저자는 그들이 더 경쟁 금융 이익이 없다는 것을 선언합니다.

CFTR 1. 정제 참고 :이 프로토콜에 사용되는 장비 및 재료의 목록은 재료 표 및 장비를 참조하십시오. 상세한 프로토콜은 S F 9의 바쿨로 바이러스 발현 계에서 인간 17,28 WT-CFTR의 과발현 돌연변이 체에 대한 필요성이 존재한다. CFTR 과발현이 프로토콜에 따라 S f를 9 세포의 알약을 준비합니다. <ol><li> 원유 막 준비 <ol><li> 신선한를 구하거나 표준 세포 배양 방법에 의해 성장, 과발현 C- 말단 그의 10 -tag와 wildtype-, F508del-, 또는 G551D-CFTR 단백질을 세포의 500ml의 문화에서 냉동 S F 9 세포 펠렛을 해동, 로 이전 17,28 설명했다. 세포 펠릿을 약 5 ml의 부피와 약 5g의 습윤 중량을 가질 것이다. </li><li> 재현 탁의 S f를 보장 4 ° C에서 단백질 분해 효소 억제제 칵테일 인산염 완충 생리 식염수 20 ㎖ (PBS)의 pH 7.4 (1 태블릿 50 mL 당) 9 셀,샘플은 시각적으로 균일 나타나고 세포의 어떤 덩어리가 남아 있지. </li><li> 통로 당 2 분 동안 10,000 PSI (바람직하게는 15,000-20,000 PSI)의 최소 도달 고압 셀 장애 물질 (재료 및 장비 표)를 사용하여 세포를 Lyse. 용해 동안 4 ° C에서 샘플을 보관하십시오. <ol><li> 즉시 세포 장애 물질의 샘플을 다시 용해 기간 후 얼음에 튜브 샘플을 수집합니다. 반복 용해 과정 3 회. 10 % 이하가 잔류되도록 현미경으로 조사한다. 주 : 등 유리 비드와 같은 다른 방법으로 용해하는 세포는 엄격하지만, 사용자가 다른 방법이 적합 찾을 수이 시스템에 대해 검사되지 않았다. </li></ol></li><li> 20 분 동안 2,000 XG에 고속​​ 원심 분리기에서 4 ℃에서 원심 분리 세포 용해 물질. 상층 액을 수집하고 펠렛 폐기하십시오. 20 튜브들 사이에서 뜨는을 나누고 ultracen 테이블 상단에 125,000 XG에서 4 ° C에서 1 시간 동안 원심 분리trifuge. </li><li> 제거하고 사용까지 2 이하 개월 -80 ° C에서 같은 튜브에 펠릿 및 저장 펠렛을 방해하지 않도록주의, 상층 액을 제거, 또는 얼음에 보관하고 즉시 정화를 계속합니다. </li></ol></li><li> CFTR 가용화 <ol><li> 1-4 신선 또는 냉동 S f를 9 원유 막 알약을 얻고 버퍼 1 1 ㎖의 각을 재현 탁 (2 % FOS -choline, 완벽한 조리법에 대한 표 1 참조) 얼음에 4 ° C에서 25 G 바늘과 1을 사용 용액까지 ㎖를 주사기를 볼 세포막 덩어리없이 눈으로 균질하다. 하나 이상의 펠릿 용해되고있는 경우, 단계 1.3.2에서 샘플을 풀링, 병렬로 아래에 하나의 펠렛에 대한 지침에 따라 각 샘플을 치료하기 위해 계속합니다. </li><li> 1 버퍼 2 ml의 1 미니 프로테아제 억제제 정제를 용해 (10 mM의 이미 다졸, 표 1 참조) FOS -choline (14) 세제를 결여 한 (단백질 분해 효소 억제제는 10 배 더 콘센트입니다이 시점에서 자신의 권장 희석보다 평가) 및 재현 탁 원유 막 펠렛 100 μl를 (단백질 분해 효소 억제제는이 시점에서 자신의 권장 희석에있다)를 추가합니다. 반전에 의해 5 시간마다 5 분을 혼합하여 45 ~ 60 분 동안 얼음에 설정합니다. </li><li> 원심 분리기는 125,000 XG, 4 ℃에서 25 분 동안 테이블 위에 초 원심 분리기에 원유 막 펠렛을 재현 탁. 용해 된 CFTR이 포함 된 상층 액을 유지하고 펠렛을 폐기합니다. </li></ol></li><li> 열 바인딩, 인산화 및 용출 <ol><li> 니켈 - NTA (니트릴 로트리 아세트산) 아가로 오스 슬러리 또는 버퍼 2 1 ml의 동등한 수지의 400 μL 세척 (10 mM의 이미 다졸을, 표 1 참조) 세제를 결여되는 용매 제거하고 4 ℃에서 버퍼링. 반복 세척 두 번 더. </li><li> (10 mM의 이미 다졸, 표 1 참조)를 버퍼 2로 10 ㎖의 총 가용화 CFTR, 나머지 프로테아제 억제제 (900 μL) 및 니켈 수지 (400 μL 슬러리로부터)을 겸용 wHICH는 추가 세제 없다. FOS -choline 14 농도는 효과적으로 (W / V)이 단계에서 0.2 %로 희석된다. 다수의 튜브가 있으면 가용화 CFTR, 프로테아제 저해제, 니켈 NTA 수지 0.2 %를 함유하는 모든 샘플을 풀 (W / V) -choline FOS-14이 때. 부드러운 흔들림 4 ° C에서 60 분 동안 품어. </li><li> 작은 선별 열 (표 1) 또는 이와 동등한 빈 열을 CFTR 프로테아제 억제제 - 니켈 NTA 솔루션을 전달합니다. </li><li> 버퍼 3의 초기 펠릿 당 4 ml로, 열에서 유지되는 니켈 NTA 수지, 세척 (10 mM의 이미 다졸 + DDM을, 표 1 참조) FOS -choline (14)이 부족하지만, 1 mM의 DDM (도데 실 말토 세제)를 포함, 4 ° C에서. DDM 세제의 추가는 크게 버퍼의 pH를 변경하지 않습니다. </li><li> 2,500 단백질 키나제 촉매 서브 유니트의 cAMP 의존성의 U (P 25 μL를 MgATP (5 mM의 최종 농도)을 첨가함으로써 PKA-MgATP 솔루션을 준비표 1 참조) 칼럼, 버퍼 3 (10 mM의 이미 다졸 + DDM의 475 μL에 KA). 캡 또는 파라 필름 컬럼의 하단을 밀봉하고, 사용 된 각 초기 펠릿 PKA-MgATP 용액 500 μl를 첨가하여 단​​백질을 인산화. </li><li> PKA는 니켈 NTA 수지의 전체 표면에 닿아 서되도록 부드럽게 혼합하고 1 ㎖의 피펫마다 2 분을 사용하여 수지의 부유로 20 분 동안 실온 (20 ℃ 온도) 부화. </li><li> 캡을 제거하고 열에서 PKA / MgATP 솔루션을 용출. 버퍼 3의 2 ㎖로 열을 씻으 (10 mM의 이미 다졸 + DDM; 표 1 참조) 4 ° C에서. </li><li> 허용 컬럼 완충액 4㎖를 첨가하여, 12 ° C에서 (표 1 참조 50mM의 이미 다졸 + DDM) 완충액 4 ㎖가이 번호 4. 세척 컬럼으로 실험에 사용 된 펠릿의 수를 곱 이 컬럼에 다음 4 mL를 추가를 통해 즉시 흐름합니다. </li><li&gt; 용출 1 버퍼 5 ㎖ (600 mM의 이미 다졸 + DDM; 표 1 참조)를 전달하여 단백질 열 건조 할 수 있도록 일시 정지하지 않고 한 번에 칼럼을 통해 1 ml에 사용되는 초기 펠릿 당 4 ° C에서, 그리고 하나의 튜브에 정제 CFTR을 포함하는 전체 용출액을 수집합니다. </li><li> 10 ml의 버퍼 (6)의 전체에, 이러한 재료 및 장비 또는 다른 유사한 장치의 표와 같이 (100,000 분자량 컷오프) 원심 분리 필터 장치를 이용하여 이미 다졸 및 저 분자량 저하 제품을 제거하는 단백질 샘플을 농축시켜 (75 mM의 KI + DDM는, 표 1 참조 2,000 XG에서 원심 분리하여,)와 4 ° C (예 : 비 요오드화 유출 실험에 대한 버퍼 7, 25 mM의 HEPES + DDM 표 1) 또는 1 mM의 DDM을 포함하는 선택의 다른 버퍼를 참조 샘플까지 약 20 분 200 μL에 집중하고 있습니다. 10 ml의 샘플을 희석 농도 단계를 반복합니다. 참고 : 우리의 경험에서 (미 출판), 이미 다졸 크게 INHICFTR의 ATP 아제 활성을 비트와 샘플 기능 측정에 사용되는 경우의 두 배 이상 희석 및 농축하여이 단계에서 제거되어야한다. </li><li> 농축 정제 CFTR를 수집합니다. 1~2일 내에서 사용할 때까지 DDM 버퍼의 존재에 4 ° C에서 보관 또는 재구성 단계로 즉시에 계속. 우리가 감소 활동을 관찰 우리의 경험에서와 같이 정제 된 단백질을 고정하지 마십시오. </li></ol></li></ol> CFTR의 2의 재구성 <ol><li> 지질 준비 주 : CFTR 성공적 에그 PC, POPC으로이 재구성 한 내용 : 1 달걀 PC (w / w) : POPC (1 : 1 w / w) 혼합물, 또는 PE의 혼합물 : PS : PC : 에르고, 5 : 2 : 2 : 1 (w / w). <ol><li> 요오드화 유출 실험 건조 에그 PC 5 ㎎ 들면 파이렉스 또는 다른 견고한 (비 붕규산 실온에서 20 분 동안 아르곤 기체 스트림하에 (25 ㎎ / ㎖ 스톡 200㎕를, 재료 및 장비의 표 참조) ) 유리관. </li><li> 280 nm에서 흡광도를 사용하여, ELISAssay 또는 다른 방법은, 정제 된 CFTR 단백질 시료의 농도를 추정한다. 하나의 지질 비율 : 300-1 : 3000에 충분한 신호를 생성하기 위해 (w / w) 야생형 CFTR와 요오드화 유출 실험을 위해, 단백질을 사용한다. 유출 활성을 검출하기 위해 1,200 (w / w) : 200-1 : 1 정도의 비율 지질 : G551D- 및 F508del-CFTR 들어, 단백질을 사용한다. </li><li> 각각의 특정 시스템에 대한 지질 비율 : 단백질을 최적화합니다. 필요한 정제 된 단백질의 양을 계산한다. 버퍼의 부피 = (필요한 단백질 용액의 부피) - 1 ㎖, 즉, 1 ml의 최종 부피를 위해 필요한 1 ㎜ DDM와 버퍼의 양을 계산한다. <ol><li> 건조 된 지질을 1 mM의 DDM으로 원하는 버퍼 시스템의 볼륨을 추가 계산 (그러나 이때 CFTR 단백질을 추가하지 않는 것) 파라 필름 유리관을 커버. 요오드 유출 실험을 위해, 버퍼 (6) 지질 재현 탁 (75 mM의 KI + DDM을, 표 1 참조). 다른 실험은 버퍼 8 재현 탁를 들어 (25 mM의 HEPES + DDM 참조표 1) 또는 1 mM의 DDM을 포함한 다른 원하는 내부 버퍼. </li><li> 실온에서 2 분 동안 와동 DDM 버퍼 지질의 현탁액에 도움. 이와 달리, 전 텍싱 1-2 분 동안 37 ° C까지 샘플을 가열한다. </li></ol></li><li> 더 리피드 필름 튜브의 측면에 보이지 않을 때까지 1ml의 주사기 25 G 바늘을 실온에서 반복적 지질 서스펜드. 미세한 기포를 생성 및 요오드화 지질의 산화에 도움 것이다 용액에 공기를 주입하지 마십시오. </li><li> 파라 필름의 중단 지질 목욕 초음파기 포함 얼음에 20 초 버스트에 대한 튜브를 적용 초음파 처리 한 후 1 분 동안 얼음에 바로 전송할 수 있습니다. 3 번 반복합니다. 참고 : 강렬한 초음파 산화로 인해 노란색 요오드 솔루션을집니다. 따라서 과도한 초음파을 피하십시오. 색상 변경에 대한 샘플을 모니터링합니다. 색상 변화가 주목되는 경우, 샘플을 폐기하고 다시 준비. 때문에 일부의 산화 색상의 변화요오드화 동일한 조건에서 지질의 산화를 초래할 것이다. 솔루션 초음파를하기 전에 아르곤 가스 튜브의 공기를 변위하는 지질과 요오드의 산화를 방지하는 데 도움이됩니다. 강렬한 초음파의 품질이 좋지 또는 샘플의 손실이 발생 긁힌 유리 튜브를 중단 할 수 있습니다. </li><li> 1 ml의 최종 부피를 달성에 초음파 지질 샘플 단계 2.1.3에서 계산 된 정제 CFTR의 볼륨을 추가합니다. 25 G 바늘과 1 ml를 주사기로 재​​ 부상 10 회 지질 및 세제 용액으로 단백질을 섞는다. </li><li> 튜브의 소용돌이와 함께 30 분 동안 얼음에 설정 지질과 단백질 샘플은 5 시간 5 분마다 혼합합니다. </li></ol></li><li> 세제 결합 열 준비를 <ol><li> 1 ml의 볼륨 용량의 단일 사용 상업 세제 결합 스핀 열 (재료 및 장비의 표 참조)를 얻어 열이 흐르는 시작 하단 탭을 휴식. </li><li> 저장 B를 제거하기 위해 2,000 XG에서 2 분 동안 열을 원심 분리기uffer는,이 버퍼를 폐기합니다. </li><li> 버퍼 (7)의 5 ㎖ 추가 컬럼 (75 mM의 KI를, 표 1 참조) 한 후 세척 완충액을 용리 4 분 동안 200 XG 원심 분리기. 저장 버퍼의 모든 흔적을 제거하는 세척의 3​​ 단계를 총 2 회 더 반복한다. 모든 흐름을 통해 폐기하십시오. 참고 : 열을 세척하는 데 사용되는 버퍼가 DDM 또는 다른 세제를 포함하지 않는 것이 중요합니다. 열은 세제 유한 결합능을 가지고 있으며, 세제를 함유하는 완충액을 사용하는 경우, 열은 단백질 - 지질 세제 샘플로부터 세제를 제거하는 데 효과적 일 것이다. </li><li> 조심스럽게 열 수지의 상부에 세제의 지질 단백질의 모든 샘플을 1ml의 분취 실온에서 2 분 동안 열 상단 샘플을 배양한다. </li><li> 2000 XG에서 4 분 동안 실온에서 원심 분리 샘플을 깨끗한 1.5 ml의 마이크로 원심 분리 또는 제 2 튜브에서 흐린 proteoliposome 샘플 또는 유리관을 수집하고 SAM을 배치얼음에 있도 록. </li><li> 칼럼의 상부에 200 ㎕의 버퍼 (7) (75 mM의 KI, 표 1) 또는 (세제)없이 다른 버퍼를 첨가하여 컬럼에 잔류 테오 모아서 2 분 동안 원심 분리 단계를 반복한다. </li><li> 이 흐린 보이는 경우 proteoliposome 샘플에 두 번째 용출액을 추가합니다. </li><li> 밤새 4 ° C에서 샘플을 보관 또는 요오드 유출 측정을 위해 즉시 사용할 수 있습니다. </li></ol></li></ol> 정화, 재구성 된 CFTR 3. 요오드 유출 측정 <ol><li> proteoliposomal 막에서 요오드화 그라데이션의 생성 <ol><li> 버퍼 (9)에 사전 팽윤 세파 덱스 G50 비즈 (약 5 g 건조 비드 50 ㎖ 완충액) 또는 원하는 외부 버퍼 실온에서 적어도 2 시간 동안 또는 4에서, (75 mM의 K-Glu가 칼륨 글루타메이트, 표 1 참조) 밤새 C를 °. </li><li> 버퍼 포화 9 넷 세파 덱스 G50 컬럼을 준비 또는 다른 (K-75 mM의 글루을, 표 1 참조)¾ 적어도 열 전체 수지를로드하여 작은 심사 열의 버퍼. </li><li> 수지의 과도한 버퍼를 제거하기 위해 2,000 XG에서 4 분 동안 원심 분리기. 원심 분리 단계의 끝에 컬럼에 충전 수화 된 수지의 약 2.25 ml를이 있어야한다. 참고 : 수지가 가볍게 수화하지만 액체에 담근 다음 간단한 스핀 버퍼의 상당한 볼륨을 용출 안되지해야합니다. 따라서, 칼럼 수지도 너무 젖은도 너무 건조하고, 사용자가 가장 성공적인 버퍼 교환 조건 숙지하기 위해 열을 실험 할 수도있다 proteoliposome 샘플의 성공적인 용출 중요하다. </li><li> 조심스럽게 2,000 x g에서 4 분 동안 각 컬럼 및 원심 분리기의 상단에 proteoliposome 샘플의 125-150 μl를 추가합니다. </li><li> 풀 proteoliposome는 요오드 유출 또는 다른 실험에서 즉시 사용할 수 있도록 함께 용출액. 주 : 각 컬럼에서 용출 된 볼륨은 대략해야150 μL 샘플은 다소 흐린하지만, 원래의 샘플보다 흐린해야합니다. 큰 볼륨이나 명확한 용출액은 열이 충분히 건조되지 않은, 또는 너무 많이, 각각 건조되었으며, 성공적인 요오드 유출 실험이 유발되지 않음을하는 것이 좋습니다. </li></ol></li><li> 요오드 유출 분석 <ol><li> 광범위하게 탈 이온수와 (재료 및 장비 표) 요오드화 선택적 미세 전극을 세척 한 다음 버퍼 (10)의 실험 전에 20 분 동안 품어 (15 μM KI, 표 1 참조). 탈 이온수로 다시 광범위하게 전극을 세척 할 것. </li><li> 버퍼 9 (분석에서 10 μM의 최종 농도를 생성하기 위하여 20 μM 전형적인 농도) 약 150 μl를 추가 96- 웰 플레이트의 한 웰에 완충액 9 또는 비히클 (75 mM의 K-의 Glu가, 표 1 참조) 작은 벼룩 교반 막대와. <ol><li> 현재 기포가 없는지 확인합니다. 길잃를 제거하기 위해 피펫 팁을 사용하여거품. 약액이 사용되는 경우, 웰의 최종 DMSO 농도는 ((대표적으로 0.1-0.2 % V / V))로 1 % 이하 (V / V)인지 확인. </li></ol></li><li> 버퍼 9의 섹션 3.1에서 생성 된 재구성 CFTR 단백질 150 μL를 추가 플레이트의 웰에 300 ㎕의 총 부피를 생성하기 위해, 약물 또는 완충액 웰 (75 mM의 K-의 Glu를, 표 1 참조). </li><li> 볶음 접시에 96 웰 플레이트를 놓고 130 rpm에서 (또는 약 ¼ 최대 속도의 완만 한 속도로) 약동하십시오. </li><li> 조심스럽게 끝이 아니라 하단을 터치하지 않거나 교반 막대 박히는 있도록 샘플 우물에 요오드화 선택성 전극의 끝 부분을 삽입합니다. 기준 전극은, 별도의 경우, 잘 용액과 접촉도 있는지 확인합니다. </li><li> 전극과의 인터페이스가 집에서 만든 또는 상업용 컴퓨터 프로그램을 사용하여 기록 트레이싱 (자세한 재료 표 및 장비 참조).로우 패스 필터를 통해 신호의 필터링이 Hz의 샘플링 레이트를 사용한다. </li><li> 샘플을 촬영하면서는 평평한, 또는 가까운 평면 기준을 생산하는 5 분 동안 평형을 허용합니다. </li><li> 3 μL MgATP (KOH와 dH보다 2 O에서 준비하고 pH를 7로 조정 100 mM의 주식을 1 mM의 최종 농도) 추가 샘플이 단백질을 활성화합니다. ~ 5 분 안정된 새 기준에 도달 할 수 있습니다. 항상 외부 버퍼의 pH의 변화를 방지하기 위해 사용하기 전에 중립에 100 mM의 MgATP 주식의 pH를 조정합니다. </li><li> CFTR을 통해 요오드화 선택적 전도에 의해 생성 된 전위차의 변화를 션트 샘플 (20 nM의 최종 농도 2 μM) 주식을 발리 노마 이신 (Valinomycin)의 3 μl를 추가합니다. 5 분 이상으로 인해 CFTR 매개 요오드 유출 활동의 감소 기울기 (MV 감소)을 기록한다. </li><li> , proteoliposome 루멘의 요오드화 트래핑이 충분 있도록 10 %의 3 μl를 추가하려면 (v / v)의 트리톤 X-100 샘플. Significant 즉시 요오드화 자료는 충분한 요오드가 트래핑하는 3.2.9 결정 기울기의 변화가 아니라 CFTR 중재 활동에 대한 제한 요인이 아니었다하도록 소포에 갇혀되었음을 나타냅니다. </li><li> 이 시약의 모든 흔적이 다음 샘플의 오염을 방지하기 위해 제거 된 확인하기 위해 약물 또는 트리톤 X-100과 샘플의 치료 후 탈 이온수로 깨끗이 전극과 교반 막대를 씻으십시오. </li><li> 완충액 나노 몰 범위 9 마이크로 KI 묽은 농도의 일련의 준비 (K-Glu가 버퍼, 표 1 참조). 제조 높은 농도 0 내지 각 농도 전극의 MV 반응을 기록한다. 프로브 응답 (MV)를 몰 농도의 요오다 이드 대 로그 플롯 표준 곡선을 작도. 릴리스 요오드화 농도 유출 실험 동안 프로브 응답 MV 변환 표준 곡선을 사용한다. 참고 : 교정 똥개 준비사용자가 확신 할 때까지 매주 적이 얼마나 빨리 변경 프로브 응답. 시간에 따른 프로브 응답 및 감도 편차가있을 것이다. 프로브 노화되므로, 반응은 저하된다. 이것은 부분적으로 주기적으로 변화하는 내부 솔루션을 사용 후 물에 프로브 팁의 광범위한 세정, 표면에 프로브 분자의 부착 가능성 한계에 의해 폐기 될 수있다. </li><li> MgATP의 추가 전에 마지막 30 초 동안 각 proteoliposome 샘플에 대한 시간 플롯 대 농도의 라인의 평균 기울기를 결정하고 발리 노마 이신 (Valinomycin)을 첨가 한 후하지만 트리톤 X-100을 첨가하기 전에. 그 샘플에 대한 CFTR 매개 요오드 유출 행동을 결정하기 위하여 발리 노마 이신 (Valinomycin)에서 기준 기울기를 뺍니다. </li></ol></li></ol>

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R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Purification+and+characterization+of+recombinant+cystic+fibrosis+transmembrane+conductance+regulator+from+Chinese+hamster+ovary+and+insect+cells.">Purification and characterization of recombinant cystic fibrosis transmembrane conductance regulator from Chinese hamster ovary and insect cells.</a> J. Biol. Chem. 270 (28), 17033-17043 (1995).</li><li>Ryan, L., Rimington, T., Cant, N., Ford, R. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Expression+and+purification+of+the+cystic+fibrosis+transmembrane+conductance+regulator+protein+in+Saccharomyces+cerevisiae.">Expression and purification of the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator protein in Saccharomyces cerevisiae.</a> JoVE. (61), (2012).</li><li>Ostedgaard, L. S., Welsh, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Partial+purification+of+the+cystic+fibrosis+transmembrane+conductance+regulator.">Partial purification of the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator.</a> J Biol Chem. 267 (36), 26142-26149 (1992).</li><li>Peng, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=One-step+affinity+isolation+of+recombinant+protein+using+the+baculovirus/insect+cell+expression+system.">One-step affinity isolation of recombinant protein using the baculovirus/insect cell expression system.</a> Protein Expr Purif. 4 (2), 95-100 (1993).</li><li>Ramjeesingh, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+novel+procedure+for+the+efficient+purification+of+the+cystic+fibrosis+transmembrane+conductance+regulator+(CFTR).">A novel procedure for the efficient purification of the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR).</a> Biochem J. 327 (1), 17-21 (1997).</li><li>Rosenberg, M. F., Kamis, A. B., Aleksandrov, L. A., Ford, R. C., Riordan, J. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Purification+and+crystallization+of+the+cystic+fibrosis+transmembrane+conductance+regulator+(CFTR).">Purification and crystallization of the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR).</a> J Biol Chem. 279 (37), 39051-39057 (2004).</li><li>Ramjeesingh, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Purification+and+reconstitution+of+epithelial+chloride+channel+cystic+fibrosis+transmembrane+conductance+regulator.">Purification and reconstitution of epithelial chloride channel cystic fibrosis transmembrane conductance regulator.</a> Methods Enzymol. 294, 227-246 (1999).</li><li>Sorscher, E. J., Sommerfelt, M. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Purification+of+recombinant+protein+derived+from+the+baculovirus+expression+system+using+glutathione+affinity+agarose.">Purification of recombinant protein derived from the baculovirus expression system using glutathione affinity agarose.</a> Methods Mol Biol. 3, 337-348 (1995).</li><li>Eckford, P. D., Li, C., Ramjeesingh, M., Bear, C. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cystic+fibrosis+transmembrane+conductance+regulator+(CFTR)+potentiator+VX-770+(ivacaftor)+opens+the+defective+channel+gate+of+mutant+CFTR+in+a+phosphorylation-dependent+but+ATP-independent+manner.">Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) potentiator VX-770 (ivacaftor) opens the defective channel gate of mutant CFTR in a phosphorylation-dependent but ATP-independent manner.</a> J Biol Chem. 287 (44), 36639-36649 (2012).</li><li>Alkhouri, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Synthesis+and+properties+of+molecular+probes+for+the+rescue+site+on+mutant+cystic+fibrosis+transmembrane+conductance+regulator.">Synthesis and properties of molecular probes for the rescue site on mutant cystic fibrosis transmembrane conductance regulator.</a> J Med Chem. 54 (24), 8693-8701 (2011).</li><li>Eckford, P. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=VX-809+and+Related+Corrector+Compounds+Exhibit+Secondary+Activity+Stabilizing+Active+F508del-CFTR+after+Its+Partial+Rescue+to+the+Cell+Surface.">VX-809 and Related Corrector Compounds Exhibit Secondary Activity Stabilizing Active F508del-CFTR after Its Partial Rescue to the Cell Surface.</a> Chem Biol. 21 (5), 666-678 (2014).</li><li>Kim Chiaw, P., Wellhauser, L., Huan, L. J., Ramjeesingh, M., Bear, C. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+chemical+corrector+modifies+the+channel+function+of+F508del-CFTR.">A chemical corrector modifies the channel function of F508del-CFTR.</a> Mol.Pharmacol. 78 (3), 411-418 (2010).</li><li>Verkman, A. S., Galietta, L. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chloride+channels+as+drug+targets.">Chloride channels as drug targets.</a> Nat Rev Drug Discov. 8 (2), 153-171 (2009).</li><li>Pasyk, S., Li, C., Ramjeesingh, M., Bear, C. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Direct+interaction+of+a+small-molecule+modulator+with+G551D-CFTR,+a+cystic+fibrosis-causing+mutation+associated+with+severe+disease.">Direct interaction of a small-molecule modulator with G551D-CFTR, a cystic fibrosis-causing mutation associated with severe disease.</a> Biochem J. 418 (1), 185-190 (2009).</li><li>Norez, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Determination+of+CFTR+chloride+channel+activity+and+pharmacology+using+radiotracer+flux+methods.">Determination of CFTR chloride channel activity and pharmacology using radiotracer flux methods.</a> J Cyst Fibros. 3 (2), 119-121 (2004).</li><li>Whitney, J. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Structural+basis+for+alginate+secretion+across+the+bacterial+outer+membrane.">Structural basis for alginate secretion across the bacterial outer membrane.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 108 (32), 13083-13088 (2011).</li><li>Islam, S. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Proton-dependent+gating+and+proton+uptake+by+Wzx+support+O-antigen-subunit+antiport+across+the+bacterial+inner+membrane.">Proton-dependent gating and proton uptake by Wzx support O-antigen-subunit antiport across the bacterial inner membrane.</a> mBio. 4 (5), e00678-e00613 (2013).</li><li>Ramjeesingh, M., Conn, P. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ch.+16.">Ch. 16.</a> Reliable Lab Solutions: Essential Ion Channel MethodsReliable Lab Solutions. , 337-357 (2010).</li><li>Wellhauser, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+small-molecule+modulator+interacts+directly+with+deltaPhe508-CFTR+to+modify+its+ATPase+activity+and+conformational+stability.">A small-molecule modulator interacts directly with deltaPhe508-CFTR to modify its ATPase activity and conformational stability.</a> Mol Pharmacol. 75 (6), 1430-1438 (2009).</li><li>Lee, S. Y., Letts, J. A., MacKinnon, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Functional+reconstitution+of+purified+human+Hv1+H++channels.">Functional reconstitution of purified human Hv1 H+ channels.</a> J Mol Biol. 387 (5), 1055-1060 (2009).</li><li>Chang, X. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Protein+kinase+A+(PKA)+still+activates+CFTR+chloride+channel+after+mutagenesis+of+all+10+PKA+consensus+phosphorylation+sites.">Protein kinase A (PKA) still activates CFTR chloride channel after mutagenesis of all 10 PKA consensus phosphorylation sites.</a> J. Biol. Chem. 268 (15), 11304-11311 (1993).</li><li>Gadsby, D. C., Nairn, A. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Regulation+of+CFTR+Cl-+ion+channels+by+phosphorylation+and+dephosphorylation.">Regulation of CFTR Cl- ion channels by phosphorylation and dephosphorylation.</a> Adv.Second Messenger Phosphoprotein Res. 33, 79-106 (1999).</li><li>Li, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=ATPase+activity+of+the+cystic+fibrosis+transmembrane+conductance+regulator.">ATPase activity of the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator.</a> J Biol Chem. 271 (45), 28463-28468 (1996).</li><li>Ma, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Thiazolidinone+CFTR+inhibitor+identified+by+high-throughput+screening+blocks+cholera+toxin-induced+intestinal+fluid+secretion.">Thiazolidinone CFTR inhibitor identified by high-throughput screening blocks cholera toxin-induced intestinal fluid secretion.</a> J Clin Invest. 110 (11), 1651-1658 (2002).</li><li>Kopeikin, Z., Sohma, Y., Li, M., Hwang, T. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=On+the+mechanism+of+CFTR+inhibition+by+a+thiazolidinone+derivative.">On the mechanism of CFTR inhibition by a thiazolidinone derivative.</a> J Gen Physiol. 136 (6), 659-671 (2010).</li><li>Wang, X. F., Reddy, M. M., Quinton, P. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effects+of+a+new+cystic+fibrosis+transmembrane+conductance+regulator+inhibitor+on+Cl-+conductance+in+human+sweat+ducts.">Effects of a new cystic fibrosis transmembrane conductance regulator inhibitor on Cl- conductance in human sweat ducts.</a> Exp Physiol. 89 (4), 417-425 (2004).</li></ol>

저자는 여기에 설명 된 정제 방법의 개발 과정에서 박사 Mohabir Ramjeesingh의 조언을 인정합니다. 이 연구는 건강 연구 (CIHR)과 낭성 섬유증 캐나다 (CFC)의 캐나다 연구소에서 CEB에 운영 보조금에 의해 지원되었다. PDWE는 CIHR 및 CFC를 통해 친목 상에 의해 부분적으로 지원되었다. 저자는 낭포 성 섬유증 재단 치료학 (CFFT)에 의해 보정, 강화제 박사 R. 교량 (의학 로잘린 대학과 과학)에서 억제제 화합물 및 유통의 제공을 인정합니다. 저자는 또한 배큘로 바이러스 시스템을 사용하여 중량 및 돌연변이 CFTR 단백질을 발현의 베일러 세포 배양 시설 (NIH 보조금 P30의 CA125123)에 의해 우수한 서비스를 인정합니다. 비활성 VX-770 아날로그, V-09-1188은, 버텍스 제약의 선물했다.

셀룰러 과발현 다양한 시스템에서, 전체 길이, 작용 성 CFTR 분리 정제를위한 프로토콜의 수가 제한되어왔다. 이 ATP 아제와 평면 이중층 단일 채널 측정을 포함한 채널 기능의 직접 측정을 포함하여 분석에 매우 기능적인 WT-CFTR 또는 적당한 양의 F508del- 및 G551D-CFTR의 높은 농축의 신속한 정화이 허용 여기에 설명 된 방법이 유리하다 작은 분자 19-21의 연구 관련성이 높은 시스템과 CFTR 인구 ?...

폐, 대장, 췌장 및 땀 분비 등의 조직에서 상피 세포의 세포막에 걸쳐 염화 수송은 주로 ABC의 낭포 성 섬유증 막 횡단 전도력 레귤레이터 (CFTR), ATP- 인산화 조절 부재 (ATP-에 의해 매개된다 검토 한 막 단백질의 카세트) C 아과 ()를 바인딩. ABCC 서브​​ 패밀리의 다른 구성원과 마찬가지로, CFTR는 뉴클레오티드 결합 도메인은 단일에 적당한 ATP 아제 활성을 갖는다 (NBDs)의 계면에서 형성된 2 개의 뉴클레오티드 결합 부위에서 ATP 결합 큰, 멀티 - 스패닝 막 관통 단백질 인 사이트. 그러나 다른 ABCC 아과 멤버는 달리, CFTR는 고유의 규제 CL 채널로보다는 활성 용질 수송로 진화하고있다. morbi로 이어지는 CFTR 원인 낭포 성 섬유증, 폐, 위장관, 췌장 및 생식 기관을 포함한 여러 장기에 영향을 미치는 질병의 돌연변이,젊은 성인에서 dity과 사망률. 폐 질환은 일반적으로 전도성의기도 상피 표면에 CFTR 기능의 손실에 의해 발생 낭포 성 섬유증의 조기 사망에 대해 대부분의 경우에 차지한다. 호흡 섬모 상피의 선 단면 상에 유체 층을 수정 상피 표면을 가로 질러 물 운동 - CFTR 클로라이드 채널 활동의 부족 모두 CL의 감소를 야기한다. 이는 호흡 섬모 상피 세포의 기능을 손상 점성기도 표면 액체 초래기도 밖으로 효과적으로 병원체 클리어. 결과적으로, 대부분의 환자는 CF 폐 염증 및 감염으로 인한 폐 손상의 재발 발작 겪는다. 예상 한 바와 같이, 통상 CFTR 단백질의 작용 기전에 대한 연구는 주로 그 채널 게이팅 전기 생리 활성의 상세한 연구에 초점을 맞추었다. 단일 채널 연구 PKA 의존 CL 직접적 CFTR 그 기능을 보여 주었다- ATP 규제 게이트 2를 보유 채널. 연구되었다 특정 단일 채널의 특성 때문에 전체 CFTR 채널들의 모집단과 단일 채널의 반사 있는가에 대해 상세한 전기 생리학 연구 단일 CFTR 채널 1,3에 많은 정보를 제공하지만 우려가있을 수있다 결과는 항상 거시적 인구를 공부하는 방법과 함께 고려되어야한다. 정제 CFTR의 인구 채널 활동을 직접 분석은 질병 유발 돌연변이와 연관된 분자 결함에 대한 통찰을 제공하는 화학 조절제 수리 CFTR 돌연변이 단백질의 발견을 구동 할 수있는 잠재력을 갖는다. 현재까지, 낭포 성 섬유증 (4)을 야기하는 것으로 생각 CFTR 1,900 상이한 돌연변이 초과있다. 북미와 유럽에서 환자의 약 90 %에서 적어도 하나의 대립 유전자에서 발견 된 주요 돌연변이, F508del-CFTR은 단백질을 미스 폴딩 리드소포체 5 차 보유. F508del-CFTR은 결함이 채널 활동 6-9를 포함하여 다른 결과를 가지고 있습니다. 세포 표면에서 CFTR의 생성 부재 중증 질환과 연관된다. G551D-CFTR, 덜 일반적인 돌연변이가 제대로 아직 접힌 세포 표면 (6)에 염화 채널로 기능 장애하다 생각된다. 소분자 보정기 및 강화제의 개발은 각각 세포 표면 상에 존재하는 폴딩 및 / 또는 세포 표면에 F508del-CFTR 같은 돌연변이 매매 및 - 증대 보정이나 G551D 같은 돌연변이 채널 활성을 증가시키는 목적을 갖는다 . 150 mg의 CF 환자&gt; 육년 적어도 하나의 G551D와의 모든 12 시간에서 사용되는 VX-770) 보정기 VX-809과 VX-661 (아직 환자에 사용하기 위해, 강화제 Kalydeco (ivacaftor을 승인하지 않은 상태 -CFTR 돌연변이, 그리고 최근 환자 G178R, S549N, S549R, G551S, G1244E, S1251N, S1255P 중 하나및 G1349D. Kalydeco CF는 질환의 임상 열 대책이 작은 분자의 작용하지만 저조한기구에 사용하기위한 환자의 FDA 승인시의 이해되었다 안전하고 개선 결과 모두이다. CFTR 정제 방법 중 소수의 완료 이전에 상당한 시간을 필요로하는 많은 어느 2,11-18을 설명되었다. 최근 출판 (19), 고유 신속한 정제 및 재구성 방법은 S의 F 9 세포 발현 시스템에서 과발현 CFTR에 기술하고, 정의 된 지질 시스템에서 정제 된 단백질은 CFTR의 인구 CFTR 할라이드 채널 활성 분석법을 개발하는 데 사용 된 분자. 분석은 CFTR 기능에 인산화, 뉴클레오티드 억제제의 알려진 효과를 되풀이. 시스템의 강화제의 효과 심문을 사용 하였다 VX-770 / Kalydeco는 중량 (야생형)에, 그리고 F508del- G551D-CFTR 그리고 제 보여주는 바와약물에 인구의 관점에서 CFTR 및 뉴클레오티드와 작은 분자와 돌연변이의 상호 작용의 연구에 이러한 방법의 유용성과 적용 가능성을 입증, ATP 독립적 인 방식으로 자사의 채널 활동을 강화시키는 데 CFTR 단백질과 직접 상호 작용 시간 단백질에 대한 임상 적 질문에 대한 답변. 방법은 또한 다른 분자 강화제 및 이들의 유도체 (20)뿐만 아니라, 단백질의 활성 (21)에 작은 분자 보정기의 효과를 연구하기 위해 사용되었다. 유출 분석은 이전에 전극, 방사성 트레이서 형광체 (22, 23)를 사용하여 전체 세포 분석법, 이온 선택성 전극 (24)과 막 소체 포함 CFTR 돌연변이 활성 및 그 활성에 CFTR - 조절 성 화합물의 효과를 조사하기 위해 많은 연구에서 사용되어왔다 , 방사성 추적자 (25) 재구성 CFTR을 정제 하였다. 그러나 토륨정제 재구성 CFTR을 연구하는 이온 선택성 전극의 전자 사용은 먼저 최근 19보고되었다. 현재의 방법은 적응 재구성 녹농균, 공통 CF 병원균 두 막 단백질의 기능적 특성화를 위해 사용되어왔다. 요오드화 유출 측정과 결합 그래피 ALGE 외막 단백질의 재구성이 음이온 수송 체 (26)를 통해 알긴 분비 모델을 지원하기 위해 사용되었다. 재구성 요오드 유출 측정 모델 (27)에 의해 단백질이 세균 내막 걸쳐 지질 결합 당사슬 전좌에 대한 H + antiport 의존적 메카니즘을 제시한다고 제안 될 수 Wzx 단백질 정제에 적용 하였다. 하나는 기본 기판 예상보다 두 경우 요오드화 낮은 스루풋이라도 음이온 기판 용 대용으로 사용 하였다. 이 방법은 C와 다른 단백질에 대한 적응에 적합 할 수있다음이온 기판에 대한 ationic 전송 또는 전도 경로. 여기서 빠른 정제 절차 CFTR 단백질 및 지질의 정의 테오으로의 재구성을 위해 설명된다. 신속한 재구성 절차를 용이하게 정제에 사용되는 세제의 종류 여기에서 사용 된 방법에 의해 제거 의무 또는 재구성 절차 전에 적합한 세제 교환 될 수 있음을 제공하는 다른 방법으로 정제 CFTR 함께 사용하도록 맞추어 질 수있다. 정제 및 재구성 CFTR 단백질의 채널 활성을 측정하는 요오드화 유출 방법은 상세하게 설명되고,이 방법으로부터 얻을 수있는 몇 가지 전형적인 결과가 제시된다.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="1269">
	<tbody>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:403px;">fos-choline 14 detergent</td>
			<td style="width:515px;">Anatrace Affymetrix (www.anatrace.affymetrix.com)</td>
			<td style="width:145px;">F312</td>
			<td style="width:207px;">Affymetrix: Anatrace Products; CAS#&#160;:77733-28-9</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">cOmplete EDTA-free protease inhibitor cocktail tablets</td>
			<td>Roche (www.roche-applied-science.com)</td>
			<td>04 693 132 001</td>
			<td>EDTA-free Protease inhibitor cocktail tablets (1 in 50 ml or mini:1 in 10 mL) (Roche Diagnostics GmbH; Ref: 11873 580 001</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">cOmplete ULTRA Tablets, Mini, EDTA-free, EASYpack&#160;</td>
			<td>Roche (www.roche-applied-science.com)</td>
			<td>05 892 791 001</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Ni-NTA Agarose</td>
			<td>Qaigen GmbH</td>
			<td align="right">1018240</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Fisherbrand Screening columns</td>
			<td>Fisher Healthcare</td>
			<td>11-387-50</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Amicon Ultra Centrifugal filters, Ultracel-100K</td>
			<td>Millipore (www.millipore.com)</td>
			<td>UFC910008</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">cAMP-Dependent Protein Kinase A (PKA), Catalytic Subunit</td>
			<td colspan="2">New England Biolabs (www.neb.com/products/p6000-camp-dependent-protein-kinase-pka-catalytic-subunit)</td>
			<td>Peirce PKA is also suitable</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">PC, Chicken Egg</td>
			<td>Avanti Polar Lipids (www.avantilipids.com)</td>
			<td>840051C</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">POPC</td>
			<td>Avanti Polar Lipids (www.avantilipids.com)</td>
			<td>850457C</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">PS, Porcine Brain</td>
			<td>Avanti Polar Lipids (www.avantilipids.com)</td>
			<td>840032C</td>
			<td>(CFTR has been successfully reconstituted into Egg PC, POPC, 2:1 (w/w) Egg PC:POPC, or a mixture of PE:PS:PC:ergosterol, 5:2:2:1 (w/w))</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">PE, Chicken Egg</td>
			<td>Avanti Polar Lipids (www.avantilipids.com)</td>
			<td>841118C</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Ergosterol</td>
			<td>Sigma (www.sigmaaldrich.com)</td>
			<td align="right">45480</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Pierce Detergent removal spin column</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td align="right">87779</td>
			<td>1 ml capacity columns</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">valinomycin</td>
			<td>Sigma (www.sigmaaldrich.com)</td>
			<td>V-0627</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">VX-770 (ivacaftor)</td>
			<td>Selleck Chemicals</td>
			<td>S1144</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">iodide selective microelectrode</td>
			<td>Lazar Research Laboratories (www.shelfscientific.com/cgi-bin/tame/newlaz/microionn.tam)</td>
			<td>LIS-146ICM</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Clampex 8.1 software</td>
			<td>Axon Instruments (www.axon.com)</td>
			<td></td>
			<td>we use components of the ClampX system with a home made filter to monitor and record the response to our electrode</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Alternate Software: ArrowLabb System&#160;</td>
			<td>Lazar Research Laboratories (www.shelfscientific.com/cgi-bin/tame/newlaz/ionsystems.tam)</td>
			<td>LIS-146LICM-XS</td>
			<td>Lazar Research sells a meter that can interface with a computer and software to record the probe response.&#160; This software should serve a similar function to our setup</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">small stir bars</td>
			<td>Big Science Inc (www.stirbars.com)</td>
			<td>SBM-0502-CMB</td>
			<td>choose a stir bar small enough to easily fit into a well of a 96-well plate</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Sephadex G50, fine</td>
			<td>GE Health Care (www.gelifesciences.com)</td>
			<td>17-0042-01</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">Sonicator</td>
			<td>Laboratory Supplies Co, Inc.</td>
			<td>G112SP1G</td>
			<td>Bath sonicators from other manufacturers should also be suitable</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

functional reconstitution and channel activity measurements of purified wildtype and mutant cftr protein

낭포 성 섬유증 막 횡단 전도력 레귤레이터 (CFTR)는 수송의 카세트 (ABC) 상과 바인딩 ATP의 고유 채널 형성 부재이다. CFTR의 인산화 및 뉴클레오티드 종속 클로라이드 채널 활성은 전 세포 자주 시스템 및 절제된 막 패치에서 단일 채널로 검토되고있다. 많은 낭포 성 섬유증을 유발하는 돌연변이 활성이 변화하는 것으로 나타났다. 정제 프로토콜 소수 게시되었지만, 채널 활성을 유지 빠른 재구성 방법 및 정화 시스템에 인구 채널 활동을 연구하기위한 적절한 방법이 결여되어있다. 여기서 빠른 방법 규제 할라이드 채널로서의 활성을 보유 정의 지질 조성물의 테오로 정제 및 전장 CFTR 단백질의 기능적 재구성을 위해 설명된다. 함께 채널 활성의 신규 한 플럭스 계 분석법이 재구성 방법에 적합한 시스템이다야생형 CFTR의 인구 채널 특성 및 질병을 일으키는 돌연변이 F508del- 및 G551D-CFTR 공부. 구체적으로, 상기 방법은 인산화, 뉴클레오티드 및 CFTR 채널 활동에 강화제와 같은 작은 분자 억제제의 직접적인 영향을 연구하는 유틸리티를 갖는다. 방법은 또한 음이온 기판 다른 막 채널 / 수송의 연구 의무가 있습니다.

이 기록 문서에 설명은, 정화 재구성 및 CFTR 단백질의 조절 채널 활동을 측정하는 방법이 있습니다. 1a는 정제, 재구성 및 요오드화 유출 절차에 대한 워크 플로우를 보여줍니다. 요오드화 플럭스에 의해 재구성 된 채널 활동 및 측정을위한 방법이 또한 관련 영상보다 상세히 도시되어있다. 테오에 CFTR의 정제 및 재구성 CFTR 기능?...

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Functional Reconstitution and Channel Activity Measurements of Purified Wildtype and Mutant CFTR Protein

여기서 설명하는 낭포 성 섬유증에 결함이 클로라이드 채널에 대한 활성을 유지 정제 야생형 및 돌연변이 CFTR 단백질의 기능적 재구성을위한 신속하고 효율적인 절차이다. CFTR 의해 매개 재구성 테오에서 요오드화 유출 채널 활성의 연구 및 작은 분자의 효과를 허용한다.

정제 된 야생형과 돌연변이 체 CFTR 단백질의 기능의 재구성 및 채널 활동 측정

The Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator (CFTR) is a unique channel-forming member of the ATP Binding Cassette (ABC) superfamily of ...

functional-reconstitution-channel-activity-measurements-purified

Research

JoVE Journal

Biology

12.1K 조회수.  Hospital for Sick Children.  여기서 설명하는 낭포 성 섬유증에 결함이 클로라이드 채널에 대한 활성을 유지 정제 야생형 및 돌연변이 CFTR 단백질의 기능적 재구성을위한 신속하고 효율적인 절차이다. CFTR 의해 매개 재구성 테오에서 요오드화 유출 채널 활성의 연구 및 작은 분자의 효과를 허용한다. 

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Staining of Proteins in Gels with Coomassie G-250 without Organic Solvent and Acetic Acid

In classical protein staining protocols using Coomassie Brilliant Blue (CBB), solutions with high contents of toxic and flammable organic solvents (Methanol, Ethanol or 2-Propanol) and acetic acid are used for fixation, staining and destaining of proteins in a gel after SDS-PAGE. To speed up the procedure, heating the staining solution in the microwave oven for a short time is frequently used. This usually results in evaporation of toxic or hazardous Methanol, Ethanol or 2-Propanol and a strong smell of acetic acid in the lab which should be avoided due to safety considerations. In a protocol originally published in two patent applications by E.M. Wondrak (US2001046709 (A1), US6319720 (B1)), an alternative composition of the staining solution is described in which no organic solvent or acid is used. The CBB is dissolved in bidistilled water (60-80mg of CBB G-250 per liter) and 35 mM HCl is added as the only other compound in the staining solution. The CBB staning of the gel is done after SDS-PAGE and thorough washing of the gel in bidistilled water. By heating the gel during the washing and staining steps, the process can be finished faster and no toxic or hazardous compunds are evaporating. The staining of proteins occurs already within 1 minute after heating the gel in staining solution and is fully developed after 15-30 min with a slightly blue background that is destained completely by prolonged washing of the stained gel in bidistilled water, without affecting the stained protein bands.

A short protocol for protein staining with Coomassie Brilliant Blue (CBB) G-250 in polyacrylamide gels is described without using organic solvents or acetic acid as in the classical staining procedures with CBB.

유기 용매 및 초산없이 쿠매시 G - 250로 젤의 단백질 염색법

In classical protein staining protocols using Coomassie Brilliant Blue (CBB), solutions with high contents of toxic and flammable organic solvents ...

연구

생물학

Using the GELFREE 8100 Fractionation System for Molecular Weight-Based Fractionation with Liquid Phase Recovery

The GELFREE 8100 Fractionation System is a novel protein fractionation system designed to maximize protein recovery during molecular weight based fractionation. The system is comprised of single-use, 8-sample capacity cartridges and a benchtop GELFREE Fractionation Instrument. During separation, a constant voltage is applied between the anode and cathode reservoirs, and each protein mixture is electrophoretically driven from a loading chamber into a specially designed gel column gel. Proteins are concentrated into a tight band in a stacking gel, and separated based on their respective electrophoretic mobilities in a resolving gel. As proteins elute from the column, they are trapped and concentrated in liquid phase in the collection chamber, free of the gel. The instrument is then paused at specific time intervals, and fractions are collected using a pipette. This process is repeated until all desired fractions have been collected. If fewer than 8 samples are run on a cartridge, any unused chambers can be used in subsequent separations.
This novel technology facilitates the quick and simple separation of up to 8 complex protein mixtures simultaneously, and offers several advantages when compared to previously available fractionation methods. This system is capable of fractionating up to 1mg of total protein per channel, for a total of 8mg per cartridge. Intact proteins over a broad mass range are separated on the basis of molecular weight, retaining important physiochemical properties of the analyte. The liquid phase entrapment provides for high recovery while eliminating the need for band or spot cutting, making the fractionation process highly reproducible1.

The accompanying video describes the use of the GELFREE 8100 Fractionation System, which partitions complex protein samples on the basis of molecular weight and recovers the fractions in liquid phase. The video describes how the technology works, how it is used, and provides resultant data, with polyacrylamide gel electrophoresis analysis of fractionated bovine liver homogenate.

액상 복구와 분자량 기반 분류에 대한 GELFREE 8100 분획화 시스템을 사용하여

The GELFREE 8100 Fractionation System is a novel protein fractionation system designed to maximize protein recovery during molecular weight based ...

Biochemical Reconstitution of Steroid Receptor&#x2022;Hsp90 Protein  Complexes and Reactivation of Ligand Binding

Hsp90 is an essential and highly abundant molecular chaperone protein that has been found to regulate more than 150 eukaryotic signaling proteins, including transcription factors (e.g. nuclear receptors, p53) and protein kinases (e.g. Src, Raf, Akt kinase) involved in cell cycling, tumorigenesis, apoptosis, and multiple eukaryotic signaling pathways 1,2. Of these many 'client' proteins for hsp90, the assembly of steroid receptor&bull;hsp90 complexes is the best defined (Figure 1). We present here an adaptable glucocorticoid receptor (GR) immunoprecipitation assay and in vitro GR&bull;hsp90 reconstitution method that may be readily used to probe eukaryotic hsp90 functional activity, hsp90-mediated steroid receptor ligand binding, and molecular chaperone cofactor requirements. For example, this assay can be used to test hsp90 cofactor requirements and the effects of adding exogenous compounds to the reconstitution process. 
The GR has been a particularly useful system for studying hsp90 because the receptor must be bound to hsp90 to have an open ligand binding cleft that is accessible to steroid 3. Endogenous, unliganded GR is present in the cytoplasm of mammalian cells noncovalently bound to hsp90. As found in the endogenous GR&bull;hsp90 heterocomplex, the GR ligand binding cleft is open and capable of binding steroid. If hsp90 dissociates from the GR or if its function is inhibited, the receptor is unable to bind steroid and requires reconstitution of the GR&bull;hsp90 heterocomplex before steroid binding activity is restored 4 . GR can be immunoprecipitated from cell cytosol using a monoclonal antibody, and proteins such as hsp90 complexed to the GR can be assayed by western blot. Steroid binding activity of the immunoprecipitated GR can be determined by incubating the immunopellet with [3H]steroid. 
Previous experiments have shown hsp90-mediated opening of the GR ligand binding cleft requires hsp70, a second molecular chaperone also essential for eukaryotic cell viability. Biochemical activity of hsp90 and hsp70 are catalyzed by co-chaperone proteins Hop, hsp40, and p23 5. A multiprotein chaperone machinery containing hsp90, hsp70, Hop, and hsp40 are endogenously present in eukaryotic cell cytoplasm, and reticulocyte lysate provides a chaperone-rich protein source 6. 
In the method presented, GR is immunoadsorbed from cell cytosol and stripped of the endogenous hsp90/hsp70 chaperone machinery using mild salt conditions. The salt-stripped GR is then incubated with reticulocyte lysate, ATP, and K+, which results in the reconstitution of the GR&bull;hsp90 heterocomplex and reactivation of steroid binding activity 7. This method can be utilized to test the effects of various chaperone cofactors, novel proteins, and experimental hsp90 or GR inhibitors in order to determine their functional significance on hsp90-mediated steroid binding 8-11.

Biochemical Reconstitution of Steroid Receptor&amp;#x2022;Hsp90 Protein  Complexes and Reactivation of Ligand Binding

An in vitro method for preparing functional glucocorticoid receptor (GR)&#x2022;hsp90 protein complexes from purified proteins and cellular lysates is described. The method utilizes immunoadsorption of recombinant GR followed by salt-stripping and protein complex reconstitution. The importance of cofactors and buffer conditions are discussed, as are potential method applications.

스테로이드 수용체의 생화 학적 리간드의 Reconstitution • Hsp90 단백질 단지와 재가입 바인딩

Hsp90 is an essential and highly abundant molecular chaperone protein that has been found to regulate more than 150 eukaryotic signaling proteins, ...

Application of MassSQUIRM for Quantitative Measurements of Lysine Demethylase Activity

Recently, epigenetic regulators have been discovered as key players in many different diseases 1-3. As a result, these enzymes are prime targets for small molecule studies and drug development 4. Many epigenetic regulators have only recently been discovered and are still in the process of being classified. Among these enzymes are lysine demethylases which remove methyl groups from lysines on histones and other proteins. Due to the novel nature of this class of enzymes, few assays have been developed to study their activity. This has been a road block to both the classification and high throughput study of histone demethylases. Currently, very few demethylase assays exist. Those that do exist tend to be qualitative in nature and cannot simultaneously discern between the different lysine methylation states (un-, mono-, di- and tri-). Mass spectrometry is commonly used to determine demethylase activity but current mass spectrometric assays do not address whether differentially methylated peptides ionize differently. Differential ionization of methylated peptides makes comparing methylation states difficult and certainly not quantitative (Figure 1A). Thus available assays are not optimized for the comprehensive analysis of demethylase activity.
Here we describe a method called MassSQUIRM (mass spectrometric quantitation using isotopic reductive methylation) that is based on reductive methylation of amine groups with deuterated formaldehyde to force all lysines to be di-methylated, thus making them essentially the same chemical species and therefore ionize the same (Figure 1B). The only chemical difference following the reductive methylation is hydrogen and deuterium, which does not affect MALDI ionization efficiencies. The MassSQUIRM assay is specific for demethylase reaction products with un-, mono- or di-methylated lysines. The assay is also applicable to lysine methyltransferases giving the same reaction products. Here, we use a combination of reductive methylation chemistry and MALDI mass spectrometry to measure the activity of LSD1, a lysine demethylase capable of removing di- and mono-methyl groups, on a synthetic peptide substrate 5. This assay is simple and easily amenable to any lab with access to a MALDI mass spectrometer in lab or through a proteomics facility. The assay has ~8-fold dynamic range and is readily scalable to plate format 5.

We present a method for using MALDI mass spectrometry and reductive methylation chemistry to quantify changes in lysine methylation.

라이신 Demethylase 활동의 양적 측정을위한 MassSQUIRM의 응용

Recently, epigenetic regulators have been discovered as key players in many different diseases 1-3. As a result, these enzymes are prime targets for small ...

Affinity Precipitation of Active Rho-GEFs Using a GST-tagged Mutant Rho Protein (GST-RhoA(G17A)) from Epithelial Cell Lysates

Proteins of the Rho family of small GTPases are central regulators of the cytoskeleton, and control a large variety of cellular processes, including cell migration, gene expression, cell cycle progression and cell adhesion 1. Rho proteins are molecular switches that are active in GTP-bound and inactive in GDP-bound state. Their activation is mediated by a family of Guanine-nucleotide Exchange Factor (GEF) proteins. Rho-GEFs constitute a large family, with overlapping specificities 2. Although a lot of progress has been made in identifying the GEFs activated by specific signals, there are still many questions remaining regarding the pathway-specific regulation of these proteins. The number of Rho-GEFs exceeds 70, and each cell expresses more than one GEF protein. In addition, many of these proteins activate not only Rho, but other members of the family, contributing further to the complexity of the regulatory networks. Importantly, exploring how GEFs are regulated requires a method to follow the active pool of individual GEFs in cells activated by different stimuli. Here we provide a step-by-step protocol for a method used to assess and quantify the available active Rho-specific GEFs using an affinity precipitation assay. This assay was developed a few years ago in the Burridge lab 3,4 and we have used it in kidney tubular cell lines 5,6,7. The assay takes advantage of a "nucleotide free" mutant RhoA, with a high affinity for active GEFs. The mutation (G17A) renders the protein unable to bind GDP or GTP and this state mimics the intermediate state that is bound to the GEF. A GST-tagged version of this mutant protein is expressed and purified from E. coli, bound to glutathione sepharose beads and used to precipitate active GEFs from lysates of untreated and stimulated cells. As most GEFs are activated via posttranslational modifications or release from inhibitory bindings, their active state is preserved in cell lysates, and they can be detected by this assay8. Captured proteins can be probed for known GEFs by detection with specific antibodies using Western blotting, or analyzed by Mass Spectrometry to identify unknown GEFs activated by certain stimuli.

Affinity Precipitation of Active Rho-GEFs Using a GST-tagged Mutant Rho Protein GST-RhoAG17A from Epithelial Cell Lysates

The method presented here describes an assay to follow activation of RhoA specific GDP/GTP Exchange Factors (GEFs) in cultured cells by making use of a mutant RhoA GST fusion protein that has high affinity for activated GEFs. GEFs are precipitated from cell lysates, detected by Western blotting and quantified by densitometry.

상피 세포 Lysates에서 GST-태그가 돌연변 Rho 단백질을 (GST-RhoA (G17A))를 사용하여 활성 Rho-GEFs의 친화력 강수량

Proteins of the Rho family of small GTPases are central regulators of the cytoskeleton, and control a large variety of cellular processes, including cell ...

In Vitro Analysis of PDZ-dependent CFTR Macromolecular Signaling Complexes

Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR), a chloride channel located primarily at the apical membranes of epithelial cells, plays a crucial role in transepithelial fluid homeostasis1-3. CFTR has been implicated in two major diseases: cystic fibrosis (CF)4 and secretory diarrhea5. In CF, the synthesis or functional activity of the CFTR Cl- channel is reduced. This disorder affects approximately 1 in 2,500 Caucasians in the United States6. Excessive CFTR activity has also been implicated in cases of toxin-induced secretory diarrhea (e.g., by cholera toxin and heat stable E. coli enterotoxin) that stimulates cAMP or cGMP production in the gut7.
Accumulating evidence suggest the existence of physical and functional interactions between CFTR and a growing number of other proteins, including transporters, ion channels, receptors, kinases, phosphatases, signaling molecules, and cytoskeletal elements, and these interactions between CFTR and its binding proteins have been shown to be critically involved in regulating CFTR-mediated transepithelial ion transport in vitro and also in vivo8-19. In this protocol, we focus only on the methods that aid in the study of the interactions between CFTR carboxyl terminal tail, which possesses a protein-binding motif [referred to as PSD95/Dlg1/ZO-1 (PDZ) motif], and a group of scaffold proteins, which contain a specific binding module referred to as PDZ domains. So far, several different PDZ scaffold proteins have been reported to bind to the carboxyl terminal tail of CFTR with various affinities, such as NHERF1, NHERF2, PDZK1, PDZK2, CAL (CFTR-associated ligand), Shank2, and GRASP20-27. The PDZ motif within CFTR that is recognized by PDZ scaffold proteins is the last four amino acids at the C terminus (i.e., 1477-DTRL-1480 in human CFTR)20. Interestingly, CFTR can bind more than one PDZ domain of both NHERFs and PDZK1, albeit with varying affinities22. This multivalency with respect to CFTR binding has been shown to be of functional significance, suggesting that PDZ scaffold proteins may facilitate formation of CFTR macromolecular signaling complexes for specific/selective and efficient signaling in cells16-18.
Multiple biochemical assays have been developed to study CFTR-involving protein interactions, such as co-immunoprecipitation, pull-down assay, pair-wise binding assay, colorimetric pair-wise binding assay, and macromolecular complex assembly assay16-19,28,29. Here we focus on the detailed procedures of assembling a PDZ motif-dependent CFTR-containing macromolecular complex in vitro, which is used extensively by our laboratory to study protein-protein or domain-domain interactions involving CFTR16-19,28,29.

In Vitro Analysis of PDZ-dependent CFTR Macromolecular Signaling Complexes

Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR), an epithelial chloride channel, has been reported to interact with various proteins and regulate important cellular processes; among them the CFTR PDZ motif-mediated interactions have been well documented. This protocol describes methods we developed to assemble a PDZ-dependent CFTR macromolecular signaling complex in vitro.

PDZ-의존 CFTR의 Macromolecular 신호 단지의 체외 분석

Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR), a chloride channel located primarily at the apical membranes of epithelial cells, plays a ...

Reconstitution of a Kv Channel into Lipid Membranes for Structural and Functional Studies

To study the lipid-protein interaction in a reductionistic fashion, it is necessary to incorporate the membrane proteins into membranes of well-defined lipid composition. We are studying the lipid-dependent gating effects in a prototype voltage-gated potassium (Kv) channel, and have worked out detailed procedures to reconstitute the channels into different membrane systems. Our reconstitution procedures take consideration of both detergent-induced fusion of vesicles and the fusion of protein/detergent micelles with the lipid/detergent mixed micelles as well as the importance of reaching an equilibrium distribution of lipids among the protein/detergent/lipid and the detergent/lipid mixed micelles. Our data suggested that the insertion of the channels in the lipid vesicles is relatively random in orientations, and the reconstitution efficiency is so high that no detectable protein aggregates were seen in fractionation experiments. We have utilized the reconstituted channels to determine the conformational states of the channels in different lipids, record electrical activities of a small number of channels incorporated in planar lipid bilayers, screen for conformation-specific ligands from a phage-displayed peptide library, and support the growth of 2D crystals of the channels in membranes. The reconstitution procedures described here may be adapted for studying other membrane proteins in lipid bilayers, especially for the investigation of the lipid effects on the eukaryotic voltage-gated ion channels.

Procedures for complete reconstitution of a prototype voltage-gated potassium channel into lipid membranes are described. The reconstituted channels are suitable for biochemical assays, electrical recordings, ligand screening and electron crystallographic studies. These methods may have general applications to the structural and functional studies of other membrane proteins.

구조 및 기능 연구를위한 지질 막에 Kv 값 채널의 재구성

To study the lipid-protein interaction in a reductionistic fashion, it is necessary to incorporate the membrane proteins into membranes of well-defined ...

In Vitro Reconstitution of Light-harvesting Complexes of Plants and Green Algae

In plants and green algae, light is captured by the light-harvesting complexes (LHCs), a family of integral membrane proteins that coordinate chlorophylls and carotenoids. In vivo, these proteins are folded with pigments to form complexes which are inserted in the thylakoid membrane of the chloroplast. The high similarity in the chemical and physical properties of the members of the family, together with the fact that they can easily lose pigments during isolation, makes their purification in a native state challenging. An alternative approach to obtain homogeneous preparations of LHCs was developed by Plumley and Schmidt in 19871, who showed that it was possible to reconstitute these complexes in vitro starting from purified pigments and unfolded apoproteins, resulting in complexes with properties very similar to that of native complexes. This opened the way to the use of bacterial expressed recombinant proteins for in vitro reconstitution. The reconstitution method is powerful for various reasons: (1) pure preparations of individual complexes can be obtained, (2) pigment composition can be controlled to assess their contribution to structure and function, (3) recombinant proteins can be mutated to study the functional role of the individual residues (e.g., pigment binding sites) or protein domain (e.g., protein-protein interaction, folding). This method has been optimized in several laboratories and applied to most of the light-harvesting complexes. The protocol described here details the method of reconstituting light-harvesting complexes in vitro currently used in our laboratory, and examples describing applications of the method are provided.

In Vitro Reconstitution of Light-harvesting Complexes of Plants and Green Algae

This protocol details the reconstitution of light-harvesting complexes in vitro. These integral membrane proteins coordinate chlorophylls and carotenoids and are responsible for harvesting light in higher plants and green algae.

식물과 녹조류의 빛 수확 단지의 체외의 재구성에

In plants and green algae, light is captured by the light-harvesting complexes (LHCs), a family of integral membrane proteins that coordinate chlorophylls ...

Probing High-density Functional Protein Microarrays to Detect Protein-protein Interactions

High-density functional protein microarrays containing ~4,200 recombinant yeast proteins are examined for kinase protein-protein interactions using an affinity purified yeast kinase fusion protein containing a V5-epitope tag for read-out. Purified kinase is obtained through culture of a yeast strain optimized for high copy protein production harboring a plasmid containing a Kinase-V5 fusion construct under a GAL inducible promoter. The yeast is grown in restrictive media with a neutral carbon source for 6 hr followed by induction with 2% galactose. Next, the culture is harvested and kinase is purified using standard affinity chromatographic techniques to obtain a highly purified protein kinase for use in the assay. The purified kinase is diluted with kinase buffer to an appropriate range for the assay and the protein microarrays are blocked prior to hybridization with the protein microarray. After the hybridization, the arrays are probed with monoclonal V5 antibody to identify proteins bound by the kinase-V5 protein. Finally, the arrays are scanned using a standard microarray scanner, and data is extracted for downstream informatics analysis1,2 to determine a high confidence set of protein interactions for downstream validation in vivo.

Using protein microarrays containing nearly the entire S. cerevisiae proteome is probed for rapid unbiased interrogation of thousands of protein-protein interactions in parallel. This method can be utilized for protein-small molecule, posttranslational modification, and other assays in high-throughput.

고밀도 기능성 단백질 마이크로 어레이를 프로빙하는 단백질 - 단백질 상호 작용을 검출하기

High-density functional protein microarrays containing ~4,200 recombinant yeast proteins are examined for kinase protein-protein interactions using an ...

Reconstitution of a Transmembrane Protein, the Voltage-gated Ion Channel, KvAP, into Giant Unilamellar Vesicles for Microscopy and Patch Clamp Studies

Giant Unilamellar Vesicles (GUVs) are a popular biomimetic system for studying membrane associated phenomena. However, commonly used protocols to grow GUVs must be modified in order to form GUVs containing functional transmembrane proteins. This article describes two dehydration-rehydration methods &#8212; electroformation and gel-assisted swelling &#8212; to form GUVs containing the voltage-gated potassium channel, KvAP. In both methods, a solution of protein-containing small unilamellar vesicles is partially dehydrated to form a stack of membranes, which is then allowed to swell in a rehydration buffer. For the electroformation method, the film is deposited on platinum electrodes so that an AC field can be applied during film rehydration. In contrast, the gel-assisted swelling method uses an agarose gel substrate to enhance film rehydration. Both methods can produce GUVs in low (e.g., 5 mM) and physiological (e.g., 100 mM) salt concentrations. The resulting GUVs are characterized via fluorescence microscopy, and the function of reconstituted channels measured using the inside-out patch-clamp configuration. While swelling in the presence of an alternating electric field (electroformation) gives a high yield of defect-free GUVs, the gel-assisted swelling method produces a more homogeneous protein distribution and requires no special equipment.

The reconstitution of the transmembrane protein, KvAP, into giant unilamellar vesicles (GUVs) is demonstrated for two dehydration-rehydration methods &#8212; electroformation, and gel-assisted swelling. In both methods, small unilamellar vesicles containing the protein are fused together to form GUVs that can then be studied by fluorescence microscopy and patch-clamp electrophysiology.

횡단 단백질의 재구성, 현미경 및 패치 클램프 연구 거대한 단일 층 소포에 전압 게이트 이온 채널, KvAP,

Giant Unilamellar Vesicles (GUVs) are a popular biomimetic system for studying membrane associated phenomena. However, commonly used protocols to grow ...