Um Protocolo Simples, Rápido e Parcialmente Automatizado para o Isolamento de Núcleos Únicos de Tecidos Congelados de Mamíferos para Sequenciamento de Núcleo Único

Esta pesquisa se concentra em apoiar estudos de descoberta de drogas usando o sequenciamento de RNA de núcleo único para investigar a eficácia e a segurança de tratamentos potenciais. Portanto, estamos desenvolvendo protocolos padronizados de extração de núcleos para amostras de tecido fresco congelado de vários órgãos. Nosso objetivo era automatizar e padronizar a extração de núcleos para alcançar resultados consistentes e confiáveis, reduzindo a variabilidade não biológica.

A vantagem é a automação parcial através do uso de um dissociador robótico e o fluxo de trabalho simples e curto que pode ser aplicado em várias amostras de tecidos de diferentes espécies. Ter protocolos padronizados pode nos ajudar a responder a perguntas sobre a biodistribuição de medicamentos, bem como explorar os mecanismos subjacentes a quaisquer sinais de segurança que possamos observar. No futuro, testaremos a aplicabilidade do nosso protocolo para outras aplicações downstream, como ATAC-seq ou multiômica.

Também tentaremos estabelecer protocolos para detectar transgenes expressos viricamente em núcleos únicos.