Method Article
Этот протокол описывает выделение двойных отрицательных тимоцитов из тимуса мыши с последующей ретровирусной трансдукцией и совместным культивированием в дельта-подобной 4-экспрессирующей системе совместного культивирования стромальных клеток костного мозга (OP9-DL4) для дальнейшего функционального анализа.
Трансдуцированные незрелые тимоциты мыши могут быть дифференцированы в Т-клетки in vitro с использованием дельта-подобной 4-экспрессирующей системы совместного культивирования линии стромальных клеток костного мозга (OP9-DL4). Поскольку ретровирусная трансдукция требует деления клеток для интеграции трансгенов, OP9-DL4 обеспечивает подходящую среду in vitro для культивирования гемопоэтических клеток-предшественников. Это особенно выгодно при изучении эффектов экспрессии определенного гена во время нормального развития Т-клеток и лейкемогенеза, поскольку позволяет исследователям обойти трудоемкий процесс создания трансгенных мышей. Для достижения успешных результатов необходимо тщательно выполнить ряд скоординированных шагов, включающих одновременное манипулирование различными типами клеток. Несмотря на то, что это очень хорошо зарекомендовавшие себя процедуры, отсутствие общего источника в литературе часто означает, что требуется ряд оптимизаций, которые могут занять много времени. Было показано, что этот протокол эффективен при трансдукции первичных тимоцитов с последующей дифференцировкой на клетках OP9-DL4. Здесь подробно описан протокол, который может служить быстрым и оптимизированным руководством для совместного культивирования ретровирусно трансдуцированных тимоцитов на стромальных клетках OP9-DL4.
Линия стромальных клеток костного мозга OP9 обеспечивает полезную систему in vitro для индукции лимфопоэза из нескольких источников предшественников1. Первые исследования, в которых использовались клетки OP9, продемонстрировали, что отсутствие экспрессии колониестимулирующего фактора макрофагов (MCSF) способствовало способности клеточной линии OP9 поддерживать кроветворение и дифференцировку В-клеток из гемопоэтических стволовых клеток (ГСК) костного мозга, что позже было показано и для эмбриональных стволовых клеток (ESCs)2,3,4,5 . В предыдущих исследованиях генерация дельта-подобных 1/4-экспрессирующих клеток OP9 (OP9-DL1/OP9-DL4) позволила индукировать приверженность линии Т-клеток6 и продемонстрировала способность успешно рекапитулировать созревание тимуса 7,8. Вкратце, развитие Т-клеток было описано последовательной экспрессией молекул CD4 и CD8. Незрелые тимоциты являются «двойноотрицательными» (DN, CD4-, CD8-) и могут быть дополнительно разделены в соответствии с поверхностной экспрессией CD44 и CD25. ДН-тимоциты дифференцируются через незрелую одноположительную (ISP) стадию, характеризующуюся экспрессией CD8 у мышей и CD4 у человека, за которой следует двойная положительная (DP) стадия, характеризующаяся совместной экспрессией CD4 и CD8, и, наконец, зрелая одноположительная стадия, характеризующаяся экспрессией CD4 или CD89. ГСК экспрессируют рецептор Notch1, который обычно взаимодействует с дельта-подобным 4 (DL4), экспрессируемым на эпителиальных клетках тимуса, индуцируя дифференцировку Т-линии10. Следовательно, интерес к модели OP9-DL1/4 постепенно возрастал, что привело к широкому использованию этого подхода в самых разных приложениях за последние два десятилетия 8,11,12,13. Хотя DL1 и DL4 способны поддерживать дифференцировку Т-клеток in vitro, они демонстрируют дифференциальные требования in vivo, и несколько исследований показали, что OP9_DL4 более эффективен, чем OP9_DL1, при повторении среды тимуса мыши 7,14.
Среди потенциальных применений системы OP9-DL1/4 особый интерес представляет комбинация этой системы с трансдукцией ДНК-клеток или ГСК ретровирусными векторами. Эта комбинация является эффективным способом манипулирования экспрессией генов во время нормального развития Т-клеток и лейкемогенеза и, как было показано, является эффективным методом индуцирования или ингибирования функции интересующего гена15,16,17. Эта модель была особенно успешно использована для изучения взаимодействия между онкогенами, управляющими лейкемией15, поскольку она является гибкой и позволяет изучать эффекты нескольких комбинаций генов в разумные сроки, в отличие от получения трансгенных мышей. Более того, подобные модели использовались ранее для оценки эффектов введения онкогенов в нормальные клетки15,16,17. Кроме того, ретровирусная трансдукция требует деления клеток для интеграции трансгена18, и хотя лентивирусная трансдукция преодолела бы это ограничение, устранив необходимость в делении клеток для интеграции трансгенов, мы не смогли добиться успешной трансдукции тимоцитов ДН с использованием лентивирусных векторов. Таким образом, OP9-DL1/DL4 является подходящим инструментом для выращивания гемопоэтических клеток-предшественников.
Стандартный протокол лимфопоэза трансдуцированных тимоцитов на OP9-DL4 включает в себя ряд скоординированных шагов, которые должны быть тщательно выполнены для достижения успешного результата. Несмотря на то, что эти методы хорошо служат обществу в течение многих лет, часто протоколы, доступные в литературе, фрагментированы. В результате каждая лаборатория вынуждена адаптировать и оптимизировать различные этапы процедуры, что может занять много времени. Здесь этот протокол описывает выделение тимоцитов ДНК из тимуса мыши с последующей ретровирусной трансдукцией и совместным культивированием на стромальных клетках OP9-DL4 для дальнейшего функционального анализа. Было показано, что этот установленный протокол эффективен и воспроизводим при трансдуцировании первичных тимоцитов с последующей дифференцировкой на клетках OP9-DL4 или индукцией Т-клеточного острого лимфобластного лейкоза15.
Все описанные эксперименты на животных были одобрены Институциональным комитетом по биобезопасности NIH (IBC) и Комитетом по уходу за животными и их использованию (ACUC). Подробную информацию обо всех реагентах и материалах, используемых в этом протоколе, см. в таблице материалов . Обратитесь к опубликованным рекомендациям19 для получения более подробной информации о культуре клеток ретровируса-продуцента и процедурах поддержания. Обзор протокола приведен на рисунке 1 .
1. Начало культивирования клеток OP9-DL4 (1-й день)
2. Начало культивирования клеточной линии ретровируса-продуцента (День 1)
3. Начало культивирования клеток-продуцентов ретровируса в 6-луночных планшетах (4–5 дни)
4. Трансфицировка клеток-продуцентов ретровируса для получения ретровируса, содержащего интересующие гены (дни 5–6)
5. Смена клеточной среды ретровируса-продуцента (6–7 день)
6. Подготовка тимоцитов и истощение CD4+ и CD8+ клеток (6–7 день)
7. Культивирование тимоцитов на клетках OP9-DL4 (6–7 дни)
8. Забор ретровируса из надосадочной жидкости и использование его для трансдукции тимоцитов (дни 8–9)
9. Поддержание трансдуцированных тимоцитов на культуре OP9-DL4 в течение 2–5 дней или замораживание по мере необходимости (день 9+)
Эффективность истощения можно оценить проточно-цитометрически, пометив магнитно немеченую клеточную фракцию для CD4 и CD8 после иммуномагнитного разделения клеток (MACS) и проанализировав ее на двумерной двумерной точечной диаграмме (рис. 3). Хороший выход двойных отрицательных (CD4-, CD8-) клеток составляет 95% или выше, как показано на рисунке 3. Двумя наиболее распространенными причинами снижения выхода являются неправильный расчет микрогранул на основе количества клеток и количества меченых клеток, превышающих емкость колонки. Рекомендуется выбирать правильное количество столбцов MACS в соответствии с количеством помеченных ячеек. При работе с тимоцитами количество меченых клеток (DP и SP клеток) практически равно количеству суммарных клеток (более 96%). Подсчет ячеек может производиться в автоматическом счетчике ячеек, камере Нойбауэра или любым альтернативным методом. В результате может потребоваться корректировка объемов, выделенных для подсчета ячеек, в зависимости от конкретной машины и выбранного метода подсчета.
Важно определить количество клеток, присутствующих до и после истощения. Эти подсчеты клеток необходимы для расчета количества необходимых столбцов истощения LD и равномерного распределения тимоцитов DN в соответствующее количество колб OP9-DL4. Контроль проточной цитометрии (немеченые клетки, клетки, меченные CD4, и клетки, меченные CD8), может быть выполнен с зарезервированным образцом до истощения, так как он содержит больше клеток. Однако, поскольку ожидается, что большая часть ячеек будет сохранена в столбце, образец после истощения, подлежащий маркировке, потребует большего объема. Следовательно, может потребоваться внести коррективы в соответствии с выбранным протоколом маркировки.
При использовании векторов, экспрессирующих скрининговые маркеры, таких как ген флуоресценции, трансфекцию и трансдукцию можно приблизительно и эмпирически оценить с помощью флуоресцентной микроскопии (рис. 2). Эффективность трансдукции может быть проанализирована путем сбора тимоцита из монослоя OP9-DL4, как описано на шаге 8.3, и изучения экспрессии гена флуоресценции с помощью проточной цитометрии. Эффективность трансдукции с использованием пустого ретровирусного вектора с GFP в качестве репортерного гена составила 84,2% (рис. 4).
Дифференцировка Т-клеток на клетках OP9-DL4 может наблюдаться через 4 дня после трансдукции. Проточную цитометрия обычно проводят для оценки дифференцировки клеток, индуцированной кокультурой на клетках OP9-DL4 и/или экспрессии трансгена, как показано на рисунке 5, где клетки были помечены для CD4, CD8, CD44 и CD25. Существует несколько возможных комбинаций маркировки молекул клеточной поверхности, которые, как было показано, полезны для исследования молекулярных и клеточных механизмов развития Т-клеток у мышей24,25,26,27. Следовательно, панели флуоресцентных антител могут варьироваться в зависимости от рассматриваемого вопроса. Трансдукция ДН-тимоцитов пустым ретровирусным вектором pMIG, показанная на панели B, представляла примерно те же пропорции одиночных положительных (CD4+ или CD8+), двойных положительных (CD4+/CD8+), двойных отрицательных (CD4-/CD8-) и ее подстадий, двойных отрицательных 1–4 (DN1–DN4), как и нетрансдуцированные тимоциты, показанные на панели А, что указывает на то, что процесс трансдукции не повлиял на развитие Т-клеток.
Рисунок 1: Схема этапов выделения, трансдукции и совместного культивирования тимоцитов. Аббревиатура: DN = двойное отрицание. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Рисунок 2: Флуоресцентная микроскопия кокультуральной тимоцитов, трансдуцированных GFP, или нетрансдуцированных тимоцитов и клеток OP9-DL4. (A) Нетрансдуцированные тимоциты и (B) стабильные GFP-экспрессирующие мышиные тимоциты на OP9-DL4 на 3-й день после второй трансдукции. Использовался флуоресцентный микроскоп Olympus-IX71 с 40-кратным объективом и фильтром 480/30, подходящим для детектирования GFP. Масштабная линейка = 40 мкм. Сокращения: GFP = зеленый флуоресцентный белок; DN = двойное отрицательное. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Рисунок 3: Проточная цитометрия истощения тимоцитов. Репрезентативные графики проточной цитометрии, анализирующие экспрессию CD4 и CD8 на тимоцитах, полученных от самок мышей C57BL/6J в возрасте 7-8 недель (A) до истощения и (B) после истощения CD4+ и CD8+ с использованием микрогранул и колонок LD в соответствии с инструкциями производителя. Точечные графики слева показывают ворота в зависимости от размера и сложности события (FCS-A и SSC-A соответственно). На средней панели показано сравнение FSC-H и FSC-A для затвора одиночных ячеек и исключения дублетов. На графиках справа клетки были определены как CD4 и CD8 от одноклеточного ворота. Сокращения: FSC-A = площадь пика прямого рассеяния; SSC-A = площадь пика бокового рассеяния; FSC-H = высота пика прямого рассеяния; FITC = изотиоцианат флуоресцеина; ПЭ = фикоэритрин. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Рисунок 4: Проточная цитометрия эффективности ретровирусной трансдукции тимоцитов. (A) Нетрансдуцированные тимоциты, совместно культивируемые на OP9-DL4; (B) ретровирусно трансдуцированные тимоциты на OP9-DL4 на 3-й день после трансдукции. Сокращения: FSC-A = площадь пика прямого рассеяния; SSC-A = площадь пика бокового рассеяния; FSC-H = высота пика прямого рассеяния; FITC = изотиоцианат флуоресцеина; ПЭ = фикоэритрин; DN = двойное отрицательное. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Рисунок 5: Проточная цитометрия трансдуцированных тимоцитов после 4 дней совместной культуры OP9-DL4. (A) Нетрансдуцированный и (B) трансдуцированный ретровирусом pMIG. Клетки сначала закрывали на живых клетках, а затем закрывали в зависимости от размера и сложности (FCS-A и SSC-A, соответственно), а затем строили график FSC-H по сравнению с FSC-A для затвора на одиночных клетках и исключения дублетов. Для нетрансдуцированных клеток мы использовали следующую стратегию ворот. Из одноклеточного затвора клетки были определены как одиночные положительные (CD4+ или CD8+), двойные положительные (CD4+/CD8+) и двойные отрицательные (CD4-/CD8-). Затем, с двойного отрицательного (CD4-/CD8-) затвора, клетки определяли как CD44+, CD25+, CD44+/CD25+ и CD44-/CD25−, как показано на панели A. Для трансдуцированных клеток pMIG, показанных на панели B, из одноклеточного ворота клетки сначала определялись как GFP+/GFP-, а затем из клеток GFP+ распределение популяции клеток на основные стадии развития Т-клеток, определяемое экспрессией CD4, CD8, CD44 и CD25, определяли с использованием той же стратегии ворот, что и для нетрансдуцированных клеток. Сокращения: FSC-A = площадь пика прямого рассеяния; SSC-A = площадь пика бокового рассеяния; FSC-H = высота пика прямого рассеяния; FITC = изотиоцианат флуоресцеина; GFP = зеленый флуоресцентный белок. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Описанный здесь протокол был разработан специально для исследований ДНК (CD4-/CD8-) Т-клеток, полученных из тимуса, с последующей ретровирусной трансфекцией с последующей моделью дифференцировки OP9-DL4. Однако вполне вероятно, что клетки-мишени, которые будут подвергнуты этому протоколу трансдукции с последующей дифференцировкой клеток, будут иметь более широкую междисциплинарную полезность. Таким образом, в дополнение к незрелым тимоцитам, гемопоэтические стволовые клетки, такие как клетки, полученные из печени плода или костного мозга, потенциально могут быть использованы в этом протоколе.
Система OP9-DL4 оказалась эффективной моделью для изучения функции генов в различных аспектах, включая дифференцировкуклеток 17 и онкогенез15. В то время как ретровирусная модификация гемопоэтических предшественников является хорошо зарекомендовавшим себя методом, который обеспечивает стабильную генетическую модификацию, сочетание индукции дифференцировки клеток в системе OP9-DL4 и ретровирусной трансдукции требует осторожности и навыков. Критическим аспектом для достижения успеха с этим протоколом является обеспечение хорошей координации всех шагов, поскольку протокол включает в себя использование трех различных типов клеток, которые необходимо поддерживать здоровыми и в идеальном слиянии, необходимом для каждого конкретного этапа. Имея это в виду, важно выполнить все анализы контрольных точек контроля качества после выполнения каждого шага, прежде чем переходить к следующему шагу. Это гарантирует, что все шаги работают. Таким образом, проверка эффективности истощения, трансфекции и трансдукции важна для успешного выполнения этого протокола (см. типичный результат эффективности трансдукции на рисунке 4). Хорошая эффективность первичной клеточной трансдукции связана с высоким титром вируса. Как правило, более крупные вставки приводят к более низким титрам вируса18. В учебных целях мы используем пустой вектор для представления результатов, которые могут быть получены с помощью этого протокола. По нашему опыту, эффективность трансдукции и трансфекции варьируется в зависимости от размера вставки, особенно с учетом репортерных генов, экспрессирующих вирусную магистраль, таких как GFP. Одна из стратегий, которая может быть использована при изучении взаимодействия более чем одного гена, заключается в клонировании каждого гена в другой вектор переноса с последующим производством отдельного вируса и, наконец, совместной трансдукцией клетки-мишени. В этом случае стадия отбора может быть применена для удаления одиночно трансдуцированных клеток и сохранения только котрансдуцированных клеток.
Стоит отметить, что большинство клеточных линий стромального фидерного слоя OP9-DL1/DL4 были генетически модифицированы для экспрессии GFP как части конструкций DL1 или DL47. В этом протоколе мы использовали ретровирусный вектор, который также экспрессирует GFP; однако он ярче, чем белок GFP, экспрессируемый клетками OP9-DL4, и не мешает трансдукционному контролю при визуализации кокультуры под флуоресцентным микроскопом.
Клетки OP9 дифференцируются в адипоциты после многих пассажей, длительных периодов в культуре или в условиях чрезмерного слияния19. Об этом свидетельствует развитие крупных вакуолей. Таким образом, ячейки OP9, обладающие этими характеристиками, не должны использоваться в этом протоколе. Трансфекция чрезмерно сливающихся клеток-продуцентов ретровируса приведет к низкому титру вируса. Действительно, субконфлюентная стадия - это когда клетки наиболее трансфицируемы. Кроме того, трансфекция клеток-продуцентов ретровируса с низким слиянием уменьшит клеточный стресс в процессе трансфекции и даст самый высокий титр вируса.
Хотя в этом протоколе мы не титруем надосадочную жидкость вируса, титрование надосадочной жидкости вируса необходимо учитывать в некоторых случаях, например, при отсутствии репортерного гена в ретровирусном векторе, что предотвратило бы косвенное определение продукции вируса, или в случаях, когда экспериментальный дизайн требует более точного количества копий трансгена, которые должны быть интегрированы в геном клетки-мишени. Однако важно отметить, что титр надосадочной жидкости ретровирусного вектора значительно снижается при хранении при -80 °C или 4 °C до получения результатов титрования. Таким образом, использование свежеприготовленного надосадочной жидкости вируса для трансдукции даст лучшую эффективность трансдукции.
Тимус содержит большое количество двойных положительных (DP) тимоцитов (более 85%) и около 10% одноположительных15 клеток (CD4 или CD8), которые являются тимоцитами пост-ДН-стадии. DP-клетки не могут выжить in vitro при ретровирусных манипуляциях, в то время как SP-клетки нетрансдумируемы. Таким образом, этот протокол может быть применен для генерации ретровирусного вектора, трансдуцируемого ДН-тимоцитов.
У авторов нет конфликтов интересов, которые необходимо раскрывать
Эта работа была поддержана очной программой Национального института рака, проект ZIABC009287. OP9-DL4 был получен от доктора Хуана Карлоса Суньига-Пфлюкера (Центр медицинских наук Саннибрук, Торонто, Онтарио, Канада). Авторы благодарят Программу NCI-Frederick Laboratory Animal Sciences Program за их постоянную техническую помощь, экспериментальные советы и вклад, а также Джеффа Каррела, Меган Карван и Кимберли Кларманн за помощь в проточной цитометрии. Мы благодарны Говарду Янгу за критические советы и вклад.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
2-mercaptoethanol | Sigma | M3148 | |
ACK Lysis buffer | Lonza | 10-548E | |
BSA | Cell Signaling Technology | 9998S | |
CD4 Microbeads | Miltenyi | 130-049-201 | |
CD8 Microbeads | Miltenyi | 130-049-401 | |
Centrifuge 5910R | eppendorf | 5942IP802353 | |
DMEM | Corning | 10-013-CV | |
EDTA | Invitrogen | 15575-038 | |
Fetal calf serum HyClone FBS | ThermoScientific | SH30910.03 | |
LD columns | Miltenyi | 130-042-901 | |
L-glutamine | Sigma | G7513 | Freeze glutamine in aliquots and use freshly-thawed glutamine |
Lipofectamine 2000 | Invitrogen | P/N 52887 | |
MEM-alpha Medium | Gibco | 12561-072 | |
OPTI-MEM I Reducing Serum Medium | Invitrogen | 31985-062 | |
PBS pH 7.2 | Corning | 21-040-CV | |
pcL-Eco Plasmid | Addgene | 12371 | |
penicillin/streptomycin | Gibco | 15140-122 | |
pMIG Plasmid | Addgene | 6492 | |
Polybrene | Chemicon | TR-1003-G | |
Pre-Separation Filters | Miltenyi | 130-041-407 | |
recombinant hFLT-3L | PeproTech | 300-19 | |
recombinant IL-7 | Peprotech | 217-17 | |
Retrovial packaging cell line Phoenix-Eco | Orbigen | RVC-10002 | |
Syringe filter (0.45 µm) | Millipore | SLHV033RS |
Запросить разрешение на использование текста или рисунков этого JoVE статьи
Запросить разрешениеThis article has been published
Video Coming Soon
Авторские права © 2025 MyJoVE Corporation. Все права защищены