This research was supported by grants from the New Jersey Commission on Cancer Research (Pre-Doctoral Fellowship DFHS13PPCO17), the National Institutes of Health (CA049062), and the National Aeronautics and Space Administration (NNX15AD62G).

문화 미디어와 세포의 1. 준비 <ol><li> 이글의 최소 필수 12.5 % (부피 / 부피)으로 보충 된 배지 열 활성화 된 우 태아 혈청 (FBS), 2 mM의 L- 알라 닐 -L- 글루타민, 페니실린 100 유니트 500 ㎖의 용액 당 스트렙토 마이신 100 μg의 준비. 주 : 성장 배지 및 보충 (들)을 쉽게 다른 세포 균주 또는 세포주의 성장 조건에 대해 교환 될 수있다. </li><li> 각각의 인서트 (6 웰 포맷 인서트)를위한 세포 배양 배지 70 ㎕를 준비 : 이글의 최소 필수 배지는 50 % (vol / vol) 열 활성화, FBS 2 mM의 L- 알라 닐 -L- 글루타민, 100 단위로 보충 페니실린과 스트렙토 마이신 ml의 당 100 μg의. 주 : 배지는 인서트의 바닥면 (즉, 하측)에 세포 부착을 용이하게하기 위해 50 % FBS가 보충된다. 성장 배지 및 보충 (들)을 쉽게 다른 세포 균주 또는 세포주의 성장 조건에 대해 교환 될 수있다. </li><li>인서트의 바닥면에 도금 될 운명 세포의 세포 현탁액을 준비한다. 주 : 여기에서, 결과 AG1522 75 ㎠로 세포 배양 플라스크에서 배양 정상적인 인간 섬유 아세포를 사용하여 수득하고, 이들 세포 따라서 세포 현탁액의 제조에 대한 설명이 분명 할 것이다. </li><li> 세포를 수집하기 위해, 성장 배지를 제거하고 5 ㎖ 1X 인산 완충 생리 식염수 (PBS)으로 세포 단층 배 씻는다. </li><li> PBS를 제거하고 RT (실온)에서 2 분 동안 세포를 실온 (RT)을 미리 예열 2.21 mM의 에틸렌 디아민 테트라 아세트산 (EDTA)과의 트립신, 0.25 % (부피 / 부피) 1 mL의 확산. </li><li> (단계 1.1에서 제조) 완전 성장 배지 9 ml의 트립신 활성을 켄 칭하고 부드럽게 플라스크에 10 배의 표면에 세포 현탁액을 피펫 팅하여 세포를 수집한다. </li><li> 혈구 전자 계수기를 사용하여 세포 농도를 결정하고 제공하기 것이다 세포 현탁액 부피 피펫전자 멸균 15 ML의 원심 분리기 튜브에 삽입 당 250,000 세포. </li><li> 원심 분리하여 세포 현탁액 (800 XG, 2 분) 펠렛. 70 μL 당 250,000 세포의 농도를 생성한다 (단계 1.2에서 제조) 성장 배지에서 세포 펠렛을 중지. 주 : 투과성 미다 공막 인서트의 세포 배양 물이 2 차원 기판에 근거 같이 세포가 초기에 부착을 촉진하는 50 % (부피 / 권) FBS를 포함하는 배지에 현탁한다 제외한 셀 시드가 마찬가지로 실행된다. </li></ol> 삽입 2. 준비 참고 : 세포 배양에 전념 층류 생물 안전 캐비닛에 무균 조건, 작업을 확인하십시오. <ol><li> 0.4 ㎛의 멤브레인 기공 크기 1 ㎛, 3 ㎛의로 선택 인서트 (기공 크기 실험이자 (들)에 의해 결정이 간 통신의 다른 모드의 역할을 조사하기 위해 사용될 수있다). 주 : 0.4 μm의 기공에 작은입니다L은 충분히 삽입 막의 양쪽 셀 간의 기능 차이 접합의 형성을 제한하는 요인에 의해 분비 세포 간 통신을 연구하는데 사용될 수있다. 반면, 1 ㎛ 내지 3 ㎛의 기공이 작동 갭 접합의 형성을 허용하기에 충분히 크고 갭 정션 분비 인자 모두 간 통신을 연구하는데 사용될 수있다. </li><li> 포장에서 개별 삽입물을 제거하고 동일한 크기의 멀티 잘 접시에 배치합니다. 참고 : 삽입 특정 애플리케이션 요구에 맞게 다양한 막 표면 영역을 사용할 수 있습니다 (예를 들어, 6 자, 12도, 24도 삽입.). 여기서, 결과는 6- 웰 인서트를 사용하여 수득 하였다, 따라서 모델 설명의 초점이 될 것이다. </li><li> 접시 뚜껑 인서트를 포함, 접시를 커버. 두 손으로 멀티 잘 접시를 잡고 부드럽게 삽입 바닥 (즉, 아래쪽은) 지금 위쪽으로 향하게되도록 접시를 반전. </li><li> 일을 제거인서트의 바닥면을 노출시키는 멀티 웰 접시의 바닥 E. 한 번에 하나의 삽입 작업, 포셉의 살균 쌍을 사용하여 조심스럽게 제자리에 삽입을 누릅니다. 무료 손으로, 25 만 세포를 포함하는 세포 현탁액 (단계 1.3-1.8에서 제조)의 70 μl를 그리는 넓은 입 팁 피펫을 사용합니다. </li><li> 세포를 플레이트에 삽입의 멤브레인의 중심을 부드럽게 피펫 팁을 배치하고, 천천히 막의 표면 주위 피펫 팁을 이동하면서 서서히 세포 현탁액 70 μL 피펫. 삽입의 가장자리에 피펫 팁 및 세포 현탁액을 연장하지 않도록주의하십시오. 주 : 인서트의 가장자리를 터치하면 첨부 동안 건조 셀에 이르는 세포 현탁액 모세관 장력의 손실을 초래할 수있다. </li><li> 주의를 행사하지 않을 가능성이 미생물 오염을 방지하기 위해 노출 삽입을 통해 직접 작업에, 나머지 삽입을 반복합니다. </li><li> 조심스럽게 다 잘 돌아갑니다접시 바닥은 삽입을 포함합니다. 반전 인서트 접시 유지 30-45 분 동안 37 ℃에서 5 % (부피 / 부피) CO 2의 가습 된 공기 분위기에서 배양한다. 주 : 삽입 콘택트 웰 바닥의 세포 현탁액을 조심스럽게 접시 바닥을 들어 올려이 약간의 각도를 형성하고, 접시의 표면 사이에 큰 거리를 생성되도록 접시 상부 가장자리에 나머지 경우 (세포를 시딩) 인서트의 바닥면. 이 대신 인서트의 웰의 표면에 부착로부터 세포를 방지한다. </li><li> 30 ~ 45 분 배양 시간에 따라 부드럽게 삽입이 들어있는 접시를 제거하고 층류 생물 안전 캐비닛에 넣습니다. </li><li> 두 손으로 꽉 접시 뚜껑을 유지하면서 부드럽게 부착 세포를 함유하는 인서트의 바닥면은 이제 아래로 향하도록 상기 접시를 다시 반전. </li><li> 3 μm의 기공이 migrati을 방지하기 위해 삽입을 위해 차분히 2 ㎖ (1 ml에 추가삽입의 바닥 침지되도록 미리 예열 완료 매체의 삽입 구멍)을 통해 세포에 (각 웰 단계 1.1)을 참조하십시오. </li><li> 삽입을 포함하는 모든 우물에서 성장 매체를 추가 한 후, 가습 인큐베이터에 다시 접시를 놓습니다. </li><li> 인서트 48 시간 동안 인큐베이터에 그대로 남아 있습니다. 48 시간 후, 웰의 바닥에서 중간의 2 ml의 흡입 신선한 성장 배지 2 ㎖를 첨가하여 세포를 공급. </li><li> 이러한 경우 (이미 바닥면에 성장하는 제 1 셀 인구 인서트의 상부면에 상기 제 세포군 현탁액 (~ 250,000 세포 / ml)의 잘 시드 1 ml의 하단에 새로운 배지를 첨가 한 후 실험은, AG1522 (대조군) 세포 암 (실험) 세포)는 인서트의 바닥면에 성장 될 운명 CAFs에 이미 AG1522 세포를 갖는 인서트의 상부에 도금된다. 가습 인큐베이터에 다시 접시를 놓습니다. 참고 : 만약 작품삽입물의 아래쪽에 잘 부착되지 않는 세포를 보내고,이 세포는 다르게 인서트의 상부면 상에 성장 될 수있다. </li><li> 웰의 삽입과 하단의 상부에서 배지를 흡인함으로써 인서트의 윗면에 셀의 두번째 집단을 시딩 한 후 24, 72의 중간 및 96 시간을 변경한다. 부드럽게 웰의 바닥에 인서트의 윗면에 새로운 배지 1 ㎖를 2 ㎖에 추가한다. 두 세포 인구 120 시간의 투과성 미세 삽입 막의 양쪽에 공동 문화에 남아있을 수 있습니다. </li></ol> 3. 트립신에 의해 삽입에서 세포를 수집 주의 : 농축 된 세포 집단을 수득하는 용이성에 더하여, 삽입 TME 모델은 유사한 실험 치료 가능 (예를 들어, 화학, 상기 주위 공기보다 낮은 산소 환경에 노출, 이온화 방사선 처리 등으로 배양) 등 다른 시험관 </em&gt; TME 공동 배양 모델. 또한, 투과성 삽입 공 배양 용 기재가 이미 표준 2D 조직 배양 모델 개발 과정에 의해 분석 될 수있다. 예를 들어, 세포 (시츄 면역 검출, 웨스턴 블랏에서 예) 다음에 엔드 포인트의 분석에 이용 될 수있는 고농축 집단을 얻기 위해 삽입 멤브레인의 양측에서 수확 될 수 있거나 후속 실험 36 전파. <ol><li> 세포를 수집하기 위해, 성장 배지로부터 삽입물을 제거하고 1 ㎖의 PBS를 함유하는 35mm 세포 배양 접시에 배치. 1 ml의 PBS로 삽입 1 배의 아래쪽과 위쪽을 씻으십시오. </li><li> PBS를 제거를 0.25 % 2.21 mM의 EDTA와 트립신 (부피 / 부피) 200 μl를 추가, RT에 미리 예열. <ol><li> 인서트의 바닥면에 성장 된 세포를 수집하는 경우, 35mm 접시에 트립신 용액을 넣고 부드럽게 RT에서 2 분 동안 트립신 용액으로 인서트의 바닥에 놓는다. </li><li> 세포를 수집하면삽입물의 상부면 상에 성장 S, A 35mm 접시에 삽입 배치하고, 삽입물의 상부에 트립신 용액을 첨가하고 실온에서 2 분간 배양한다. </li></ol></li><li> 완전 성장 배지 800 μl를 첨가함으로써 트립신의 활성을 해소. <ol><li> 인서트의 저면에 성장 된 세포를 수집하는 경우, 35mm 접시에 성장 배지를 추가하고 부드럽게 삽입이 약간 유지되면서 삽입 배의 표면 위에 세포 현탁액 1 ml의 피펫 팅하여 세포를 수집 각도는, 세포 현탁액은 접시에 수집되도록. </li><li> 인서트의 상면으로부터 세포를 수집하는 경우, 상면에 성장 배지를 추가하고 부드럽게 삽입 배의 표면 위에 세포 현탁액 1 ml의 피펫. </li></ol></li></ol> 유동 세포 계측법에 의해 세포 순도 4. 특성 주 : t의 순도를 유지하는 통기성 미세 다공성 막 삽입 능력을 특성화120 시간까지, 섹션 1-3 녹색 형광 단백질 (GFP)을 수행 하였다 위해 (즉, 상단과 하단) 그는 두 개의 세포 집단은 MDA-MB-231 세포는 삽입물의 상단면에 도금되는 -tagged하고, 비 GFP 태깅 AG1522 세포는 0.4 μm-의 바닥면에 1 μm-, 3 ㎛의 포어 인서트 도금된다. <ol><li> 인서트의 바닥 측으로부터 셀 (절차 3 장에 기재되어 있음)을 수집 후 원심 분리하여 세포 현탁액 (500g, 30 초) 펠렛. </li><li> 상층 액을 제거하고 1 % (부피 / 권) FBS로 보충 행크스 &#39;균형 소금 솔루션 (HBSS) 400 μL의 세포 펠렛을 일시 중지합니다. </li><li> GFP 및 GFP의 광자 (37)를 검출하기 30분의 530의 대역 통과 필터를 여기하는 사이토 488 nm 인 레이저를 구비 한 흐름 세포 측정 분석을 수행한다. </li><li> 셀 식별을 위해, 유동 세포 계측기에 순방향 조정할 AG1522 조절 세포 집단 및 측면 산란 전압을 사용한다. 맞추다GFP의 채널 전압은 GFP 신호에 대한 낮은 검출 임계치와 셀룰러 형광도 값을 설정한다. </li><li> 대조군 세포를 이용하여 임계 값을 결정 게이팅. 제어 대 GFP 양성 세포의 존재에 기초하여 각각의 세포 집단의 순도를 평가한다. 주 : 순수 인구가 감지 된 GPF 양성 세포의 반사 될 것이다. </li></ol> 제자리에 면역 형광에 의한 세포의 5. 특성 <ol><li> 삽입에서 세포의 트립신에 따라, (3 절 참조) 세포를 수집, 판 5 × 10 4 멸균 커버 글라스 상에 250 ㎕의 성장 매체 (참조 단계 1.1) 세포, 그리고 가습 공기 분위기에서 1 시간 동안 부착 할 수 있도록 37 ° C 배양기에서 5 % (부피 / 부피) CO 2. </li><li> 인큐베이션의 끝에, 부드럽게 커버 슬립을 함유하는 접시를 제거하고 층류 생물학적 안전 캐비넷에 배치. </li><li> 조심스럽게 (단계 참조 미리 예열 완전 배지 2 ㎖를 추가1.1) 각 접시에,되도록 커버 슬립을 담근다. </li><li> 커버 슬립을 포함하는 모든 요리에 성장 매체를 추가 한 후, 48 시간 동안 인큐베이터에서 37 ° C에서 5 % (부피 / 부피) CO 2의 가습 공기 분위기에 요리를 반환합니다. </li><li> 48 시간 배양 후, PBS로 샘플 배를 씻어 RT에서 10 분 동안 PBS에서 4 % (중량 / 부피) 포름 알데히드로 고정한다. </li><li> 트리스 완충 식염수 (TBS : 50 mM 트리스 - CL, 산도 7.5, 150 mM의 염화나트륨)로 5 배를 씻어 후 5 분에서 0.25 % (부피 / 부피) 트리톤 X-100, 0.1 % (중량 / 부피) 사포닌과 Permeabilize 하시려면 RT. </li><li> 비특이적 2 % (부피 / 권) 정상 염소 혈청 (NGS), 1 % (중량 / 부피) 소 혈청 알부민 (BSA), 0.1 % (부피 / 부피) TBS 트리톤 X-100을 가진 결합 부위를 차단 (블로킹 RT에서 1 시간 동안 용액). </li><li> 밤새 4 ° C에서 솔루션을 차단에 : 차 항체 (1,000 방지 카베 올린 1 (CAV1), 1)에 품어. </li><li> 0.2 % NGS (부피 / 부피), 1 % (중량 / 부피) BSA, 0.1 %로 언 바운드 일차 항체 (배, 5 분 / 세척)을 씻어 (VOl / 부피) TBS 트리톤 X-100 (세정액). </li><li> 솔루션을 차단에서 1 시간 동안 실온에서 차 항체와 함께 품어 (섹션 5.4 참조). </li><li> 언 바운드 차 항체 세척 용액 (3 배, 5 분 / 세척)을 씻어 (단계 5.6 참조). </li><li> 마운트 4 &#39;, 6-diamidino-2-페닐 인돌 (DAPI)를 포함하는 안티 - 페이드 장착 매체와 슬라이드에 커버 슬립, 매니큐어로 밀봉. </li><li> 형광 여기를 위해 외부 광원을 구비 거꾸로 현미경에 오일 63X 배율 대물 렌즈를 사용하여 세포를 관찰하고, 후속 분석을 위해 부착 된 디지털 카메라를 사용하여 이미지를 캡쳐. </li></ol> 서양의 얼룩에 의해 세포의 6. 특성 주 : 웨스턴 블롯 절차는 다른 38 설명한다. 간략한 개요는 여기에 설명되어 있습니다 : <ol><li> 트립신 처리에 의해 삽입로부터 세포의 분리 이후, (제 3) 원심 분리 (500g, 30 초)에 의해 세포 현탁액 펠렛. </li><li> 상층 액을 제거하고 100 μl의 PBS로 세포 펠렛의 2 배를 일시 중지합니다. </li><li> 변성 radioimmunoprecipitation 분석 50 μL의 상등액를 Lyse 세포를 제거 (RIPA) 완충액 (트리스 pH를 7.5의 50 mM NaCl을 150 mm의 NP40 1 % (부피 / 권), 소듐 데 옥시 콜레이트 수화물 (DOC) 0.5 % (부피 / 부피), 소듐 도데 실 설페이트 (SDS), 0.1 % (부피 / 부피의)), 프로테아제 및 포스파타제 억제제 칵테일을 함유. </li><li> 4 ℃에서 15 분 동안 19,000g에서 얼음과 원심 분리기에 20 분 동안 품어. </li><li> RIPA 버퍼 내의 세제와 호환 가능한 광학 밀도 단백질 분석을 이용하여 상등액의 단백질 농도를 결정한다. </li><li> 0.2 μm의 니트로 셀룰로오스 막 상 electroblot 소듐 도데 실 설페이트 폴리 아크릴 아미드 겔 전기 영동 (SDS-PAGE)에 의해 분리 된 단백질. </li><li> 0.1 % (부피 / 부피) 트윈 - 20 (TBST), 4 % (중량 / 부피)를 포함하는 TBS에서 막을 품어 60 분 동안 우유 (차단 솔루션을) 탈지 및 (4 ° C에서 하룻밤 일차 항체와 반응 방지CAV1, 1 : 1000). </li><li> RT (5 분 / 세탁)에서 TBST로 막 배를 씻으십시오. </li><li> 양 고추 냉이 퍼 옥시 다제 (HRP) (5,000 1)와 접합 항 - 마우스 이차 항체를 함유하는 차단 용액에 30 분 동안 막을 인큐베이션. </li><li> RT (5 분 / 세탁)에서 TBST로 막 배를 씻으십시오. </li><li> 웨스턴 블 롯팅 검출 시스템을 이용하여 화학 발광 법에 의해 반응 생성물을 가시화. </li></ol> 유동 세포 계측법에 의해 세포 간 통신의 7 특성 주 : 투과성 미다 공막의 적응성을 특징들은 간 통신 (예를 들어, 분비 된 인자 간극 연접)의 다양한 모드를 검사하기 위해 삽입한다. 섹션 1-2.12 비 형광 AG1522 세포 0.4 μm-의 바닥면, 한 μm-, 3 μm의 구멍에 삽입되는 도금으로 수행 하였다. <ol><li> 문화 섹션 1.1에 기재된 배지를 사용하여 90 % 포화 상태에 35mm 접시에 AG1522 세포는 비 - 표지. </li><li> 아르 자형INSE 세포 HBSS 1 mL의 1 배. </li><li> 칼 세인 오전 30 μM을 포함하는 HBSS에 세포를 배양하여 칼 세인 AM와로드 셀. </li><li> 37 ℃에서 5 % (부피 / 부피) CO 2의 가습 된 공기 분위기에서 15 분 동안 인큐베이션. </li><li> 워시 세포 HBSS 1 mL의 2 배. </li><li> RT에서 2 분 동안 2.21 mM의 EDTA와 0.25 % 트립신 200 μL 용액 (부피 / 부피)을 첨가하여 세포를 Trypsinize. </li><li> 12.5 %를 함유하는 완전 배지 (부피 / 부피) FBS 800 μl를 첨가함으로써 트립신의 활성을 해소. </li><li> 반복 피펫 팅에 의해 현탁액에 세포를 가져와. </li><li> 혈구 전자 계수기를 사용하여 세포 농도를 결정 이미 바닥면에 성장 AG1522 셀이 인서트의 윗면에 칼 세인 AM 로케이션 250,000 세포 접시. </li><li> 37 ℃에서 5 % CO 2의 가습 된 공기 분위기에서 삽입 부화 6 시간 동안. </li><li> 설명 된 바와 같이 6 시간 후, 인서트의 바닥면으로부터 세포를 수집섹션 3인치 </li><li> 원심 분리하여 세포 현탁액 (500g, 30 초) 펠렛. </li><li> 상층 액을 제거하고 1 % (부피 / 부피) FBS로 보충 된 HBSS 400 μL의 세포 펠렛을 일시 중지합니다. </li><li> 레이저가 장착 된 사이토에 세포를 분석하고 흥미로운 가능한 필터 제조사의 프로토콜에 따라, 칼 세인 (496 nm 내지 516 nm의 각각)의 방출을 검출. </li><li> 셀 식별을 위해, 유동 세포 계측기에 전방 및 측면 스 캐터 전압을 조정하는 흠 AG1522 조절 세포 집단을 사용한다. 칼 세인 신호 낮은 검출 임계치와 셀룰러 형광도 값을 설정하기 위해 칼 세인 채널 전압을 조정한다. </li><li> 칼 세인 제어로드 셀을 사용하여 상위 임계 값 제한을 결정한다. 제어 대 칼 세인 양성 세포의 존재에 기초하여 각각의 셀을 삽입 통신 평가. </li></ol>

저자는 더 경쟁 또는 상충되는 이해 관계가 없음을 선언합니다.

여기에 설명 된 프로토콜은 투과성 미다 공막 인서트 이형 세포의 공 배양에서 고농축 개별 세포 집단을 생성하기 위해 이용하는 간단한 시험 관내 절차에 적응 (도 1)이다. 현저하게, 간 모델은 다양한 통신 방식을 연구하기에 적합하다. 중요한 단계는 상단 측에 제 세포군 시드 50 % FBS로 보충 된 배지에서 인서트의 바닥면에 상기 제 세포군 시드 특정 실험이자 (S)에 적절한 기?...

종양 미세 환경 (TME)을 공존 기질 및 호스트와 함께 진화 암종 세포로 구성된 복잡한 시스템이다. 이 기질 성분은 일반적으로 섬유 아세포, 근육 섬유 모세포, 내피 세포, 다양한 면역 성분뿐만 아니라, 세포 외 매트릭스 (1)로 구성된다. 중요한 성분이 기질의 대부분은 종종 활성 섬유 아세포 자주 암 관련 아세포 또는 암 - 관련 아세포 (CAF) 2,3-라고 칭한다. 정상적인 비 - 활성화 된 섬유 아세포와 달리 CAFs에 유방, 전립선, 폐, 췌장, 피부, 결장, 식도를 포함한 암의 다양한에서 종양의 개시, 진행, 혈관 형성, 침윤, 전이 및 재발 4-11에 기여하고, 5,6,12-17 난소. 그러나, 암 발병에 걸쳐 CAFs에의 기여의 정확한 특성을 제대로 정의 된 상태로 유지됩니다. 또한, 임상 적 증거는 CAFs에의 예후 값을 보여 주었다높은 등급의 악성 종양, 치료 실패 및 전반적인 불량한 예후의 10,18,19에 자신의 존재의 상관 관계. 분명히, CAF 개발 개시 이벤트뿐만 아니라 TME 내 역할을 매개 세포 간 통신에 대한 이해를 향상 환자 결과를 향상시킬 수있는 새롭고 흥미로운 치료 대상 향상된 전략을 제공 할 수있다. 이 목표를 향해, 생체 내 및 생체 외 모델에서 여러 가지가 개발되어왔다. 생체 내 방법은 환자의 TME 더 반사하지만, 그들은 내 종양 사이에 모두 엄청난 복잡성과 이질성을 포함한 한계를 가지고있다. 또한, 피험자의 종양 샘플은 종종 매우 TME 개발 대표하고 TME 개시 이벤트에 대한 이해를 허용하지 않는다. 실험 동물 연구 때문에 그 풍모의 차이 그러나 인간에게 동물 데이터의 일반화가주의해야합니다 몇 가지 장점을 제공합니다같은 설치류 (예를 들어, 티올 화학 (20), 신진 대사 속도 (21), 관용 등, (22)을 강조하는)와 같은 인간과 동물 사이의 ology. 또한, 자연의 유전자 유형이있는 인구는 달리, 실험 동물은 일반적으로 동질성을 사육하고 있습니다. 또한, 일시적인 생리 학적 변화 및 ​​세포 표현형의 변화를 조사 할뿐만 아니라 설치류 동물을 사용하는 실험의 특정 매개 변수를 제어하는​​ 것이 곤란하다. 따라서, 체외 2- 및 3- 차원 (2D 및 3D) 조직 배양 모델에서 자주 TME 개발의 기본적인 이해를 전진하는 데에 이용된다. 생체 시스템의 복잡성을 정확하게 묘사의 부족에도 불구하고, 이러한 모델은 매우 기계적 조사를 용이 장점을 제공한다. 관내 모델은 TME보다 단순화 집중하고 비용 효과적인 분석을 위해, 이에 유의 허용 데이터가 생성 될 수있다동물에서 발생하는 전신 변동이없는 세포. 체외 시스템의 여러 종류가 있습니다. 두 개의 가장 일반적으로 사용되는 TME 체외 모델은 혼합 단층 또는 회전 타원체 세포 배양으로 구성되어 있습니다. 두 배양 방법은 세포 간 상호 작용과 각종 TME 특정 세포 표현형 변화를 분석 (종양 세포 예를 들어, 정상 세포)의 기초 연구에 유리하다 (예를 들면, 정상 섬유 아세포에서 암과 관련된 섬유 아세포의 출현). 또한, 구 상체는 TME보다 반사 형 조직 구조를 만들 수 있고, 종양 이질성 (23)을 대표 할 수있다. 그러나 타원체는 종종 실험의 결론 (24)를 복잡하게 할 수있다 층에 걸쳐 매우 다양한 산소 장력 구배를 생산하고 있습니다. 불행하게도, 두 모델은 매우 코 아래의 추가 특성화 및 연구를위한 순수한 세포 집단을 분리하는 능력에 제한이문화. 이렇게 형광 태그 또는 머신 식별 표지 한 후 세포 집단을 분리 정렬 광범위한 프로세싱 셀에 공 배양을 행하여 혼합되도록 적어도 하나의 세포 유형을 필요로 할 수있다. 셀 소터는 다소 순수한 세포 집단을 분리 할 수 있지만, 하나는 세포 스트레스 및 전위 미생물 오염을 인식 25 위험이어야한다. 간 통신의 이해를 용이하게하기 위해 많은 노력과 개발 간략화 된 방식을 허용하면서 밀접 생체 내 환경을 모방 한 시험 관내 시스템에서 최적화 향해 헌신되었다. 그러한 도구는 투과성 미다 삽입, 제 1953 26 개발이어서 다양한 애플리케이션 및 연구 (예를 들어, 셀의 극성 (27), 엔도 시토 시스 (28), 약물 수송 29 티슈 모델링 30 FERT 적응 된 막 기판ilization 31 방관자 효과 32, 33 등). 이 시스템은 불 침투성 plasticware에 때 배양 관찰되지 않은 34, 35 마커 생체 내에서 많은 사람들의 생체 -like 해부학 적 및 기능적 분화와 세포의 성장뿐만 아니라 표현을 허용한다. 또한, 매우 얇은 다공질 막 (10 μm의 두께)의 생체 내 환경을 시뮬레이트 모두 꼭대기 및 기저 세포 영역에서 독립적으로 세포 기능을 허용 분자 평형 시간의 신속한 확산을 허용한다. 멤브레인의 기공을 통해 간 다양한 통신 모드를 유지하면서 TME 시스템으로 삽입 효용의 추가적인 장점은 동일한 환경 조건에서 멤브레인의 양측 상에 성장 개의 이형 세포 집단의 물리적 분리된다. 비록 물리적으로 분리 된 두 세포 집단은 대사 드로 분비 소자를 통해 접속되며또한 갭 접합부 채널을 통해, 여기 스크라이브. 또한, 생체 부분 산소 장력의 인서트 (PO 2)를 유지함으로써,이 모델은 다른 시스템들에서 관찰 된 산소와 화학 구배의 합병증을 감소시킨다. 오히려, 그것은 자연 TME 제어 메커니즘에 대한 이해를 증가시킨다. 특히, 두 세포 집단 쉽게 공 배양 장기간 다음 형광 태그 및 / 또는 세포 소팅 않고 고순도로 분리 할 수​​있다. 여기서 우리는 멤브레인 기공을 통해 지속적인 양방향 통신 아직 인간 유방암 세포 투과성 미다 공막 인서트의 양쪽에 각각 자란 인간 섬유 아세포 이루어지는 관내 TME 프로토콜을 설명하지만. 우리는 그 표시 발달로 다양한 기공 크기와 간 통신의 특정 유형의 기여 (간극 연접 비교 예 분비 인자) 막을 사용하여TME으로 조사 할 수있다.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="886">
	<tbody>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">For Cell Culture</td>
			<td style="width:180px;"></td>
			<td style="width:139px;"></td>
			<td style="width:279px;"></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:289px;">AG01522 (i.e., AG1522) human diploid fibroblast</td>
			<td style="width:180px;">Coriell</td>
			<td style="width:139px;">107661</td>
			<td style="width:279px;">Passage 8-13</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:289px;">MDA-MB-231-luc-D3H1 breast adenocarcinoma cell line</td>
			<td style="width:180px;">PerkinElmer</td>
			<td style="width:139px;">119261</td>
			<td style="width:279px;">Parental line: ATCC (#HTB-26)</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:289px;">MDA-MB-231/GFP breast adenocarcinoma cell line</td>
			<td style="width:180px;">Cell Biolabs</td>
			<td style="width:139px;">AKR-201</td>
			<td style="width:279px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">Eagle&#39;s minimal essential medium (MEM)</td>
			<td style="width:180px;">Corning Cellgro</td>
			<td style="width:139px;">15-010-CV</td>
			<td style="width:279px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">Fetal Bovine Serum (FBS), Qualified</td>
			<td style="width:180px;">Sigma</td>
			<td style="width:139px;">F6178-500mL</td>
			<td style="width:279px;"></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:289px;">Corning Glutagro Supplement (200mM L-alanyl-L-glutamine)</td>
			<td style="width:180px;">Corning Cellgro</td>
			<td style="width:139px;">25-015-Cl</td>
			<td style="width:279px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">Penicillin Streptomycin Solution, 100X</td>
			<td style="width:180px;">Corning Cellgro</td>
			<td style="width:139px;">30-002-Cl</td>
			<td style="width:279px;"></td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;width:289px;">Transwell Insert (i.e., permeable microporous membrane insert) (0.4 &#956;m pore)</td>
			<td style="width:180px;">Costar</td>
			<td style="width:139px;">3450</td>
			<td style="width:279px;"></td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;width:289px;">Transwell Insert (i.e., permeable microporous membrane insert) (1 &#956;m pore)</td>
			<td style="width:180px;">Greiner bio-one</td>
			<td style="width:139px;">657610</td>
			<td style="width:279px;"></td>
		</tr>
		<tr height="63">
			<td height="63" style="height:63px;width:289px;">Transwell Insert (i.e., permeable microporous membrane insert) (3 &#956;m pore)</td>
			<td style="width:180px;">Costar</td>
			<td style="width:139px;">3452</td>
			<td style="width:279px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">6-well Culture Plate</td>
			<td style="width:180px;">Greiner Bio-One Cellstar</td>
			<td style="width:139px;">657160-01</td>
			<td style="width:279px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">75 cm2 cell culture flask</td>
			<td style="width:180px;">CellStar</td>
			<td style="width:139px;">658 170</td>
			<td style="width:279px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">Phosphate-Buffered Saline (PBS), 1X</td>
			<td style="width:180px;">Corning Cellgro</td>
			<td style="width:139px;">21-040-CV</td>
			<td style="width:279px;">without calcium &#38; magnesium</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:289px;">0.25% (vol/vol) Trypsin, 2.21 mM EDTA, 1X</td>
			<td style="width:180px;">Corning Cellgro</td>
			<td style="width:139px;">25-053-Cl</td>
			<td style="width:279px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">15 mL Centrifuge Tube</td>
			<td style="width:180px;">CellTreat</td>
			<td style="width:139px;">229411</td>
			<td style="width:279px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">35 x 10 mm Cell Culture Dish</td>
			<td style="width:180px;">Greiner bio-one</td>
			<td style="width:139px;">627 160</td>
			<td style="width:279px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">Name</td>
			<td style="width:180px;">Company</td>
			<td style="width:139px;">Catalog Number</td>
			<td>Comments</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">For Immunofluorescent Microscopy</td>
			<td style="width:180px;"></td>
			<td style="width:139px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:289px;">Mouse anti-Caveolin 1</td>
			<td style="width:180px;">BD Transduction Laboratories</td>
			<td style="width:139px;">610406</td>
			<td style="width:279px;">In situ Immunofluorescence - 1:5000</td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:289px;">Goat anti-Mouse IgG (H+L) Secondary Antibody, Alexa Fluor 488 conjugate</td>
			<td style="width:180px;">ThermoFisher Scientific</td>
			<td style="width:139px;">A-11029</td>
			<td>In situ Immunofluorescence - 1:2000</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">Bovine Serum Albumin - Fraction V</td>
			<td style="width:180px;">Rockland</td>
			<td style="width:139px;">BSA-50</td>
			<td>Immunoglobulin and protease free</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">16% (wt/vol) Formaldehyde Solution</td>
			<td style="width:180px;">ThermoFisher Scientific</td>
			<td style="width:139px;">28908</td>
			<td>Dilute to 4% with 1X PBS</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">Premium Cover Glass (22x22 mm No.1)</td>
			<td style="width:180px;">Fisher</td>
			<td style="width:139px;">12548B</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">Triton X-100</td>
			<td style="width:180px;">Sigma</td>
			<td style="width:139px;">T8787-50ML</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">SlowFade Gold antifade reagent with DAPI</td>
			<td style="width:180px;">Invitrogen</td>
			<td style="width:139px;">S36938</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">Name</td>
			<td style="width:180px;">Company</td>
			<td style="width:139px;">Catalog Number</td>
			<td>Comments</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">For Flow Cytometric Analysis</td>
			<td style="width:180px;"></td>
			<td style="width:139px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">Calcein, AM</td>
			<td style="width:180px;">Molecular Probes</td>
			<td style="width:139px;">C3100MP</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">Hanks&#39; Balanced Salt Solution (HBSS)</td>
			<td style="width:180px;">Gibco</td>
			<td style="width:139px;">14025-076</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">Name</td>
			<td style="width:180px;">Company</td>
			<td style="width:139px;">Catalog Number</td>
			<td>Comments</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">For Western Blot Analysis</td>
			<td style="width:180px;"></td>
			<td style="width:139px;"></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:289px;">Mouse anti-Caveolin 1</td>
			<td style="width:180px;">BD Transduction Laboratories</td>
			<td style="width:139px;">610406</td>
			<td style="width:279px;">Western Blot - 1:10000</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">Tween-20</td>
			<td style="width:180px;">BioRad</td>
			<td style="width:139px;">170-6531</td>
			<td style="width:279px;"></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">Nitrocellulose Membrane (0.2 &#956;m)</td>
			<td style="width:180px;">BioRad</td>
			<td>162-0112</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">Western Lightning Plus-ECL</td>
			<td style="width:180px;">PerkinElmer</td>
			<td style="width:139px;">NEL104001EA</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">BioRad DC Protein Assay</td>
			<td style="width:180px;">BioRad</td>
			<td style="width:139px;">500-0116</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">Sodium dodecyl sulfate (SDS)</td>
			<td style="width:180px;">BioRad</td>
			<td style="width:139px;">161-0302</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">Sodium deoxycholate monohydrate (DOC)</td>
			<td style="width:180px;">Sigma</td>
			<td style="width:139px;">D5670</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">IGEPAL CA-630 (NP40)</td>
			<td style="width:180px;">Sigma</td>
			<td style="width:139px;">I8896</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:289px;">30% Acrylamide/Bis Solution, 37.5:1</td>
			<td style="width:180px;">BioRad</td>
			<td style="width:139px;">161-0158</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

a mimic of the tumor microenvironment: a simple method for generating enriched cell populations and investigating intercellular communication

암세포와 주위의 비 - 암성 기질의 초기 이형 작용을 이해하는 것은 실질 활성화 및 종양 미세 환경 (TME) 설립 이어지는 이벤트를 아는데 중요하다. 시험 관내 및 생체 TME 모델 일부는 개발되었다; 그러나, 일반적으로 이러한 모델 용이 추후 연구 비 교란 조건 하에서 각각의 세포군의 분리를 허용하지 않는다. 이러한 어려움을 회피하기 위해 연장 된 공동에 대한 인서트의 멤브레인의 양측에 개별적으로 밀접 성장 고도로 농축 된 세포 집단의 단순 생성하면서도 허용하는 투과성 미다 공막 인서트 이루어진 세포 성장 기판을 이용한 시험 관내 TME 모델을 채용 한 - 문화 회. 이 모델의 사용을 통해, 우리는 정상 이배체 인간 섬유 아세포에서 (CAF) 인구는 다음과 같은 매우 풍부한 암 관련 섬유 아세포를 생성 할 수있다형광 태그 및 / 또는 셀의 정렬을 사용하지 않고 높은 전이성 인간 유방암 세포와 공 배양 (120 시간). 또한, 삽입물의 기공 크기를 조절함으로써, 우리는 개발 근본적인 메커니즘의 조사를 허용하는 두 개의 이형 세포 집단 사이 간 통신 (예를 들어, 갭 정션 통신 분비 인자)의 모드에 대해 제어 할 수있다 갭 접합 투과성의 역할을 포함 TME. 이 모델은 암 기질 개시의 TME의 초기 진화 및 치료제에 대한 암세포의 반응에 기질의 조절 효과로 이어지는 초기 사건에 대한 우리의 이해를 높이는 데 유용한 도구 역할을한다.

여기서 우리는 생체 내 종양 미세 환경 (도 1)를 모방 한 시험 관내 이형 세포 공 배양 시스템을 개발하는 투과성 미다 공막 인서트 장치. 서로 다른 세포 집단은 (유스에서는, 120 시간 이하) 장시간 동안 삽입물의 다공질 막의 양측에 성장 될 때까지 이러한 시스템은 허용한다. 0.4-, 1-, 3 M-세공 인서트의 윗면에 GFP 표지 된 MDA-MB-231 세포를 도금들이 ...

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A Mimic of the Tumor Microenvironment: A Simple Method for Generating Enriched Cell Populations and Investigating Intercellular Communication

We adapted a permeable microporous membrane insert to mimic the tumor microenvironment (TME). The model consists of a mixed cell culture, allows simplified generation of highly enriched individual cell populations without using fluorescent tagging or cell sorting, and permits studying intercellular communication within the TME under normal or stress conditions.

종양 미세 환경의 모방 : 세포 간 통신을 농축 세포 인구를 생성 및 조사를위한 간단한 방법

Understanding the early heterotypic interactions between cancer cells and the surrounding non-cancerous stroma is important in elucidating the events ...

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Conditional Knockdown of Gene Expression in Cancer Cell Lines to Study the Recruitment of Monocytes/Macrophages to the Tumor Microenvironment

siRNA and shRNA-mediated knock down (KD) methods of regulating gene expression are invaluable tools for understanding gene and protein function. However, in the case that the KD of the protein of interest has a lethal effect on cells or the anticipated effect of the KD is time-dependent, unconditional KD methods are not appropriate. Conditional systems are more suitable in these cases and have been the subject of much interest. These include Ecdysone-inducible overexpression systems, Cytochrome P-450 induction system1, and the tetracycline regulated gene expression systems. 
The tetracycline regulated gene expression system enables reversible control over protein expression by induction of shRNA expression in the presence of tetracycline. In this protocol, we present an experimental design using functional Tet-ON system in human cancer cell lines for conditional regulation of gene expression. We then demonstrate the use of this system in the study of tumor cell-monocyte interaction.

This protocol serves as a scheme for setting up a functional Tet-ON system in cancer cell lines and its subsequent use, in particular for studying the role of tumor cell-derived proteins in recruitment of monocytes/macrophages to the tumor microenvironment.

암 세포 선 종양 Microenvironment에 Monocytes/대 식 세포의 모집 연구에서 유전자 발현의 조건부 최저

siRNA and shRNA-mediated knock down (KD) methods of regulating gene expression are invaluable tools for understanding gene and protein function. However, ...

연구

암 연구학

In Vivo EPR Assessment of pH, pO2, Redox Status, and Concentrations of Phosphate and Glutathione in the Tumor Microenvironment

This protocol demonstrates the capability of low-field electron paramagnetic resonance (EPR)-based techniques in combination with functional paramagnetic probes to provide quantitative information on the chemical tumor microenvironment (TME), including pO2, pH, redox status, concentrations of interstitial inorganic phosphate (Pi), and intracellular glutathione (GSH). In particular, an application of a recently developed soluble multifunctional trityl probe provides unsurpassed opportunity for in vivo concurrent measurements of pH, pO2 and Pi in Extracellular space (HOPE probe). The measurements of three parameters using a single probe allow for their correlation analyses independent of probe distribution and time of the measurements.

In Vivo EPR Assessment of pH, pO2, Redox Status, and Concentrations of Phosphate and Glutathione in the Tumor Microenvironment

Low-field (L-band, 1.2 GHz) electron paramagnetic resonance using soluble nitroxyl and trityl probes is demonstrated for assessment of physiologically important parameters in the tumor microenvironment in mouse models of breast cancer.

Vivo에서 PH, pO2, 산화 환 원 상태, 고 농도의 인산 염 및 종양 Microenvironment에 티의 EPR 평가

This protocol demonstrates the capability of low-field electron paramagnetic resonance (EPR)-based techniques in combination with functional paramagnetic ...

Simple and Rapid Method to Obtain High-quality Tumor DNA from Clinical-pathological Specimens Using Touch Imprint Cytology

It is critical to determine the mutational status in cancer before administration and treatment of specific molecular targeted drugs for cancer patients. In the clinical setting, formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues are widely used for genetic testing. However, FFPE DNA is generally damaged and fragmented during the fixation process with formalin. Therefore, FFPE DNA is sometimes not adequate for genetic testing because of low quality and quantity of DNA. Here we present a method of touch imprint cytology (TIC) to obtain genomic DNA from cancer cells, which can be observed under a microscope. Cell morphology and cancer cell numbers can be evaluated using TIC specimens. Furthermore, the extraction of genomic DNA from TIC samples can be completed within two days. The total amount and quality of TIC DNA obtained using this method was higher than that of FFPE DNA. This rapid and simple method allows researchers to obtain high-quality DNA for genetic testing (e.g., next generation sequencing analysis, digital PCR, and quantitative real time PCR) and to shorten the turnaround time for reporting results.

Obtaining high-quality genomic DNA from tumor tissues is an essential first step for analyzing genetic alterations using next generation sequencing. In this article, we present a simple and rapid method to enrich tumor cells and obtain intact DNA from touch imprint cytology specimens.

터치 인쇄물 세포학을 사용 하 여 병 적인 임상 표본에서 높은-품질 종양 DNA를 간단 하 고 빠른 방법

It is critical to determine the mutational status in cancer before administration and treatment of specific molecular targeted drugs for cancer patients. ...

Digital Polymerase Chain Reaction Assay for the Genetic Variation in a Sporadic Familial Adenomatous Polyposis Patient Using the Chip-in-a-tube Format

The quantitative analysis of human genetic variation is crucial for understanding the molecular characteristics of serious medical conditions, such as tumors. Because digital polymerase chain reactions (PCR) enable the precise quantification of DNA copy number variants, they are becoming an essential tool for detecting rare genetic variations, such as drug-resistant mutations. It is expected that molecular diagnoses using digital PCR (dPCR) will be available in clinical practice in the near future; thus, how to efficiently conduct dPCR with human genetic material is a hot topic. Here, we introduce a method to detect Adenomatous polyposis coli (APC) somatic mosaicism using dPCR with the chip-in-a-tube format, which allows eight dPCR reactions to be simultaneously conducted. Care should be taken when filling and sealing the reaction mixture on the chips. This article demonstrates how to avoid the over- and underestimation of positive partitions. Furthermore, we present a simple procedure for collecting the dPCR product from the partitions on the chips, which can then be used to confirm the specific amplification. We hope that this methods report will help promote the dPCR with the chip-in-a-tube method in genetic research.

Digital polymerase chain reaction (PCR) is a useful tool for the high-sensitivity detection of single nucleotide variants and DNA copy number variants. Here, we demonstrate key considerations for measuring rare variants in the human genome using digital PCR with the chip-in-a-tube format.

튜브에 칩 형식을 사용 하 여 산발적 인 가족 용 대 환자에 있는 유전 변이 대 한 디지털 중 합 효소 연쇄 반응 분석 결과

The quantitative analysis of human genetic variation is crucial for understanding the molecular characteristics of serious medical conditions, such as ...

Measuring Bone Remodeling and Recreating the Tumor-Bone Microenvironment Using Calvaria Co-culture and Histomorphometry

Bone is a connective tissue constituted of osteoblasts, osteocytes, and osteoclasts and a mineralized extracellular matrix, which gives it its strength and flexibility and allows it to fulfill its functions. Bone is continuously exposed to a variety of stimuli, which in pathological conditions can deregulate bone remodeling. To study bone biology and diseases and evaluate potential therapeutic agents, it has been necessary to develop in vitro and in vivo models.
This manuscript describes the dissection process and culture conditions of calvarias isolated from neonatal mice to study bone formation and the bone tumor microenvironment. In contrast to in vitro and in vivo models, this ex vivo model allows preservation of the three-dimensional environment of the tissue as well as the cellular diversity of the bone while culturing under defined conditions to simulate the desired microenvironment. Therefore, it is possible to investigate bone remodeling and its mechanisms, as well as the interactions with other cell types, such as the interactions between cancer cells and bone.
The assays reported here use calvarias from 5-7 day old BALB/C mice. The hemi-calvarias obtained are cultured in the presence of insulin, breast cancer cells (MDA-MB-231), or conditioned medium from breast cancer cell cultures. After analysis, it was established that insulin induced new bone formation, while cancer cells and their conditioned medium induced bone resorption. The calvarial model has been successfully used in basic and applied research to study bone development and cancer-induced bone diseases. Overall, it is an excellent option for an easy, informative, and low-cost assay.

The ex vivo culture of bone explants can be a valuable tool for the study of bone physiology and the potential evaluation of drugs in bone remodeling and bone diseases. The presented protocol describes the preparation and culture of calvarias isolated from newborn mice skulls, as well as its applications.

Calvaria 공동 배양 및 조직 학을 사용하여 뼈 리모델링 및 종양 - 뼈 미세 환경 재현

Bone is a connective tissue constituted of osteoblasts, osteocytes, and osteoclasts and a mineralized extracellular matrix, which gives it its strength ...

Generation of Orthotopic Pancreatic Tumors and Ex vivo Characterization of Tumor-Infiltrating T Cell Cytotoxicity

In vivo models of pancreatic cancer provide invaluable tools for studying disease dynamics, immune infiltration and new therapeutic strategies. The orthotopic murine model can be performed on large cohorts of immunocompetent mice simultaneously, is relatively inexpensive and preserves the cognate tissue microenvironment. The quantification of T cell infiltration and cytotoxic activity within orthotopic tumors provides a useful indicator of an antitumoral response.
This protocol describes the methodology for surgical generation of orthotopic pancreatic tumors by injection of a low number of syngeneic tumor cells resuspended in 5 &#181;L basement membrane directly into the pancreas. Mice bearing orthotopic tumors take approximately 30 days to reach endpoint, at which point tumors can be harvested and processed for characterization of tumor-infiltrating T cell activity. Rapid enzymatic digestion using collagenase and DNase allows a single-cell suspension to be extracted from tumors. The viability and cell surface markers of immune cells extracted from the tumor are preserved; therefore, it is appropriate for multiple downstream applications, including flow-assisted cell sorting of immune cells for culture or RNA extraction, flow cytometry analysis of immune cell populations. Here, we describe the ex vivo stimulation of T cell populations for intracellular cytokine quantification (IFN&#947; and TNF&#945;) and degranulation activity (CD107a) as a measure of overall cytotoxicity. Whole-tumor digests were stimulated with phorbol myristate acetate and ionomycin for 5 h, in the presence of anti-CD107a antibody in order to upregulate cytokine production and degranulation. The addition of brefeldin A and monensin for the final 4 h was performed to block extracellular transport and maximize cytokine detection. Extra- and intra-cellular staining of cells was then performed for flow cytometry analysis, where the proportion of IFN&#947;+, TNF&#945;+ and CD107a+ CD4+ and CD8+ T cells was quantified.
This method provides a starting base to perform comprehensive analysis of the tumor microenvironment.

Generation of Orthotopic Pancreatic Tumors and Ex vivo Characterization of Tumor-Infiltrating T Cell Cytotoxicity

This protocol describes the surgical generation of orthotopic pancreatic tumors and the rapid digestion of freshly isolated murine pancreatic tumors. Following digestion, viable immune cell populations can be used for further downstream analysis, including ex vivo stimulation of T cells for intracellular cytokine detection by flow cytometry.

종양 침투 T 세포 독성의 정형 외 췌장 종양 및 Ex 생체 특성의 생성

In vivo models of pancreatic cancer provide invaluable tools for studying disease dynamics, immune infiltration and new therapeutic strategies. The ...

Analysis of Side Population in Solid Tumor Cell Lines

Cancer stem cells (CSCs) are an important cause of tumor growth, metastasis, and recurrence. Isolation and identification of CSCs are of great significance for tumor research. Currently, several techniques are used for the identification and purification of CSCs from tumor tissues and tumor cell lines. Separation and analysis of side population (SP) cells are two of the commonly used methods. The methods rely on the ability of CSCs to rapidly expel fluorescent dyes, such as Hoechst 33342. The efflux of the dye is associated with the ATP-binding cassette (ABC) transporters and can be inhibited by ABC transporter inhibitors. Methods for staining cultured tumor cells with Hoechst 33342 and analyzing the proportion of their SP cells by flow cytometry are described. This assay is convenient, fast, and cost-effective. Data generated in this assay can contribute to a better understanding of the effect of genes or other extracellular and intracellular signals on the stemness properties of tumor cells.

A convenient, fast, and cost-effective method to measure the proportion of side population cells in solid tumor cell lines is presented.

고형 종양 세포주에서 측면 인구의 분석

Cancer stem cells (CSCs) are an important cause of tumor growth, metastasis, and recurrence. Isolation and identification of CSCs are of great ...

Isolation of Proximal Fluids to Investigate the Tumor Microenvironment of Pancreatic Adenocarcinoma

Pancreatic adenocarcinoma (PDAC) is the fourth leading cause of cancer-related death, and soon to become the second. There is an urgent need of variables associated to specific pancreatic pathologies to help preoperative differential diagnosis and patient profiling. Pancreatic juice is a relatively unexplored body fluid, which, due to its close proximity to the tumor site, reflects changes in the surrounding tissue. Here we describe in detail the intraoperative collection procedure. Unfortunately, translating pancreatic juice collection to murine models of PDAC, to perform mechanistic studies, is technically very challenging. Tumor interstitial fluid (TIF) is the extracellular fluid, outside blood and plasma, which bathes tumor and stromal cells. Similarly to pancreatic juice, for its property to collect and concentrate molecules that are found diluted in plasma, TIF can be exploited as an indicator of microenvironmental alterations and as a valuable source of disease-associated biomarkers. Since TIF is not readily accessible, various techniques have been proposed for its isolation. We describe here two simple and technically undemanding methods for its isolation: tissue centrifugation and tissue elution.

Pancreatic juice is a precious source of biomarkers for human pancreatic cancer. We describe here a method for intraoperative collection procedure. To overcome the challenge of adopting this procedure in murine models, we suggest an alternative sample, tumor interstitial fluid, and describe here two protocols for its isolation.

췌장 선암의 종양 미세 환경을 조사하기위한 근위액 분리

Pancreatic adenocarcinoma (PDAC) is the fourth leading cause of cancer-related death, and soon to become the second. There is an urgent need of variables ...

A Label-Free Segmentation Approach for Intravital Imaging of Mammary Tumor Microenvironment

The ability to visualize complex and dynamic physiological interactions between numerous cell types and the extracellular matrix (ECM) within a live tumor microenvironment is an important step toward understanding mechanisms that regulate tumor progression. While this can be accomplished through current intravital imaging techniques, it remains challenging due to the heterogeneous nature of tissues and the need for spatial context within the experimental observation. To this end, we have developed an intravital imaging workflow that pairs collagen second harmonic generation imaging, endogenous fluorescence from the metabolic co-factor NAD(P)H, and fluorescence lifetime imaging microscopy (FLIM) as a means to non-invasively compartmentalize the tumor microenvironment into basic domains of the tumor nest, the surrounding stroma or ECM, and the vasculature. This non-invasive protocol details the step-by-step process ranging from the acquisition of time-lapse images of mammary tumor models to post-processing analysis and image segmentation. The primary advantage of this workflow is that it exploits metabolic signatures to contextualize the dynamically changing live tumor microenvironment without the use of exogenous fluorescent labels, making it advantageous for human patient-derived xenograft (PDX) models and future clinical use where extrinsic fluorophores are not readily applicable.

The intravital imaging method described here utilizes collagen second harmonic generation and endogenous fluorescence from the metabolic co-factor NAD(P)H to non-invasively segment an unlabeled tumor microenvironment into tumor, stromal, and vascular compartments for in-depth analysis of 4D intravital images.

유방 종양 미세환경의 생체 내 이미징을 위한 라벨 없는 세분화 접근법

The ability to visualize complex and dynamic physiological interactions between numerous cell types and the extracellular matrix (ECM) within a live tumor ...

Industrialized, Artificial Intelligence-guided Laser Microdissection for Microscaled Proteomic Analysis of the Tumor Microenvironment

The tumor microenvironment (TME) represents a complex ecosystem comprised of dozens of distinct cell types, including tumor, stroma, and immune cell populations. To characterize proteome-level variation and tumor heterogeneity at scale, high-throughput methods are needed to selectively isolate discrete cellular populations in solid tumor malignancies. This protocol describes a high-throughput workflow, enabled by artificial intelligence (AI), that segments images of hematoxylin and eosin (H&#38;E)-stained, thin tissue sections into pathology-confirmed regions of interest for selective harvest of histology-resolved cell populations using laser microdissection (LMD). This strategy includes a novel algorithm enabling the transfer of regions denoting cell populations of interest, annotated using digital image software, directly to laser microscopes, thus enabling more facile collections. Successful implementation of this workflow was performed, demonstrating the utility of this harmonized method to selectively harvest tumor cell populations from the TME for quantitative, multiplexed proteomic analysis by high-resolution mass spectrometry. This strategy fully integrates with routine histopathology review, leveraging digital image analysis to support enrichment of cellular populations of interest and is fully generalizable, enabling harmonized harvests of cell populations from the TME for multiomic analyses.

This protocol describes a high-throughput workflow for artificial intelligence-driven segmentation of pathology-confirmed regions of interest from stained, thin tissue section images for enrichment of histology-resolved cell populations using laser microdissection. This strategy includes a novel algorithm enabling the transfer of demarcations denoting cell populations of interest directly to laser microscopes.

종양 미세환경의 미세스케일 프로테오믹 분석을 위한 산업화된 인공 지능 유도 레이저 미세 해부

The tumor microenvironment (TME) represents a complex ecosystem comprised of dozens of distinct cell types, including tumor, stroma, and immune cell ...