을 클릭하고 DICOM 파일 가져오기 버튼을 클릭하여 의학 또는 DICOM 데이터의 디지털 이미징 및 통신을 가져옵니다. 이미지의 밝기를 조정하려면 창 및 볼륨 수준 조정을 클릭하거나 이미지를 마우스 왼쪽 버튼으로 클릭하고 마우스를 위 또는 아래로 끕니다. 그런 다음 이미지 조각을 마우스 왼쪽 버튼으로 클릭하고 마우스를 왼쪽이나 오른쪽으로 이동하여 대비를 조정합니다.

깊은 회백질 핵 또는 대비 눈금 막대 신호 강도를 참조하고 맥락총에 적합한 대비를 선택하기 위해 분할 전반에 걸쳐 일관되게 유지되는지 확인합니다. 외측 제3심실 및 제4심실 맥락총의 분할을 시작하려면 모듈의 드롭다운 메뉴에서 세그먼트 편집기를 선택합니다. 이제 세그멘테이션에 대한 드롭다운 메뉴를 클릭하여 다른 세그멘테이션을 선택하고 선택한 세그멘테이션의 이름을 바꿉니다.

마스터 볼륨 드롭다운을 사용하여 편집이 필요한 NIfTI 또는 DICOM 세트를 선택합니다. 추가 버튼을 두 번 클릭하여 외측 심실 맥락총에 대한 두 개의 세그먼트를 포함합니다. 제목을 두 번 클릭하고 이름을 오른쪽 외측 심실 맥락총(right lateral lateral ventricle choroid plexus) 및 왼쪽 외측 심실 맥락총(left lateral lateral ventricle choroid plexus)으로 바꿉니다.

추가 버튼을 한 번 더 클릭하면 제3뇌실과 제4뇌실의 맥락총에 대한 분절이 소개됩니다. 그런 다음 각각 제 3 뇌실 맥락막 신경총과 제 4 뇌실 맥락막 신경총으로 이름을 바꿉니다. 축면의 외측 심실 맥락막 신경총으로 시작하여 bicommissural line을 기준으로 이미지를 배치합니다.

삼각 측부를 기준점으로 사용하여 외측 심실 맥락총의 위치를 찾습니다. 수동 세그먼트화를 시작하려면 세그먼트 편집기의 효과 섹션에 있는 페인트 또는 그리기 도구를 선택합니다. 페인트 도구를 사용하는 동안 페인팅할 브러시 직경을 선택합니다.

적색 핵 수준을 사용하여 외측 심실의 맥락막 신경총 분할을 멈출 시기를 결정합니다. 제 3 뇌실 맥락막 신경총을 찾으려면 시상면에서 시작하여 Monro, fornix, corpus callosum, thalamus 및 internal cerebral vein의 구멍을 이정표로 사용합니다. 마찬가지로, 제 4 뇌실 맥락막 신경총의 경우 시상면에서 시작하여 상소뇌 꽃자루, 폰스 및 수질을 기준점으로 사용하여 제 4 뇌실의 맥락막 신경총을 정확히 찾아냅니다.

모듈 드롭다운 메뉴에서 quantification(수량화)으로 이동하고 세그먼트 통계(segment statistics)를 선택합니다. 그런 다음 입력 섹션에서 세분화 도구 아래의 정량화를 위해 새로 생성된 세분화 맵을 선택하고 스케일러 볼륨에서 MRI 볼륨을 선택합니다. 출력 테이블의 경우 출력에서 테이블 옵션을 선택하고 적용을 누릅니다.

맥락총의 부피를 다른 단위로 표시하는 표가 나타납니다. 도구 모음의 왼쪽 상단에 있는 저장 버튼을 클릭하여 생성된 파일을 저장합니다. 분할 파일을 nrrd, nii 형식으로 유지합니다.

gz 또는 tsv.