JoVE Journal

Genetics

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Multi-Locus variável-número tandem-repita a análise do peixe-patogénico bactéria Yersinia ruckeri pela PCR multiplex e pela electroforese capilar

Transcrição

O ensaio de análise em tandem-repetição de número variável multi-Locus (MLVA) apresentado aqui permite a genotipagem de alta resolução barata, robusta e portátil da bactéria patogênica Yersinia ruckeri. Partindo das culturas puras, o ensaio emprega o PCR multiplex e a electroforese capilar para produzir os perfis do MLVA do dez-loci para aplicações a jusante.

Capítulos neste vídeo

0:04

Title

0:53

Bacterial Cultivation and Extraction of Genomic DNA

1:54

Multiplex PCR Setup and Cycling Conditions

3:14

PCR Amplicon Confirmation by Gel Electrophoresis

4:37

Capillary Electrophoresis Setup and Run Conditions

6:06

VNTR (Variable-number Tandem-repeat) Size Calling, Repeat Count Calculation and MLVA (Multi-locus Variable-number Tandem-repeat Analysis) Profiling

7:36

Minimum Spanning Tree Cluster Analysis of MLVA Data

9:21

Results: Gel Electrophoresis, Electropherograms, and Minimum Spanning Tree

10:09

Conclusion

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