콜로라도 주립 대학의 식물 성장 시설과 EcoCore 분석 시설에이 프로젝트에 도움을 준 많은 학생들과 교사들에게 특별한 감사. 이 작품은 USDA 국립 교제를 요구 NSF DEB 부여 # 0918482, 토양 생태 연구를위한 Cotrufo-Hoppess 기금에 의해 투자된다.

1. 상공 회의소 건설 <ol><li> 식물의 성장에 대한 최대 자연광 잠재력 수 있도록 온실에서 라벨 챔버를 구축합니다. 충분한 전원 공급 장치는 모든 챔버 부품에 전원을 공급하는 데 사용할 수 있는지 확인합니다. </li><li> 3.175 ㎜ 두께의 투명 아크릴 벽 (폴리 카보네이트도 적합 할 것)와 6.35 mm 태양 반사율을 극대화하기 위해 흰색으로 그린​​ 스틸 바닥 알루미늄 프레임에 두꺼운 투명 아크릴 천장을 설치하여 라벨 챔버를 구축합니다. 챔버의 치수는 개별 연구 목적에 맞게 맞춤화 할 수있다. </li><li> 콘크리트 블록 (19 ㎜) 합판에 ¾에 챔버를 탑재합니다. </li><li> 아크릴 유리, 알루미늄 프레임과 강 바닥과 함께 모든 구성 요소를 고정하는 나사를 사용에 구멍을 뚫습니다. </li><li> 완벽한 밀봉을 보장하기 위해 실리콘 코킹 모든 솔기를 밀봉. </li><li> 레모를 사용하여 아래 나사 될 수있다 긴 나사의 아크릴 패널의 한 부분을 장착하여 문을 구축vable 날개 너트. </li><li> 공기 누출을 방지하기 위해 기상 스트리핑과 도어를 밀봉. </li><li> 모든 온도, 습도, CO 2 제어 및 감시 장비를 장착하는 제어 센터와 같은 챔버에 직접 인접 영역을 선택합니다. </li><li> 조심스럽게 모든 전기 배선 및 가스 배관에 대한 제어 센터에 인접한 챔버 벽에 작은 구멍을 드릴. 공기 누출을 방지하기 위해 전선 및 튜브 주위 구멍을 밀봉하는 실리콘 코킹을 사용한다. </li><li> CO 2의 높은 수준 (예 : 800 ppm)를 함께 작성하고 밤새 앉아 시켜서 공기 누출에 대한 실을 테스트합니다. 챔버 내의 CO 2 농도는 원래의 수준으로 유지되고있는 경우, 그것은 기밀이다. 농도가 하룻밤 인하의 경우 밀폐 밀봉이 달성 될 때까지 모든 솔기는 검사 및 실리콘 코킹으로 재 밀봉해야한다. </li><li> 높은 빛의 조건에 맞게 일부 식물의 경우, C의 바로 외부로 타이머에 연결 등을 추가hamber 빛의 침투 및 공장의 생산성을 높일 수 있습니다. </li></ol> 2. 온도 및 습도 제어 <ol><li> 챔버 내부에 위치한 냉각 (증발기) 코일과 열을 발산하는 온실 외부에 압축기 및 응축기 코일과 상용 분리형 공기 조화 장치를 설치하여 챔버 온도를 조절한다. 원하는 온도를 유지하기 위해 에어컨을 설정한다. </li><li> 실내에 습도를 제어하는​​ 작은 방 제습기를 사용합니다. <ol><li> 제습기에 인접한 챔버의 바닥을 통해 배수 구멍을 드릴. </li><li> 제습기에서 응축수 콜렉터를 제거하고, 챔버의 바닥에 배수 구멍을 통해 제습로부터 배액관을 연결한다. </li><li> 챔버 아래로 직접 배출 할 수있는 제습기에 물이 가득 열려있는 항아리를 놓습니다. 이 밀폐 씰을 만들어뿐만 아니라 압력 평형을 허용. </li></ol></li><l난&gt; 챔버 내부의 습도 센서와 제어 센터에서 이러한 오메가 iSeries의 컨트롤러와 컨트롤러를 설치합니다. <ol><li> 솔리드 스테이트 릴레이 제습 시스템 제어기를 연결하고 높은 알람 조습을 설정하고 챔버 내의 최적의 성장 조건을 유지하는 스윙. 최적의 온도와 습도 조건이 다른 식물 종에 따라 다를 것입니다. </li></ol></li></ol> 3. CO 2 제어 <ol><li> 13 C-CO 2는 농축이 순수한 CO 2 가스 탱크, 10 원자 %의 하나를 사용하여 달성된다 (13) C-CO 2 이상, 1.1 원자 %, C (13)-CO 2 (천연 풍부) 중 하나. </li><li> 다이어프램 펌프가 지속적으로 적외선 가스 분석기 (IRGA)를 통해 챔버 공기를 그린 다음 다시 챔버에 공기 펌프, 따라서 폐쇄 된 시스템 (그림 1)를 유지함으로써 CO 2 농도를 모니터링합니다. </li><li> SE원하는 범위 내에서 CO 2 농도를 유지하기 위해 IRGA 소프트웨어에 따 낮은 경보 및 데드 밴드. 여기, 우리는 360-400 ppm의 사이에 CO 2 농도를 유지하기 위해 40 ppm의 데드 밴드와 함께 360 ppm으로 낮은 알람을 사용합니다. </li><li> 각각의 탱크에 계량 밸브를 연결하고 신중하게 목표 13 C의 농축 수준을 달성하도록 조정합니다. 20 PSI에 탱크 조절기를 설정합니다. </li><li> 계량 밸브와 각 탱크의 조절기 사이에 솔레노이드 밸브를 삽입합니다. 함께 두 개의 계량 밸브의 콘센트와 챔버의 중심에 파이프를 가입. 와이어 솔레노이드 밸브 (도 1)를 제어하기 IRGA 출력 고체 릴레이. </li></ol> 4. 웹 기반 원격 모니터링 시스템 <ol><li> 로컬 파일에 한 번씩 30 초에 로그인하여 IRGA 소프트웨어의 CO 2 농도를 모니터링합니다. </li><li> 선택하는 (펄의 예 또는 다른 프로그래밍 언어) 사용자 정의 유틸리티를 만들기현재까지 노트북 타임 스탬프와 함께 로컬 CO 2 로그 파일로부터 항목, 및 백엔드 웹 애플리케이션에 업로드. </li><li> 온도 및 습도 센서 데이터를 쿼리하는 웹 애플리케이션을 설정한다. </li><li> 공기 조화 시스템이 실패하면 식물을 파괴 할 가능성이 온도 스파이크를 방지하기 위해 상기 챔버를 5 분마다의 온도의 상태를 확인하기 위해 모니터링 시스템을 사용한다. </li><li> 예기치 않은 온도 스파이크 또는 CO 2 방울을 즉시에 참석 할 수 있도록 모든 표준 웹 브라우저에서 CO 2, 온도 및 습도 데이터를 모니터링합니다. </li></ol> 5. 관개 시스템 <ol><li> 포트 당 아크릴 유리 챔버의 벽에있는 하나의 작은 구멍을 드릴. </li><li> 포트 당 하나의 관개 링을 생성하고 외부로 챔버 벽을 통해 관개 튜브를 공급하는 관개 튜브를 사용합니다. </li><li> 실리콘 코킹과 관개 튜브 주위에 구멍을 밀봉공기 누출을 방지한다. </li><li> 챔버의 외부에, 연동 펌프의 튜브에 관개 튜브를 연결합니다. </li><li> 물 사이에 공기 누출을 방지하기 위해 모든 관개 튜브를 닫 작은 호스 클램프를 사용합니다. </li></ol> 6. 화분 용 식물 <ol><li> 재배되고있는 식물에 적합한 냄비 크기를 선택합니다. 여기, 40, 15 L 포트가 사용됩니다. </li><li> 모래, 질석 및 프로필 다공성 세라믹을 혼합하여 토양이없는 화분 믹스를 만듭니다. </li><li> , 채워진 냄비 건조 무게 물을 냄비에 몸을 담근 채가 완전히 배출 할 수 있도록하고, 냄비에 젖은 무게로 포팅 믹스의 수분 보유 능력을 테스트합니다. 그 초과 표시 비료와 물을 물을 때 냄비에서 누출하지 않도록하기 위해이 최대 물 보유 용량을 사용합니다. </li><li> 전에 냄비를 심는 화분 용 흙에 씨앗을 발아. 이 경우에만 성공적으로 발아 씨앗 라벨 챔버에서 시작되었는지 확인합니다. </li><li> T 접종<html> 그는 유익한 미생물을 소개하는 신선한 토양 슬러리 모종. </li><li> 씨앗이 발아 한 후, 조심스럽게 원하는 수의 화분에 모종을 이식. </li><li> 화분에 심은 후, 챔버에 냄비를 이동하고 개별 관개 호스로 각 포트를 조립합니다. </li></ol> 7. 상공 회의소 씰링 <ol><li> 우선 챔버 도어를 밀봉 할 때, 외부 공기의 질량이 큰 챔버 공간을 채운다. 13 C-CO 2 탱크의 혼합물을 사용하여 400 ppm의 최대 다시 실을 작성하기 전에 적어도 200 ~ 250 ppm으로 아래로 CO 2 농도를 제거하기 위하여 공기 펌프에 소다 석회 스크러버를 연결하여 외부 CO 2를 닦습니다. </li><li> 자연의 풍요 로움 CO 2 오염을 최소화하기 위해 성장시기의 기간을 통해 챔버는 폐쇄 유지하십시오. </li><li> 시각적으로 식물의 성장을 모니터링하고 필요에 따라 수정 및 관개를 조정합니다. </li></ol>itle &quot;&gt; 8. 수정 및 관개 <ol><li> 관개 시스템을 통해 식물을 비옥하게하는, 그런 수정 호글 랜드의 솔루션 (23), 비료 솔루션을 사용합니다. </li><li> 자연의 풍요 로움 (15)와 15 N-KNO 3 98 원자 %를 혼합하여 타겟 원자의 15 % N 수준에서 15 N-KNO 3 subsolution를 사용하여 15 N과 비료 레이블 N-KNO 3 (0.37 원자 % 15 N). </li><li> 포팅 믹스의 수분 보유 능력을 기준으로 전체 실에 대한 각각의 수정 이벤트에 따라 비료 솔루션, 충분히 섞는다. 유리 항아리에 하나의 냄비에 비료의 적절한 금액을 놓고 많은 항아리 화분이 준비를합니다. </li><li> 관개 호스를 언 클램프 및 비료 솔루션을 항아리에 각각 배치하고 그들을 연동 펌프에 연결합니다. </li><li> 개별 드립 IRRI를 통해 연동 펌프를 통해 물을 펌프로 물 식물증거 자료 호스 정기적으로 식물이 필요로. </li><li> 호글 랜드의 솔루션과 시비가 생산성을 극대화 할 수있는 공장의 생산성이 증가함에 따라 증가하는 영양 수요, 공장 수요 또는 실험 설계를 수행한다. </li><li> 우선, 튜브 조류 및 박테리아 성장을 최소화 통해 물 린스를 펌핑 한 다음, 관개 호스를 통해 호글 랜드의 용액 펌프. </li><li> 수정 및 챔버 공기 누설을 제거하기 위해 관개 후 모든 호스를 Reclamp. </li></ol> 9. 통일 및 차등 라벨링 <ol><li> 구조 및 대사 성분의 차이 라벨의 경우 1-3 주 전에 수확에 라벨 실에서 식물을 제거합니다. 균일하게 표시 할 수있다 식물은 수확 할 때까지 지속적으로 봉인 라벨 챔버에 남아있는 15 N-호글 랜드의 솔루션과 관개 수 있습니다. </li><li> 그들은 충분한 빛을받을 수 있도록이 기간 동안 온실에서 제거 된 식물 유지자연 풍부한 13 ℃에서 CO 2 </li><li> 차동 15 N 표시를 들어, 비옥하고 평소와 같이 식물을 관개 계속하지만, 호글 랜드의 비료 용액에 자연의 풍요 15 N-KNO 3를 사용합니다. </li></ol> 10. 수확 <ol><li> 식물 senesce하기 시작 포팅 매체가 마르기 때문에 이전에 수확하는 식물 일주에 물을 중지합니다. </li><li> 챔버를 열고 지상 바이오 매스의 즉각적인 클리핑 수확 냄비를 이동 </li><li> 거친 화면에 포팅 믹스와 뿌리를 부어. </li><li> 포팅 믹스에서 뿌리를 분리하고 포팅 믹스 무료 뿌리를 흔들어 화면을 사용합니다. </li><li> 2mm 체에 뿌리를두고 나머지 포팅 물질을 제거하기 위해 물로 씻어 내십시오. 뿌리에 집착 수있는 지렁이를 제거하는 핀셋을 사용합니다. </li><li> 미래의 실험을위한 준비에 자연 건조시킨 뿌리를 허용합니다. </li></ol><ol><li> 라벨 챔버 바이오 매스를 결정하기 위해 자연 건조 식물 재료의 무게를. </li><li> 화학 분석을위한 표본 그라인드. </li><li> 125 ㎖의 산에 오븐 건조 (60 ° C) 쓰레기의 2.0 g을 놓고 플라스크를 세척하고 탈 이온수 50 ㎖를 추가합니다. </li><li> 예열 (60 ° C) 교반기 플레이트에 샘플을 놓고 플라스크에 교반기 막대를 배치합니다. 200 RPM의 교반을 설정하고 샘플을 30 분 동안 가열 할 수 있습니다. </li><li> 30 분 후, 나일론 진공 여과 시스템에서 메쉬 20 μm의 관통 담가 용액을 고를. </li><li> preweighed 산 세척 튜브 추출물을 전송하고 동결. </li><li> 60 ° C에서 preweighed 알루미늄 팬과 건조한 고체 쓰레기 잔류 물을 전송 뜨거운 물 잔류 물 질량을 결정하기 위해 건조 후 팬과 쓰레기의 무게를 측정. </li><li> 열수 추출물을 동결 건조 및 열수 추출물의 질량을 결정하기 위해 무게. </li><li> 오븐 건조 분석 (60 ℃) 쓰레기, 동결 건조 뜨거운 물추출하고, 원소 분석기에서 오븐 건조 뜨거운 물 잔류 - 동위 원소 비율 질량 분석기 (EA-IRMS). </li></ol>

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저자가 공개하는 게 없다.

연속 동위 원소 라벨 챔버위한이 디자인은 균일하고 차분 13 C를 생성하기 위해 사용하고 15 N은 A.를 표지 하였다 이후 현장 및 실험실 실험 gerardii. 세 가지 작업 성장 시즌 동안, 챔버는 성공적으로 온도, 습도, 설정 매개 변수 내에서 CO 2 농도 (그림 2)를 유지하고있다. 온도 제어 시스템의 신뢰성은 높은 태양 복사가 밀폐 챔버가 과열 될 수있는 여름의 피크시 중요합니다. 성장하는 식물의 증산에 의한 여분의 습기를 제거하는 것은 그 식물의 기공은 광합성 흡수 (22)와 물 응축 빛 침투를 억제하거나 챔버의 구조를 손상하지 않습니다에 대해 열린 상태로 유지 보장합니다. IRGA 소프트웨어에 의해 CO 2 농도의 거의 지속적으로 모니터링을 지속적으로 유지식물의 13 C 라벨들은 챔버에서 성장하는 동안. 때문에 A의 높은 광합성 활동 gerardii이 챔버에서 성장, CO 2는 광합성 활동이 360 ppm으로, 대략 매 15 ~ 20 분까지 CO 2 농도를 그린 피크 성장시기의 일광 시간 동안 자주 시스템에 주입 하였다. 의 계량 충실하고 균일 한 식물 조직 라벨의 성장시기를 통해 제어 4.4 원자 %, 13 C 분위기 허용 자연의 풍요 13 C-CO 2 탱크. 13 C-CO 2 생산도 13 C-나트륨을 혼합함으로써 달성 될 수있다 중탄산염 또는 13 C-탄산나트륨 염산, 시스템 그러나이 유형은 더 복잡하고 더 많은 모니터링 및 유지 보수가 필요, 그래서 우리는 13 C-CO 2 가스를 사용하는 것이 좋습니다. CO 2 conce을 모니터링하기위한 중요한 고려IRGA를 사용 ntrations 13 C-CO 2를 측정 할 때 적외선 분석기는 민감도의 3 분의 2를 잃는 것입니다. 우리의 4.4 % 13 C-CO 2 혼합물 약 2.9 % PPM이 과소 평가는 우리에게 큰 관심사가 아니었지만, 더 높은 13 C 레벨 27에서 라벨을 때 더 중요한 문제가 될 수 있습니다. A.의 gerardii 다년생 사라졌고가 graminoid 종 대초원 따뜻한 계절입니다. 이 챔버의 설계는 A.에 최적화 된 gerardii 생산 (그림 1). 챔버의 크기 및 높이가 A.의 최대 높이 생산성을 고려하여 선택되었다 현장에서 gerardii뿐만 아니라, 미래의 실험에 대해 원하는 식물 바이오 매스 생산을위한. A. gerardii는 필드 (24, 25)의 제한 등으로 알려져있다. 외부 구조 층 (26)에 비교하여 온실 내에서 PAR는 30-47% 의해 감소 될 수있다. 이후 우리의 공장의는 온실 내부에 아크릴 유리 실에서 성장했다, PAR 제한은 우려했다. 전원을 켜면 형광등이 빛에 민감 종의 생산성을 향상하는 데 도움이되었을 수도있는, 9.5 %로 챔버 내에서 PAR 증가했다. 크기, 조명, 영양 요구, 온도 민감성, 및 토양 수분 등의 식물 특정 생리적 요구의 다른 유형의 성장이 챔버 디자인을 사용할 때는 신중 식물 성장을위한 최적의 조건을 유지하도록 맞추어 질 것이다. 이러한 10 원자 % 13 C-CO 2, 98 원자 % 15 N-KNO 3, 라벨의 효율성 비싼 동위 원소 표지 화합물, 작업을 할 때 고려해야하는 중요한 사항이다. 이 챔버 설계는 챔버를 밀봉 에어 누설에 최소화하기 위해 모든 노력을함으로써 챔버의 13 중 C 라벨을 최적화합니다. 이 챔버는 성장 기간 동안 개방하지 않으면, 13 C 레이블 없음챔버로부터 ED CO 2는 대기로 유출된다. CO 2는 야간 호흡하는 동안 구축하면 성장하는 식물을 손상 나타나지 않고 빨리 일출 (그림 2) 후 촬영됩니다. 차동 표시하는 동안, 챔버는 간단히 차동 표시된 냄비를 제거하기 위해 열린하지만이 지속적으로 표시 식물 (표 1)의 대상으로 4.4 원자 %, 13 C 라벨을 희석을하지 않은 것으로 보입니다. 13 C 라벨도 밖으로 세척하여 최적화 된 초기 대기는 밀봉에 실에 갇혀있다. 대기 CO 2의 초기 스크럽없이 챔버에 예비 시험 중에 식물을 생산하기 잎에 비해 생산 제 나뭇잎 희석 13 C 레벨이 측정되었다. 챔버 폐쇄에 따라 대기 CO 2의 초기 스크럽에서 연속 13 C 라벨을 허용하여이 문제를 제거하기 위해 나타납니다성숙 모종. 모래, 질석, 점토의 토양이없는 포팅 혼합물을 유지하는 것은 또한 자연의 풍부한 토양 호흡에서 이산화탄소 오염을 제거한다. 시스템에서 토양의 제거는 다른 식물 종에 고유 수있는주의 수정 및 접종 고려 사항을 요구한다. 6.7 원자 % 15 N (테이블에 매우 표시된 식물 재료를 생산 대상으로 7 원자 % 15 N Hoegland의 솔루션을 통해 15 N 표시 1). 대상 15 N 레이블에서 약간 희석 포팅 혼합 또는 기본 토양 접종에서 일부 자연 풍부 N에 의해 발생할 수 있습니다. 화합물의 생합성 동안 13 C (15 N)의 자연적인 차별 운동 분류하고 합성 된 화합물의 nonstatistical 동위 원소 분포의 결과로 발생합니다. 따라서, C의 경우는, 보조 용품 (예 : 지질기본 제품 (탄수화물)에 비해, 페놀 화합물)는 일반적으로 13 C 고갈된다. 온수 추출하고 균일하게 표시 식물 (표 1의 뜨거운 물 잔류 원자 % 13 C의 약간의 차이에서 알 수있는 바와 같이 식물이, 풍부한 13 C 분위기에서 재배되는 때 자연 (13) C 차별은 계속 나타납니다 ). 이 자연스러운 운동 분획은 농축에 비해 매우 작고, 라벨링의 균일 성을 손상시키지 않는다. 구조 및 대사 식물 조직의 차동 라벨은 쓰레기 분해, 미생물 생태학 및 토양 유기물의 형성에 고급 연구에 대한 가능성이있는 새로운 기술이다. C (13) 및 온수 추출 및 온수 잔기의 15 N의 차이가 낮은, 상당한 13 C의 희석 및 침출 15 N을 나타낸다구조 식물 재료 (뜨거운 물 잔류)에서 분자량 화합물 (뜨거운 물 추출물) 차동 라벨 (P &lt;0.005)의 7, 14, 22 일 후에. 식물 조직이 차등 라벨링 생태계를 통해 별도의 구조와 대사 구성 요소의 운명을 추적하는 데 사용할 수 있습니다. 13 C 차동 라벨은 15 N 차동 라벨보다 더 극단적이었다. 13 C-CO 2라는 분위기에서 식물을 제거 할 때 15 N 라벨이 여전히 약간의 시간 포팅 믹스에 남아있는 15 N 희석이 더 느리게 발생하면서는, 13 C 희석의 직접 원인 일 수 있습니다. 15 N의 더 과감한 차동 표시를 들어, 하나의 챔버 외부 성장의 마지막 주 동안 이전에 자연의 풍요 수정에 물을 냄비 세척을 고려할 수 있습니다. 이 연속 (13)의 설계 및 운영 &lt;균일 또는 차등, 신진 대사 및 구조, 식물 조직 라벨링 / SUP&gt; C, 15 N 라벨링 시스템은 첨단 연구를위한 동위 원소 표지 된 식물 재료를 제조하는 새로운 방법을 제공합니다. 이 챔버의 설계 및 운영 세부 사항은 4.4 원자 %, 13 C, 7 원자 % A. 15 N 표시를 위해 선택되었다 gerardii하지만, 다른 식물의 종류와 동위 원소 표지의 수준에 맞게 할 수 있습니다. 여기에 설명 된 성장 조건은 관심의 특정 식물 종의 크기, 온도, 습도, 빛, 물, 영양 요구에 맞게 맞게 조정해야합니다. 18 O 2와 H 레이블링은 관개 시스템에 사용되는 물을 라벨링함으로써 달성 될 수있다. 여기에 설명 된 시스템은 균일의 여러 문제점을 해결하고 식물 재료의 13 C 라벨 차동. 이 기본적인 챔버 설계는 ADV위한 높게 표시된 식물 물질을 생산하는 다른 연구 그룹에 의해 사용될 수있다생태계의 생지 화학적 연구를 잡힌.

식물 - 토양 - 대기 프로세스의 역학을 이해하는 것은 정확하게 예측하기위한 중요한 방법 글로벌 탄소 (C), 질소 (N) 현재와 미래의 환경 조건에서주기 기능. 안정 동위 원소는 식물 - 토양 - 대기 C와 N 순환의 양적 연구에 강력한 도구입니다. 식물 재료의 생태계를 통해 희귀 안정 동위 원소를 추적하는 생물 지구 화학적 순환 연구에 중요한 정보를 제공하고, CO 2 플럭스 및 예를 들면 4,8,9 프로빙 소규모 안정 동위 원소 바이오 마커에 ​​토양 유기물 형성. 15 N 라벨, 또는 2 H 또는 식물 조직에서 18 O 등의 안정 동위 원소 13 C 라벨을 결합하여 높은 탐지, 식물과 토양의 생화학의 결합 연구에 사용 추적, 아직 복잡한 기판을 제공한다. 균일 또는 차동 구조 및 대사 식물 재료 광고 레이블을 할 수있는 능력C와 N 생태계를 순환에 대한 복잡한 문제를 해결하기 위해 DS 추가 기능. C 및 N 회계 정량적 연구에서 동위 원소 표지 된 식물 물질을 사용하는 이점은, 그러나, C (13) 및 하나 또는 균일 차분 레이블이 15 N 표지 물질을 생산하는 능력에 달려있다. 동위 원소 표지 식물 C와 N 동화 (10), 분배 (11)와 rhizodeposition 12를 해결 연구에 사용되었다. 균일하게 13 C, 15 N 표시 식물 재료는 쓰레기 분해 1,4의 연구를위한 복잡한 표시 기판을 제공하고, 토양 유기물 형성 2,6, 토양의 CO 2 토양 먹이 그물 (13)을 연구 배출량 4, 토양 C의 연구 체류 시간 2,14. 라는 식물 재료에서 13 C 레이블 바이오 숯을 이용한 연구는 또한 이전에 간과에 대한 새로운 정보를 공개하기 시작토양 문자 풀 15. 15 N 2, H, 18 O 표시 물과 비료 처리를 통해 달성하기 위해 상대적으로 쉬운 반면, 문제는 13 C-CO 2 고정을 통해 균일하게 13 C라는 식물 재료를 생산하는 존재합니다. 밀폐 된 챔버 내에서 만기 모종의 연속 동위 원소 표지는 식물 전체에 균일 한 동위 원소 라벨을 생산하고 있습니다. 이러한 반복 펄스 라벨 (16)와 잎 신청 또는 (17, 18)를 위킹과 같은 다른 방법으로 균일하게 동위 원소 표지 된 식물 재료, 또는 특정 C-화합물의 명확한 차이 라벨 (예를 들면 신진 대사 대 구조) 19을 생산하지 않습니다. 동위 원소 표지에 중요한 고려 사항으로 인해 라벨에 사용 된 희귀 동위 원소가 풍부한 화합물의 높은 비용 효율을 라벨링한다. 연속 13 C 라벨이 과거 2-4,20에 사용되었지만, 우리의 지식이없는높은 라벨링 효율과 양의 동위 원소 표지의 균일 정확한 제어의 증거 연속 라벨 챔버의 게시 된 세부적인 기술 설명입니다. 쓰레기 분해 및 토양의 최전선에서 유기물 형성 연구는 신진 대사 식물 재료 (즉, 침출, 불안정한, 저 분자량 화합물) 및 구조 식물 재료 (예. 리그닌, 셀룰로오스, 헤미셀룰로오스가) 미생물의 관점에서 다르게 처리되는 개념이다 효율성, 토양 유기물의 형성, 장기 토양 C 저장 5-7를 사용합니다. 차등의 구조와 대사 구성 요소에 표시되는 식물 재료는, 그러므로, 쓰레기 분해 및 토양 유기물 형성 연구 발전에 유용한 도구입니다. 이중 동위 원소 차동 라벨은 여러 풀 동위 원소 techniqu을을 사용하여 에코 시스템을 통해 별도의 구조와 대사 구성 요소의 추적을 허용전자 21. 밀폐 된 챔버 내에서 13 C와 다른 동위 원소 연속 동위 원소 표지 식물의 생산성 및 동위 원소 표지 효율을 극대화하기 위해 생리적 조건을 심는 세심한주의가 필요합니다. 낮 온도 스파이크는 밀폐 된 챔버 내에서 성장하면 식물의 손상을 방지하기 위해 제어 할 수 있어야합니다. 습도와 온도의 최적 범위는 오픈 공장 기공 및 CO 2 흡수 (22)를 유지하기 위해 필요합니다. 빛 가용성을 최소화하고 챔버 구조가 손상 될 수 있습니다 챔버 벽의 습도 원인 흐림, 높은 수준의. 고가의 무거운 동위 원소 표지 화합물로 작업 할 때 (예를 들면 토양 유기물로 포팅에서 오는) 챔버의 자연 풍부한 동위 원소를 제거하고 외부 공기에 노출을 방지하여 라벨 효율을 동위 원소주의 깊은 고려가 중요합니다. 여기서, 우리는 건물 및 운영하기위한 방법을 제시수정 및 15 N 라벨링 동안 균일하게 표지 된 또는 별개의 단계에서 표지 된 구조적 및 대사 성분을 갖는다 어느 식물 재료의 제조를위한 연속적인 이중 13 C, 15 N 동위 원소 라벨 챔버. 13 C 라벨링은 챔버 레벨에서 제어된다 개별 포트 수준에서 제어. 대표적인 결과는 성장시기에 걸쳐 온도, 습도, 및 CO 2 농도를 제어하기위한 본 방법의 기능을 설명하기 위해 도시된다. 성장 Andropogon의 gerardii의 결과는, 카우는 균일 또는 차등라는 식물 재료를 생산하는이 방법의 능력을 보여줍니다. 기재된 특정 챔버 설계 및 동작 방식은 상이한 종의 식물을 성장뿐만 아니라, H 2 O (18) 또는 라벨을 수용하도록 변형 될 수있다.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="583">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">40 in Remote Tower Fan</td>
			<td style="width:81px;">Living Accents</td>
			<td style="width:119px;">FS10-S3R-A</td>
			<td style="width:167px;"></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">42 in Electric Tower Fan with remote control</td>
			<td style="width:81px;">LASKO</td>
			<td style="width:119px;">2559</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Mr. Slim Split-type air conditioner</td>
			<td style="width:81px;">Mitsubishi Electric</td>
			<td style="width:119px;">R410A</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Electronic 24 hr time switches</td>
			<td style="width:81px;">Intermatic</td>
			<td style="width:119px;">ET100C</td>
			<td>Operates Fluorescent Light System</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">iSeries Humidity and Temp Controller</td>
			<td style="width:81px;">Omega</td>
			<td style="width:119px;">CHiTH-i8DV33-5-El</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">Solid State Relay</td>
			<td style="width:81px;">Omega</td>
			<td style="width:119px;">SSRL240</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">CKR Series Solid State Relay</td>
			<td style="width:81px;">Crydon</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">Solenoid Coils</td>
			<td style="width:81px;">Dayton</td>
			<td style="width:119px;">6X543</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">GasHound CO2 Analyzer</td>
			<td style="width:81px;">LI-COR</td>
			<td style="width:119px;">LI-800</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">Dehumidifier</td>
			<td style="width:81px;">Dayton</td>
			<td style="width:119px;">1DGX4</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">Specialty gas regulator</td>
			<td style="width:81px;">Airgas</td>
			<td style="width:119px;">CGA 580</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">T5 Hight Output Commercial Fluorescent Light System</td>
			<td style="width:81px;">Hydro Farm</td>
			<td style="width:119px;">FLT48</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Air pump</td>
			<td style="width:81px;">Thermo Scientific</td>
			<td style="width:119px;">420-1901</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Masterflex Cartridge Pump HeadSystem</td>
			<td style="width:81px;">Cole Parmer</td>
			<td style="width:119px;">7553-70</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">1900 Series Network Switch</td>
			<td style="width:81px;">Catalyst</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Profile Porus Ceramic Top Dressing</td>
			<td style="width:81px;">Greens Grade</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">Industrial Quartz 40 mesh</td>
			<td style="width:81px;">Unimin</td>
			<td style="width:119px;">4095</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Mycorrhizae Professional Growing Medium</td>
			<td style="width:81px;">ProMix</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Vermiculite and Perlite</td>
			<td style="width:81px;">Thermo-Ran</td>
			<td style="width:119px;">C633</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Potassium Nitrate- 15N 98 atom %</td>
			<td style="width:81px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">335134</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Carbon-13C Dioxide 10 atom %</td>
			<td style="width:81px;">Sigma-Aldrich</td>
			<td style="width:119px;">600180</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">Medical grade CO2</td>
			<td style="width:81px;">Airgas</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">Regulator</td>
			<td style="width:81px;">Airgas</td>
			<td style="width:119px;">&#160;CGA 350</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:216px;">4 in box fans</td>
			<td style="width:81px;">Grainger</td>
			<td style="width:119px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:216px;">Masterflex PharMed BPT Tubing</td>
			<td style="width:81px;">Cole Parmer</td>
			<td style="width:119px;">HV-06508-24</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

design and operation of a continuous 13c and 15n labeling chamber for uniform or differential, metabolic and structural, plant isotope labeling

식물 재료의 생태계를 통해 희귀 안정 동위 원소를 추적하는 것은 생태계 과정에 대한 가장 중요한 정보를 제공하며, CO에서 작은 규모의 안정 동위 원소의 바이오 마커 2 플럭스와 토양 유기물 형성 프로빙. 18 O 2 H는 생지 화학적 변환하는 동안 복잡한 화학 양 론적 관계에 대한 더 많은 정보를 공개 할 수있는 잠재력을 가지고, 15 N과 같은 13 C 여러 안정 동위 원소를 결합. 동위 원소 표지 된 식물 재료는 쓰레기 분해 및 토양 유기물의 형성 1-4의 다양한 연구에 이용되고있다. 이들 및 다른 연구에서, 그러나, 식물 재료의 구조적 요소를 다르게 미생물 활용 및 장기 탄소 저장 5-7 환산 대사 성분 (예. 침출 가능한 저분자 화합물)보다 동작 것이 명백했다. 구조 및 대사 구성 요소를 연구 할 수있는 능력별도 생태계 생지 화학 연구의 선두 발전을위한 강력한 새로운 도구를 제공합니다. 여기에서 우리는 13 C 균일 식물 전체에 표시하거나 차동 구조적 및 대사 식물 성분에 표시되는 어느 하나 15 N 표지 된 식물 재료를 제조하는 방법을 설명한다. 여기서, 우리는 연속 13 C 및 다양한 연구 목적에 맞게 수정 될 수있다 (15) N 라벨 챔버의 구성 및 동작을 제시한다. 차동 라벨이 이전에 수확 챔버 주에서 성장하는 식물을 제거함으로써 달성되는 동안 균일하게 표시 식물 재료는 수확하는 모종의 연속 라벨에 의해 생산됩니다. 성장 Andropogon 대표 결과 카우가 목표 수준에서 효율적으로 라벨 식물 재료에 대한 시스템의 능력을 입증 gerardii. 이 방법을 통해 우리는 4.4 원자 %, 13 C, 6.7 원자 % 15 &lt;으로 식물 재료를 생산합니다/ SUP&gt; N 유니폼 식물 라벨, 또는 차별적으로 최대 1.29 원자 % 13 C 0.56 원자 %로 표시되어 물질의 대사와 (각각 뜨거운 물 추출 및 온수 잔류 성분) 구조 구성 요소에있는 15 N. 도전은 밀폐 13 성공적인 공장 생산을위한 C-CO 2 분위기에서 적당한 온도, 습도, 이산화탄소 농도, 빛의 수준을 유지하는 거짓말. 이 챔버 기술을 효과적으로 생태계 생물 지구 화학적 순환에 실험에 사용하기 위해 균등 또는 차등 다중 동위 원소 표지 된 식물 재료 생산하는 유용한 연구 도구를 나타냅니다.

우리의 라벨 챔버의 크기는 1.2 MX 2.4 MX 3.6 m이며, 40,15 L 포트 (그림 1)를 보유하고있다. 컴퓨터 IRGA 제어 시스템은 하루의 광합성 활성 기간 (그림 2a) 동안 360과 400 ppm으로 우리의 설정 값 사이의 CO 2 농도를 유지했다. IRGA의 낮은 CO 2 알람 기능은 농도가 최소 임계 값 (예 : 360 ppm)를 하회 할 때 13 C에서 CO 2 챔버로 자연의 풍요 로움 탱크에 충실 할 수 있도록 솔레노이드 밸브를 트리거. 농도가 상위 설정 점 (예를 들면 400 PPM)에 도달 할 때 데드 밴드 기능의 흐름을 중단했다. iSeries의 온도와 성장시기에 걸쳐 설정 매개 변수 내에서 기후 조건을 개최 에어컨과 제습기에 연결 습도 모니터링 시스템 (그림 2B). 우리는 애에 하나의 톤 (3.5 kW 급) 공기 조절 장치를 사용챔버 멋진 EP. 원격 모니터링 시스템은 기록 된 데이터가 표준 웹 브라우저에 의해 언제든지 볼 수 있었다. CO 2 농도, 온도 및 습도 값은 아래로 24 시간 단위로, 지난 24-240 시간에 그래프를 표시 할 웹 응용 프로그램에서 샘플링되었다. 이 매일 변동이 예상 범위 내에서 이었다는 것을 확인하는 빠른 영상을 만들었습니다. 웹 인터페이스를 보는 또한 최근의 데이터를 수신하지 같은 잠재적 문제 챔버 현재 상태뿐만 아니라 제공된 경고를 보였다. 언제든지 완전한 데이터 집합은 웹 인터페이스에서도 다운로드 할 수 있습니다. 우리의 광합성 활성 복사 (PAR)를 측정 즉시로와 양자 센서를 사용하여 여름과 하루의 중간 중간에의 표시등이없는 네 개의 지점에서 내부와 챔버의 외관. 챔버의 PAR은 외부보다 31.5 % 낮은 때 챔버 등 w오프 감수하고 표시등이 켜져 있었다 외부보다 22 % 낮은. 따라서, 챔버 조명 크게 9.5 % (P &lt;0.05)에 의해 챔버 내에 PAR 침투를 향상시키는 데 도움. 우리의 지속적인 라벨링 시스템은 A.의 2천7백59그램을 생성 할 수 있었다 gerardii 바이오 매스의 37 %는 지상 바이오 매스이었고, 63 %는 belowground 바이오 매스했다. 우리는 (그림 1, 표 1 참조) 이에 따라 두 CO 2 탱크에 솔레노이드 밸브를 설정하여 우리의 균일 한 식물 재료에서 4.4 원자 %, 13 C 전체 공장의 라벨을 달성했다. 우리는 수정 호글 랜드의 솔루션 (23)의 KNO 3 subsolution (표 1)에 15 N-KNO 3 0.37 원자 %로 15 N-KNO 3 98 원자 %를 혼합하여 우리의 균일 한 식물 재료에서 6.7 원자 % 15 N 전체 공장의 라벨을 달성 . 우리는 A를 물을 성장 바다에 걸쳐 750 ㎖의 총 유체 (물 플러스 호글 랜드의 솔루션)와 gerardii 주간아들. 우리는 공장의 생산성에 따라 주당 호글 랜드의 솔루션을 표시 15 N의 200 ~ 500 ㎖로 수정 된. 우리는 균일하고 차별적으로 표지 된 식물 재료 동위 원소 간의 차이가 있다면 결정하기 위하여 온수 추출 방법을 이용했다. 차동 표시 식물을 수확에 우리는 완전히 죽은 그들이 가능성이 차별적으로 표시되지 않은 별도로 이들을 취급 된 잎을 제거. 13 C의 내용을 볼 때, 네 개의 내장 일 전체 공장과 열수 추출물에 서로 유의 한 차이가 있었지만, 뜨거운 물 잔류 물 하루에 14, 22 (표 1) 서로 유의 한 차이가 없었다. 매일 내의 식물 조직 분획을 비교할 경우, 열수 추출물과 잔류 물을 모두 나흘 서로 크게 달랐다과 일 (22)에 의해 전체 식물, 추출물, 및 잔류 물을 모두 signi되었습니다서로 다른 ficantly (표 1). 식물 성분으로 15 N의 설립을위한 법인 설립 및 식물 조직 분수의 일의 차이가 있었다. 열수 추출물의 경우 편입 일의 네 15 N에 서로 유의 한 차이가 있었고, 전체 공장과 뜨거운 물에 설립 짧은 일 설립 (표 1)의 긴 일에 비해 유의 한 차이가 있었다 잔류. 균일 한 식물에서 식물 조직 분획은 15 N으로 서로 차이가 없었다하지만 열수 추출물과 잔류 물을 차등 적 표지 깔짚을위한 15 N으로 서로 크게 달랐다. 모든 동위 원소 값은 % 농후 높은 수준으로 사용하는 것보다 더 정확한 표기 원자 % (원자 %) 표기법 (식 1)을 사용하여보고된다동위 원소 농축 21. 예를 들면 : <img alt="" height="54" src="/files/ftp_upload/51117/51117eq2.jpg" width="202" /> (1) 이 연구를 위해, 우리는 SAS 버전 9.2을 사용하여 통계 분석을 실행했습니다. 우리는 쌍 t-검정을 사용하여 챔버 내부 및 외부 조명 레벨 사이의 차이를 시험했다. 우리는 13 C 및 PROC ANOVA에 일원 변량 분석 (ANOVA)를 사용하여 뜨거운 물 추출 및 온수 잔기의 15 N 라벨 사이의 차이점을 시험 하였다. 우리는 다중 비교 분석을 위해 던컨의 여러 범위의 테스트를 사용했습니다. 의미는 0.05 P 수준에서 받아 들여졌다. 우리는 데이터 분석의 가정을 만족하는지 테스트하는 윌 콕슨 순위 합 시험을 사용 하였다. <img alt="그림 1" fo:content-width="5in" fo:src="/files/ftp_upload/51117/51117fig1highres.jpg" src="/files/ftp_upload/51117/51117fig1.jpg" /> 그림 1. Schemat조감도에서 40 포트 용량 연속 멀티 동위 원소 표지 챔버의 IC도. 실선은 가스 또는 물 튜브를 대표하는 동안 점선은, 전기 배선을 나타냅니다. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/51117/51117fig1highres.jpg" target="_blank">더 큰 이미지를 보려면 여기를 클릭하십시오.</a> <img alt="그림 2" fo:content-width="5in" fo:src="/files/ftp_upload/51117/51117fig2highres.jpg" src="/files/ftp_upload/51117/51117fig2.jpg" /> . 그림 2) 평균 CO 2 농도 (ppm)를 (+ / -. 전체 성장시기에 대한 이십사 시간 동안 SE) B) 평균 기온 (° C), 열린 원, 습도 (%)을, 원 마감 . 전체 성장시기에 대한 이십사 시간 동안 (+ / - SE)는 <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/51117/51117fig2highres.jpg" target="_blank">큰 메신저를 보려면 여기를 클릭하십시오</a>나이. <table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="559"><colgroup><col /><col /><col /><col /><col span="2" /></colgroup><tbody><tr height="17"><td height="17" style="height:17px;width:77px;"></td><td style="width:85px;"></td><td style="width:92px;"> 통일 (0) </td><td style="width:97px;"> 차동 (7) </td><td style="width:104px;"> 차동 (14) </td><td style="width:104px;"> 차동 (22) </td></tr><tr height="19"><td height="38" rowspan="2" style="height:38px;width:77px;"> 전체 쓰레기 </td><td> 13 C 원자 % </td><td> 4.46 ± 0.02 AAB </td><td> 3.93 ± 0.05 바 </td><td> 3.64 ± 0.03 칼슘 </td><td> 3.35 ± 0.06 DB를 </td></tr><tr height="19"><td height="19" style="height:19px;"> 15 N 원자 % </td><td> 6.69 ± 0.07 금주 모임 </td><td> 6.72 ± 0.01 금주 모임 </td><td> 6.33 ± 0.06 바 </td><td> 6.41 ± 0.07 바 </td></tr><tr height="19"><td height="38" rows팬 = &quot;2&quot;스타일 = &quot;높이 : 38px; 폭 : 77px;&quot;&gt; 온수 추출 </td><td> 13 C 원자 % </td><td> 4.59 ± 0.04 금주 모임 </td><td> 3.35 ± 0.06 비비 </td><td> 2.79 ± 0.06 CB </td><td> 2.37 ± 0.03는 Dc </td></tr><tr height="19"><td height="19" style="height:19px;"> 15 N 원자 % </td><td> 6.69 ± 0.03 금주 모임 </td><td> 6.43 ± 0.01 비비 </td><td> 5.89 ± 0.07 DB를 </td><td> 6.16 ± 0.05 CB </td></tr><tr height="19"><td height="38" rowspan="2" style="height:38px;width:77px;"> 온수 잔류 </td><td> 13 C 원자 % </td><td> 4.37 ± 0.06 AB </td><td> 4.1 ± 0.03 바 </td><td> 3.79 ± 0.10 칼슘 </td><td> 3.66 ± 0.05 칼슘 </td></tr><tr height="19"><td height="19" style="height:19px;"> 15 N 원자 % </td><td> 6.57 ± 0.04 바 </td><td> 6.71 ± 0.02 금주 모임 </td><td> 6.45 ± 0.02 칼슘 </td><td> 6.44 ± 0.03 칼슘 </td></tr></tbody></table> 표 1. <strong&gt; 균일하고 차별적으로 표시 쓰레기에 대한 동위 원소 조성과 쓰레기 화학. 챔버 외부 차동 라벨의 일이 괄호에 있습니다. 정관의 일 사이의 비교는 각 변수 (열 아래) 소문자입니다 (행에서) 대문자와 쓰레기 분수 사이.

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Design and Operation of a Continuous 13C and 15N Labeling Chamber for Uniform or Differential, Metabolic and Structural, Plant Isotope Labeling

이 방법은 연속 13 C 균일 또는 차동 식물 조직 라벨 15 N 동위 원소 표지 챔버를 구축하고 운영하는 방법을 설명합니다. 신진 대사 및 Andropogon의 gerardii의 구조 라벨링 대표 결과에 대해 설명합니다.

연속의 설계 및 운영<sup&gt; 13</sup&gt; C 및<sup&gt; 15</sup통일 또는 차등을위한&gt; N 레이블 상공 회의소, 대사 및 구조, 식물 동위 원소 라벨링

Tracing rare stable isotopes from plant material through the ecosystem provides the most sensitive information about ecosystem processes; from CO2 fluxes ...

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Research

JoVE Journal

Environment

Design and Operation of a Continuous 13C and 15N Labeling Chamber for Uniform or Differential, Metabolic and Structural, Plant Isotope Labeling

21.7K 조회수.  Colorado State University.  이 방법은 연속 13 C 균일 또는 차동 식물 조직 라벨 15 N 동위 원소 표지 챔버를 구축하고 운영하는 방법을 설명합니다. 신진 대사 및 Andropogon의 gerardii의 구조 라벨링 대표 결과에 대해 설명합니다. 

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A Rapid and Efficient Method for Assessing Pathogenicity of Ustilago maydis on Maize and Teosinte Lines

Maize is a major cereal crop worldwide. However, susceptibility to biotrophic pathogens is the primary constraint to increasing productivity. U. maydis is a biotrophic fungal pathogen and the causal agent of corn smut on maize. This disease is responsible for significant yield losses of approximately $1.0 billion annually in the U.S.1 Several methods including crop rotation, fungicide application and seed treatments are currently used to control corn smut2. However, host resistance is the only practical method for managing corn smut. Identification of crop plants including maize, wheat, and rice that are resistant to various biotrophic pathogens has significantly decreased yield losses annually3-5. Therefore, the use of a pathogen inoculation method that efficiently and reproducibly delivers the pathogen in between the plant leaves, would facilitate the rapid identification of maize lines that are resistant to U. maydis. As, a first step toward indentifying maize lines that are resistant to U. maydis, a needle injection inoculation method and a resistance reaction screening method was utilized to inoculate maize, teosinte, and maize x teosinte introgression lines with a U. maydis strain and to select resistant plants.
Maize, teosinte and maize x teosinte introgression lines, consisting of about 700 plants, were planted, inoculated with a strain of U. maydis, and screened for resistance. The inoculation and screening methods successfully identified three teosinte lines resistant to U. maydis. Here a detailed needle injection inoculation and resistance reaction screening protocol for maize, teosinte, and maize x teosinte introgression lines is presented. This study demonstrates that needle injection inoculation is an invaluable tool in agriculture that can efficiently deliver U. maydis in between the plant leaves and has provided plant lines that are resistant to U. maydis that can now be combined and tested in breeding programs for improved disease resistance.

A Rapid and Efficient Method for Assessing Pathogenicity of Ustilago maydis on Maize and Teosinte Lines

The use of a needle injection method to inoculate maize and teosinte plants with the biotrophic pathogen Ustilago maydis is described. The needle injection inoculation method facilitates the controlled delivery of the fungal pathogen in between the plant leaves where the pathogen enters the plant through the formation of appresoria. This method is highly efficient, enabling reproducible inoculations with U. maydis.

옥수수와 테오신테 라인에 우스틸라고 성 실증의 병원성을 평가하기위한 신속하고 효율적인 방법

Maize is a major cereal crop worldwide. However, susceptibility to biotrophic pathogens is the primary constraint to increasing productivity. U. maydis is ...

연구

환경과학

Transcript and Metabolite Profiling for the Evaluation of Tobacco Tree and Poplar as Feedstock for the Bio-based Industry

The global demand for food, feed, energy, and water poses extraordinary challenges for future generations. It is evident that robust platforms for the exploration of renewable resources are necessary to overcome these challenges. Within the multinational framework MultiBioPro we are developing biorefinery pipelines to maximize the use of plant biomass. More specifically, we use poplar and tobacco tree (Nicotiana glauca) as target crop species for improving saccharification, isoprenoid, long chain hydrocarbon contents, fiber quality, and suberin and lignin contents. The methods used to obtain these outputs include GC-MS, LC-MS and RNA sequencing platforms. The metabolite pipelines are well established tools to generate these types of data, but also have the limitations in that only well characterized metabolites can be used. The deep sequencing will allow us to include all transcripts present during the developmental stages of the tobacco tree leaf, but has to be mapped back to the sequence of Nicotiana tabacum. With these set-ups, we aim at a basic understanding for underlying processes and at establishing an industrial framework to exploit the outcomes. In a more long term perspective, we believe that data generated here will provide means for a sustainable biorefinery process using poplar and tobacco tree as raw material. To date the basal level of metabolites in the samples have been analyzed and the protocols utilized are provided in this article.

Plant biomass offers a renewable resource for multiple products, including fuel, feed, food, and a variety of materials. In this paper we investigate the properties of tobacco tree (Nicotiana glauca) and poplar as suitable sources for a biorefinery pipeline.

바이오 기반 산업을위한 원료로 담배 나무와 포플러의 평가에 대한 성적 증명서 및 대사 산물 프로파일

The global demand for food, feed, energy, and water poses extraordinary challenges for future generations. It is evident that robust platforms for the ...

Design and Construction of an Urban Runoff Research Facility

As the urban population increases, so does the area of irrigated urban landscape. Summer water use in urban areas can be 2-3x winter base line water use due to increased demand for landscape irrigation. Improper irrigation practices and large rainfall events can result in runoff from urban landscapes which has potential to carry nutrients and sediments into local streams and lakes where they may contribute to eutrophication. A 1,000 m2 facility was constructed which consists of 24 individual 33.6 m2 field plots, each equipped for measuring total runoff volumes with time and collection of runoff subsamples at selected intervals for quantification of chemical constituents in the runoff water from simulated urban landscapes. Runoff volumes from the first and second trials had coefficient of variability (CV) values of 38.2 and 28.7%, respectively. CV values for runoff pH, EC, and Na concentration for both trials were all under 10%. Concentrations of DOC, TDN, DON, PO4-P, K+, Mg2+, and Ca2+ had CV values less than 50% in both trials. Overall, the results of testing performed after sod installation at the facility indicated good uniformity between plots for runoff volumes and chemical constituents. The large plot size is sufficient to include much of the natural variability and therefore provides better simulation of urban landscape ecosystems.

This paper describes the design, construction, and function of a 1,000 m2 facility containing 24 individual 33.6 m2 field plots equipped for measuring total runoff volumes with time and collection of runoff subsamples at selected intervals for quantification of chemical constituents in the runoff water from simulated home lawns.

도시 유출의 연구 시설의 설계 및 건설

As the urban population increases, so does the area of irrigated urban landscape. Summer water use in urban areas can be 2-3x winter base line water use ...

Operation of a 25 KWth Calcium Looping Pilot-plant with High Oxygen Concentrations in the Calciner

Calcium looping (CaL) is a post-combustion CO2 capture technology that is suitable for retrofitting existing power plants. The CaL process uses limestone as a cheap and readily available CO2 sorbent. While the technology has been widely studied, there are a few available options that could be applied to make it more economically viable. One of these is to increase the oxygen concentration in the calciner to reduce or eliminate the amount of recycled gas (CO2, H2O and impurities); therefore, decreasing or removing the energy necessary to heat the recycled gas stream. Moreover, there is a resulting increase in the energy input due to the change in the combustion intensity; this energy is used to enable the endothermic calcination reaction to occur in the absence of recycled flue gases. This paper presents the operation and first results of a CaL pilot plant with 100% oxygen combustion of natural gas in the calciner. The gas coming into the carbonator was a simulated flue gas from a coal-fired power plant or cement industry. Several limestone particle size distributions are also tested to further explore the effect of this parameter on the overall performance of this operating mode. The configuration of the reactor system, the operating procedures, and the results are described in detail in this paper. The reactor showed good hydrodynamic stability and stable CO2 capture, with capture efficiencies of up to 70% with a gas mixture simulating the flue gas of a coal-fired power plant.

Operation of a 25 KWth Calcium Looping Pilot-plant with High Oxygen Concentrations in the Calciner

This manuscript describes a procedure for operating a calcium looping pilot-plant for post-combustion carbon capture with high oxygen concentrations in the calciner in order to reduce or eliminate the flue gas recycle.

25 KW회 칼슘 반복 파일럿-식물은 Calciner에서 높은 산소 농도와 운영

Calcium looping (CaL) is a post-combustion CO2 capture technology that is suitable for retrofitting existing power plants. The CaL process uses limestone ...

RGB and Spectral Root Imaging for Plant Phenotyping and Physiological Research: Experimental Setup and Imaging Protocols

Better understanding of plant root dynamics is essential to improve resource use efficiency of agricultural systems and increase the resistance of crop cultivars against environmental stresses. An experimental protocol is presented for RGB and hyperspectral imaging of root systems. The approach uses rhizoboxes where plants grow in natural soil over a longer time to observe fully developed root systems. Experimental settings are exemplified for assessing rhizobox plants under water stress and studying the role of roots. An RGB imaging setup is described for cheap and quick quantification of root development over time. Hyperspectral imaging improves root segmentation from the soil background compared to RGB color based thresholding. The particular strength of hyperspectral imaging is the acquisition of chemometric information on the root-soil system for functional understanding. This is demonstrated with high resolution water content mapping. Spectral imaging however is more complex in image acquisition, processing and analysis compared to the RGB approach. A combination of both methods can optimize a comprehensive assessment of the root system. Application examples integrating root and aboveground traits are given for the context of plant phenotyping and plant physiological research. Further improvement of root imaging can be obtained by optimizing RGB image quality with better illumination using different light sources and by extension of image analysis methods to infer on root zone properties from spectral data.

An experimental protocol is presented for assessment of soil grown plant root systems with RGB and hyperspectral imaging. Combination of RGB image time series with chemometric information from hyperspectral scans optimizes insights into plant root dynamics.

RGB 및 식물 형질 및 생리 적 연구에 대 한 스펙트럼 루트 이미징: 실험적인 체제 및 프로토콜을 이미징

Better understanding of plant root dynamics is essential to improve resource use efficiency of agricultural systems and increase the resistance of crop ...

Continuous Hydrologic and Water Quality Monitoring of Vernal Ponds

Vernal ponds, also referred to as vernal pools, provide critical ecosystem services and habitat for a variety of threatened and endangered species. However, they are vulnerable parts of the landscapes that are often poorly understood and understudied. Land use and management practices, as well as climate change are thought to be a contribution to the global amphibian decline. However, more research is needed to understand the extent of these impacts. Here, we present methodology for characterizing a vernal pond's morphology and detail a monitoring station that can be used to collect water quantity and quality data over the duration of a vernal pond's hydroperiod. We provide methodology for how to conduct field surveys to characterize the morphology and develop stage-storage curves for a vernal pond. Additionally, we provide methodology for monitoring the water level, temperature, pH, oxidation-reduction potential, dissolved oxygen, and electrical conductivity of water in a vernal pond, as well as monitoring rainfall data. This information can be used to better quantify the ecosystem services that vernal ponds provide and the impacts of anthropogenic activities on their ability to provide these services.

Understanding the ecosystem services and processes provided by vernal ponds and the impacts of anthropogenic activities on their ability to provide these services requires intensive hydrologic monitoring. This sampling protocol using in-situ monitoring equipment was developed to understand the impact of anthropogenic activities on water levels and quality.

지속적인 문학적 품질 모니터링 Vernal 연못의 물

Vernal ponds, also referred to as vernal pools, provide critical ecosystem services and habitat for a variety of threatened and endangered species. ...

Quantifying Plant Soluble Protein and Digestible Carbohydrate Content, Using Corn (Zea mays) As an Exemplar

Elemental data are commonly used to infer plant quality as a resource to herbivores. However, the ubiquity of carbon in biomolecules, the presence of nitrogen-containing plant defensive compounds, and variation in species-specific correlations between nitrogen and plant protein content all limit the accuracy of these inferences. Additionally, research focused on plant and/or herbivore physiology require a level of accuracy that is not achieved using generalized correlations. The methods presented here offer researchers a clear and rapid protocol for directly measuring plant soluble proteins and digestible carbohydrates, the two plant macronutrients most closely tied to animal physiological performance. The protocols combine well characterized colorimetric assays with optimized plant-specific digestion steps to provide precise and reproducible results. Our analyses of different sweet corn tissues show that these assays have the sensitivity to detect variation in plant soluble protein and digestible carbohydrate content across multiple spatial scales. These include between-plant differences across growing regions and plant species or varieties, as well as within-plant differences in tissue type and even positional differences within the same tissue. Combining soluble protein and digestible carbohydrate content with elemental data also has the potential to provide new opportunities in plant biology to connect plant mineral nutrition with plant physiological processes. These analyses also help generate the soluble protein and digestible carbohydrate data needed to study nutritional ecology, plant-herbivore interactions and food-web dynamics, which will in turn enhance physiology and ecological research.

Quantifying Plant Soluble Protein and Digestible Carbohydrate Content, Using Corn Zea mays As an Exemplar

The protocols described herein provide a clear and approachable methodology for measuring soluble protein and digestible (non-structural) carbohydrate content in plant tissues. The ability to quantify these two plant macronutrients has significant implications for advancing the fields of plant physiology, nutritional ecology, plant-herbivore interactions and food-web ecology.

공장 수용 성 단백질과 소화 탄수화물 콘텐츠를 사용 하 여 옥수수 (지 시 메이 스)를 표본으로 측정

Elemental data are commonly used to infer plant quality as a resource to herbivores. However, the ubiquity of carbon in biomolecules, the presence of ...

Colletotrichum fioriniae Development in Water and Chloroform-based Blueberry and Cranberry Floral Extracts

To accurately monitor the phenology of the bloom period and the temporal dynamics of floral chemical cues on fungal fruit rotting pathogens, floral extraction methods and coverslip bioassays were developed utilizing Colletotrichum fioriniae. In blueberry and cranberry, this pathogen is optimally controlled by applying fungicides during the bloom period because of the role flowers play in the initial stages of infection. The protocol detailed here describes how floral extracts (FE) were obtained using water-, chloroform-, and field rainwater-based methods for later use in corresponding glass coverslip bioassays. Each FE served to provide a different set of information: response of C. fioriniae to mobilized floral chemical cues in water (water-based), pathogen response to flower and fruit surface waxes (chloroform-based), and field-based monitoring of collected floral rainwater, moving in vitro observations to an agricultural setting. The FE is broadly described as either water- or chloroform-based, with an appropriate bioassay described to compensate for the inherent differences between these two materials. Rainwater that had run off flowers was collected in unique devices for each crop, alluding to the flexibility and application of this approach for other crop systems. The bioassays are quick, inexpensive, simple, and provide the ability to generate spatiotemporal and site-specific information about the presence of stimulatory floral compounds from various sources. This information will ultimately better inform disease management strategies, as FE decrease the time needed for infection to occur, thus providing insight into changing risks for pathogen infection over the growing season.

Colletotrichum fioriniae Development in Water and Chloroform-based Blueberry and Cranberry Floral Extracts

Here, bioassays designed to monitor the development of a fungal pathogen, Colletotrichum fioriniae, in the presence of blueberry or cranberry floral extracts on glass coverslips are described. Water-, chloroform-, and field rainwater- based floral extraction techniques are detailed as well as insight into how this information can be applied.

Colletotrichum fioriniae 물, 클로 프롬 기반 블루베리와 크랜베리 꽃 추출 물 개발

To accurately monitor the phenology of the bloom period and the temporal dynamics of floral chemical cues on fungal fruit rotting pathogens, floral ...

A Uniaxial Compression Experiment with CO2-Bearing Coal Using a Visualized and Constant-Volume Gas-Solid Coupling Test System

Injecting carbon dioxide (CO2) into a deep coal seam is of great significance for reducing the concentration of greenhouse gases in the atmosphere and increasing the recovery of coalbed methane. A visualized and constant-volume gas-solid coupling system is introduced here to investigate the influence of CO2 sorption on the physical and mechanical properties of coal. Being able to keep a constant volume and monitor the sample using a camera, this system offers the potential to improve instrument accuracy and analyze fracture evolution with a fractal geometry method. This paper provides all steps to perform a uniaxial compression experiment with a briquette sample in different CO2 pressures with the gas-solid coupling test system. A briquette, cold-pressed by raw coal and sodium humate cement, is loaded in high-pressure CO2, and its surface is monitored in real-time using a camera. However, the similarity between the briquette and the raw coal still needs improvement, and a flammable gas such as methane (CH4) cannot be injected for the test. The results show that CO2 sorption leads to peak strength and elastic modulus reduction of the briquette, and the fracture evolution of the briquette in a failure state indicates fractal characteristics. The strength, elastic modulus, and fractal dimension are all correlated with CO2 pressure but not with a linear correlation. The visualized and constant-volume gas-solid coupling test system can serve as a platform for experimental research about rock mechanics considering the multifield coupling effect.

A Uniaxial Compression Experiment with CO2-Bearing Coal Using a Visualized and Constant-Volume Gas-Solid Coupling Test System

This protocol demonstrates how to prepare a briquette sample and conduct a uniaxial compression experiment with a briquette in different CO2 pressures using a visualized and constant-volume gas-solid coupling test system. It also aims to investigate changes in terms of coal&#8217;s physical and mechanical properties induced by CO2 adsorption.

시각화되고 일정한 부피의가스 고체 커플링 테스트 시스템을 사용하여 CO 2-베어링 석탄을 사용한 축축한 압축 실험

Injecting carbon dioxide (CO2) into a deep coal seam is of great significance for reducing the concentration of greenhouse gases in the atmosphere and ...

PARbars: Cheap, Easy to Build Ceptometers for Continuous Measurement of Light Interception in Plant Canopies

Ceptometry is a technique used to measure the transmittance of photosynthetically active radiation through a plant canopy using multiple light sensors connected in parallel on a long bar. Ceptometry is often used to infer properties of canopy structure and light interception, notably leaf area index (LAI) and effective plant area index (PAIeff). Due to the high cost of commercially available ceptometers, the number of measurements that can be taken is often limited in space and time. This limits the usefulness of ceptometry for studying genetic variability in light interception, and precludes thorough analysis of, and correction for, biases that can skew measurements depending on the time of day. We developed continuously logging ceptometers (called PARbars) that can be produced for USD $75 each and yield high quality data comparable to commercially available alternatives. Here we provide detailed instruction on how to build and calibrate PARbars, how to deploy them in the field and how to estimate PAI from collected transmittance data. We provide representative results from wheat canopies and discuss further considerations that should be made when using PARbars.

Here, we present detailed instructions on how to build and calibrate research quality ceptometers (light sensors that integrate light intensity across many sensors arrayed linearly along a horizontal bar).

PARbars: 저렴 한 공장 캐노피에서 빛 차단을 지속적으로 측정 하기 위한 Ceptometers를 쉽게 구축 할 수 있습니다.

Ceptometry is a technique used to measure the transmittance of photosynthetically active radiation through a plant canopy using multiple light sensors ...

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