이탈리아 연구소 핵 물리학 (INFN)에 대 한 부분적으로 INFN 자오선 프로젝트를 통해이 작품을 자금. 저자는 INFN 자오선 프로젝트 조정;에 대 한 교수 Edoardo Milotti (물리학과, 대학교의 트리 에스테, 이탈리아)를 인정 닥터 Roberto Chignola (생명 공학 부, 대학교의 베로나, 이탈리아) Caco-2 셀, ohmmeter, 제공 하 고 그의 귀중 한 도움과 훈련에 대 한. 우리는 또한 기술 지원에 대 한 Agnese Solari 인정합니다.

다음 프로토콜 건강 한 지원자에서 인간의 피 철수를 포함 한다. 기증자 등록 사전 서 면된 동의 제공합니다. 이 절차는 헬싱키 선언에 따라 그리고 혈액 인출 전문 의료 조 수에 의해 수행 되었다.
1. 세포 문화 및 공동 문화 설정
<ol><li>1 주일 전에 방사선, 2.5 × 105 셀/mL와 10% 태아 둔감 한 혈 청 (FBS), 2 mM L-글루타민, 100 U/mL 페니실린, 100 μ g/mL 스 보충 하는 신선한 RPMI1640 매체에 포함 된 Caco-2 셀 서 스 펜 션 준비.</li>
	<li>종자의 살 균 1 µ m 기 공 직경 세포 배양에서 세포 현 탁 액 2 mL 6 잘 플레이트에 대 한 삽입 하 고 삽입 6 잘 플레이트에 넣어. 참고: 셀 문화 삽입 셀 뿌리기 전에 메 마른 완전 한 매체를 가진 외피에 의해 활성화 해야 합니다. 이 경우에, 문화 미디어 삭제 하 고 셀 서 스 펜 션 미디어로 대체 되어야 한다.</li>
	<li>10 %FBS, 2 mM L-글루타민, 100 IU/mL 페니실린, 및 각 바닥 구획, 100 µ g/mL 스 보충 하는 신선한 RPMI1640 매체의 3 mL를 추가 하 고 습도 분위기 5% CO2를 포함 하는 인큐베이터에서 37 ° C에서 세포 문화.</li>
	<li>Caco-2 셀 방사선의 같은 날, 상용 리튬-헤 파 린 코팅 6 mL 튜브에 인간의 전체 혈액 수집 (튜브 크기: 13 x 100 m m).</li>
	<li>그 후, Ficoll 기울기를 사용 하 여 주변 혈액 단 세포 (PBMC)를 격리 합니다. PBMC를 분리, 50 mL 원뿔 원심 분리기 튜브 및 레이어 전체 혈액의 동일 볼륨 Ficoll 25 mL를 넣어 Ficoll 표면에 RPMI1640와 함께 1:1 희석. 참고: 정상적인 건강 한 기증자는 일반적으로 약 4-10 × 106 PBMC/mL 있다.</li>
	<li>실 온에서 30 분 400 x g에서 50 mL 튜브 원심</li>
	<li>부드럽게 파스퇴르 피 펫과 포부에 의해 Ficoll와 플라즈마 사이의 인터페이스에서 PBMC를 수집 하 고 15 mL 원뿔 튜브에 넣어.</li>
	<li>두 번 버퍼링 하는 인산 염 (PBS)의 10 mL를 추가 하 여 10 분 동안 250 x g에서 PBMC centrifuging에서 PBMC를 씻어.</li>
	<li>문화 PBMC T25 h 조 3-5의 최대 c m2 플라스 크에서 완료 하기 전에, 5% CO2를 포함 하는 습도 분위기에서 37 ° C에서 설명한 대로 RPMI1640 미디어. 참고: 실험 당일 PBMC를 수집 하 고 2 × 106 셀/글쎄, 공동 문화의 아래쪽 구획에서 완전 한 RPMI1640 매체의 3 mL에 씨앗. Caco-2 셀 삽입 PBMC 포함 된 웰 스 30 분 그들의 방사선 조사 후 전송 됩니다. PBMC 전체 혈액에서 수집 수 없습니다 수 이상 약 72 h에 대 한 문화에서 유지 아니라면 예를 들어와 자극. phytohaemagglutinin (PHA), 세포의 생존 후 손실 됩니다. 주의: 모든 혈액과 혈액 제품의 안전과 품질 전체 과정을 통해 보장 되어야 한다.</li>
</ol>2. 방사선 설정
참고: Caco-2 세포의 방사선은 정기적으로 다양 한 유형의 암 치료에 사용 되는 선형 가속기 Istituto 디 Ricovero e Cura Carattere Scientifico (IRCCS) 미 됩니다 (파 비아, 이탈리아)의 방사선 치료 부서에서 수행 되었다.
<ol><li>6 MV 피크를 광자 엑스레이 에너지를 설정 합니다. 선형 가속기 pulsing 정권에서 작동 한다 (대략 4 ms의 2 연속 펄스 사이의 시간; 5 µs 복용량에 대 한 단일 펄스의 지속 시간 최대 1 × 10-3 Gy/p 비율).</li>
	<li>Caco-2 장에 1.4 cm 두께 유리 야 (사용 된 방사선의 보다 약간 더 큰 거리에 해당) 방사선의 소스에서 100 cm에서 엑스레이의 궤도에 삽입을 포함 하는 6-잘 접시를 놓습니다.</li>
	<li>방사선 backscattered 방사선 구성 요소 및 입자 평형 발생 하기 전에 각 샘플에 0.5 cm 두께 bolus를 놓습니다.</li>
	<li>셀을 비추는 (2-10 Gy 사이의 복용량) 아파트와 대칭 (± 2%) 20 x 20 cm2 방사선 분야 그리고 분당 3 Gy의 복용량 비율. 참고: "가짜" 제어-비친된 셀 받았다 방사선 룸을 입력 하지 않고 비친된 그들의 동일한 절차 조건 (받은 복용량: 0 Gy). 주의: 이온화 방사선 생산 장치 전문된 인력에 의해서만 사용 되어야 한다.</li>
</ol>3. 세포 생존 능력 분석 실험 (MTT 분석 결과)
참고: Caco-2 세포 대사 활동143-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium 브 로마 이드 (MTT) 분석 결과 통해 평가 했다.
<ol><li>시드 2 × 105 Caco-2 24-잘 접시 24 h에에서 완전 한 매체의 1.25 mL에 조사 하기 전에.</li>
	<li>2.1-2.4 단계에서 설명한 대로 셀을 비추는 다음 5% CO2를 포함 하는 습도 분위기에서 37 ° C에서 세포를 품 어.</li>
	<li>방사선 조사, 후 21 h 5 mg/mL MTT 솔루션의 100 µ L을 추가 하 고 포함 된 5% CO2 3 h 습도 분위기에서 37 ° C에서 셀을 계속.</li>
	<li>삭제는 상쾌한 고 1 mL의 PBS로 세포를 씻어.</li>
	<li>각 잘에서 디 메 틸 sulfoxide (DMSO)의 500 µ L을 추가 하 여 formazan 결정을 녹이 고 λ에서 다 잘 플레이트 리더 흡 광도 평가 = 570 nm.</li>
	<li>방사선 조사 후 단계 3.3-3.4-3.5-3.6에서 45 h를 반복 합니다. 참고: 결과 100%로 표준화 해당 가짜 상태에서 섭 동으로 표시 됩니다. 주의: DMSO는 피부, 눈 및 호흡 체계 (GHS07, GHS08)에 대 한 가연성 및 자극 에이전트입니다. 눈 접촉, 풍부한 물으로 즉시 세척 하 고 의료 조언을 추구 합니다. MTT는 피부, 눈 및 호흡 체계 (GHS07, GHS08)에 대 한 자극 에이전트. 눈 접촉, 물로 하 고 의료 조언을 추구 합니다.</li>
</ol>4. 가능한 셀 결정 (Trypan Blue 염료 배제 분석 결과)의 비율
참고: 실행 가능한 세포의 백분율 Trypan Blue 염료 배제 분석 결과 의해 평가 되었다.
<ol><li>시드 2 × 105 Caco-2 24-잘 접시 24 h에에서 완전 한 매체의 1.25 mL에 조사 하기 전에.</li>
	<li>셀 범위 0에에서 복용량을 비추는-10 Gy (2.1-2.4 단계 참조) 다음 24-48 h에 대 한 5% CO2 를 포함 하는 습도 분위기에서 37 ° C에서 세포를 품 어.</li>
	<li>2 선택한 시간 포인트, PBS로 세포 세척, 후, 삭제 다음 트립 신-ethylenediaminetetraacetic 산 (EDTA) 솔루션의 100 µ L를 추가 합니다. 2 분 동안 5% CO2 를 포함 하는 습도 분위기에서 37 ° C에서 세포를 넣어 다음 완전 한 매체 효소 반응 체포를 추가 합니다.</li>
	<li>1.5 mL 튜브에 세포를 수집 하 고 원심 5 분 삭제에 대 한 500 x g에 튜브는 상쾌한 다시 PBS의 50 µ L에서 세포를 일시 중지.</li>
	<li>Trypan Blue 염료 솔루션의 50 µ L로 세포 현 탁 액을 혼합 하 고 실 온에서 3 분을 위한 혼합물을 품 어.</li>
	<li>스테인드 계산 (비 가능한) 및 (가능한) 셀 Bürker 챔버와 흠 없는.</li>
</ol>5. 트랜스 상피 전기 저항 (TEER)
<ol><li>씨앗 5 × 105 Caco-2 셀 6 잘 플레이트에 조사 이전 1 주일 공동 삽입 (폴 리 에틸렌 테 레프 탈 산 (애완 동물), 2 x 106 모/cm2) 문화.</li>
	<li>1 시간 전에 방사선, 전압계/ohmmeter와 TEER를 측정 합니다.</li>
	<li>2.1-2.4 단계에서 설명한 대로 셀을 비추는.</li>
	<li>Caco-2 셀 5% CO2를 포함 하는 습도 분위기에서 37 ° C에서 PBMC 공동 문화의 존재/부재에 품 어.</li>
	<li>처음 몇 시간 후 방사선에 대 한 측정 TEER 매 시간, 그리고 이후에 모든 3 h 48 h까지.</li>
</ol>6. 서쪽 오 점 분석 Claudin-1, Occludin, Afadin, 조 1, ZO-2, NF-kB, 및 XIAP
<ol><li>씨앗 5 × 105 셀 6 잘 플레이트 공동 문화에 엑스레이 노출 하기 전에 1 주 (애완 동물, 2 x 106 모/cm2)를 삽입 하 고 2.1-2.4 단계에서 설명한 대로 셀을 비추는.</li>
	<li>Caco-2 셀 5% CO2를 포함 하는 습도 분위기에서 37 ° C에서 PBMC 공동 문화의 존재/부재에 품 어.</li>
	<li>Caco-2를 준비 하는 방사선 조사, 후 48 h 및 PBMC 세포 lysates 셀 세포와 세포를 치료 하 여 버퍼-20 ° c.에 샘플 저장 참고: 프로토콜 수 수 일시 중지 여기.</li>
	<li>Bicinchoninic 산 (BCA) 메서드에서 총 단백질 양을 계량. 참고: 프로토콜 수 수 일시 중지 여기.</li>
	<li>Laemli 샘플 버퍼 β-mercaptoethanol 추가 총 단백질의 동등한 양으로 혼합 (β-mercaptoethanol의 최종 농도 5%), 5 분 동안 95 ° C에서 샘플을 열 고 10000 x g에서 그들을 회전.</li>
	<li>부하 샘플 4-20%에서 젤 캐스트 및 polyvinildiene 불 소 (PVDF) 막에 1 h. 전송 단백질에 대 한 120 V에서 전기 영동을 수행.</li>
	<li>잠복기 5% 비 지방 건조 우유 (NFDM) 0.2% 추가 PBS에 실 온에서 PVDF 막 여 비 특정 바인딩 사이트 차단 트윈-20 (PBT). 막 세 번 0.2%의 10 mL로 씻어 PBT 5 분.</li>
	<li>다음 주 항 체와 4 ° C에서 하룻밤 배치 되 고 전에 실 온에서 1 h에 대 한 부드러운 동요와 막 품 어: 안티-claudin-1, 안티-ZO-1, 안티-ZO-2, 안티-afadin, 안티 occludin, 안티-NF-kB, 안티-XIAP와 안티 말라. 막 세 번 0.2%의 10 mL로 씻어 PBT 5 분.</li>
	<li>부드러운 동요와 함께 실 온에서 1 h에 대 한 2 차 항 체 양 고추냉이 과산화 효소 HRP 활용으로 막 품 어. 막 세 번 0.2%의 10 mL로 씻어 PBT 5 분.</li>
	<li>실내 온도에, 향상 된 화학 발광 키트와 함께 막을 배양 하 여 사진 필름을 개발 합니다.</li>
	<li>사진 필름 스캐닝 시스템으로 취득 하 고 적당 한 이미지 분석 소프트웨어와 함께 얻은 밴드 계량. 참고: Claudin 1, Occludin, Afadin, ZO-1, 그리고 조 2의 평가 Caco-2 셀에서 수행 됩니다. NF-kB와 XIAP의 평가 PBMC에서 수행 됩니다. 주의: β-mercaptoethanol은 독성 (GHS05, GHS06, GHS08, GHS09). 하지 증기를 호흡, 환경에 릴리스를 방지 하 고 개인 보호 장치 및 호흡기 보호를 착용. 삼 키는 경우 즉시 의료 조언을 부탁 드립니다.</li>
</ol>7. 통계 분석
<ol><li>방사선 노출 및 공동 문화는 통계적으로 중요 한 섭 동 유발 여부를 확인 하려면 테스트를 수행 양방향 분산 분석 (ANOVA) 여러 비교 반복 측정 (비교 Bonferroni 게시물 임시 테스트와 함께 복제) 의미합니다.</li>
	<li>명시 하지 않으면, 양측 스튜던트 t-검정에 의해 통계적 유의 성 (p)를 계산 합니다. 각 값은 ≥3 독립적인 실험 ± 표준 오차의 의미 (SEM)의 평균입니다.</li>
</ol>

<ol>
	<li>Cunningham, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Colorectal+cancer.">Colorectal cancer.</a> Lancet. 375 (9719), 1030-1047 (2010).</li><li>Mancuso, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Oncogenic+bystander+radiation+effects+in+Patched+heterozygous+mouse+cerebellum.">Oncogenic bystander radiation effects in Patched heterozygous mouse cerebellum.</a> PNAS. 105 (34), 12445-12450 (2008).</li><li>Demaria, S., Formenti, S. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Can+abscopal+effects+of+local+radiotherapy+be+predicted+by+modeling+T+cell+trafficking.">Can abscopal effects of local radiotherapy be predicted by modeling T cell trafficking.</a> J Immunother Cancer. 4 (1), 29 (2016).</li><li>Trott, K. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biological+mechanisms+of+normal+tissue+damage:+Importance+for+the+design+of+NTCP+models.">Biological mechanisms of normal tissue damage: Importance for the design of NTCP models.</a> Radiother Oncol. 105 (1), 79-85 (2012).</li><li>Derer, A., Deloch, L., Rubner, Y., Fietkau, R., Frey, B., Gaipl, U. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Radio-immunotherapy-induced+immunogenic+cancer+cells+as+basis+for+induction+of+systemic+anti-tumor+immune+responses+-+pre-clinical+evidence+and+ongoing+clinical+applications.">Radio-immunotherapy-induced immunogenic cancer cells as basis for induction of systemic anti-tumor immune responses - pre-clinical evidence and ongoing clinical applications.</a> Front Immunol. 6, 505 (2015).</li><li>Frey, B., Gaipl, U. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Radio-immunotherapy:+The+focused+beam+expands.">Radio-immunotherapy: The focused beam expands.</a> Lancet Oncol. 16 (7), 742-743 (2015).</li><li>Prise, K. M., O'Sullivan, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Radiation-induced+bystander+signalling+in+cancer+therapy.">Radiation-induced bystander signalling in cancer therapy.</a> Nat Rev Cancer. 9 (5), 351-360 (2009).</li><li>Sambuy, Y., De Angelis, I., Ranaldi, G., Scarino, M. L., Stammati, A., Zucco, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Caco-2+cell+line+as+a+model+of+the+intestinal+barrier:+Influence+of+cell+and+culture-related+factors+on+Caco-2+cell+functional+characteristics.">The Caco-2 cell line as a model of the intestinal barrier: Influence of cell and culture-related factors on Caco-2 cell functional characteristics.</a> Cell Biol Toxicol. 21 (1), 1-26 (2005).</li><li>Babini, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mechanisms+of+the+induction+of+apoptosis+mediated+by+radiation-induced+cytokine+release.">Mechanisms of the induction of apoptosis mediated by radiation-induced cytokine release.</a> Radiat Prot Dosim. 166 (1-4), 165-169 (2015).</li><li>Pellegrina, C. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effects+of+wheat+germ+agglutinin+on+human+gastrointestinal+epithelium:+Insights+from+an+experimental+model+of+immune/epithelial+cell+interaction.">Effects of wheat germ agglutinin on human gastrointestinal epithelium: Insights from an experimental model of immune/epithelial cell interaction.</a> Toxicol Appl Pharm. 237 (2), 146-153 (2009).</li><li>Pozo-Rubio, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Immunostimulatory+effect+of+faecal+Bifidobacterium+species+of+breast-fed+and+formula-fed+infants+in+a+peripheral+blood+mononuclear+cell/Caco-2+co-culture+system.">Immunostimulatory effect of faecal Bifidobacterium species of breast-fed and formula-fed infants in a peripheral blood mononuclear cell/Caco-2 co-culture system.</a> Brit J Nutr. 106 (8), 1216-1223 (2011).</li><li>Parlesak, A., Haller, D., Brinz, S., Baeuerlein, A., Bode, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Modulation+of+cytokine+release+by+differentiated+CACO-2+cells+in+a+compartmentalized+coculture+model+with+mononuclear+leucocytes+and+nonpathogenic+bacteria.">Modulation of cytokine release by differentiated CACO-2 cells in a compartmentalized coculture model with mononuclear leucocytes and nonpathogenic bacteria.</a> Scand J Immunol. 60 (5), 477-485 (2004).</li><li>Haller, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Non-pathogenic+bacteria+elicit+a+differential+cytokine+response+by+intestinal+epithelial+cell/leucocyte+co-cultures.">Non-pathogenic bacteria elicit a differential cytokine response by intestinal epithelial cell/leucocyte co-cultures.</a> Gut. 47 (1), 79-87 (2000).</li><li>Mosmann, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rapid+colorimetric+assay+for+cellular+growth+and+survival:+application+to+proliferation+and+cytotoxicity+assay.">Rapid colorimetric assay for cellular growth and survival: application to proliferation and cytotoxicity assay.</a> J Immunol Methods. 65 (1-2), 55-63 (1983).</li><li>Morini, J., Babini, G., Barbieri, S., Baiocco, G., Ottolenghi, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Interplay+between+Radioresistant+Caco-2+Cells+and+the+Immune+System+Increases+Epithelial+Layer+Permeability+and+Alters+Signaling+Protein+Spectrum.">The Interplay between Radioresistant Caco-2 Cells and the Immune System Increases Epithelial Layer Permeability and Alters Signaling Protein Spectrum.</a> Front Immunol. 8, 1-12 (2017).</li><li>Dittmar, S., Harms, H., Runkler, N., Maisner, A., Kim, K. S., Schneider-Schaulies, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Measles+virus-induced+block+of+transendothelial+migration+of+T+lymphocytes+and+infection-mediated+virus+spread+across+endothelial+cell+barriers.">Measles virus-induced block of transendothelial migration of T lymphocytes and infection-mediated virus spread across endothelial cell barriers.</a> J Virol. 82 (22), 11273-11282 (2008).</li><li>Srinivasan, B., Kolli, A. R., Esch, M. B., Abaci, H. E., Shuler, M. L., Hickman, J. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=TEER+Measurement+Techniques+for+In+Vitro+Barrier+Model+Systems.">TEER Measurement Techniques for In Vitro Barrier Model Systems.</a> J Lab Autom. 20 (2), 107-126 (2015).</li><li>Moyes, S. M., Killick, E. M., Morris, J. F., Kadhim, M. A., Hill, M. A., Carr, K. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Changes+produced+by+external+radiation+in+parameters+influencing+intestinal+permeability+and+microparticle+uptake+in+vitro.">Changes produced by external radiation in parameters influencing intestinal permeability and microparticle uptake in vitro.</a> Int J Radiat Biol. 84 (6), 467-486 (2008).</li></ol>

저자는 충돌의 관심을 선언합니다.

선진국에서 그것의 높은 발생으로 대 장 암 사망률 및 인구에서 사망률의 가장 빈번한 원인 중 하나입니다. 그것은 일반적으로 수술, 화학요법, 그리고 방사선 치료1에 의해 관리 됩니다. 방사선 치료의 프레임 워크에서 특정 주의 건강 한 조직을 노출4;의 효과를 부여 해야 합니다. 또한, 방사선 노출 및 면역 체계의 관계에 대 한 체계적인 연구는 라디오 immunotherapy3의 접근을 개발 하기 위한 기본.
우리는이 작품에서 채택 하는 방법론 Caco-2 셀 및 PBMC 크로스 토크의 조사를 맞게 되었습니다. 우리는 종양 세포의 엑스레이 노출의 효과에 집중 하지만 동일한 프로토콜 약리 작용 연구에 적용할 수 있습니다. 표준 세포 배양 관련 생리 적 조건에 가까이 되 고, 강한이 방법의 장점은 다른 세포 유형 및 자료의 분석의 가능성을 주어진 복잡 한 시스템의 완전 한 해 부의 가능성 공동 문화 자체의 두 구획으로 신호 분자. 이 방법에서는, 정기적으로 적용 된 생물 학적 방법 상호 관련된 메커니즘 휴대의 이해를 도울 수 있다.
Caco-2 셀에 X 레이 유도 효과의 초기 특성 두 보완 측정에 근거 했다, 즉 MTT 색도계 분석 결과 고 Trypan blue 염료 제외 테스트. 이러한 두 가지 분석 실험의 다른 초점에 의해 분명히 일관성 없는 결과 설명할 수 있었다. MTT은 Trypan 파랑 염료 생활 셀 제외 염료 메커니즘에 기반 하면서 oxidoreductase 효소 활동을 평가 합니다.
Caco-2-PBMC 상호 작용의 조사 공동 문화의 2 개의 구획 사이 완전 한 별거에 지도할 수 있는 상피 단층의 생성을 필요 합니다. Caco-2 셀 공동 문화 삽입에 뿌리기의 가능성이 셀 인구 조사 수 있습니다. 공동 문화 조사 후 시작, 이후 PBMC의 어떤 실수로 노출으로 인해 아무 편견이 있다. 이 설정 해야 손상 (또는 오염)을 피하기 위해 신중 하 게 처리 되어야 세포 단층 삽입의 움직임 동안 다른 한 6 잘 플레이트에서 합니다. 신중 하 게 수행 하는 경우 TEER 측정 조사 단층 침투성을 간단 하 고 비-침략 적 방법입니다. 이 분석 결과 엄격 하 게 공동 문화 설정에 관련 된 그리고 단층 침투성의 조사에 대 한 유일한 선택이 아니다. 그것은 잘 신선한 완전 한 매체와 보정은 일단 좋은 재현성을 측정의 수 있습니다. 일반적인 분석 아래 "basolateral" 하나에 위 "꼭대기" 구획에서 화학 염료의 확산에 초점 (예: fluorescein isothiocyanate (FITC)-dextran 분석 결과)16. 그러나, PBMC이이 연구에서 basolateral 구획에 있기 때문에, 우리는 실험에서 화학 시 약의 소개를 방지 하기로.
이 작품에서 채택 하는 다른 기법 중 TEER 측정은 유일 하 게 공동 문화 설정17,18필요 합니다. 그러나, 다른 일반적인 실험실 기술은 설치 생리에 가까운 조건의 조사 수 데이터 강한 생물 학적 중요성으로 셀 공동 문화에 적용 될 때 더 유익한 결과 제공 합니다. 다른 한편으로, 그것은 다공성 지원에 성장 하는 세포를 사용 하 여 서 부 럽 통해 분석할 세포 추출의 준비를 위한 세포 세포의 용 해 등 샘플을 준비 하는 데 필요한 작업에 몇 가지 문제가 발생할 수 언급 해야 합니다.
이 연구에서 채택 하는 시스템 개선, 예를 들면 기질 환경 재현 수 물질의 응용 프로그램으로 추가 될 가능성이 있다. 그러나,이 또한 시스템의 증가 복잡성 귀 착될 것 이다 고 설정의 완전 한 해 부 달성 될 더 어려울 것 이다.
셀 공동 문화에 대 한 설정을 확실히 복잡 한 시스템의 이해에 대 한 생체 외에서 연구의 발전을 위한 강력한 도구를 나타냅니다. 이 기술은 분자 신호에 그리고 가능한 응용 프로그램의 프레임 워크에서 면역 체계의 활동의 변조에 기초 연구 연구에 새로운 입력을 제공 하는 기본 메커니즘에 대 한 지식을 증가 하는 종양학 임상 환자 관리입니다.

이 작품에서 채택 하는 방법론은 대 장 암 세포와 면역 체계를 이용 하는 일반 2 차원 세포 배양에 비해 생리 적 조건에 가깝게 설정 간의 상호 작용을 조사 하도록 설계 되었습니다.
대 장 암 (CRC) 세 번째 가장 빈번한 유형의 (글로벌 암 전망대, 암, 세계 보건 기구, http://gco.iarc.fr에 대 한 연구를 위한 국제 기관)의 경우 전세계 1 백만 이상으로 암으로 간주 됩니다. CRC의 관리는 수술, 화학요법 또는 방사선 치료1통해 정기적으로 수행 됩니다. 수술 또는 화학요법 같은 침략 적 기법에 비해, 방사선 치료는 크게 일반적인 해로운 조직의 반응 방사선 복용량의 지역화 된 배달 덕분에 이러한 임상 접근에서 파생 방지 합니다. 그러나, 부작용은 건강 한 세포에 직접적인 피해와 피해 대상 비 효과2,,34중재 염증 트리거링 주변의 건강 한 조직에 발생할 수 있습니다. 대 장 암 치료 중 방사선 조사로 인해 불리 한 효과에 초점을 맞추고, 두 가지 측면 조사 될 필요가 있다. 첫째, 장 불 침투성의 책임 메커니즘 방사선 전달 일으키는, 차례 차례로, 세균성 인구 변경된 포함 및 paracellular 통로 분자와 용액의 부작용의 가능성에 의해 변경 될 수 있습니다. 둘째, 창 자 연관 된 림프 조직 (GALT)의 존재 세균성 성장을 통제 하 고 일반적인 면역 반응5,,67중재의 기능을 가진 면역 시스템의 전초 역할을 합니다. 이러한 기능을 수행 하기 위해 장 불 침투성 세포의 세포 막 사이 접합 단지의 기능 때문에 유지 됩니다. 이러한 이유로, 엑스레이의 다른 복용량 인해 유발된 해로운 결과 혼자 및 공동 문화 PBMC Caco-2 셀에 조사 되었다.
생물 의학 연구에 조사의 첫번째 setline는 세포 배양에 대 한 연구를 실시, 운전 하는 다른 세포 유형 사이 세포 생물학과 상호 상호 작용 하는 메커니즘의 상세한 지식이 부족 될 수 있습니다 중요 한 때 기관, 시스템, 그리고 실험실에서 쉽게 다시 만들 수 없는 기구의 생리학의 학문에 접근. 따라서, 우리 두 셀 인구 함께의 연구와 세포와 extracellular 메커니즘에 관련 된 측면의 해 부를 수 있도록 공동 문화 체제를 채택 하기로.
공동 문화 상피 기능과 다른 세포 유형 사이 상호 작용을 공부 하는 때 악용 하는 기법 이다. 특히, 이러한 기술의 사용 epithelia 셀 특징 극성으로 구성 되어 있기 때문에 우리의 경우, 필수 됩니다. 장 배리어의 경우 enterocytes 표시 꼭대기와 잘 정의 된 분극 하 고 basolateral 극 일반적으로 꽉 교차점을 만드는 접착 분자의 존재로 인해 분리 합니다. 이 구획은 paracellular 인신 매매와 결정된 분자만 통과 허용 피하 조직 생리학에 대 한 필요 합니다. 이 기능은 물론 설정 배양 정상 세포와 함께 재현 가능한 되지 않습니다. 또한, 공동 문화 체제의 채택 꼭대기 표면 (창 자 루멘에 해당)은 다른 세포와 직접 접촉 하는 동안만 basolateral 표면에에서 면역 세포의 존재를 재현 합니다.
최근, Caco-2 셀 라인 장 방 벽의 생체 외에서 모델로 더 많은 중요성을 얻었다. 인간 결 장 선 암에서 파생, Caco-2 세포 분화 능력을 유지 하 고 기능 편광된 단층8, 공동 문화 삽입에서 성장 될 때 세포 막 속성의 조사 수 있는 만듭니다.
Caco-2 다공성 막에 경작 장 단층의 잘 설립 된 생체 외에서 모델 이후 개선 Caco-2와 다른 세포 사이 공동 문화 되었습니다. 이 설치는 빈번 하 게 채택 되었다 측정 다른 사이 누화 종류9 셀 Caco-2를 해명 하는 데 사용 수 불안정 Caco-2 혼자 경작에 관하여 공동 문화에서 외 인 자극에 응답.
많은 연구 Caco-2 해결 동작 때 모두 비 병원 성 박테리아와 공동 경작 하 고 주변 혈액 단 세포, 특히 면역 시스템10와 혼선을 명료 하 게. 포-루비 오 외. 11 공부 Caco-2/PBMC 공동 문화에 여러 가지 cytokines의 표정을 Caco-2 세포를 자극 하는 bifidobacteria. 그들의 작품에 cytokine 식 프로필 PBMC의 존재/부재에서 세균성 자극에 따라 상당한 수정 강조 표시 됩니다. 그들의 결과 PBMC 존재 bifidobacteria에 Caco-2 sensitizes 결론으로 이어질.
비 병원 성 및 병원 성 박테리아 Caco-2 셀의 다른 응답 다른 연구 팀에 의해 평가 되어 있다. Parlesak 외. 12 대장균에 Caco-2 셀의 면역 억제 효과 입증-PBMC를 자극. 또한, 할 러 외. 13 enteropathogenic 대장균 종 또는 비 enteropathogenic 박테리아 i.e.E. 대장균 종, Caco-2 셀 두 lipopolysaccharide (LPS)와 자극된의 응답 공부 균 종, 강화는 Caco-2 세포의 응답 공동 문화 설정에 백혈구의 존재에 엄격 하 게 따라 하는 추측.
다른 상호 보완적인 실험실 분석을 수행 하 여 (예: 서쪽 오 점, 트랜스 상피 전기 저항, MTT, 등), 공동 문화에서 성장 하는 다른 세포 유형의 분석 뿐만 아니라 전체 방법론 약속 더 많은 대표에 비보를 정말 어떻게 간주 될 수 있는 결과. 또한,이 설정 관련된 셀 형식의 연구 뿐만 아니라 위 대 더 낮은 구획에 또는 존재 에서에서 발표 하는 세포 신호 분자를 수 있도록 다른 공동 문화 구획의 분리 수 있습니다. 대 공동 문화의 부재.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" style="width:1007px;" width="1007">
	<colgroup>
		<col />
		<col />
		<col />
		<col />
	</colgroup>
	<tbody>
		<tr height="42">
			<td height="42" style="height:42px;width:535px;">ThinCert 
			6 Well Cell Culture Inserts for Multiwell Plates</td>
			<td style="width:187px;">Greiner Bio-one</td>
			<td style="width:119px;">657610</td>
			<td style="width:167px;">Equipment</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Cell Culture Multiwell Plate, 6 Well&#160;</td>
			<td>Greiner Bio-one</td>
			<td>657160</td>
			<td>Plastic</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Cell Culture Multiwell Plate, 24 Well&#160;</td>
			<td>Greiner Bio-one</td>
			<td>662160</td>
			<td>Plastic</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">RPMI 1640 without L-Glutamine</td>
			<td>Lonza</td>
			<td>12-167F</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Foetal Bovine Serum</td>
			<td>Lonza</td>
			<td>DE14-801</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">L-Glutamine 200 mM</td>
			<td>Lonza</td>
			<td>17-605C</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Penicillin/Streptomycin&#160; 10K/10K</td>
			<td>Lonza</td>
			<td>17-602E</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">CO2 Incubator</td>
			<td>Heal Force</td>
			<td>HF240</td>
			<td>Equipment</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Ficoll Histopaque-1077</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>10771</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:535px;">Tube, 50 mL, PP, Conical Bottom</td>
			<td>Greiner Bio-one</td>
			<td>227261</td>
			<td>Plastic</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;width:535px;">Tube, 15 mL, PP, Conical Bottom</td>
			<td>Greiner Bio-one</td>
			<td>188261</td>
			<td>Plastic</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Centrifuge</td>
			<td>ThermoScientific</td>
			<td>CL31R</td>
			<td>Equipment</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Phosphate Buffered Saline (PBS)</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>P3813</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="24">
			<td height="24" style="height:24px;">Cell Culture Flask, 25 cm2, PS</td>
			<td>Greiner Bio-one</td>
			<td>690175</td>
			<td>Plastic</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Clinac 2100 Linear Accelerator</td>
			<td>Varian</td>
			<td>CLINAC 2100C/D</td>
			<td>Equipment</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide (MTT)</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>M5655</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Dimethyl sulfoxide (DMSO)</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>D8418</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Multiwell Plate Reader</td>
			<td>GDV</td>
			<td>DV990BV6</td>
			<td>Equipment</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Trypan Blue Solution 0,4 %&#160;</td>
			<td>Amresco</td>
			<td>K940</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Trypsin-EDTA Solution</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>T4049</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">1.5 mL tubes</td>
			<td>Eppendorf</td>
			<td>0030125150</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Millicell-ERS voltmeter/ohmeter</td>
			<td>Millipore</td>
			<td>MERS 00001</td>
			<td>Equipment</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Cell Lysis Buffer (10x)</td>
			<td>Cell Signalling Technology</td>
			<td>#9803</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">B&#252;rker Hemocytometer</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>BR719520</td>
			<td>Equipment</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">BCA Protein Quantification Kit</td>
			<td>Abcam</td>
			<td>ab102536</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">2x Laemmli Sample Buffer&#160;</td>
			<td>BioRad</td>
			<td>#1610737</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">2-Mercaptoethanol&#160;</td>
			<td>BioRad</td>
			<td>#1610710</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Accublock Digital Dry Bath</td>
			<td>Labnet International Inc.</td>
			<td>D1100</td>
			<td>Equipment</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">4&#8211;20% Mini-PROTEAN TGX Stain-Free Protein Gels, 10 well, 30 &#181;L</td>
			<td>BioRad</td>
			<td>#4568093&#160;</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Mini-PROTEAN&#160;Tetra Vertical Electrophoresis Cell for Mini Precast Gels, 4-gel</td>
			<td>BioRad</td>
			<td>#1658004</td>
			<td>Equipment</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">PowerPac HC High-Current Power Supply</td>
			<td>BioRad</td>
			<td>#1645052&#160;</td>
			<td>Equipment</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Precision Plus Protein WesternC Blotting Standards</td>
			<td>BioRad</td>
			<td>#1610385&#160;</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">10x Tris/Glycine/SDS Running Buffer</td>
			<td>BioRad</td>
			<td>#1610732&#160;</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Trans-Blot&#160;Turbo Mini PVDF Transfer Packs</td>
			<td>BioRad</td>
			<td>#1704156</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Trans-Blot&#160;Turbo Transfer System</td>
			<td>BioRad</td>
			<td>#1704150</td>
			<td>Equipment</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Blotting-Grade Blocker&#160;</td>
			<td>BioRad</td>
			<td>#1706404</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Tween-20</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>93773</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Claudin-1 (D5H1D) XP&#160;Rabbit mAb&#160;</td>
			<td>Cell Signalling Technology</td>
			<td>#13255</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Bovine Serum Albumine</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>A7906</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">ZO-1 (D7D12) Rabbit mAb&#160;</td>
			<td>Cell Signalling Technology</td>
			<td>#8193</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">ZO-2 Antibody&#160;</td>
			<td>Cell Signalling Technology</td>
			<td>#2847</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Afadin (D1Y3Z) Rabbit mAb</td>
			<td>Cell Signalling Technology</td>
			<td>&#160;#13531</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Anti-Occludin Antibody</td>
			<td>Millipore</td>
			<td>ABT146</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Anti-NF-kB p65 antibody [E379]</td>
			<td>Abcam</td>
			<td>ab32536</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Anti-XIAP antibody&#160;</td>
			<td>Abcam</td>
			<td>ab21278</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Amersham ECL Mouse IgG, HRP-linked whole Ab (from sheep)</td>
			<td>GE Healthcare Life Sciences</td>
			<td>NA931V</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Amersham ECL Rabbit IgG, HRP-linked whole Ab (from donkey)</td>
			<td>GE Healthcare Life Sciences</td>
			<td>NA934V</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Clarity Western ECL Substrate, 200 mL</td>
			<td>BioRad</td>
			<td>#1705060&#160;</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Carestream&#160;Kodak&#160;autoradiography GBX developer/replenisher</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>P7042</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Carestream&#160;Kodak&#160;autoradiography GBX fixer/replenisher</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>P7167</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Carestream&#160;Kodak&#160;BioMax&#160;light film</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>Z370401</td>
			<td>Reagents</td>
		</tr>
		<tr height="21">
			<td height="21" style="height:21px;">Gel Doc EZ System</td>
			<td>BioRad</td>
			<td>#1708270&#160;</td>
			<td>Equipment</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

a co-culture method to investigate the crosstalk between x-ray irradiated caco-2 cells and pbmc

프로토콜 채택에이 작품을 어떻게 엑스레이 교란 장 장벽의 기능 대 장 종양 세포와 면역계 사이의 상호 작용에 초점을 맞추고 탈피 목표로. 대 장 암 암, 수술, 화학요법, 그리고 방사선 치료에 의해 일반적으로 처리의 가장 일반적인 유형 중 하나입니다. 타겟팅 종양에 방사선 치료의 장점은 잘 알려져 있습니다. 그러나, 건강 한 조직의 제한 노출 장의 장벽 및 면역 체계에 미치는 영향에 대해 특히 큰 관심사입니다. 일반 세포 배양에 비해 더 생리 적인 것과 유사한 조건에서 두 셀 인구 사이 상호 작용을 공부 하 채택된 설치 수 있습니다. 이 위해 우리가 다른 기술에 리조트와 우리는 생체 외에서 공동 문화 모델 사용, 단층과 같은 문화 매체를 공유 PBMC 분화 Caco-2 셀에 따라. 이 프로토콜에 염증 통로의 활성화 그리고, 서쪽 오 점, 분자 변경, 즉 거시적인 효과, 즉 세포 생존 능력 및 트랜스 상피 전기 저항 (TEER)에 초점을 개발 되었습니다. 면역 세포와 Caco-2 셀에 꽉 접합 단백질 표정. Caco-2 세포 생존 능력에 방사선 효과의 초기 평가 동안 TEER는 ohmmeter를 통해 고정된 시간 간격 측정 되었다 Trypan 블루 분석 실험, 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium 브 로마 이드 (MTT)를 통해 평가 되었다 특히 공동 문화 시스템을 위해 설계 되었습니다. 이 방법에서는, 방사선, 존재의 주변 혈액 단 세포 (PBMC), 그리고 결국 그들의 시너지 효과 인해 효과 설명할 수 있습니다. 이러한 상호 보완적인 기술을 통해 PBMCs 추가 된 때 높은 라디오-저항 Caco-2의 2-10 Gy의 x-레이 및 증가 Caco-2 단층 침투성의 범위 내에서 관찰 합니다. 특히, PBMC 존재 관련 꽉 접합 비 계 단백질 식에서 변형 된 것으로 밝혀졌다.

실험 전에 1 주 셀 삽입의 다공성 막에 뿌 렸 고 있으며 다음과 같은 일 동안 성장할 수 있습니다. 합류의 레벨도는 거꾸로 한 현미경을 사용 하 여 확인할 수 있습니다 또는 TEER 값의 측정을 통해. 실제로, 성장 단계 TEER 모든 다공성 막 세포에 의해 덮여 있다 그리고 그들은 차별화 된 셀 단층을 형성 될 때까지 늘리면 유지 합니다. 세포 증식 빠른/느린, 실험 후 시드 되 고 이전/나중 지점에서 시작할 수 있습니다. 때에 합류, 세포는 다음 가져 방사선 조사 시설, imparted 환경 스트레스 (온도, pH)와 함께/없이 아래 칸 (그림 1A)에 시드 PBMC 공동 문화를 시작 하기 전에 최소화 또는 Caco-2 세포의 확산을 평가. 초기 시드 밀도 주어진 하루에 0 셀 한다 도달 100% 합류 하 고 고원 TEER 그림 1B에 의해 관찰 될 수 있는 상피 세포의 차별화 된 단층을 만듭니다. 셀 같은 상태에 도달, TEER 값으로 오래 된 문화 매체는 대체 신선한 매체와 적어도 일주일에 한 번 (그림 1B) 상대적으로 다음 주 일정 유지 됩니다. 그림 1C같이 24 시간에도 접수 (최대 10 Gy) 복용량 별도로 48 h에 MTT 분석 결과 어떤 통계적 Caco-2 세포의 증식 상태 변경을 표시 되지 않습니다.
다른 결과 Caco-2 셀의 단기 사망률에 관한 관찰 되었다. 두 시간 지점에서 셀 사망률에는 복용량-의존 증가 표시 Trypan 푸른 얼룩. 이 결과 죽은 세포의 백분율 높은 배달된 복용량 (10 Gy) 생산 세포 죽음 (그림 1D)의 20% 대략만 고려 하는 경우에 특히 매우 낮은 것으로 나타날 있지만 방사선 노출의 명확한 효과 보여 줍니다.
샘플 또는 더 낮은 구획에서 PBMC 없이 공동 경작 했다. PBMC에 어떤 외부 자극에는 영향을 받지 못한 사실을 감안할 때, 48 h 실험 PBMC 죽을 시작으로 도입 하는 바이어스를 피하기 위해 이상적인 여겨졌다. 따라서,에서 방사선, 직전 TEER 정기적으로 측정 했다 48 h에 대 한 조사 프로토콜에 의해 발생 가능한 일시적인 효과를 추적. 그림 1 E F같이 TEER 값 제시는 더 나은 (1200-1500 Ω·cm2순서의 있던) 미리 치료 조건에 관하여 상대 변형을 강조 x 선 방사선에 의해 유도 된 섭 동 및 존재/부재 PBMC의 공동 문화에 의해 또는. 두 경우 모두에서 초기 과도 피크 볼 수 있습니다 명확 하 게 첫 번째 시간이 시점에서 방사선 노출, 방사선 프로시저에 표시 될 수 있습니다.
하지에서 PBMC (그림 1E)와 함께 공동 문화, TEER 값은 48 h 동안,까지 거의 일정 한 엑스레이의 10 Gy 후, 셀 표시 TEER 장기간된 감소 3 h 방사선 조사 후에 시작. PBMCs의 존재는 완전히 TEER 임시 역학 (그림 1F)를 수정합니다. 모든 복용에 대 한 감소는 TEER 때 명확 하 게 약 30 h 방사선 조사 후, 최대 3 h에서 관찰 TEER 정착 상수 값 (그림 1F)에 나타납니다.
단단한 접속점 단지 식 수준 서쪽 오 점 분석 결과 통해 Caco-2 세포 lysates에서 조사 되었다. Caco-2 셀 (0, 2, 및 10 Gy의 복용량)과 이온화 방사선에 노출 되었고 이후에 성장 혼자 또는 공동 문화 48 h에 대 한 맨 아래 칸에 PBMCs ( 그림 2A-F에서 같이). Claudin-1와 Occludin (그림 22B) x 선 및/또는 공동 문화 PBMC 크게 변경 하지 것을 발견 했다. 큰 변동이 대신 ZO-1 조 2, Afadin (그림 2C, 2D, 2E) 비 계 단백질에서 관찰 되었다. 특히, ZO-2 식 수준에 있는 감소는 Caco-2 혼자 성장 하는 때 동안 10 Gy에서 PBMC와 공동 문화에 때 2 Gy 후 이미 관찰 됩니다. Afadin 식 수준 대신 영향을 받습니다 10 Gy 엑스레이의 직후 Caco-2는 PBMCs와 공동 경작 하는 때 추가 감소.
PBMCs 공동 Caco-2 교양 염증 상태에 관한 분석 했다, 특히 핵 전사 인자 kB (NF-kB)와 apoptosis 단백질 (XIAP) 레벨의 X 연결 된 억제 물 조사 되었습니다 (그림 2 G-난). NF-kB 총 금액은 영향을 받지는 공동 문화 Caco-2 다른 방사선 복용량 (그림 2G)에 노출. 그와 반대로, XIAP 레벨 4-fold 최대 2 Gy에 10 Gy 공동 문화, 규제 하지만 했다 큰 변화가 요구 같은 변동을 얻을 더 나은 통계적 인 힘 분석 샘플의 더 높은 번호.
같이 그림 2F 와 2I, 일부 일반적인 악대는 관심사의 단백질의 예상된 분자량 옆 나타날 수 있습니다. 사실과 일반적인 밴드 쉽게 구별할 수 있습니다, 하지 않는 한 다른 항 체 또는 BSA 또는 NFDM 농도 고려 되어야 한다.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56908/56908fig1.jpg"> 그림 1 . 전반적으로 실험적인 체제 및 방사선 노출 PBMC 공동 문화의 거시적인 효과. 공동 문화 모델의 A) 회로도 묘사. B) TEER 값은 단층의 적절 한 성장과 분화 상태를 평가 하기 위해 Caco-2 셀의 초기 씨앗에서 매일 측정. C) 세포 생존 능력 및 D) Caco-2 엑스레이 (0, 2, 5, 및 10 Gy)에 노출에 사망. Gy의 엑스레이 없이 교양 또는 F E) TEER 측정 Caco-2 셀에 0, 2, 및 10 반구) PBMCs와 함께. 각 값은 ≥3 독립적인 실험 ± SEM.의 평균 * p 발 < 0.05; * * p-버지니아 l < 0.01; p-발 < 0.001입니다. 그래프 Morini 알 외에서에서 적응입니다. 15. <a href="//cloudflare.jove.com/files/ftp_upload/56908/56908fig1large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.</a>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56908/56908fig2.jpg"> 그림 2. 서쪽 오 점 결과 Caco-2와 PBMC lysates의. 꽉 접합 단백질 (Claudin-1 (A), Occludin (B), ZO-1 (C), ZO-2 (D), 및 Afadin (E)) 0, 2, 및 10 Gy의 엑스레이 후 Caco-2 및 공동 문화에서 PBMC의 존재/부재의 식 수준입니다. 값은 말라 수준에서 정규화 됩니다. 각 단단한 연결 단백질 및 조건에 대 한 설명을 영화 패널 (F)에 표시 됩니다. NF-κB (G) 및 XIAP (H) PBMCs 공동 Caco-2 세포와 배양의 식 수준입니다. NF-kB, XIAP, 그리고 걸에 대 한 대표적인 영화 패널에 표시 됩니다. 각 값은 ≥3 독립적인 실험 ± SEM. 그래프 Morini 알 외에서에서 적응의 의미입니다. 15. <a href="//cloudflare.jove.com/files/ftp_upload/56908/56908fig2large.jpg" target="_blank">이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.</a>

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A Co-culture Method to Investigate the Crosstalk Between X-ray Irradiated Caco-2 Cells and PBMC

우리는 X 레이 방사선 Caco-2와 주변 혈액 단 세포 (PBMC) 사이 누화를 조사 하는 프로토콜을 제시. 프로토콜은 Caco-2 조사와 PBMC; 공동 문화권의 시작 그 후, 트랜스 상피 전기 저항 48 h 및 서양 오 점 Caco-2에 PBMC 수행을 통해 정기적으로 측정 됩니다.

X-선 사이 누화를 조사 하는 공동 문화 방법을 반구 Caco-2 셀 및 PBMC

The protocol adopted in this work aims at unraveling how X-rays perturb the functioning of the intestinal barrier, focusing on the interplay between ...

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Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

12.9K 조회수.  Università degli Studi di Pavia. 우리는 X 레이 방사선 Caco-2와 주변 혈액 단 세포 (PBMC) 사이 누화를 조사 하는 프로토콜을 제시. 프로토콜은 Caco-2 조사와 PBMC; 공동 문화권의 시작 그 후, 트랜스 상피 전기 저항 48 h 및 서양 오 점 Caco-2에 PBMC 수행을 통해 정기적으로 측정 됩니다.

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Co-culture Models of Pseudomonas aeruginosa Biofilms Grown on Live Human Airway Cells

Bacterial biofilms have been associated with a number of different human diseases, but biofilm development has generally been studied on non-living surfaces. In this paper, we describe protocols for forming Pseudomonas aeruginosa biofilms on human airway epithelial cells (CFBE cells) grown in culture. In the first method (termed the Static Co-culture Biofilm Model), P. aeruginosa is incubated with CFBE cells grown as confluent monolayers on standard tissue culture plates. Although the bacterium is quite toxic to epithelial cells, the addition of arginine delays the destruction of the monolayer long enough for biofilms to form on the CFBE cells. The second method (termed the Flow Cell Co-culture Biofilm Model), involves adaptation of a biofilm flow cell apparatus, which is often used in biofilm research, to accommodate a glass coverslip supporting a confluent monolayer of CFBE cells. This monolayer is inoculated with P. aeruginosa and a peristaltic pump then flows fresh medium across the cells. In both systems, bacterial biofilms form within 6-8 hours after inoculation. Visualization of the biofilm is enhanced by the use of P. aeruginosa strains constitutively expressing green fluorescent protein (GFP). The Static and Flow Cell Co-culture Biofilm assays are model systems for early P. aeruginosa infection of the Cystic Fibrosis (CF) lung, and these techniques allow different aspects of P. aeruginosa biofilm formation and virulence to be studied, including biofilm cytotoxicity, measurement of biofilm CFU, and staining and visualizing the biofilm.

Co-culture Models of Pseudomonas aeruginosa Biofilms Grown on Live Human Airway Cells

This paper describes different methods of growing Pseudomonas aeruginosa biofilms on cultured human airway epithelial cells. These protocols can be adapted to study different aspects of biofilm formation, including visualization of the biofilm, staining of the biofilm, measuring the colony forming units (CFU) of the biofilm, and studying biofilm cytotoxicity.

공동 문화 모델 녹농균 Biofilms는 라이브 인간 에어웨이 세포에 들어라

Bacterial biofilms have been associated with a number of different human diseases, but biofilm development has generally been studied on non-living ...

연구

면역학 및 감염병학

Using Bioluminescent Imaging to Investigate Synergism Between Streptococcus pneumoniae and Influenza A Virus in Infant Mice

During the 1918 influenza virus pandemic, which killed approximately 50 million people worldwide, the majority of fatalities were not the result of infection with influenza virus alone. Instead, most individuals are thought to have succumbed to a secondary bacterial infection, predominately caused by the bacterium Streptococcus pneumoniae (the pneumococcus). The synergistic relationship between infections caused by influenza virus and the pneumococcus has subsequently been observed during the 1957 Asian influenza virus pandemic, as well as during seasonal outbreaks of the virus (reviewed in 1, 2). Here, we describe a protocol used to investigate the mechanism(s) that may be involved in increased morbidity as a result of concurrent influenza A virus and S. pneumoniae infection. We have developed an infant murine model to reliably and reproducibly demonstrate the effects of influenza virus infection of mice colonised with S. pneumoniae. Using this protocol, we have provided the first insight into the kinetics of pneumococcal transmission between co-housed, neonatal mice using in vivo imaging 3.

Using Bioluminescent Imaging to Investigate Synergism Between Streptococcus pneumoniae and Influenza A Virus in Infant Mice

A concurrent infection with influenza A virus is one of the factors implicated in the induction of invasive pneumococcal disease during asymptomatic Streptococcus pneumoniae carriage. Here we describe a mixed infection method using infant mice to investigate the synergism between these two respiratory pathogens.

사이 Synergism을 맡은 이후로 발광 생물 이미징을 사용하여 연쇄상 구균 pneumoniae</em유아 마우스에서>와 인플루엔자 바이러스

During the 1918 influenza virus pandemic, which killed approximately 50 million people worldwide, the majority of fatalities were not the result of ...

The Insect Galleria mellonella as a Powerful Infection Model to Investigate Bacterial Pathogenesis

The study of bacterial virulence often requires a suitable animal model. Mammalian models of infection are costly and may raise ethical issues. The use of insects as infection models provides a valuable alternative. Compared to other non-vertebrate model hosts such as nematodes, insects have a relatively advanced system of antimicrobial defenses and are thus more likely to produce information relevant to the mammalian infection process. Like mammals, insects possess a complex innate immune system1. Cells in the hemolymph are capable of phagocytosing or encapsulating microbial invaders, and humoral responses include the inducible production of lysozyme and small antibacterial peptides2,3. In addition, analogies are found between the epithelial cells of insect larval midguts and intestinal cells of mammalian digestive systems. Finally, several basic components essential for the bacterial infection process such as cell adhesion, resistance to antimicrobial peptides, tissue degradation and adaptation to oxidative stress are likely to be important in both insects and mammals1. Thus, insects are polyvalent tools for the identification and characterization of microbial virulence factors involved in mammalian infections.
Larvae of the greater wax moth Galleria mellonella have been shown to provide a useful insight into the pathogenesis of a wide range of microbial infections including mammalian fungal (Fusarium oxysporum, Aspergillus fumigatus, Candida albicans) and bacterial pathogens, such as Staphylococcus aureus, Proteus vulgaris, Serratia marcescens Pseudomonas aeruginosa, Listeria monocytogenes or Enterococcus faecalis4-7. Regardless of the bacterial species, results obtained with Galleria larvae infected by direct injection through the cuticle consistently correlate with those of similar mammalian studies: bacterial strains that are attenuated in mammalian models demonstrate lower virulence in Galleria, and strains causing severe human infections are also highly virulent in the Galleria model8-11. Oral infection of Galleria is much less used and additional compounds, like specific toxins, are needed to reach mortality.
G. mellonella larvae present several technical advantages: they are relatively large (last instar larvae before pupation are about 2 cm long and weight 250 mg), thus enabling the injection of defined doses of bacteria; they can be reared at various temperatures (20 &deg;C to 30 &deg;C) and infection studies can be conducted between 15 &deg;C to above 37 &deg;C12,13, allowing experiments that mimic a mammalian environment. In addition, insect rearing is easy and relatively cheap. Infection of the larvae allows monitoring bacterial virulence by several means, including calculation of LD5014, measurement of bacterial survival15,16 and examination of the infection process17. Here, we describe the rearing of the insects, covering all life stages of G. mellonella. We provide a detailed protocol of infection by two routes of inoculation: oral and intra haemocoelic. The bacterial model used in this protocol is Bacillus cereus, a Gram positive pathogen implicated in gastrointestinal as well as in other severe local or systemic opportunistic infections18,19.

The Insect Galleria mellonella as a Powerful Infection Model to Investigate Bacterial Pathogenesis

Oral and intra haemocolic infection of larvae of the greater wax moth Galleria mellonella is described. This insect can be used to study virulence factors of entomopathogenic as well as mammalian opportunistic bacteria. Rearing of the insects, methods of infection and examples of in vivo analysis are described.

곤충<em&gt; 갤러리아 mellonella</em&gt; 세균 Pathogenesis를 조사 할 수있는 강력한 감염 모델로

The study of bacterial virulence often requires a suitable animal model. Mammalian models of infection are costly and may raise ethical issues. The use of ...

Monitoring Dendritic Cell Migration using 19F / 1H Magnetic Resonance Imaging

Continuous advancements in noninvasive imaging modalities such as magnetic resonance imaging (MRI) have greatly improved our ability to study physiological or pathological processes in living organisms. MRI is also proving to be a valuable tool for capturing transplanted cells in vivo. Initial cell labeling strategies for MRI made use of contrast agents that influence the MR relaxation times (T1, T2, T2*) and lead to an enhancement (T1) or depletion (T2*) of signal where labeled cells are present. T2* enhancement agents such as ultrasmall iron oxide agents (USPIO) have been employed to study cell migration and some have also been approved by the FDA for clinical application. A drawback of T2* agents is the difficulty to distinguish the signal extinction created by the labeled cells from other artifacts such as blood clots, micro bleeds or air bubbles. In this article, we describe an emerging technique for tracking cells in vivo that is based on labeling the cells with fluorine (19F)-rich particles. These particles are prepared by emulsifying perfluorocarbon (PFC) compounds and then used to label cells, which subsequently can be imaged by 19F MRI. Important advantages of PFCs for cell tracking in vivo include (i) the absence of carbon-bound 19F in vivo, which then yields background-free images and complete cell selectivityand(ii) the possibility to quantify the cell signal by 19F MR spectroscopy.

Monitoring Dendritic Cell Migration using 19F / 1H Magnetic Resonance Imaging

Tracking of cells using MRI has gained remarkable attention in the past years. This protocol describes the labeling of dendritic cells with fluorine (19F)-rich particles, the in vivo application of these cells, and monitoring the extent of their migration to the draining lymph node with 19F/1H MRI and 19F MRS.

사용 모니터링 수지상 세포 이동<sup&gt; 19</sup&gt; F /<sup&gt; 1</sup&gt; H 자기 공명 영상

Continuous  advancements in noninvasive imaging modalities such as magnetic resonance  imaging (MRI) have greatly improved our ability to study ...

Assessing the Innate Sensing of HIV-1 Infected CD4+ T Cells by Plasmacytoid Dendritic Cells Using an Ex vivo Co-culture System.

HIV-1 innate sensing requires direct contact of infected CD4+ T cells with plasmacytoid dendritic cells (pDCs). In order to study this process, the protocols described here use freshly isolated human peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) or plasmacytoid dendritic cells (pDCs) to sense infections in either T cell line (MT4) or heterologous primary CD4+ T cells. In order to ensure proper sensing, it is essential that PBMC are isolated immediately after blood collection and that optimal percentage of infected T cells are used. Furthermore, multi-parametric flow cytometric staining can be used to confirm that PBMC samples contain the different cell lineages at physiological ratios. A number of controls can also be included to evaluate viability and functionality of pDCs. These include, the presence of specific surface markers, assessing cellular responses to known agonist of Toll-Like Receptors (TLR) pathways, and confirming a lack of spontaneous type-I interferon (IFN) production. In this system, freshly isolated PBMCs or pDCs are co-cultured with HIV-1 infected cells in 96 well plates for 18-22 hr. Supernatants from these co-cultures are then used to determine the levels of bioactive type-I IFNs by monitoring the activation of the ISGF3 pathway in HEK-Blue IFN-&#945;/&#946; cells. Prior and during co-culture conditions, target cells can be subjected to flow cytometric analysis to determine a number of parameters, including the percentage of infected cells, levels of specific surface markers, and differential killing of infected cells. Although, these protocols were initially developed to follow type-I IFN production, they could potentially be used to study other imuno-modulatory molecules released from pDCs and to gain further insight into the molecular mechanisms governing HIV-1 innate sensing.

Assessing the Innate Sensing of HIV-1 Infected CD4+ T Cells by Plasmacytoid Dendritic Cells Using an Ex vivo Co-culture System.

Unlike cell-free HIV-1 particles, infected CD4+ T cells are effectively sensed by plasmacytoid dendritic cells (pDCs). This manuscript describes a method where peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) or isolated pDCs are co-cultured with HIV-1 infected T cells to evaluate innate sensing by pDCs as assessed by release of type-I IFN.

HIV-1 감염 CD4의 타고난 감지 평가<sup&gt; +</sup&gt;를 사용하여 형질 수지상 세포에 의한 T 세포<em&gt; 예 생체 내</em&gt; 공동 문화 시스템.

HIV-1 innate sensing requires direct contact of infected CD4+ T cells with plasmacytoid dendritic cells (pDCs). In order to study this process, the ...

Methods to Investigate the Regulatory Role of Small RNAs and Ribosomal Occupancy of Plasmodium falciparum

The genetic variation responsible for the sickle cell allele (HbS) enables erythrocytes to resist infection by the malaria parasite, P. falciparum. The molecular basis of this resistance, which is known to be multifactorial, remains incompletely understood. Recent studies found that the differential expression of erythrocyte microRNAs, once translocated into malaria parasites, affect both gene regulation and parasite growth. These miRNAs were later shown to inhibit mRNA translation by forming a chimeric RNA transcript via 5&#39; RNA fusion with discreet subsets of parasite mRNAs. Here, the techniques that were used to study the functional role and putative mechanism underlying erythrocyte microRNAs on the gene regulation and translational potential of P. falciparum, including the transfection of modified synthetic microRNAs into host erythrocytes, will be detailed.&#160; Finally, a polysome gradient method is used to determine the extent of translation of these transcripts. Together, these techniques allowed us to demonstrate that the dysregulated levels of erythrocyte microRNAs contribute to cell-intrinsic malaria resistance of sickle erythrocytes.

Methods to Investigate the Regulatory Role of Small RNAs and Ribosomal Occupancy of Plasmodium falciparum

Human microRNAs translocate from host erythrocytes to Plasmodium falciparum parasites. Here, the techniques used to transfect synthetic microRNAs into host erythrocytes and isolate all RNAs from P. falciparum are described. In addition, this paper will detail a method of polysome isolation in P. falciparum to determine the ribosomal occupancy and translational potential of parasite transcripts.

방법은 작은 RNA를과의 리보솜 점유 규제 역할을 조사하기 위해<em&gt; 말라리아 원충</em

The genetic variation responsible for the sickle cell allele (HbS) enables erythrocytes to resist infection by the malaria parasite, P. falciparum. The ...

Using X-ray Crystallography, Biophysics, and Functional Assays to Determine the Mechanisms Governing T-cell Receptor Recognition of Cancer Antigens

Human CD8+ cytotoxic T lymphocytes (CTLs) are known to play an important role in tumor control. In order to carry out this function, the cell surface-expressed T-cell receptor (TCR) must functionally recognize human leukocyte antigen (HLA)-restricted tumor-derived peptides (pHLA). However, we and others have shown that most TCRs bind sub-optimally to tumor antigens. Uncovering the molecular mechanisms that define this poor recognition could aid in the development of new targeted therapies that circumnavigate these shortcomings. Indeed, present therapies that lack this molecular understanding have not been universally effective. Here, we describe methods that we commonly employ in the laboratory to determine how the nature of the interaction between TCRs and pHLA governs T-cell functionality. These methods include the generation of soluble TCRs and pHLA and the use of these reagents for X-ray crystallography, biophysical analysis, and antigen-specific T-cell staining with pHLA multimers. Using these approaches and guided by structural analysis, it is possible to modify the interaction between TCRs and pHLA and to then test how these modifications impact T-cell antigen recognition. These findings have already helped to clarify the mechanism of T-cell recognition of a number of cancer antigens and could direct the development of altered peptides and modified TCRs for new cancer therapies.

Here, we describe methods that we commonly employ in the laboratory to determine how the nature of the interaction between the T-cell receptor and tumor antigens, presented by human leukocyte antigens, governs T-cell functionality; these methods include protein production, X-ray crystallography, biophysics, and functional T-cell experiments.

X 선 결정학, 생물 물리학 및 기능 분석 실험을 사용하면 메커니즘 집행 T 세포 암 항원의 수용체 인식을 확인하는 방법

Human CD8+ cytotoxic T lymphocytes (CTLs) are known to play an important role in tumor control. In order to carry out this function, the cell ...

Using Phylogenetic Analysis to Investigate Eukaryotic Gene Origin

Phylogenetic analysis uses nucleotide or amino acid sequences or other parameters, such as domain sequences and three-dimensional structure, to construct a tree to show the evolutionary relationship among different taxa (classification units) at the molecular level. Phylogenetic analysis can also be used to investigate domain relationships within an individual taxon, particularly for organisms that have undergone substantial change in morphology and physiology, but for which researchers lack fossil evidence due to the organisms&#39; long evolutionary history or scarcity of fossilization.
In this text, a detailed protocol is described for using the phylogenetic method, including amino acid sequence alignment using Clustal Omega, and subsequent phylogenetic tree construction using both Maximum Likelihood (ML) of Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) and Bayesian Inference via MrBayes. To investigate the origin of eukaryotic Sugars Will Eventually be Exported Transporters (SWEET) genes, 228 SWEETs including 35 SWEET proteins from unicellular eukaryotes and 57 SemiSWEET proteins from prokaryotes were analyzed. Interestingly, SemiSWEETs were found in prokaryotes, but SWEETs were found in eukaryotes. Two phylogenetic trees constructed using theoretically distinct methods have consistently&#160;suggested that the first eukaryotic SWEET gene might stem from the fusion of a bacterial SemiSWEET gene and an archaeal SemiSWEET gene.&#160;It is worth noting that one should be cautious to draw a conclusion based only on phylogenetic analysis, although it is useful to explain the underlying relationship between different taxa, which is difficult or even impossible to discern through experimental means.

A method of constructing a phylogenetic tree based on sequence homology of SWEETs from eukaryotes and SemiSWEETs from prokaryotes is described. Phylogenetic analysis is a useful tool for explaining the evolutionary relatedness between homologous proteins or genes from different organism groups.

사용 하 여 계통 발생 분석은 진 핵 유전자 원산지 조사

Phylogenetic analysis uses nucleotide or amino acid sequences or other parameters, such as domain sequences and three-dimensional structure, to construct ...

A Novel Feeder-free System for Mass Production of Murine Natural Killer Cells In Vitro

Natural killer (NK) cells belong to the innate immune system and are a first-line anti-cancer immune defense; however, they are suppressed in the tumor microenvironment and the underlying mechanism is still largely unknown. The lack of a consistent and reliable source of NK cells limits the research progress of NK cell immunity. Here, we report an in vitro system that can provide high quality and quantity of bone marrow-derived murine NK cells under a feeder-free condition. More importantly, we also demonstrate that siRNA-mediated gene silencing successfully inhibits the E4bp4-dependent NK cell maturation by using this system. Thus, this novel in vitro NK cell differentiating system is a biomaterial solution for immunity research.

A Novel Feeder-free System for Mass Production of Murine Natural Killer Cells In Vitro

Here, we present a protocol to mass-produce gene-silencing murine NK cells by using a feeder-free differentiation system for mechanistic study in vitro and in vivo.

소설 급지대 무료 시스템 대량 생산을 위한 생체 외에서 Murine 자연 킬러 세포의

Natural killer (NK) cells belong to the innate immune system and are a first-line anti-cancer immune defense; however, they are suppressed in the tumor ...

Bone Marrow Transplantation Platform to Investigate the Role of Dendritic Cells in Graft-versus-Host Disease

Allogeneic bone marrow transplantation (BMT) is an effective therapy for hematological malignancies due to the graft-versus-leukemia (GVL) effect to eradicate tumors. However, its application is limited by the development of graft-versus-host disease (GVHD), a major complication of BMT. GVHD is evoked when T-cells in the donor grafts recognizealloantigen expressed by recipient cells and mount unwanted immunological attacks against recipient healthy tissues. Thus, traditional therapies are designed to suppress donor T-cell alloreactivity. However, these approaches substantially impair the GVL effect so that the recipient&#39;s survival is not improved. Understanding the effects of therapeutic approaches on BMT, GVL, and GVHD, is thus essential. Due to the antigen-presenting and cytokine-secreting capacities to stimulate donor T-cells, recipient dendritic cells (DCs) play a significant role in the induction of GVHD. Therefore, targeting recipient DCs becomes a potential approach for controlling GVHD. This work provides a description of a novel BMT platform to investigate how host DCs regulate GVH and GVL responses after transplantation. Also presented is an effective BMT model to study the biology of GVHD and GVL after transplantation.

Graft-versus-host disease is a major complication after allogeneic bone marrow transplantation. Dendritic cells play a critical role in the pathogenesis of graft-versus-host disease. The current article describes a novel bone marrow transplantation platform to investigate the role of dendritic cells in the development of graft-versus-host disease and the graft-versus-leukemia effect.

이식대 숙주 질환에서 수지상 세포의 역할을 조사하는 골수 이식 플랫폼

Allogeneic bone marrow transplantation (BMT) is an effective therapy for hematological malignancies due to the graft-versus-leukemia (GVL) effect to ...